# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat May  2 12:01:48 2020
#   Inital geometry file: a 45 line input string
#   Ligand name: (3S,3aR,6aS)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-ol
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O[C@@H]1CO[C@@H]2OCC[C@H]12
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 RSG  RSG  (3S,3aR,6aS)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-ol  ligand  19  9  .  2021-08-23  2021-08-23  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as GRAND
;

data_comp_RSG
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 RSG  C1   C  CR15  0   0.035  -1.2890   0.6871  -0.2515
 RSG  O1   O  O     0  -0.503  -0.5556  -1.4824   0.1930
 RSG  C2   C  CR15  0  -0.419   0.0210   0.4701  -1.0223
 RSG  O2   O  O2    0  -0.499   1.6668  -0.9261  -0.0246
 RSG  C3   C  CR15  0   0.327   0.4388  -0.9771  -0.6686
 RSG  O3   O  OH1   0  -0.662  -1.0332   1.3511   0.9634
 RSG  C4   C  CH2   0  -0.212  -1.7428  -0.7522  -0.0427
 RSG  C5   C  CH2   0  -0.188   1.8919   0.3985   0.4507
 RSG  C6   C  CH2   0  -0.457   1.2326   1.2939  -0.5890
 RSG  H1   H  HCR5  0   0.226  -2.0169   1.2409  -0.8544
 RSG  H2   H  HCR5  0   0.283  -0.1734   0.5724  -2.0901
 RSG  H3   H  HCR5  0   0.215   0.5405  -1.6353  -1.5392
 RSG  HO3  H  HOH1  0   0.455  -1.8691   1.4643   1.4266
 RSG  H4   H  HCH2  0   0.244  -2.4171  -0.8801   0.8071
 RSG  H4A  H  HCH2  0   0.210  -2.2617  -1.1132  -0.9409
 RSG  H5   H  HCH2  0   0.216   1.4488   0.5420   1.4406
 RSG  H5A  H  HCH2  0   0.232   2.9685   0.5502   0.5341
 RSG  H6   H  HCH2  0   0.246   1.9036   1.4352  -1.4384
 RSG  H6A  H  HCH2  0   0.251   0.9811   2.2790  -0.2001

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 RSG  C4  C1   single  1.523  0.020  1.523
 RSG  C1  O3   single  1.408  0.020  1.408
 RSG  C1  C2   single  1.535  0.020  1.535
 RSG  C1  H1   single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C4  O1   single  1.414  0.020  1.414
 RSG  O1  C3   single  1.409  0.020  1.409
 RSG  C2  C3   single  1.547  0.020  1.547
 RSG  C2  C6   single  1.528  0.020  1.528
 RSG  C2  H2   single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C3  O2   single  1.388  0.020  1.388
 RSG  O2  C5   single  1.425  0.020  1.425
 RSG  C3  H3   single  0.970  0.020  1.090
 RSG  O3  HO3  single  0.850  0.020  0.980
 RSG  C4  H4   single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C4  H4A  single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C6  C5   single  1.522  0.020  1.522
 RSG  C5  H5   single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C5  H5A  single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C6  H6   single  0.970  0.020  1.090
 RSG  C6  H6A  single  0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 RSG  H1   C1  C4  110.80  3.000
 RSG  H1   C1  O3  110.93  3.000
 RSG  C4   C1  O3  112.42  3.000
 RSG  H1   C1  C2  111.23  3.000
 RSG  O3   C1  C2  110.17  3.000
 RSG  C4   C1  C2  100.92  3.000
 RSG  C4   O1  C3  107.78  3.000
 RSG  H2   C2  C6  111.63  3.000
 RSG  H2   C2  C3  111.09  3.000
 RSG  C6   C2  C3  103.02  3.000
 RSG  H2   C2  C1  109.04  3.000
 RSG  C6   C2  C1  117.26  3.000
 RSG  C3   C2  C1  104.35  3.000
 RSG  C5   O2  C3  109.19  3.000
 RSG  H3   C3  O2  107.98  3.000
 RSG  H3   C3  C2  113.90  3.000
 RSG  O2   C3  C2  108.10  3.000
 RSG  H3   C3  O1  109.61  3.000
 RSG  O2   C3  O1  110.73  3.000
 RSG  C2   C3  O1  106.53  3.000
 RSG  HO3  O3  C1  108.24  3.000
 RSG  H4A  C4  H4  107.82  3.000
 RSG  H4A  C4  O1  111.31  3.000
 RSG  H4   C4  O1  109.16  3.000
 RSG  H4A  C4  C1  109.83  3.000
 RSG  H4   C4  C1  113.64  3.000
 RSG  O1   C4  C1  105.11  3.000
 RSG  H5A  C5  H5  108.21  3.000
 RSG  H5A  C5  C6  113.45  3.000
 RSG  H5   C5  C6  111.43  3.000
 RSG  H5A  C5  O2  108.10  3.000
 RSG  H5   C5  O2  111.09  3.000
 RSG  C6   C5  O2  104.50  3.000
 RSG  H6A  C6  H6  107.63  3.000
 RSG  H6A  C6  C5  112.85  3.000
 RSG  H6   C6  C5  109.96  3.000
 RSG  H6A  C6  C2  113.96  3.000
 RSG  H6   C6  C2  109.66  3.000
 RSG  C5   C6  C2  102.71  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 RSG  Var_01  O2  C5  C6  C2    34.74  30.0  1
 RSG  Var_02  C6  C5  O2  C3   -33.67  30.0  1
 RSG  Var_03  H4  C4  O1  C3  -161.47  30.0  1

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 RSG  chir_01  C1  C4  O3  C2  negativ
 RSG  chir_02  C2  C1  C3  C6  positiv
 RSG  chir_03  C3  O1  O2  C2  positiv

