# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version 1.18.1-3865-
#   - file written: Tue Jul  7 16:48:31 2020
#   Inital geometry file: a 319 line input string
#   Ligand name: (2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}tetrahydro-2H-pyran-4-yl (3R)-3-hydroxytetradecanoate (non-preferred name)
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CCCCCCCCCCC[C@@H](O)CC(=O)N[C@H]1[C@H](O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 UDG  UDG  '(2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}tetrahydro-2H-pyran-4-yl (3R)-3-hydroxytetradecanoate (non-preferred name)'  ligand  143  68  .  2021-08-24  2021-08-24  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_UDG
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 UDG  N1    N  NT     0  -0.573    3.7111   0.9691  -0.4987
 UDG  C2    C  C      0   0.740    4.8278   0.2880  -0.0636
 UDG  O2    O  O      0  -0.470    5.1071  -0.8346  -0.4280
 UDG  N3    N  NH1    0  -0.736    5.6206   0.9849   0.8101
 UDG  C4    C  C      0   0.582    5.4643   2.2886   1.2568
 UDG  O4    O  O      0  -0.476    6.2951   2.7934   1.9895
 UDG  C5    C  C1     0  -0.498    4.2802   2.9262   0.7431
 UDG  C6    C  C1     0   0.101    3.4701   2.2510  -0.0839
 UDG  PA    P  P      0   1.405    0.7260  -4.8523   0.4749
 UDG  PB    P  P      0   1.382    2.7368  -4.3433   2.6172
 UDG  C1'   C  CH1    0   0.289    1.9088  -2.1291   3.8044
 UDG  C11   C  CH1    0   0.220    2.7655   0.3244  -1.4038
 UDG  O1A   O  OP    -1  -0.771   -0.7756  -4.8644   0.5910
 UDG  O1B   O  OP    -1  -0.770    3.8110  -4.5832   1.6119
 UDG  C2'   C  CH1    0  -0.157    1.0653  -0.9328   3.3394
 UDG  C12   C  CH1    0  -0.045    3.3399  -0.1266  -2.7604
 UDG  O2'   O  OH1    0  -0.676    2.4884   0.3584  -3.7671
 UDG  O2A   O  O      0  -0.784    1.4224  -5.9406  -0.2715
 UDG  O2B   O  O      0  -0.784    2.7792  -4.9245   3.9923
 UDG  C3'   C  CH1    0   0.008    1.9211   0.2914   3.0087
 UDG  C13   C  CH1    0  -0.037    3.2613  -1.6622  -2.6872
 UDG  O3'   O  OH1    0  -0.664    2.9200  -2.2476  -3.9197
 UDG  N34   N  NH1    0  -0.638    0.2342  -1.3178   2.2309
 UDG  C35   C  C      0   0.566   -1.0454  -0.9382   2.0773
 UDG  O36   O  O      0  -0.520   -1.6667  -0.3040   2.9230
 UDG  C37   C  CH2    0  -0.609   -1.6895  -1.3606   0.7785
 UDG  C38   C  CH1    0   0.050   -2.8882  -2.2759   1.0436
 UDG  C39   C  CH2    0  -0.439   -3.5117  -2.7440  -0.2693
 UDG  O3A   O  O2     0  -0.745    1.2632  -4.7645   2.0177
 UDG  O3B   O  O2     0  -0.628    2.5525  -2.7025   2.7079
 UDG  C4'   C  CH1    0   0.027    2.9754   0.5524   4.0740
 UDG  O4'   O  OH1    0  -0.647    3.8103   1.5732   3.5957
 UDG  C14   C  CH1    0   0.019    2.1380  -1.8867  -1.6770
 UDG  O14   O  O2     0  -0.471    2.2007  -0.7904  -0.7863
 UDG  C40   C  CH2    0  -0.412   -4.7922  -3.5457  -0.0773
 UDG  C41   C  CH2    0  -0.412   -5.3981  -4.0288  -1.3891
 UDG  C42   C  CH2    0  -0.412   -6.7457  -4.7164  -1.2088
 UDG  C43   C  CH2    0  -0.412   -7.3431  -5.2273  -2.5140
 UDG  C44   C  CH2    0  -0.412   -8.7379  -5.8171  -2.3479
 UDG  C45   C  CH2    0  -0.411   -9.3323  -6.3353  -3.6519
 UDG  C46   C  CH2    0  -0.411  -10.7490  -6.8735  -3.4971
 UDG  C47   C  CH2    0  -0.406  -11.3410  -7.3940  -4.8013
 UDG  C48   C  CH2    0  -0.419  -12.7674  -7.9090  -4.6549
 UDG  C49   C  CH3    0  -0.662  -13.3435  -8.4325  -5.9636
 UDG  C5'   C  CH1    0  -0.027    3.7416  -0.7425   4.3582
 UDG  O5'   O  O2     0  -0.492    2.8222  -1.7348   4.7771
 UDG  C15   C  CH2    0  -0.165    2.2871  -3.1780  -0.9161
 UDG  O15   O  O2     0  -0.628    1.1221  -3.3873  -0.1351
 UDG  O50   O  OH1    0  -0.718   -2.5307  -3.3441   1.8826
 UDG  O51   O  O2     0  -0.472    1.0853   1.4543   2.9957
 UDG  C52   C  C      0   0.638    0.5333   1.9078   1.8762
 UDG  O53   O  O      0  -0.440    0.6776   1.4078   0.7916
 UDG  C54   C  CH2    0  -0.609   -0.3353   3.1096   2.1414
 UDG  C55   C  CH1    0   0.042   -0.2516   4.1407   1.0211
 UDG  C56   C  CH2    0  -0.448   -1.2202   5.2926   1.2651
 UDG  C57   C  CH2    0  -0.410   -1.1976   6.3481   0.1675
 UDG  C58   C  CH2    0  -0.414   -2.2987   7.3898   0.3225
 UDG  C59   C  CH2    0  -0.412   -2.2778   8.4454  -0.7751
 UDG  C6'   C  CH2    0  -0.165    4.7569  -0.5655   5.4658
 UDG  O6'   O  OH1    0  -0.664    5.4802  -1.7615   5.6220
 UDG  C60   C  CH2    0  -0.412   -3.4207   9.4478  -0.6761
 UDG  C61   C  CH2    0  -0.411   -3.4027  10.4888  -1.7876
 UDG  C62   C  CH2    0  -0.411   -4.5637  11.4729  -1.7172
 UDG  C63   C  CH2    0  -0.411   -4.5480  12.5003  -2.8415
 UDG  C64   C  CH2    0  -0.406   -5.7128  13.4805  -2.7846
 UDG  C65   C  CH2    0  -0.419   -5.6996  14.4956  -3.9207
 UDG  C66   C  CH3    0  -0.662   -6.8629  15.4757  -3.8593
 UDG  O67   O  OH1    0  -0.660    1.0791   4.5825   0.8376
 UDG  H5    H  H      0   0.275    4.0382   3.9331   1.0434
 UDG  H6    H  H      0   0.317    2.5690   2.7031  -0.4675
 UDG  H1'   H  HCH1   0   0.241    1.2416  -2.8420   4.2973
 UDG  H1'A  H  HCH1   0   0.249    2.0077   1.0889  -1.5941
 UDG  H2'   H  HCH1   0   0.271    0.4145  -0.6738   4.1778
 UDG  H2'A  H  HCH1   0   0.245    4.3643   0.2320  -2.9129
 UDG  HO2'  H  HOH1   0   0.446    2.3886  -0.3528  -4.4152
 UDG  H3'   H  HCH1   0   0.271    2.4056   0.1588   2.0365
 UDG  H3'A  H  HCH1   0   0.258    4.2021  -2.0641  -2.3078
 UDG  HO3'  H  HOH1   0   0.469    3.7285  -2.4459  -4.4026
 UDG  HN34  H  HNH1   0   0.414    0.6972  -1.7600   1.4481
 UDG  H37   H  HCH2   0   0.250   -2.0230  -0.4582   0.2587
 UDG  H37A  H  HCH2   0   0.254   -0.9787  -1.8653   0.1212
 UDG  H38   H  HCH1   0   0.203   -3.6403  -1.6941   1.5895
 UDG  H39   H  HCH2   0   0.207   -3.7288  -1.8680  -0.8902
 UDG  H39A  H  HCH2   0   0.214   -2.7766  -3.3386  -0.8234
 UDG  H4'   H  HCH1   0   0.224    2.4656   0.8528   5.0018
 UDG  HO4'  H  HOH1   0   0.455    4.2038   2.0409   4.3368
 UDG  H4'A  H  HCH1   0   0.223    1.1766  -1.8866  -2.2132
 UDG  H40   H  HCH2   0   0.210   -4.5934  -4.4041   0.5703
 UDG  H40A  H  HCH2   0   0.203   -5.5258  -2.9269   0.4527
 UDG  H41   H  HCH2   0   0.204   -5.5195  -3.1791  -2.0709
 UDG  H41A  H  HCH2   0   0.207   -4.6992  -4.7131  -1.8830
 UDG  H42   H  HCH2   0   0.206   -6.6408  -5.5493  -0.5044
 UDG  H42A  H  HCH2   0   0.205   -7.4452  -4.0138  -0.7416
 UDG  H43   H  HCH2   0   0.205   -7.3845  -4.4056  -3.2382
 UDG  H43A  H  HCH2   0   0.207   -6.6767  -5.9801  -2.9496
 UDG  H44   H  HCH2   0   0.206   -8.7064  -6.6303  -1.6141
 UDG  H44A  H  HCH2   0   0.205   -9.4022  -5.0547  -1.9251
 UDG  H45   H  HCH2   0   0.205   -9.3314  -5.5290  -4.3940
 UDG  H45A  H  HCH2   0   0.206   -8.6861  -7.1212  -4.0589
 UDG  H46   H  HCH2   0   0.206  -10.7549  -7.6761  -2.7511
 UDG  H46A  H  HCH2   0   0.205  -11.3938  -6.0833  -3.0959
 UDG  H47   H  HCH2   0   0.205  -11.3207  -6.5959  -5.5521
 UDG  H47A  H  HCH2   0   0.205  -10.7046  -8.1948  -5.1948
 UDG  H48   H  HCH2   0   0.210  -12.7910  -8.7040  -3.9030
 UDG  H48A  H  HCH2   0   0.210  -13.4026  -7.1064  -4.2667
 UDG  H49   H  HCH3   0   0.215  -12.7464  -9.2604  -6.3504
 UDG  H49A  H  HCH3   0   0.225  -14.3653  -8.7928  -5.8388
 UDG  H49B  H  HCH3   0   0.215  -13.3593  -7.6539  -6.7285
 UDG  H5'   H  HCH1   0   0.229    4.2677  -1.0568   3.4466
 UDG  H5'A  H  HCH2   0   0.213    2.4163  -3.9887  -1.6391
 UDG  H5AA  H  HCH2   0   0.241    3.1766  -3.1341  -0.2847
 UDG  HO50  H  HOH1   0   0.451   -1.8407  -3.8818   1.4240
 UDG  H54   H  HCH2   0   0.280   -1.3638   2.7441   2.2311
 UDG  H54A  H  HCH2   0   0.260   -0.0849   3.5624   3.1036
 UDG  H55   H  HCH1   0   0.229   -0.5257   3.6575   0.0793
 UDG  H56   H  HCH2   0   0.224   -2.2289   4.8740   1.3457
 UDG  H56A  H  HCH2   0   0.219   -1.0068   5.7556   2.2360
 UDG  H57   H  HCH2   0   0.214   -0.2247   6.8472   0.1495
 UDG  H57A  H  HCH2   0   0.209   -1.3052   5.8586  -0.8069
 UDG  H58   H  HCH2   0   0.207   -3.2726   6.8873   0.3237
 UDG  H58A  H  HCH2   0   0.208   -2.2113   7.8771   1.2999
 UDG  H59   H  HCH2   0   0.207   -1.3214   8.9796  -0.7496
 UDG  H59A  H  HCH2   0   0.206   -2.3180   7.9498  -1.7518
 UDG  H6'   H  HCH2   0   0.200    5.4196   0.2665   5.1998
 UDG  H6'A  H  HCH2   0   0.196    4.2352  -0.2795   6.3905
 UDG  HO6'  H  HOH1   0   0.455    6.1823  -1.6003   6.2585
 UDG  H60   H  HCH2   0   0.206   -4.3749   8.9093  -0.6991
 UDG  H60A  H  HCH2   0   0.206   -3.3837   9.9519   0.2962
 UDG  H61   H  HCH2   0   0.206   -2.4568  11.0410  -1.7546
 UDG  H61A  H  HCH2   0   0.206   -3.4191   9.9801  -2.7582
 UDG  H62   H  HCH2   0   0.206   -5.5090  10.9191  -1.7447
 UDG  H62A  H  HCH2   0   0.206   -4.5462  11.9899  -0.7512
 UDG  H63   H  HCH2   0   0.206   -3.6047  13.0572  -2.8121
 UDG  H63A  H  HCH2   0   0.205   -4.5594  11.9801  -3.8060
 UDG  H64   H  HCH2   0   0.205   -6.6568  12.9243  -2.8065
 UDG  H64A  H  HCH2   0   0.205   -5.6980  14.0094  -1.8249
 UDG  H65   H  HCH2   0   0.210   -4.7547  15.0478  -3.9006
 UDG  H65A  H  HCH2   0   0.210   -5.7174  13.9644  -4.8776
 UDG  H66   H  HCH3   0   0.225   -6.8368  16.1807  -4.6908
 UDG  H66A  H  HCH3   0   0.215   -7.8211  14.9540  -3.8981
 UDG  H66B  H  HCH3   0   0.216   -6.8430  16.0543  -2.9337
 UDG  HO67  H  HOH1   0   0.442    1.3617   5.0429   1.6354
 UDG  HN3   H  HNH1   0   0.419    6.4404   0.4873   1.1342

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 UDG  C2   N1    single  1.378  0.020  1.378
 UDG  N1   C11   single  1.459  0.020  1.459
 UDG  N1   C6    single  1.369  0.020  1.369
 UDG  O2   C2    double  1.213  0.020  1.213
 UDG  N3   C2    single  1.370  0.020  1.370
 UDG  N3   C4    single  1.387  0.020  1.387
 UDG  O4   C4    double  1.217  0.020  1.217
 UDG  C4   C5    single  1.440  0.020  1.440
 UDG  C5   C6    double  1.340  0.020  1.340
 UDG  C5   H5    single  0.930  0.020  1.080
 UDG  C6   H6    single  0.930  0.020  1.080
 UDG  O15  PA    single  1.636  0.020  1.636
 UDG  O3A  PA    single  1.636  0.020  1.636
 UDG  PA   O2A   deloc   1.492  0.020  1.492
 UDG  PA   O1A   deloc   1.506  0.020  1.506
 UDG  O2B  PB    deloc   1.494  0.020  1.494
 UDG  O3B  PB    single  1.654  0.020  1.654
 UDG  O3A  PB    single  1.646  0.020  1.646
 UDG  PB   O1B   deloc   1.491  0.020  1.491
 UDG  O5'  C1'   single  1.391  0.020  1.391
 UDG  O3B  C1'   single  1.395  0.020  1.395
 UDG  C2'  C1'   single  1.536  0.020  1.536
 UDG  C1'  H1'   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C11  O14   single  1.394  0.020  1.394
 UDG  C11  C12   single  1.541  0.020  1.541
 UDG  C11  H1'A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C3'  C2'   single  1.530  0.020  1.530
 UDG  C2'  N34   single  1.438  0.020  1.438
 UDG  C2'  H2'   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O2'  C12   single  1.405  0.020  1.405
 UDG  C12  C13   single  1.539  0.020  1.539
 UDG  C12  H2'A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O2'  HO2'  single  0.850  0.020  0.980
 UDG  C4'  C3'   single  1.521  0.020  1.521
 UDG  O51  C3'   single  1.432  0.020  1.432
 UDG  C3'  H3'   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C14  C13   single  1.527  0.020  1.527
 UDG  O3'  C13   single  1.407  0.020  1.407
 UDG  C13  H3'A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O3'  HO3'  single  0.850  0.020  0.980
 UDG  N34  C35   single  1.344  0.020  1.344
 UDG  N34  HN34  single  0.860  0.020  1.020
 UDG  C35  O36   double  1.226  0.020  1.226
 UDG  C35  C37   single  1.510  0.020  1.510
 UDG  C37  C38   single  1.531  0.020  1.531
 UDG  C37  H37   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C37  H37A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C38  C39   single  1.527  0.020  1.527
 UDG  C38  O50   single  1.405  0.020  1.405
 UDG  C38  H38   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C39  C40   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C39  H39   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C39  H39A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O4'  C4'   single  1.403  0.020  1.403
 UDG  C4'  C5'   single  1.531  0.020  1.531
 UDG  C4'  H4'   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O4'  HO4'  single  0.850  0.020  0.980
 UDG  O14  C14   single  1.414  0.020  1.414
 UDG  C14  C15   single  1.506  0.020  1.506
 UDG  C14  H4'A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C40  C41   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C40  H40   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C40  H40A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C41  C42   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C41  H41   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C41  H41A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C42  C43   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C42  H42   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C42  H42A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C43  C44   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C43  H43   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C43  H43A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C45  C44   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C44  H44   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C44  H44A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C45  C46   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C45  H45   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C45  H45A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C46  C47   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C46  H46   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C46  H46A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C47  C48   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C47  H47   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C47  H47A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C48  C49   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C48  H48   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C48  H48A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C49  H49   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C49  H49A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C49  H49B  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C6'  C5'   single  1.513  0.020  1.513
 UDG  C5'  O5'   single  1.416  0.020  1.416
 UDG  C5'  H5'   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C15  O15   single  1.418  0.020  1.418
 UDG  C15  H5'A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C15  H5AA  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O50  HO50  single  0.850  0.020  0.980
 UDG  O51  C52   single  1.328  0.020  1.328
 UDG  O53  C52   double  1.203  0.020  1.203
 UDG  C52  C54   single  1.506  0.020  1.506
 UDG  C54  C55   single  1.525  0.020  1.525
 UDG  C54  H54   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C54  H54A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C55  C56   single  1.525  0.020  1.525
 UDG  C55  O67   single  1.414  0.020  1.414
 UDG  C55  H55   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C56  C57   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C56  H56   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C56  H56A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C57  C58   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C57  H57   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C57  H57A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C58  C59   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C58  H58   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C58  H58A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C60  C59   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C59  H59   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C59  H59A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C6'  O6'   single  1.407  0.020  1.407
 UDG  C6'  H6'   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C6'  H6'A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O6'  HO6'  single  0.850  0.020  0.980
 UDG  C60  C61   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C60  H60   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C60  H60A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C61  C62   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C61  H61   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C61  H61A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C62  C63   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C62  H62   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C62  H62A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C63  C64   single  1.523  0.020  1.523
 UDG  C63  H63   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C63  H63A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C64  C65   single  1.524  0.020  1.524
 UDG  C64  H64   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C64  H64A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C65  C66   single  1.522  0.020  1.522
 UDG  C65  H65   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C65  H65A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C66  H66   single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C66  H66A  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  C66  H66B  single  0.970  0.020  1.090
 UDG  O67  HO67  single  0.850  0.020  0.980
 UDG  N3   HN3   single  0.860  0.020  1.020

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 UDG  C11   N1   C6    119.19  3.000
 UDG  C6    N1   C2    120.65  3.000
 UDG  C11   N1   C2    120.16  3.000
 UDG  N3    C2   O2    121.94  3.000
 UDG  N3    C2   N1    114.75  3.000
 UDG  O2    C2   N1    123.30  3.000
 UDG  HN3   N3   C4    116.76  3.000
 UDG  HN3   N3   C2    115.01  3.000
 UDG  C4    N3   C2    128.18  3.000
 UDG  C5    C4   O4    126.33  3.000
 UDG  C5    C4   N3    113.21  3.000
 UDG  O4    C4   N3    120.45  3.000
 UDG  H5    C5   C6    120.45  3.000
 UDG  H5    C5   C4    119.92  3.000
 UDG  C6    C5   C4    119.62  3.000
 UDG  H6    C6   C5    120.88  3.000
 UDG  H6    C6   N1    115.59  3.000
 UDG  C5    C6   N1    123.54  3.000
 UDG  O15   PA   O3A   102.95  3.000
 UDG  O3A   PA   O2A   110.95  3.000
 UDG  O15   PA   O2A   110.72  3.000
 UDG  O2A   PA   O1A   119.87  3.000
 UDG  O3A   PA   O1A   104.78  3.000
 UDG  O15   PA   O1A   106.10  3.000
 UDG  O3B   PB   O3A   100.03  3.000
 UDG  O3A   PB   O2B   105.15  3.000
 UDG  O3B   PB   O2B   109.80  3.000
 UDG  O3A   PB   O1B   111.00  3.000
 UDG  O3B   PB   O1B   106.08  3.000
 UDG  O2B   PB   O1B   122.54  3.000
 UDG  H1'   C1'  O5'   105.67  3.000
 UDG  H1'   C1'  O3B   111.58  3.000
 UDG  O5'   C1'  O3B   111.29  3.000
 UDG  H1'   C1'  C2'   108.01  3.000
 UDG  O3B   C1'  C2'   109.61  3.000
 UDG  O5'   C1'  C2'   110.58  3.000
 UDG  H1'A  C11  O14   110.83  3.000
 UDG  H1'A  C11  C12   108.05  3.000
 UDG  O14   C11  C12   107.88  3.000
 UDG  H1'A  C11  N1    104.37  3.000
 UDG  C12   C11  N1    115.72  3.000
 UDG  O14   C11  N1    109.95  3.000
 UDG  H2'   C2'  N34   108.10  3.000
 UDG  H2'   C2'  C3'   108.02  3.000
 UDG  N34   C2'  C3'   111.77  3.000
 UDG  H2'   C2'  C1'   106.23  3.000
 UDG  N34   C2'  C1'   110.01  3.000
 UDG  C3'   C2'  C1'   112.43  3.000
 UDG  H2'A  C12  C13   112.37  3.000
 UDG  H2'A  C12  O2'   110.72  3.000
 UDG  C13   C12  O2'   110.34  3.000
 UDG  H2'A  C12  C11   112.04  3.000
 UDG  C13   C12  C11   103.36  3.000
 UDG  O2'   C12  C11   107.70  3.000
 UDG  HO2'  O2'  C12   106.79  3.000
 UDG  H3'   C3'  O51   110.41  3.000
 UDG  H3'   C3'  C4'   109.64  3.000
 UDG  O51   C3'  C4'   105.75  3.000
 UDG  H3'   C3'  C2'   110.05  3.000
 UDG  O51   C3'  C2'   108.98  3.000
 UDG  C4'   C3'  C2'   111.93  3.000
 UDG  H3'A  C13  C14   110.49  3.000
 UDG  H3'A  C13  O3'   111.14  3.000
 UDG  C14   C13  O3'   109.87  3.000
 UDG  H3'A  C13  C12   109.88  3.000
 UDG  O3'   C13  C12   112.70  3.000
 UDG  C14   C13  C12   102.45  3.000
 UDG  HO3'  O3'  C13   108.76  3.000
 UDG  HN34  N34  C35   118.11  3.000
 UDG  HN34  N34  C2'   116.69  3.000
 UDG  C35   N34  C2'   124.26  3.000
 UDG  C37   C35  O36   121.45  3.000
 UDG  C37   C35  N34   115.18  3.000
 UDG  O36   C35  N34   123.36  3.000
 UDG  H37A  C37  H37   107.09  3.000
 UDG  H37A  C37  C38   109.73  3.000
 UDG  H37   C37  C38   109.68  3.000
 UDG  H37A  C37  C35   111.68  3.000
 UDG  H37   C37  C35   107.94  3.000
 UDG  C38   C37  C35   110.62  3.000
 UDG  H38   C38  O50   106.30  3.000
 UDG  H38   C38  C39   108.10  3.000
 UDG  O50   C38  C39   112.60  3.000
 UDG  H38   C38  C37   107.81  3.000
 UDG  O50   C38  C37   111.02  3.000
 UDG  C39   C38  C37   110.73  3.000
 UDG  H39A  C39  H39   106.27  3.000
 UDG  H39A  C39  C40   110.01  3.000
 UDG  H39   C39  C40   109.02  3.000
 UDG  H39A  C39  C38   109.10  3.000
 UDG  H39   C39  C38   108.85  3.000
 UDG  C40   C39  C38   113.35  3.000
 UDG  PB    O3A  PA    130.64  3.000
 UDG  C1'   O3B  PB    120.16  3.000
 UDG  H4'   C4'  C5'   107.83  3.000
 UDG  H4'   C4'  O4'   111.38  3.000
 UDG  C5'   C4'  O4'   112.39  3.000
 UDG  H4'   C4'  C3'   108.43  3.000
 UDG  C5'   C4'  C3'   109.37  3.000
 UDG  O4'   C4'  C3'   107.37  3.000
 UDG  HO4'  O4'  C4'   109.57  3.000
 UDG  H4'A  C14  C15   109.42  3.000
 UDG  H4'A  C14  O14   110.21  3.000
 UDG  C15   C14  O14   110.01  3.000
 UDG  H4'A  C14  C13   108.67  3.000
 UDG  C15   C14  C13   112.79  3.000
 UDG  O14   C14  C13   105.67  3.000
 UDG  C14   O14  C11   111.04  3.000
 UDG  H40A  C40  H40   106.17  3.000
 UDG  H40A  C40  C41   109.21  3.000
 UDG  H40   C40  C41   109.47  3.000
 UDG  H40A  C40  C39   109.05  3.000
 UDG  H40   C40  C39   109.57  3.000
 UDG  C41   C40  C39   113.12  3.000
 UDG  H41A  C41  H41   105.92  3.000
 UDG  H41A  C41  C42   109.61  3.000
 UDG  H41   C41  C42   108.99  3.000
 UDG  H41A  C41  C40   109.42  3.000
 UDG  H41   C41  C40   109.50  3.000
 UDG  C42   C41  C40   113.14  3.000
 UDG  H42A  C42  H42   105.92  3.000
 UDG  H42A  C42  C43   109.26  3.000
 UDG  H42   C42  C43   109.47  3.000
 UDG  H42A  C42  C41   109.01  3.000
 UDG  H42   C42  C41   109.53  3.000
 UDG  C43   C42  C41   113.38  3.000
 UDG  H43A  C43  H43   105.98  3.000
 UDG  H43A  C43  C44   109.52  3.000
 UDG  H43   C43  C44   109.13  3.000
 UDG  H43A  C43  C42   109.42  3.000
 UDG  H43   C43  C42   109.24  3.000
 UDG  C44   C43  C42   113.29  3.000
 UDG  H44A  C44  H44   105.98  3.000
 UDG  H44A  C44  C45   109.28  3.000
 UDG  H44   C44  C45   109.38  3.000
 UDG  H44A  C44  C43   109.13  3.000
 UDG  H44   C44  C43   109.51  3.000
 UDG  C45   C44  C43   113.29  3.000
 UDG  H45A  C45  H45   106.00  3.000
 UDG  H45A  C45  C46   109.43  3.000
 UDG  H45   C45  C46   109.24  3.000
 UDG  H45A  C45  C44   109.37  3.000
 UDG  H45   C45  C44   109.20  3.000
 UDG  C46   C45  C44   113.32  3.000
 UDG  H46A  C46  H46   106.01  3.000
 UDG  H46A  C46  C47   109.33  3.000
 UDG  H46   C46  C47   109.30  3.000
 UDG  H46A  C46  C45   109.24  3.000
 UDG  H46   C46  C45   109.45  3.000
 UDG  C47   C46  C45   113.26  3.000
 UDG  H47A  C47  H47   105.98  3.000
 UDG  H47A  C47  C48   109.33  3.000
 UDG  H47   C47  C48   109.23  3.000
 UDG  H47A  C47  C46   109.35  3.000
 UDG  H47   C47  C46   109.30  3.000
 UDG  C48   C47  C46   113.39  3.000
 UDG  H48A  C48  H48   106.04  3.000
 UDG  H48A  C48  C49   109.72  3.000
 UDG  H48   C48  C49   109.43  3.000
 UDG  H48A  C48  C47   109.23  3.000
 UDG  H48   C48  C47   109.37  3.000
 UDG  C49   C48  C47   112.82  3.000
 UDG  H49B  C49  H49A  107.59  3.000
 UDG  H49B  C49  H49   107.49  3.000
 UDG  H49A  C49  H49   107.60  3.000
 UDG  H49B  C49  C48   111.26  3.000
 UDG  H49A  C49  C48   111.70  3.000
 UDG  H49   C49  C48   111.00  3.000
 UDG  H5'   C5'  C6'   108.65  3.000
 UDG  H5'   C5'  O5'   110.85  3.000
 UDG  C6'   C5'  O5'   107.52  3.000
 UDG  H5'   C5'  C4'   109.12  3.000
 UDG  O5'   C5'  C4'   108.82  3.000
 UDG  C6'   C5'  C4'   111.88  3.000
 UDG  C5'   O5'  C1'   114.71  3.000
 UDG  H5AA  C15  H5'A  108.41  3.000
 UDG  H5AA  C15  O15   110.90  3.000
 UDG  H5'A  C15  O15   110.59  3.000
 UDG  H5AA  C15  C14   109.78  3.000
 UDG  H5'A  C15  C14   108.25  3.000
 UDG  O15   C15  C14   108.87  3.000
 UDG  C15   O15  PA    122.45  3.000
 UDG  HO50  O50  C38   108.33  3.000
 UDG  C52   O51  C3'   121.84  3.000
 UDG  C54   C52  O53   124.02  3.000
 UDG  C54   C52  O51   111.33  3.000
 UDG  O53   C52  O51   124.63  3.000
 UDG  H54A  C54  H54   106.34  3.000
 UDG  H54A  C54  C55   110.75  3.000
 UDG  H54   C54  C55   109.72  3.000
 UDG  H54A  C54  C52   110.70  3.000
 UDG  H54   C54  C52   106.84  3.000
 UDG  C55   C54  C52   112.24  3.000
 UDG  H55   C55  O67   105.20  3.000
 UDG  H55   C55  C56   108.21  3.000
 UDG  O67   C55  C56   112.49  3.000
 UDG  H55   C55  C54   108.68  3.000
 UDG  O67   C55  C54   110.99  3.000
 UDG  C56   C55  C54   111.00  3.000
 UDG  H56A  C56  H56   105.99  3.000
 UDG  H56A  C56  C57   110.03  3.000
 UDG  H56   C56  C57   109.38  3.000
 UDG  H56A  C56  C55   109.70  3.000
 UDG  H56   C56  C55   107.95  3.000
 UDG  C57   C56  C55   113.51  3.000
 UDG  H57A  C57  H57   106.06  3.000
 UDG  H57A  C57  C58   108.96  3.000
 UDG  H57   C57  C58   109.42  3.000
 UDG  H57A  C57  C56   109.25  3.000
 UDG  H57   C57  C56   109.97  3.000
 UDG  C58   C57  C56   112.94  3.000
 UDG  H58A  C58  H58   105.89  3.000
 UDG  H58A  C58  C59   109.49  3.000
 UDG  H58   C58  C59   109.32  3.000
 UDG  H58A  C58  C57   109.70  3.000
 UDG  H58   C58  C57   109.19  3.000
 UDG  C59   C58  C57   112.99  3.000
 UDG  H59A  C59  H59   105.86  3.000
 UDG  H59A  C59  C60   109.14  3.000
 UDG  H59   C59  C60   109.42  3.000
 UDG  H59A  C59  C58   109.17  3.000
 UDG  H59   C59  C58   109.46  3.000
 UDG  C60   C59  C58   113.51  3.000
 UDG  H6'A  C6'  H6'   107.07  3.000
 UDG  H6'A  C6'  O6'   111.83  3.000
 UDG  H6'   C6'  O6'   111.18  3.000
 UDG  H6'A  C6'  C5'   109.13  3.000
 UDG  H6'   C6'  C5'   108.47  3.000
 UDG  O6'   C6'  C5'   109.08  3.000
 UDG  HO6'  O6'  C6'   107.85  3.000
 UDG  H60A  C60  H60   105.90  3.000
 UDG  H60A  C60  C61   109.44  3.000
 UDG  H60   C60  C61   109.32  3.000
 UDG  H60A  C60  C59   109.57  3.000
 UDG  H60   C60  C59   109.18  3.000
 UDG  C61   C60  C59   113.17  3.000
 UDG  H61A  C61  H61   105.88  3.000
 UDG  H61A  C61  C62   109.23  3.000
 UDG  H61   C61  C62   109.33  3.000
 UDG  H61A  C61  C60   109.20  3.000
 UDG  H61   C61  C60   109.43  3.000
 UDG  C62   C61  C60   113.50  3.000
 UDG  H62A  C62  H62   105.92  3.000
 UDG  H62A  C62  C63   109.40  3.000
 UDG  H62   C62  C63   109.35  3.000
 UDG  H62A  C62  C61   109.47  3.000
 UDG  H62   C62  C61   109.26  3.000
 UDG  C63   C62  C61   113.18  3.000
 UDG  H63A  C63  H63   105.89  3.000
 UDG  H63A  C63  C64   109.29  3.000
 UDG  H63   C63  C64   109.28  3.000
 UDG  H63A  C63  C62   109.23  3.000
 UDG  H63   C63  C62   109.39  3.000
 UDG  C64   C63  C62   113.49  3.000
 UDG  H64A  C64  H64   105.91  3.000
 UDG  H64A  C64  C65   109.35  3.000
 UDG  H64   C64  C65   109.32  3.000
 UDG  H64A  C64  C63   109.44  3.000
 UDG  H64   C64  C63   109.35  3.000
 UDG  C65   C64  C63   113.22  3.000
 UDG  H65A  C65  H65   105.96  3.000
 UDG  H65A  C65  C66   109.59  3.000
 UDG  H65   C65  C66   109.52  3.000
 UDG  H65A  C65  C64   109.17  3.000
 UDG  H65   C65  C64   109.26  3.000
 UDG  C66   C65  C64   113.09  3.000
 UDG  H66B  C66  H66A  107.42  3.000
 UDG  H66B  C66  H66   107.66  3.000
 UDG  H66A  C66  H66   107.63  3.000
 UDG  H66B  C66  C65   111.20  3.000
 UDG  H66A  C66  C65   111.20  3.000
 UDG  H66   C66  C65   111.54  3.000
 UDG  HO67  O67  C55   108.54  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 UDG  CONST_01  C4    N3   C2   N1      0.00   0.0  0
 UDG  CONST_02  C5    C4   N3   C2      0.00   0.0  0
 UDG  CONST_03  C11   N1   C2   N3    180.00   0.0  0
 UDG  CONST_04  C6    N1   C2   N3      0.00   0.0  0
 UDG  CONST_05  O4    C4   N3   C2    180.00   0.0  0
 UDG  CONST_06  C11   N1   C2   O2      0.00   0.0  0
 UDG  CONST_07  C6    N1   C2   O2    180.00   0.0  0
 UDG  CONST_08  C4    N3   C2   O2    180.00   0.0  0
 UDG  CONST_09  HN3   N3   C2   N1    180.00   0.0  0
 UDG  CONST_10  O36   C35  N34  C2'     0.00   0.0  0
 UDG  CONST_11  C37   C35  N34  C2'   180.00   0.0  0
 UDG  CONST_12  HN34  N34  C35  O36   180.00   0.0  0
 UDG  Var_01    C14   C15  O15  PA    161.86  30.0  2
 UDG  Var_02    O2B   PB   O3B  C1'   -27.59  30.0  3
 UDG  Var_03    O53   C52  O51  C3'    -0.28  30.0  3
 UDG  Var_04    O15   PA   O3A  PB    -51.91  30.0  3
 UDG  Var_05    C38   C37  C35  N34   118.72  30.0  3
 UDG  Var_06    C41   C40  C39  C38  -179.10  30.0  3
 UDG  Var_07    C42   C41  C40  C39  -174.56  30.0  3
 UDG  Var_08    C43   C42  C41  C40  -178.81  30.0  3
 UDG  Var_09    C44   C43  C42  C41  -175.52  30.0  3
 UDG  Var_10    C45   C44  C43  C42  -179.67  30.0  3
 UDG  Var_11    C46   C45  C44  C43  -177.66  30.0  1
 UDG  Var_12    C47   C46  C45  C44  -179.88  30.0  3
 UDG  Var_13    C48   C47  C46  C45  -178.92  30.0  3
 UDG  Var_14    C49   C48  C47  C46  -179.70  30.0  3
 UDG  Var_15    C55   C54  C52  O51   143.13  30.0  3
 UDG  Var_16    C58   C57  C56  C55   172.08  30.0  3
 UDG  Var_17    C59   C58  C57  C56  -179.96  30.0  3
 UDG  Var_18    C60   C59  C58  C57   176.77  30.0  3
 UDG  Var_19    C61   C60  C59  C58  -179.25  30.0  1
 UDG  Var_20    C62   C61  C60  C59   178.47  30.0  3
 UDG  Var_21    C63   C62  C61  C60  -179.31  30.0  3
 UDG  Var_22    C64   C63  C62  C61   179.50  30.0  3
 UDG  Var_23    C65   C64  C63  C62  -179.36  30.0  3
 UDG  Var_24    C66   C65  C64  C63  -179.86  30.0  3
 UDG  Var_25    H49   C49  C48  C47    60.12  30.0  3
 UDG  Var_26    H66   C66  C65  C64  -179.18  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 UDG  chir_03  C1'  O5'  O3B  C2'  positiv
 UDG  chir_04  C11  N1   O14  C12  positiv
 UDG  chir_05  C2'  N34  C3'  C1'  positiv
 UDG  chir_06  C12  O2'  C11  C13  negativ
 UDG  chir_07  C3'  C2'  C4'  O51  positiv
 UDG  chir_08  C13  C12  C14  O3'  negativ
 UDG  chir_09  C38  C37  C39  O50  negativ
 UDG  chir_10  C4'  O4'  C3'  C5'  negativ
 UDG  chir_11  C14  O14  C13  C15  negativ
 UDG  chir_12  C5'  C4'  C6'  O5'  negativ
 UDG  chir_13  C55  C54  C56  O67  negativ

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 UDG  plan-1  O51   0.020
 UDG  plan-1  C52   0.020
 UDG  plan-1  O53   0.020
 UDG  plan-1  C54   0.020
 UDG  plan-2  N1    0.020
 UDG  plan-2  C2    0.020
 UDG  plan-2  O2    0.020
 UDG  plan-2  N3    0.020
 UDG  plan-2  C4    0.020
 UDG  plan-2  O4    0.020
 UDG  plan-2  C5    0.020
 UDG  plan-2  C6    0.020
 UDG  plan-2  C11   0.020
 UDG  plan-2  H5    0.020
 UDG  plan-2  H6    0.020
 UDG  plan-2  HN3   0.020
 UDG  plan-3  C2'   0.020
 UDG  plan-3  N34   0.020
 UDG  plan-3  C35   0.020
 UDG  plan-3  O36   0.020
 UDG  plan-3  C37   0.020
 UDG  plan-3  HN34  0.020

