# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sun May 24 16:25:11 2020
#   Inital geometry file: a 96 line input string
#   Ligand name: 3-{[(5-bromo-2-methoxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-chloro-2-hydroxybenzoic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(Br)cc1[S](=O)(=O)Nc2cc(Cl)cc(C(O)=O)c2O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 Q1M  Q1M  '3-{[(5-bromo-2-methoxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-chloro-2-hydroxybenzoic acid'  ligand  35  24  .  2021-08-20  2021-08-20  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_Q1M
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 Q1M  C18  C   CR16  0  -0.234  -1.2434   0.8975  -0.3379
 Q1M  C16  C   CR6   0  -0.049  -1.9896   2.0684  -0.4030
 Q1M  C15  C   CR16  0  -0.238  -3.3583   2.0423  -0.2714
 Q1M  C20  C   CR6   0   0.475   1.8990  -2.0336  -0.9573
 Q1M  C22  C   CH3   0  -0.443   1.3179  -3.6895  -2.5540
 Q1M  C23  C   CR16  0  -0.376   3.0792  -1.6981  -1.6160
 Q1M  C24  C   CR16  0  -0.196   3.8916  -0.6863  -1.1298
 Q1M  C11  C   CR6   0  -0.232  -4.0063   0.8232  -0.0536
 Q1M  C02  C   CR6   0  -0.130   3.5359   0.0061   0.0173
 Q1M  C03  C   CR16  0  -0.204   2.3670  -0.3062   0.6910
 Q1M  C04  C   CR6   0  -0.316   1.5572  -1.3183   0.1993
 Q1M  C12  C   C     0   0.612  -5.4700   0.7480   0.0838
 Q1M  S05  S   S     0   1.380   0.0783  -1.7308   1.0823
 Q1M  O06  O   OS    0  -0.631  -0.0728  -0.7495   2.1416
 Q1M  C08  C   CR6   0   0.303  -1.8684  -0.3097  -0.0958
 Q1M  C09  C   CR6   0   0.345  -3.2650  -0.3635   0.0548
 Q1M  O10  O   OH1   0  -0.607  -3.8070  -1.5539   0.2767
 Q1M  O13  O   O     0  -0.477  -6.0629  -0.3012   0.2734
 Q1M  O14  O   OH1   0  -0.577  -6.0827   1.9055  -0.0198
 Q1M  CL7  CL  CL    0  -0.117  -1.1753   3.5702  -0.6808
 Q1M  O19  O   OS    0  -0.637   0.0969  -3.1453   1.3960
 Q1M  O21  O   O2    0  -0.455   1.0538  -2.9808  -1.3519
 Q1M  H1   H   HCR6  0   0.297  -0.1728   0.9310  -0.4901
 Q1M  H2   H   HCR6  0   0.298  -3.9276   2.9581  -0.3421
 Q1M  H3   H   HCH3  0   0.242   1.3709  -3.0170  -3.4121
 Q1M  H4   H   HCH3  0   0.243   2.2435  -4.2639  -2.4859
 Q1M  H5   H   HCH3  0   0.271   0.4853  -4.3736  -2.6887
 Q1M  H6   H   HCR6  0   0.307   3.3834  -2.2179  -2.5137
 Q1M  H7   H   HCR6  0   0.297   4.8030  -0.4484  -1.6615
 Q1M  H8   H   HCR6  0   0.309   2.0821   0.2284   1.5867
 Q1M  H9   H   HNC1  0   0.431  -1.5588  -2.3545  -0.3554
 Q1M  H10  H   HOH1  0   0.488  -4.7819  -1.4411   0.3276
 Q1M  H11  H   HOH1  0   0.498  -7.0414   1.7917   0.0696
 Q1M  N07  N   NC1   0  -0.851  -1.1358  -1.5013  -0.0127
 Q1M  BR1  BR  BR    0  -0.028   4.6455   1.3836   0.6672

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 Q1M  O06  S05  double    1.452  0.020  1.452
 Q1M  CL7  C16  single    1.731  0.020  1.731
 Q1M  O19  S05  double    1.449  0.020  1.449
 Q1M  S05  C04  single    1.771  0.020  1.771
 Q1M  S05  N07  single    1.651  0.020  1.651
 Q1M  C18  C16  aromatic  1.390  0.020  1.390
 Q1M  C18  C08  aromatic  1.381  0.020  1.381
 Q1M  BR1  C02  single    1.884  0.020  1.884
 Q1M  C03  C04  aromatic  1.386  0.020  1.386
 Q1M  C03  C02  aromatic  1.385  0.020  1.385
 Q1M  C16  C15  aromatic  1.375  0.020  1.375
 Q1M  C04  C20  aromatic  1.402  0.020  1.402
 Q1M  N07  C08  single    1.401  0.020  1.401
 Q1M  C02  C24  aromatic  1.386  0.020  1.386
 Q1M  C08  C09  aromatic  1.406  0.020  1.406
 Q1M  C15  C11  aromatic  1.398  0.020  1.398
 Q1M  C20  O21  single    1.329  0.020  1.329
 Q1M  C20  C23  aromatic  1.393  0.020  1.393
 Q1M  C24  C23  aromatic  1.386  0.020  1.386
 Q1M  O21  C22  single    1.420  0.020  1.420
 Q1M  C09  C11  aromatic  1.403  0.020  1.403
 Q1M  C09  O10  single    1.327  0.020  1.327
 Q1M  C11  C12  single    1.472  0.020  1.472
 Q1M  C12  O13  double    1.220  0.020  1.220
 Q1M  C12  O14  single    1.314  0.020  1.314
 Q1M  C18  H1   single    0.930  0.020  1.080
 Q1M  C15  H2   single    0.930  0.020  1.080
 Q1M  C22  H3   single    0.970  0.020  1.090
 Q1M  C22  H4   single    0.970  0.020  1.090
 Q1M  C22  H5   single    0.970  0.020  1.090
 Q1M  C23  H6   single    0.930  0.020  1.080
 Q1M  C24  H7   single    0.930  0.020  1.080
 Q1M  C03  H8   single    0.930  0.020  1.080
 Q1M  N07  H9   single    0.890  0.020  1.040
 Q1M  O10  H10  single    0.850  0.020  0.980
 Q1M  O14  H11  single    0.850  0.020  0.980

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 Q1M  H1   C18  C08  119.98  3.000
 Q1M  H1   C18  C16  119.91  3.000
 Q1M  C08  C18  C16  120.11  3.000
 Q1M  CL7  C16  C15  120.00  3.000
 Q1M  C15  C16  C18  120.92  3.000
 Q1M  CL7  C16  C18  119.07  3.000
 Q1M  H2   C15  C11  120.34  3.000
 Q1M  H2   C15  C16  120.13  3.000
 Q1M  C11  C15  C16  119.53  3.000
 Q1M  O21  C20  C04  116.96  3.000
 Q1M  O21  C20  C23  124.75  3.000
 Q1M  C04  C20  C23  118.28  3.000
 Q1M  H5   C22  H4   109.05  3.000
 Q1M  H5   C22  H3   109.13  3.000
 Q1M  H4   C22  H3   109.40  3.000
 Q1M  H5   C22  O21  106.07  3.000
 Q1M  H4   C22  O21  111.57  3.000
 Q1M  H3   C22  O21  111.53  3.000
 Q1M  H6   C23  C24  118.52  3.000
 Q1M  H6   C23  C20  121.03  3.000
 Q1M  C24  C23  C20  120.45  3.000
 Q1M  H7   C24  C02  120.87  3.000
 Q1M  H7   C24  C23  118.82  3.000
 Q1M  C02  C24  C23  120.31  3.000
 Q1M  C09  C11  C12  118.35  3.000
 Q1M  C12  C11  C15  121.34  3.000
 Q1M  C09  C11  C15  120.31  3.000
 Q1M  BR1  C02  C03  119.61  3.000
 Q1M  C03  C02  C24  120.43  3.000
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 Q1M  H8   C03  C04  120.05  3.000
 Q1M  H8   C03  C02  120.93  3.000
 Q1M  C04  C03  C02  119.02  3.000
 Q1M  S05  C04  C03  118.75  3.000
 Q1M  C03  C04  C20  121.51  3.000
 Q1M  S05  C04  C20  119.73  3.000
 Q1M  O14  C12  O13  122.91  3.000
 Q1M  O14  C12  C11  114.29  3.000
 Q1M  O13  C12  C11  122.79  3.000
 Q1M  O19  S05  N07  106.78  3.000
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 Q1M  C09  C08  N07  118.72  3.000
 Q1M  C09  C08  C18  120.13  3.000
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 Q1M  O10  C09  C08  117.27  3.000
 Q1M  O10  C09  C11  123.77  3.000
 Q1M  C08  C09  C11  118.96  3.000
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 Q1M  H11  O14  C12  110.51  3.000
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 Q1M  H9   N07  S05  114.50  3.000
 Q1M  C08  N07  S05  122.82  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 Q1M  CONST_01  C11  C15  C16  C18     0.00   0.0  0
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 Q1M  CONST_04  C09  C11  C15  C16     0.00   0.0  0
 Q1M  CONST_05  C08  C18  C16  C15     0.00   0.0  0
 Q1M  CONST_06  C08  C09  C11  C15     0.00   0.0  0
 Q1M  CONST_07  C02  C03  C04  C20     0.00   0.0  0
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 Q1M  CONST_10  C03  C02  C24  C23     0.00   0.0  0
 Q1M  CONST_11  C04  C03  C02  C24     0.00   0.0  0
 Q1M  CONST_12  C04  C20  C23  C24     0.00   0.0  0
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 Q1M  CONST_16  O10  C09  C11  C15   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_17  S05  C04  C20  C23   180.00   0.0  0
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 Q1M  CONST_20  CL7  C16  C15  C11   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_21  N07  C08  C09  C11   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_22  S05  C04  C03  C02   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_23  O21  C20  C04  C03   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_24  BR1  C02  C03  C04   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_25  C08  C09  C11  C12   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_26  CL7  C16  C18  C08   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_27  H2   C15  C16  C18   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_28  H1   C18  C16  C15   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_29  H8   C03  C04  C20   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_30  H7   C24  C23  C20   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_31  H6   C23  C24  C02   180.00   0.0  0
 Q1M  CONST_35  H11  O14  C12  C11   180.00   0.0  0
 Q1M  Var_01    O13  C12  C11  C15   179.95  30.0  2
 Q1M  Var_02    O06  S05  C04  C20  -174.63  30.0  2
 Q1M  Var_03    C04  C20  O21  C22   176.87  30.0  2
 Q1M  Var_04    C08  N07  S05  C04   -95.14  30.0  3
 Q1M  Var_05    H3   C22  O21  C20   -59.19  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 Q1M  plan-1  C18  0.020
 Q1M  plan-1  C16  0.020
 Q1M  plan-1  C15  0.020
 Q1M  plan-1  C11  0.020
 Q1M  plan-1  C12  0.020
 Q1M  plan-1  C08  0.020
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 Q1M  plan-4  H11  0.020

