# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version 1.18.1-3865-
#   - file written: Fri Jul  3 12:36:12 2020
#   Inital geometry file: a 259 line input string
#   Ligand name: N,N-dimethyl-L-valyl-N-{(1S,2S)-2-methoxy-4-[(2S)-2-{(1R,2S)-1-methoxy-2-methyl-3-oxo-3-[(2-phenylethyl)amino]propyl}pyrrolidin-1-yl]-1-[(1R)-1-methylpropyl]-4-oxobutyl}-N-methyl-L-valinamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC[C@@H](C)[C@@H]([C@H](CC(=O)N1CCC[C@H]1[C@H](OC)[C@H](C)C(=O)NCCc2ccccc2)OC)N(C)C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C)C(C)C
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 TZT  TZT  N,N-dimethyl-L-valyl-N-{(1S,2S)-2-methoxy-4-[(2S)-2-{(1R,2S)-1-methoxy-2-methyl-3-oxo-3-[(2-phenylethyl)amino]propyl}pyrrolidin-1-yl]-1-[(1R)-1-methylpropyl]-4-oxobutyl}-N-methyl-L-valinamide  ligand  117  50  .  2021-08-23  2022-09-16
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK (reasonable std)
;

data_comp_TZT
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 TZT  C6    C  CH3   0  -0.675    7.6297  -0.6979  -2.1153
 TZT  C5    C  CH1   0  -0.244    8.6387  -0.6807  -0.9684
 TZT  C7    C  CH3   0  -0.661    9.9475  -0.0561  -1.4411
 TZT  C4    C  CH1   0  -0.181    8.0534   0.0626   0.2419
 TZT  N2    N  NT    0  -0.409    8.8731   0.1664   1.4424
 TZT  C3    C  CH3   0  -0.529    9.5939  -1.0187   1.8429
 TZT  C1    C  CH3   0  -0.512    9.6518   1.3761   1.5742
 TZT  C8    C  C     0   0.594    6.7276  -0.5619   0.6789
 TZT  O9    O  O     0  -0.498    6.6062  -1.7620   0.8913
 TZT  N10   N  NH1   0  -0.631    5.7262   0.3187   0.8469
 TZT  C11   C  CH1   0  -0.184    4.4090  -0.0228   1.3333
 TZT  C12   C  CH1   0  -0.237    3.9837   0.8995   2.4853
 TZT  C14   C  CH3   0  -0.679    2.5923   0.5201   2.9780
 TZT  C13   C  CH3   0  -0.653    4.9925   0.8371   3.6263
 TZT  C15   C  C     0   0.588    3.4486   0.1094   0.1440
 TZT  O16   O  O     0  -0.506    3.3691   1.2061  -0.3988
 TZT  N17   N  NT    0  -0.462    2.7653  -0.9763  -0.2721
 TZT  C78   C  CH3   0  -0.575    2.8473  -2.2542   0.4226
 TZT  C18   C  CH1   0  -0.104    1.9660  -0.8896  -1.4969
 TZT  C19   C  CH1   0  -0.243    2.4349  -1.9051  -2.5609
 TZT  C22   C  CH3   0  -0.669    3.9595  -1.9447  -2.6469
 TZT  C20   C  CH2   0  -0.432    1.8445  -1.5498  -3.9339
 TZT  C21   C  CH3   0  -0.667    1.9673  -2.6632  -4.9658
 TZT  C23   C  CH1   0   0.083    0.4528  -0.9297  -1.2132
 TZT  O24   O  O2    0  -0.494    0.0287  -2.1800  -0.7126
 TZT  C25   C  CH3   0  -0.412   -0.7164  -2.9759  -1.6024
 TZT  C26   C  CH2   0  -0.627    0.0491   0.1453  -0.2152
 TZT  C27   C  C     0   0.589   -1.4419   0.4351  -0.2328
 TZT  O28   O  O     0  -0.497   -2.1898  -0.0681  -1.0636
 TZT  N29   N  NT    0  -0.481   -1.8995   1.3133   0.6777
 TZT  C30   C  CH2   0  -0.279   -1.1603   1.8925   1.7861
 TZT  C31   C  CH2   0  -0.448   -2.2211   1.9767   2.8707
 TZT  C32   C  CH2   0  -0.496   -3.4693   2.3795   2.0910
 TZT  C33   C  CH1   0  -0.071   -3.3066   1.7262   0.7036
 TZT  C34   C  CH1   0   0.062   -3.6144   2.6432  -0.4859
 TZT  O35   O  O2    0  -0.484   -2.8520   3.8124  -0.3267
 TZT  C36   C  CH3   0  -0.404   -2.5743   4.4959  -1.5228
 TZT  C37   C  CH1   0  -0.397   -5.1144   2.9632  -0.6998
 TZT  C38   C  CH3   0  -0.699   -5.7535   3.8561   0.3588
 TZT  C39   C  C     0   0.551   -5.8534   1.6671  -0.9981
 TZT  O40   O  O     0  -0.500   -5.7082   1.0946  -2.0711
 TZT  N41   N  NH1   0  -0.645   -6.6508   1.1831  -0.0339
 TZT  C42   C  CH2   0  -0.233   -7.4038  -0.0446  -0.1764
 TZT  C43   C  CH2   0  -0.561   -8.4912  -0.1263   0.8908
 TZT  C44   C  CR6   0   0.124   -9.3025  -1.3818   0.7341
 TZT  C45   C  CR16  0  -0.307   -8.9208  -2.5610   1.3697
 TZT  C46   C  CR16  0  -0.240   -9.6469  -3.7317   1.1934
 TZT  C47   C  CR16  0  -0.271  -10.7681  -3.7390   0.3738
 TZT  C48   C  CR16  0  -0.241  -11.1574  -2.5690  -0.2657
 TZT  C49   C  CR16  0  -0.305  -10.4281  -1.4011  -0.0865
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 TZT  H6B   H  HCH3  0   0.217    7.3598   0.3156  -2.4217
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 TZT  H7B   H  HCH3  0   0.216    9.8134   0.9954  -1.7059
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 TZT  H3A   H  HCH3  0   0.231    9.9429  -0.8966   2.8706
 TZT  H3B   H  HCH3  0   0.241    8.9445  -1.8913   1.8246
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 TZT  H38A  H  HCH3  0   0.254   -5.1959   4.7868   0.4519
 TZT  H38B  H  HCH3  0   0.253   -6.7721   4.1158   0.0696
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 TZT  H46   H  HCR6  0   0.254   -9.3389  -4.6374   1.7002
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 TZT  H48   H  HCR6  0   0.254  -12.0325  -2.5644  -0.9029
 TZT  H49   H  HCR6  0   0.249  -10.7408  -0.4917  -0.5870

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 TZT  C6   C5    single    1.528  0.020  1.528
 TZT  C5   C7    single    1.525  0.020  1.525
 TZT  C5   C4    single    1.536  0.020  1.536
 TZT  C4   N2    single    1.457  0.020  1.457
 TZT  C4   C8    single    1.529  0.020  1.529
 TZT  N2   C3    single    1.444  0.020  1.444
 TZT  N2   C1    single    1.445  0.020  1.445
 TZT  C8   O9    double    1.225  0.020  1.225
 TZT  C8   N10   single    1.344  0.020  1.344
 TZT  N10  C11   single    1.445  0.020  1.445
 TZT  C11  C12   single    1.536  0.020  1.536
 TZT  C11  C15   single    1.534  0.020  1.534
 TZT  C12  C14   single    1.524  0.020  1.524
 TZT  C12  C13   single    1.524  0.020  1.524
 TZT  C15  O16   double    1.226  0.020  1.226
 TZT  C15  N17   single    1.349  0.020  1.349
 TZT  N17  C78   single    1.457  0.020  1.457
 TZT  N17  C18   single    1.465  0.020  1.465
 TZT  C18  C19   single    1.544  0.020  1.544
 TZT  C18  C23   single    1.540  0.020  1.540
 TZT  C19  C22   single    1.528  0.020  1.528
 TZT  C19  C20   single    1.536  0.020  1.536
 TZT  C20  C21   single    1.523  0.020  1.523
 TZT  C23  O24   single    1.412  0.020  1.412
 TZT  C23  C26   single    1.521  0.020  1.521
 TZT  O24  C25   single    1.407  0.020  1.407
 TZT  C26  C27   single    1.519  0.020  1.519
 TZT  C27  O28   double    1.226  0.020  1.226
 TZT  C27  N29   single    1.345  0.020  1.345
 TZT  N29  C30   single    1.453  0.020  1.453
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_chem_comp_tor.id
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_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
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_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
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 TZT  chir_05  C23  O24  C18  C26  positiv
 TZT  chir_06  C33  N29  C32  C34  negativ
 TZT  chir_07  C34  O35  C33  C37  negativ
 TZT  chir_08  C37  C34  C38  C39  positiv

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
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_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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