# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Mon May  4 16:06:45 2020
#   Inital geometry file: a 162 line input string
#   Ligand name: 4-[1-decyl-6-(sulfamoyloxy)-1H-indol-2-yl]phenyl sulfamate
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CCCCCCCCCCn1c2cc(O[S](N)(=O)=O)ccc2cc1c3ccc(O[S](N)(=O)=O)cc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 SIE  SIE  '4-[1-decyl-6-(sulfamoyloxy)-1H-indol-2-yl]phenyl sulfamate'  ligand  68  35  .  2021-08-23  2021-08-23  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_SIE
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 SIE  CS1   C  CR6   0   0.031   5.5413   -4.7404   9.7084
 SIE  CS2   C  CR16  0  -0.290   5.2656   -3.3774   9.8040
 SIE  CS3   C  CR16  0  -0.282   4.5727   -2.8674  10.8910
 SIE  CS4   C  CR6   0   0.309   4.1592   -3.7316  11.8905
 SIE  CS5   C  CR16  0  -0.282   4.4215   -5.0907  11.8228
 SIE  CS6   C  CR16  0  -0.294   5.1182   -5.5876  10.7342
 SIE  OS7   O  OC2   0  -0.603   3.5152   -3.2177  13.0047
 SIE  SS7   S  S     0   1.555   1.8807   -3.1739  12.9581
 SIE  OS8   O  OS    0  -0.630   1.4087   -4.5369  12.9312
 SIE  OS9   O  OS    0  -0.631   1.4991   -2.2540  11.9146
 SIE  NS0   N  NC2   0  -0.879   1.5334   -2.5228  14.3910
 SIE  NI1   N  NR5   0  -0.571   5.8676   -6.3011   7.7863
 SIE  CI2   C  CR5   0   0.340   6.3065   -5.2505   8.5662
 SIE  CI3   C  CR15  0  -0.447   7.5292   -4.8252   8.1248
 SIE  CI4   C  CR16  0  -0.351   8.9808   -5.6994   6.1517
 SIE  CI5   C  CR16  0  -0.313   8.9884   -6.6240   5.1279
 SIE  CI6   C  CR6   0   0.297   7.9009   -7.4906   4.9637
 SIE  CI7   C  CR16  0  -0.372   6.7924   -7.4688   5.7832
 SIE  CI8   C  CR56  0   0.365   6.8036   -6.5359   6.8171
 SIE  CI9   C  CR56  0   0.083   7.8751   -5.6356   7.0058
 SIE  CP2   C  CH2   0  -0.425   3.6109   -6.0110   6.8146
 SIE  CP3   C  CH2   0  -0.421   2.1652   -6.4860   6.8675
 SIE  CP4   C  CH2   0  -0.412   1.2604   -5.7159   5.9136
 SIE  CP5   C  CH2   0  -0.412  -0.2037   -6.1251   6.0083
 SIE  CP6   C  CH2   0  -0.411  -1.1001   -5.3635   5.0396
 SIE  CP7   C  CH2   0  -0.411  -2.5713   -5.7433   5.1508
 SIE  CP8   C  CH2   0  -0.406  -3.4633   -4.9799   4.1796
 SIE  CP9   C  CH2   0  -0.419  -4.9392   -5.3386   4.3026
 SIE  CP0   C  CH3   0  -0.662  -5.8187   -4.5666   3.3286
 SIE  O27   O  OS    0  -0.634   8.1223   -6.9429   1.9792
 SIE  S27   S  S     0   1.554   7.3364   -8.0315   2.5083
 SIE  O28   O  OS    0  -0.633   5.9108   -7.8774   2.6732
 SIE  O29   O  OC2   0  -0.608   7.9647   -8.4468   3.9548
 SIE  N20   N  NC2   0  -0.880   7.6239   -9.3599   1.6366
 SIE  HS2   H  HCR6  0   0.266   5.5853   -2.7098   9.0146
 SIE  HS3   H  HCR6  0   0.282   4.3653   -1.8080  10.9615
 SIE  HS5   H  HCR6  0   0.282   4.1102   -5.7506  12.6212
 SIE  HS6   H  HCR6  0   0.276   5.3525   -6.6438  10.6972
 SIE  HS01  H  HNC2  0   0.437   1.8058   -1.5533  14.5048
 SIE  HS02  H  HNC2  0   0.437   1.7627   -3.0969  15.1944
 SIE  HI3   H  HCR5  0   0.256   8.1261   -4.0507   8.5807
 SIE  HI4   H  HCR6  0   0.257   9.8198   -5.0287   6.2848
 SIE  HI5   H  HCR6  0   0.268   9.8337   -6.6948   4.4568
 SIE  HI7   H  HCR6  0   0.279   5.9771   -8.1634   5.6296
 SIE  HP11  H  HCH2  0   0.268   4.1065   -6.8211   8.7510
 SIE  HP12  H  HCH2  0   0.264   4.5568   -7.8621   7.4299
 SIE  HP21  H  HCH2  0   0.229   3.9876   -6.0731   5.7891
 SIE  HP22  H  HCH2  0   0.228   3.6585   -4.9561   7.1025
 SIE  HP31  H  HCH2  0   0.217   2.1160   -7.5545   6.6322
 SIE  HP32  H  HCH2  0   0.216   1.7908   -6.3802   7.8913
 SIE  HP41  H  HCH2  0   0.210   1.3498   -4.6435   6.1186
 SIE  HP42  H  HCH2  0   0.211   1.6129   -5.8595   4.8864
 SIE  HP51  H  HCH2  0   0.208  -0.2963   -7.2002   5.8190
 SIE  HP52  H  HCH2  0   0.207  -0.5574   -5.9649   7.0328
 SIE  HP61  H  HCH2  0   0.206  -0.7564   -5.5393   4.0141
 SIE  HP62  H  HCH2  0   0.206  -0.9904   -4.2876   5.2157
 SIE  HP71  H  HCH2  0   0.206  -2.6841   -6.8193   4.9774
 SIE  HP72  H  HCH2  0   0.205  -2.9144   -5.5633   6.1758
 SIE  HP81  H  HCH2  0   0.205  -3.3389   -3.9037   4.3437
 SIE  HP82  H  HCH2  0   0.205  -3.1290   -5.1702   3.1534
 SIE  HP91  H  HCH2  0   0.210  -5.0662   -6.4131   4.1377
 SIE  HP92  H  HCH2  0   0.209  -5.2729   -5.1481   5.3275
 SIE  HP01  H  HCH3  0   0.225  -6.8724   -4.8206   3.4495
 SIE  HP02  H  HCH3  0   0.215  -5.7201   -3.4895   3.4772
 SIE  HP03  H  HCH3  0   0.216  -5.5448   -4.7814   2.2941
 SIE  H201  H  HNC2  0   0.434   7.1071  -10.1828   1.9245
 SIE  H202  H  HNC2  0   0.434   8.6027   -9.5530   1.4581
 SIE  CP1   C  CH2   0  -0.330   4.5125   -6.8174   7.7407

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 SIE  CS1  CS2   aromatic  1.394  0.020  1.394
 SIE  CS1  CS6   aromatic  1.396  0.020  1.396
 SIE  CS1  CI2   single    1.466  0.020  1.466
 SIE  CS2  CS3   aromatic  1.386  0.020  1.386
 SIE  CS2  HS2   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CS3  CS4   aromatic  1.385  0.020  1.385
 SIE  CS3  HS3   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CS4  CS5   aromatic  1.386  0.020  1.386
 SIE  CS4  OS7   single    1.386  0.020  1.386
 SIE  CS5  CS6   aromatic  1.385  0.020  1.385
 SIE  CS5  HS5   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CS6  HS6   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  OS7  SS7   single    1.636  0.020  1.636
 SIE  SS7  OS8   deloc     1.443  0.020  1.443
 SIE  SS7  OS9   deloc     1.443  0.020  1.443
 SIE  SS7  NS0   single    1.612  0.020  1.612
 SIE  NS0  HS01  single    0.890  0.020  1.040
 SIE  NS0  HS02  single    0.890  0.020  1.040
 SIE  NI1  CI2   aromatic  1.380  0.020  1.380
 SIE  NI1  CI8   aromatic  1.368  0.020  1.368
 SIE  NI1  CP1   single    1.451  0.020  1.451
 SIE  CI2  CI3   aromatic  1.368  0.020  1.368
 SIE  CI3  CI9   aromatic  1.424  0.020  1.424
 SIE  CI3  HI3   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CI4  CI5   aromatic  1.379  0.020  1.379
 SIE  CI4  CI9   aromatic  1.399  0.020  1.399
 SIE  CI4  HI4   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CI5  CI6   aromatic  1.400  0.020  1.400
 SIE  CI5  HI5   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CI6  CI7   aromatic  1.379  0.020  1.379
 SIE  CI6  O29   single    1.392  0.020  1.392
 SIE  CI7  CI8   aromatic  1.393  0.020  1.393
 SIE  CI7  HI7   single    0.930  0.020  1.080
 SIE  CI8  CI9   aromatic  1.412  0.020  1.412
 SIE  CP1  CP2   single    1.523  0.020  1.523
 SIE  CP1  HP11  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP1  HP12  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP2  CP3   single    1.523  0.020  1.523
 SIE  CP2  HP21  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP2  HP22  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP3  CP4   single    1.524  0.020  1.524
 SIE  CP3  HP31  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP3  HP32  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP4  CP5   single    1.523  0.020  1.523
 SIE  CP4  HP41  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP4  HP42  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP5  CP6   single    1.524  0.020  1.524
 SIE  CP5  HP51  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP5  HP52  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP6  CP7   single    1.524  0.020  1.524
 SIE  CP6  HP61  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP6  HP62  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP7  CP8   single    1.524  0.020  1.524
 SIE  CP7  HP71  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP7  HP72  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP8  CP9   single    1.524  0.020  1.524
 SIE  CP8  HP81  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP8  HP82  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP9  CP0   single    1.523  0.020  1.523
 SIE  CP9  HP91  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP9  HP92  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP0  HP01  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP0  HP02  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  CP0  HP03  single    0.970  0.020  1.090
 SIE  O27  S27   deloc     1.443  0.020  1.443
 SIE  S27  O28   deloc     1.443  0.020  1.443
 SIE  S27  O29   single    1.631  0.020  1.631
 SIE  S27  N20   single    1.615  0.020  1.615
 SIE  N20  H201  single    0.890  0.020  1.040
 SIE  N20  H202  single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 SIE  CI2   CS1  CS6   121.29  3.000
 SIE  CI2   CS1  CS2   119.78  3.000
 SIE  CS6   CS1  CS2   118.89  3.000
 SIE  HS2   CS2  CS3   119.52  3.000
 SIE  HS2   CS2  CS1   119.66  3.000
 SIE  CS3   CS2  CS1   120.82  3.000
 SIE  HS3   CS3  CS4   120.46  3.000
 SIE  HS3   CS3  CS2   120.48  3.000
 SIE  CS4   CS3  CS2   119.06  3.000
 SIE  OS7   CS4  CS5   119.40  3.000
 SIE  OS7   CS4  CS3   119.19  3.000
 SIE  CS5   CS4  CS3   121.35  3.000
 SIE  HS5   CS5  CS6   120.41  3.000
 SIE  HS5   CS5  CS4   120.52  3.000
 SIE  CS6   CS5  CS4   119.05  3.000
 SIE  HS6   CS6  CS5   119.07  3.000
 SIE  HS6   CS6  CS1   120.09  3.000
 SIE  CS5   CS6  CS1   120.82  3.000
 SIE  SS7   OS7  CS4   116.84  3.000
 SIE  NS0   SS7  OS9   109.18  3.000
 SIE  NS0   SS7  OS8   109.13  3.000
 SIE  OS9   SS7  OS8   120.16  3.000
 SIE  NS0   SS7  OS7   101.59  3.000
 SIE  OS9   SS7  OS7   107.58  3.000
 SIE  OS8   SS7  OS7   107.59  3.000
 SIE  HS02  NS0  HS01  113.08  3.000
 SIE  HS02  NS0  SS7   115.28  3.000
 SIE  HS01  NS0  SS7   115.36  3.000
 SIE  CP1   NI1  CI8   123.76  3.000
 SIE  CP1   NI1  CI2   125.86  3.000
 SIE  CI8   NI1  CI2   108.27  3.000
 SIE  CI3   CI2  NI1   109.79  3.000
 SIE  CI3   CI2  CS1   127.57  3.000
 SIE  NI1   CI2  CS1   122.61  3.000
 SIE  HI3   CI3  CI9   127.31  3.000
 SIE  HI3   CI3  CI2   125.55  3.000
 SIE  CI9   CI3  CI2   107.08  3.000
 SIE  HI4   CI4  CI9   120.63  3.000
 SIE  HI4   CI4  CI5   120.15  3.000
 SIE  CI9   CI4  CI5   119.22  3.000
 SIE  HI5   CI5  CI6   119.59  3.000
 SIE  HI5   CI5  CI4   120.57  3.000
 SIE  CI6   CI5  CI4   119.84  3.000
 SIE  O29   CI6  CI7   118.60  3.000
 SIE  O29   CI6  CI5   118.34  3.000
 SIE  CI7   CI6  CI5   123.02  3.000
 SIE  HI7   CI7  CI8   122.79  3.000
 SIE  HI7   CI7  CI6   120.75  3.000
 SIE  CI8   CI7  CI6   116.45  3.000
 SIE  CI9   CI8  CI7   122.17  3.000
 SIE  CI9   CI8  NI1   108.37  3.000
 SIE  CI7   CI8  NI1   129.46  3.000
 SIE  CI8   CI9  CI4   119.28  3.000
 SIE  CI8   CI9  CI3   106.47  3.000
 SIE  CI4   CI9  CI3   134.25  3.000
 SIE  HP22  CP2  HP21  106.63  3.000
 SIE  HP22  CP2  CP3   109.44  3.000
 SIE  HP21  CP2  CP3   109.98  3.000
 SIE  HP22  CP2  CP1   108.94  3.000
 SIE  HP21  CP2  CP1   109.63  3.000
 SIE  CP3   CP2  CP1   112.06  3.000
 SIE  HP32  CP3  HP31  106.24  3.000
 SIE  HP32  CP3  CP4   109.47  3.000
 SIE  HP31  CP3  CP4   109.38  3.000
 SIE  HP32  CP3  CP2   109.08  3.000
 SIE  HP31  CP3  CP2   109.85  3.000
 SIE  CP4   CP3  CP2   112.60  3.000
 SIE  HP42  CP4  HP41  106.12  3.000
 SIE  HP42  CP4  CP5   109.41  3.000
 SIE  HP41  CP4  CP5   109.25  3.000
 SIE  HP42  CP4  CP3   109.25  3.000
 SIE  HP41  CP4  CP3   109.22  3.000
 SIE  CP5   CP4  CP3   113.33  3.000
 SIE  HP52  CP5  HP51  106.12  3.000
 SIE  HP52  CP5  CP6   109.36  3.000
 SIE  HP51  CP5  CP6   109.32  3.000
 SIE  HP52  CP5  CP4   109.22  3.000
 SIE  HP51  CP5  CP4   109.52  3.000
 SIE  CP6   CP5  CP4   113.06  3.000
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 SIE  HP62  CP6  CP5   109.25  3.000
 SIE  HP61  CP6  CP5   109.29  3.000
 SIE  CP7   CP6  CP5   113.39  3.000
 SIE  HP72  CP7  HP71  106.08  3.000
 SIE  HP72  CP7  CP8   109.31  3.000
 SIE  HP71  CP7  CP8   109.32  3.000
 SIE  HP72  CP7  CP6   109.25  3.000
 SIE  HP71  CP7  CP6   109.43  3.000
 SIE  CP8   CP7  CP6   113.20  3.000
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 SIE  HP82  CP8  CP9   109.28  3.000
 SIE  HP81  CP8  CP9   109.21  3.000
 SIE  HP82  CP8  CP7   109.35  3.000
 SIE  HP81  CP8  CP7   109.28  3.000
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 SIE  HP92  CP9  CP0   109.55  3.000
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 SIE  HP92  CP9  CP8   109.26  3.000
 SIE  HP91  CP9  CP8   109.35  3.000
 SIE  CP0   CP9  CP8   112.86  3.000
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 SIE  N20   S27  O29   101.58  3.000
 SIE  N20   S27  O28   108.99  3.000
 SIE  O29   S27  O28   107.84  3.000
 SIE  N20   S27  O27   109.01  3.000
 SIE  O29   S27  O27   107.91  3.000
 SIE  O28   S27  O27   119.95  3.000
 SIE  S27   O29  CI6   116.77  3.000
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 SIE  H202  N20  S27   115.07  3.000
 SIE  H201  N20  S27   115.07  3.000
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 SIE  HP12  CP1  CP2   110.97  3.000
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 SIE  HP12  CP1  NI1   108.17  3.000
 SIE  HP11  CP1  NI1   108.68  3.000
 SIE  CP2   CP1  NI1   112.55  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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 SIE  CONST_03  CI8   NI1  CI2  CS1   180.00   0.0  0
 SIE  CONST_04  CI9   CI3  CI2  CS1   180.00   0.0  0
 SIE  CONST_05  CS5   CS6  CS1  CS2     0.00   0.0  0
 SIE  CONST_08  CS5   CS4  CS3  CS2     0.00   0.0  0
 SIE  CONST_09  CS6   CS1  CS2  CS3     0.00   0.0  0
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 SIE  Var_03    CP3   CP2  CP1  NI1  -175.01  30.0  3
 SIE  Var_04    O27   S27  O29  CI6    64.47  30.0  2
 SIE  Var_05    CP4   CP3  CP2  CP1  -178.23  30.0  3
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 SIE  Var_09    CP8   CP7  CP6  CP5  -179.96  30.0  3
 SIE  Var_10    CP9   CP8  CP7  CP6  -179.02  30.0  3
 SIE  Var_11    CP0   CP9  CP8  CP7   179.88  30.0  3
 SIE  Var_12    HS01  NS0  SS7  OS7    67.96  30.0  3
 SIE  Var_13    HP01  CP0  CP9  CP8  -178.64  30.0  3
 SIE  Var_14    H201  N20  S27  O27  -179.30  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 SIE  plan-1  CS1  0.020
 SIE  plan-1  CS2  0.020
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