# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue Mar 22 19:58:51 2022
#   Inital geometry file: a 188 line input string
#   Ligand name: 2-amino-3-[(R)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1-[(S)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1H-imidazol-3-ium
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3OC[C@H](O[P](O)(=O)n4cc[n+](c4N)[P](O)(=O)O[C@H]5CO[C@H]([C@@H]5O)n6cnc7C(=O)NC(=Nc67)N)[C@H]3O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 Q1V  Q1V  2-amino-3-[(R)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1-[(S)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1H-imidazol-3-ium  ligand  72  48  .  2022-03-23  2022-03-23
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_Q1V
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 Q1V  OP3  O  OP    -1  -0.733  63.5833  15.0515  -3.5384
 Q1V  OP1  O  OP    -1  -0.734  68.8544  18.5983  -0.1033
 Q1V  OP2  O  O      0  -0.728  66.9412  20.3580  -0.6162
 Q1V  C4'  C  CH2    0  -0.167  68.0814  18.1221   3.1278
 Q1V  O4'  O  O2     0  -0.494  67.2860  18.6400   4.1966
 Q1V  C3'  C  CH1    0  -0.059  67.1008  17.6409   2.0730
 Q1V  O3'  O  O2     0  -0.611  66.6652  18.7023   1.2400
 Q1V  C2'  C  CH1    0  -0.053  65.9175  17.2036   2.9296
 Q1V  C1'  C  CH1    0   0.178  65.9614  18.2393   4.0679
 Q1V  N9   N  NR5    0  -0.527  65.1255  19.3969   3.7730
 Q1V  C8   C  CR15   0   0.097  65.4995  20.6504   3.3625
 Q1V  N7   N  N      0  -0.451  64.4842  21.4345   3.1548
 Q1V  C5   C  CR5    0  -0.081  63.3848  20.6649   3.4347
 Q1V  C6   C  C      0   0.504  61.9933  20.9665   3.3708
 Q1V  O6   O  O      0  -0.467  61.4481  22.0096   3.0536
 Q1V  N1   N  NH1    0  -0.724  61.2308  19.8535   3.7517
 Q1V  C2   C  C      0   0.683  61.7139  18.6307   4.1162
 Q1V  N2   N  NH2    0  -0.838  60.8143  17.7008   4.4786
 Q1V  N3   N  N      0  -0.513  62.9933  18.3546   4.1644
 Q1V  C4   C  CR5    0   0.495  63.7681  19.3954   3.8209
 Q1V  O2'  O  OH1    0  -0.660  66.2087  15.9205   3.4113
 Q1V  N10  N  NR5    0  -0.670  66.6278  17.8395  -1.2038
 Q1V  C14  C  CR5    0   0.840  65.3931  17.9567  -1.7227
 Q1V  N15  N  NH2    0  -0.856  64.6360  19.0461  -1.6734
 Q1V  C11  C  CR15   0  -0.106  67.0680  16.5380  -1.4397
 Q1V  C12  C  CR15   0  -0.123  66.0918  15.8884  -2.0872
 Q1V  N13  N  NR5    1  -0.669  65.0333  16.7783  -2.2604
 Q1V  P34  P  P      0   1.386  63.4084  16.3541  -2.8499
 Q1V  OP4  O  O      0  -0.731  62.8751  17.5995  -3.4656
 Q1V  O33  O  O2     0  -0.606  62.6290  16.1935  -1.4298
 Q1V  C32  C  CR15   0  -0.058  62.6849  15.0248  -0.6321
 Q1V  C28  C  CR15   0  -0.022  61.3889  14.9590   0.1758
 Q1V  O29  O  OH1    0  -0.656  61.2577  13.6412   0.6312
 Q1V  C31  C  CH2    0  -0.181  63.7227  15.1167   0.4804
 Q1V  O30  O  O      0  -0.492  63.0769  15.7541   1.5849
 Q1V  C27  C  CR15   0   0.162  61.7169  15.8959   1.3515
 Q1V  N26  N  NR5    0  -0.525  61.4149  17.2894   1.0480
 Q1V  C22  C  CR56   0   0.494  60.1661  17.8194   0.9909
 Q1V  N21  N  N      0  -0.518  59.0218  17.1666   1.2444
 Q1V  C19  C  CR6    0   0.679  57.9618  17.9292   1.1374
 Q1V  N20  N  NH2    0  -0.832  56.7473  17.4240   1.4039
 Q1V  N18  N  NR16   0  -0.728  58.0289  19.2505   0.7970
 Q1V  C17  C  CR6    0   0.496  59.1970  19.9784   0.5213
 Q1V  O16  O  O      0  -0.466  59.1345  21.1615   0.2346
 Q1V  C23  C  CR56   0  -0.075  60.3441  19.1424   0.6340
 Q1V  N24  N  N      0  -0.449  61.6768  19.4234   0.4792
 Q1V  C25  C  CR15   0   0.095  62.2833  18.3040   0.7328
 Q1V  H5   H  HCH1   0   0.278  67.5012  16.8021   1.4973
 Q1V  H6   H  HCH1   0   0.280  64.9721  17.2367   2.3819
 Q1V  H7   H  HCH1   0   0.276  65.5972  17.8126   5.0084
 Q1V  H8   H  HCR5   0   0.286  66.5339  20.9285   3.2425
 Q1V  H9   H  HNH1   0   0.422  60.2275  19.9870   3.7317
 Q1V  H10  H  HNH2   0   0.412  61.1492  16.7601   4.6043
 Q1V  H11  H  HNH2   0   0.413  59.8430  17.7965   4.2330
 Q1V  H12  H  HOH1   0   0.461  65.4703  15.6192   3.9514
 Q1V  H13  H  HNH2   0   0.422  65.0856  19.9124  -1.4081
 Q1V  H14  H  HNH2   0   0.419  63.8143  19.0733  -2.2611
 Q1V  H15  H  HCR5   0   0.310  68.0443  16.2079  -1.1321
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 Q1V  H18  H  HCR5   0   0.267  60.5195  15.2962  -0.3980
 Q1V  H19  H  HOH1   0   0.463  60.4528  13.5715   1.1555
 Q1V  H20  H  HCH2   0   0.247  64.0455  14.1170   0.7799
 Q1V  H21  H  HCH2   0   0.255  64.6090  15.6891   0.2047
 Q1V  H22  H  HCR5   0   0.279  61.1492  15.6280   2.2481
 Q1V  H23  H  HNH2   0   0.410  56.6735  16.4251   1.4994
 Q1V  H24  H  HNH2   0   0.413  55.9102  17.9075   1.1252
 Q1V  H25  H  HNR6   0   0.423  57.1666  19.7783   0.7376
 Q1V  H26  H  HCR5   0   0.289  63.3517  18.1643   0.7162
 Q1V  H3   H  HCH2   0   0.237  68.6902  17.2904   3.4915
 Q1V  P    P  P      0   1.390  67.4358  19.0314  -0.1566
 Q1V  H4   H  HCH2   0   0.253  68.7465  18.9030   2.7600

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 Q1V  OP4  P34  deloc     1.488  0.020  1.488
 Q1V  P34  N13  single    1.780  0.020  1.780
 Q1V  P34  OP3  deloc     1.484  0.020  1.484
 Q1V  P34  O33  single    1.628  0.020  1.628
 Q1V  N13  C12  aromatic  1.394  0.020  1.394
 Q1V  N13  C14  aromatic  1.344  0.020  1.344
 Q1V  C12  C11  aromatic  1.340  0.020  1.340
 Q1V  O33  C32  single    1.416  0.020  1.416
 Q1V  C14  N15  single    1.328  0.020  1.328
 Q1V  C14  N10  aromatic  1.344  0.020  1.344
 Q1V  C11  N10  aromatic  1.394  0.020  1.394
 Q1V  N10  P    single    1.781  0.020  1.781
 Q1V  OP2  P    deloc     1.489  0.020  1.489
 Q1V  C32  C28  single    1.529  0.020  1.529
 Q1V  C32  C31  single    1.524  0.020  1.524
 Q1V  P    OP1  deloc     1.484  0.020  1.484
 Q1V  P    O3'  single    1.629  0.020  1.629
 Q1V  O29  C28  single    1.400  0.020  1.400
 Q1V  C28  C27  single    1.539  0.020  1.539
 Q1V  C31  O30  single    1.429  0.020  1.429
 Q1V  C25  N24  aromatic  1.298  0.020  1.298
 Q1V  C25  N26  aromatic  1.372  0.020  1.372
 Q1V  N24  C23  aromatic  1.371  0.020  1.371
 Q1V  N26  C27  single    1.458  0.020  1.458
 Q1V  N26  C22  aromatic  1.358  0.020  1.358
 Q1V  C27  O30  single    1.387  0.020  1.387
 Q1V  O3'  C3'  single    1.418  0.020  1.418
 Q1V  C23  C22  aromatic  1.382  0.020  1.382
 Q1V  C23  C17  single    1.424  0.020  1.424
 Q1V  O16  C17  double    1.219  0.020  1.219
 Q1V  C22  N21  single    1.342  0.020  1.342
 Q1V  C17  N18  single    1.404  0.020  1.404
 Q1V  N21  C19  double    1.310  0.020  1.310
 Q1V  N18  C19  single    1.366  0.020  1.366
 Q1V  C19  N20  single    1.342  0.020  1.342
 Q1V  C3'  C4'  single    1.518  0.020  1.518
 Q1V  C3'  C2'  single    1.525  0.020  1.525
 Q1V  C4'  O4'  single    1.429  0.020  1.429
 Q1V  C2'  O2'  single    1.401  0.020  1.401
 Q1V  C2'  C1'  single    1.540  0.020  1.540
 Q1V  C8   N7   aromatic  1.299  0.020  1.299
 Q1V  C8   N9   aromatic  1.371  0.020  1.371
 Q1V  O4'  C1'  single    1.390  0.020  1.390
 Q1V  N7   C5   aromatic  1.371  0.020  1.371
 Q1V  N9   C1'  single    1.458  0.020  1.458
 Q1V  N9   C4   aromatic  1.358  0.020  1.358
 Q1V  C5   C4   aromatic  1.381  0.020  1.381
 Q1V  C5   C6   single    1.425  0.020  1.425
 Q1V  O6   C6   double    1.219  0.020  1.219
 Q1V  C4   N3   single    1.342  0.020  1.342
 Q1V  C6   N1   single    1.402  0.020  1.402
 Q1V  N3   C2   double    1.310  0.020  1.310
 Q1V  N1   C2   single    1.364  0.020  1.364
 Q1V  C2   N2   single    1.344  0.020  1.344
 Q1V  C4'  H3   single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C4'  H4   single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C3'  H5   single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C2'  H6   single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C1'  H7   single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C8   H8   single    0.930  0.020  1.080
 Q1V  N1   H9   single    0.860  0.020  1.020
 Q1V  N2   H10  single    0.890  0.020  1.040
 Q1V  N2   H11  single    0.890  0.020  1.040
 Q1V  O2'  H12  single    0.850  0.020  0.980
 Q1V  N15  H13  single    0.890  0.020  1.040
 Q1V  N15  H14  single    0.890  0.020  1.040
 Q1V  C11  H15  single    0.930  0.020  1.080
 Q1V  C12  H16  single    0.930  0.020  1.080
 Q1V  C32  H17  single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C28  H18  single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  O29  H19  single    0.850  0.020  0.980
 Q1V  C31  H20  single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C31  H21  single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  C27  H22  single    0.970  0.020  1.090
 Q1V  N20  H23  single    0.890  0.020  1.040
 Q1V  N20  H24  single    0.890  0.020  1.040
 Q1V  N18  H25  single    0.860  0.020  1.020
 Q1V  C25  H26  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 Q1V  H4   C4'  H3   108.51  3.000
 Q1V  H4   C4'  C3'  112.75  3.000
 Q1V  H3   C4'  C3'  110.47  3.000
 Q1V  H4   C4'  O4'  109.41  3.000
 Q1V  H3   C4'  O4'  109.68  3.000
 Q1V  C3'  C4'  O4'  105.96  3.000
 Q1V  C1'  O4'  C4'  110.89  3.000
 Q1V  H5   C3'  C2'  111.10  3.000
 Q1V  H5   C3'  O3'  112.18  3.000
 Q1V  C2'  C3'  O3'  107.84  3.000
 Q1V  H5   C3'  C4'  111.86  3.000
 Q1V  C2'  C3'  C4'  101.64  3.000
 Q1V  O3'  C3'  C4'  111.67  3.000
 Q1V  C3'  O3'  P    120.64  3.000
 Q1V  H6   C2'  O2'  112.32  3.000
 Q1V  H6   C2'  C1'  112.01  3.000
 Q1V  O2'  C2'  C1'  110.85  3.000
 Q1V  H6   C2'  C3'  112.39  3.000
 Q1V  C1'  C2'  C3'  101.55  3.000
 Q1V  O2'  C2'  C3'  107.12  3.000
 Q1V  H7   C1'  N9   107.00  3.000
 Q1V  H7   C1'  C2'  111.31  3.000
 Q1V  N9   C1'  C2'  111.61  3.000
 Q1V  H7   C1'  O4'  110.47  3.000
 Q1V  N9   C1'  O4'  109.65  3.000
 Q1V  C2'  C1'  O4'  106.83  3.000
 Q1V  C4   N9   C8   106.51  3.000
 Q1V  C4   N9   C1'  124.40  3.000
 Q1V  C8   N9   C1'  129.06  3.000
 Q1V  H8   C8   N7   125.19  3.000
 Q1V  H8   C8   N9   122.08  3.000
 Q1V  N7   C8   N9   112.73  3.000
 Q1V  C5   N7   C8   104.79  3.000
 Q1V  C4   C5   C6   118.56  3.000
 Q1V  C6   C5   N7   130.93  3.000
 Q1V  C4   C5   N7   110.51  3.000
 Q1V  N1   C6   O6   120.45  3.000
 Q1V  N1   C6   C5   110.54  3.000
 Q1V  O6   C6   C5   129.01  3.000
 Q1V  H9   N1   C2   118.32  3.000
 Q1V  H9   N1   C6   115.40  3.000
 Q1V  C2   N1   C6   126.27  3.000
 Q1V  N3   C2   N2   119.88  3.000
 Q1V  N2   C2   N1   117.08  3.000
 Q1V  N3   C2   N1   123.00  3.000
 Q1V  H11  N2   H10  116.14  3.000
 Q1V  H11  N2   C2   120.97  3.000
 Q1V  H10  N2   C2   117.24  3.000
 Q1V  C4   N3   C2   113.02  3.000
 Q1V  N3   C4   C5   128.61  3.000
 Q1V  N3   C4   N9   125.93  3.000
 Q1V  C5   C4   N9   105.46  3.000
 Q1V  H12  O2'  C2'  108.66  3.000
 Q1V  C11  N10  C14  107.83  3.000
 Q1V  C11  N10  P    125.53  3.000
 Q1V  C14  N10  P    125.83  3.000
 Q1V  N13  C14  N15  125.57  3.000
 Q1V  N15  C14  N10  125.52  3.000
 Q1V  N13  C14  N10  108.88  3.000
 Q1V  H14  N15  H13  119.40  3.000
 Q1V  H14  N15  C14  117.65  3.000
 Q1V  H13  N15  C14  117.33  3.000
 Q1V  H15  C11  C12  130.61  3.000
 Q1V  H15  C11  N10  121.66  3.000
 Q1V  C12  C11  N10  107.72  3.000
 Q1V  H16  C12  N13  121.61  3.000
 Q1V  H16  C12  C11  130.69  3.000
 Q1V  N13  C12  C11  107.69  3.000
 Q1V  P34  N13  C12  125.61  3.000
 Q1V  C12  N13  C14  107.87  3.000
 Q1V  P34  N13  C14  125.85  3.000
 Q1V  O33  P34  OP4  105.78  3.000
 Q1V  O33  P34  N13   99.89  3.000
 Q1V  OP4  P34  N13  105.35  3.000
 Q1V  O33  P34  OP3  112.00  3.000
 Q1V  N13  P34  OP3  104.79  3.000
 Q1V  OP4  P34  OP3  125.80  3.000
 Q1V  C32  O33  P34  123.64  3.000
 Q1V  H17  C32  C31  111.86  3.000
 Q1V  H17  C32  C28  111.82  3.000
 Q1V  C31  C32  C28  101.19  3.000
 Q1V  H17  C32  O33  111.20  3.000
 Q1V  C31  C32  O33  112.85  3.000
 Q1V  C28  C32  O33  107.44  3.000
 Q1V  H18  C28  C27  112.47  3.000
 Q1V  H18  C28  O29  112.70  3.000
 Q1V  C27  C28  O29  110.15  3.000
 Q1V  H18  C28  C32  112.52  3.000
 Q1V  C27  C28  C32  101.36  3.000
 Q1V  O29  C28  C32  106.96  3.000
 Q1V  H19  O29  C28  108.87  3.000
 Q1V  H21  C31  H20  108.03  3.000
 Q1V  H21  C31  O30  109.18  3.000
 Q1V  H20  C31  O30  109.25  3.000
 Q1V  H21  C31  C32  113.61  3.000
 Q1V  H20  C31  C32  110.25  3.000
 Q1V  O30  C31  C32  106.46  3.000
 Q1V  C27  O30  C31  111.01  3.000
 Q1V  H22  C27  N26  107.28  3.000
 Q1V  H22  C27  O30  110.22  3.000
 Q1V  N26  C27  O30  109.62  3.000
 Q1V  H22  C27  C28  111.49  3.000
 Q1V  O30  C27  C28  105.98  3.000
 Q1V  N26  C27  C28  112.26  3.000
 Q1V  C25  N26  C22  106.49  3.000
 Q1V  C22  N26  C27  124.92  3.000
 Q1V  C25  N26  C27  128.57  3.000
 Q1V  C23  C22  N21  128.64  3.000
 Q1V  N21  C22  N26  125.92  3.000
 Q1V  C23  C22  N26  105.44  3.000
 Q1V  C19  N21  C22  113.05  3.000
 Q1V  N18  C19  N20  117.26  3.000
 Q1V  N20  C19  N21  119.79  3.000
 Q1V  N18  C19  N21  122.93  3.000
 Q1V  H24  N20  H23  116.25  3.000
 Q1V  H24  N20  C19  121.13  3.000
 Q1V  H23  N20  C19  117.32  3.000
 Q1V  H25  N18  C17  115.27  3.000
 Q1V  H25  N18  C19  118.48  3.000
 Q1V  C17  N18  C19  126.25  3.000
 Q1V  C23  C17  O16  129.03  3.000
 Q1V  O16  C17  N18  120.45  3.000
 Q1V  C23  C17  N18  110.52  3.000
 Q1V  N24  C23  C17  130.84  3.000
 Q1V  C17  C23  C22  118.61  3.000
 Q1V  N24  C23  C22  110.52  3.000
 Q1V  C25  N24  C23  104.80  3.000
 Q1V  H26  C25  N24  124.89  3.000
 Q1V  H26  C25  N26  122.36  3.000
 Q1V  N24  C25  N26  112.75  3.000
 Q1V  N10  P    O3'   98.88  3.000
 Q1V  O3'  P    OP2  106.72  3.000
 Q1V  N10  P    OP2  105.32  3.000
 Q1V  O3'  P    OP1  111.25  3.000
 Q1V  OP2  P    OP1  126.06  3.000
 Q1V  N10  P    OP1  105.04  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 Q1V  CONST_01  C5   N7   C8   N9      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_02  N7   C5   C4   N9      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_03  C4   C5   N7   C8      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_04  C5   C4   N9   C8      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_05  C4   N9   C8   N7      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_06  C12  N13  C14  N10     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_07  N13  C12  C11  N10     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_08  C11  C12  N13  C14     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_09  C12  C11  N10  C14     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_10  N13  C14  N10  C11     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_11  C23  N24  C25  N26     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_12  N24  C23  C22  N26     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_13  N24  C25  N26  C22     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_14  C25  N24  C23  C22     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_15  C25  N26  C22  C23     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_16  N7   C8   N9   C1'   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_17  C5   C4   N9   C1'   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_18  N3   C4   N9   C1'     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_19  N24  C25  N26  C27   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_20  C23  C22  N26  C27   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_21  N21  C22  N26  C27     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_22  C2   N1   C6   C5      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_23  N3   C2   N1   C6      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_24  C4   N3   C2   N1      0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_25  N18  C19  N21  C22     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_26  C17  N18  C19  N21     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_27  C23  C17  N18  C19     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_28  N13  C14  N10  P     180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_29  C12  C11  N10  P     180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_30  P34  N13  C14  N10   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_31  C12  N13  C14  N15   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_32  C11  N10  C14  N15   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_33  P34  N13  C12  C11   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_34  N2   C2   N1   C6    180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_35  C2   N1   C6   O6    180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_36  C4   N3   C2   N2    180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_37  N20  C19  N21  C22   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_38  O16  C17  N18  C19   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_39  C17  N18  C19  N20   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_40  H8   C8   N9   C1'     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_41  H16  C12  C11  N10   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_42  H15  C11  N10  C14   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_43  H26  C25  N26  C27     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_44  H9   N1   C6   C5    180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_45  H25  N18  C19  N21   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_46  H13  N15  C14  N10     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_47  H14  N15  C14  N10   180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_48  H10  N2   C2   N1    180.00   0.0  0
 Q1V  CONST_50  H23  N20  C19  N21     0.00   0.0  0
 Q1V  CONST_51  H24  N20  C19  N21   180.00   0.0  0
 Q1V  Var_01    H3   C4'  O4'  C1'  -104.64  30.0  1
 Q1V  Var_02    H20  C31  O30  C27  -110.68  30.0  1
 Q1V  Var_03    C12  N13  P34  OP3   -19.45  30.0  2
 Q1V  Var_04    C14  N10  P    OP1  -167.76  30.0  2
 Q1V  Var_05    N10  P    O3'  C3'    83.59  30.0  2

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 Q1V  chir_02  C3'  O3'  C4'  C2'  negativ
 Q1V  chir_03  C2'  O2'  C3'  C1'  positiv
 Q1V  chir_04  C1'  O4'  N9   C2'  negativ
 Q1V  chir_06  C32  O33  C28  C31  positiv
 Q1V  chir_07  C28  O29  C32  C27  positiv
 Q1V  chir_08  C27  O30  N26  C28  negativ

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 Q1V  plan-1  N10  0.020
 Q1V  plan-1  C14  0.020
 Q1V  plan-1  N15  0.020
 Q1V  plan-1  C11  0.020
 Q1V  plan-1  C12  0.020
 Q1V  plan-1  N13  0.020
 Q1V  plan-1  P34  0.020
 Q1V  plan-1  H15  0.020
 Q1V  plan-1  H16  0.020
 Q1V  plan-1  P    0.020
 Q1V  plan-2  C14  0.020
 Q1V  plan-2  N15  0.020
 Q1V  plan-2  H13  0.020
 Q1V  plan-2  H14  0.020
 Q1V  plan-3  C1'  0.020
 Q1V  plan-3  N9   0.020
 Q1V  plan-3  C8   0.020
 Q1V  plan-3  N7   0.020
 Q1V  plan-3  C5   0.020
 Q1V  plan-3  C6   0.020
 Q1V  plan-3  O6   0.020
 Q1V  plan-3  N1   0.020
 Q1V  plan-3  C2   0.020
 Q1V  plan-3  N2   0.020
 Q1V  plan-3  N3   0.020
 Q1V  plan-3  C4   0.020
 Q1V  plan-3  H8   0.020
 Q1V  plan-3  H9   0.020
 Q1V  plan-3  H10  0.020
 Q1V  plan-3  H11  0.020
 Q1V  plan-4  C27  0.020
 Q1V  plan-4  N26  0.020
 Q1V  plan-4  C22  0.020
 Q1V  plan-4  N21  0.020
 Q1V  plan-4  C19  0.020
 Q1V  plan-4  N20  0.020
 Q1V  plan-4  N18  0.020
 Q1V  plan-4  C17  0.020
 Q1V  plan-4  O16  0.020
 Q1V  plan-4  C23  0.020
 Q1V  plan-4  N24  0.020
 Q1V  plan-4  C25  0.020
 Q1V  plan-4  H23  0.020
 Q1V  plan-4  H24  0.020
 Q1V  plan-4  H25  0.020
 Q1V  plan-4  H26  0.020

