# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Apr 30 10:50:03 2020
#   Inital geometry file: a 113 line input string
#   Ligand name: 5-bromo-N-(4-hydroxy[1,1'-biphenyl]-3-yl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(Br)cc1[S](=O)(=O)Nc2cc(ccc2O)c3ccccc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 Q1J  Q1J  5-bromo-N-(4-hydroxy[1,1'-biphenyl]-3-yl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide  ligand  42  26  .  2021-08-20  2021-08-20  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_Q1J
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 Q1J  C05  C   CR6   0  -0.130  -1.3037   1.8920   1.0137
 Q1J  C13  C   CR6   0   0.219   2.4593  -1.0188  -0.1980
 Q1J  C18  C   CR6   0   0.080   0.6247  -2.6051  -0.2866
 Q1J  C17  C   CR16  0  -0.302   1.4315  -3.5182   0.3920
 Q1J  C16  C   CR16  0  -0.373   2.7268  -3.2019   0.7660
 Q1J  C19  C   CR6   0   0.101  -0.7540  -2.9428  -0.6912
 Q1J  C20  C   CR16  0  -0.315  -1.5563  -3.7575   0.1103
 Q1J  C21  C   CR16  0  -0.240  -2.8529  -4.0733  -0.2687
 Q1J  C22  C   CR16  0  -0.269  -3.3771  -3.5761  -1.4547
 Q1J  C23  C   CR16  0  -0.239  -2.5901  -2.7634  -2.2600
 Q1J  C24  C   CR16  0  -0.316  -1.2919  -2.4528  -1.8831
 Q1J  C11  C   CH3   0  -0.444   1.2558   3.1587  -3.1069
 Q1J  C03  C   CR6   0  -0.328   0.9744   1.8764   0.2924
 Q1J  C04  C   CR16  0  -0.188   0.0271   1.6119   1.2695
 Q1J  C07  C   CR16  0  -0.194  -1.6838   2.4294  -0.2059
 Q1J  C08  C   CR16  0  -0.381  -0.7344   2.6955  -1.1789
 Q1J  C09  C   CR6   0   0.471   0.6137   2.4273  -0.9470
 Q1J  C14  C   CR6   0   0.336   3.2526  -1.9447   0.4877
 Q1J  C25  C   CR16  0  -0.317   1.1717  -1.3583  -0.5812
 Q1J  N12  N   NC1   0  -0.808   2.9504   0.2781  -0.4895
 Q1J  O01  O   OS    0  -0.649   3.5428   2.5750   0.2932
 Q1J  O10  O   O2    0  -0.445   1.5853   2.6406  -1.8272
 Q1J  O15  O   OH1   0  -0.612   4.4940  -1.5706   0.8268
 Q1J  O26  O   OS    0  -0.636   2.7005   0.9380   1.9849
 Q1J  S02  S   S     0   1.376   2.6645   1.4706   0.6316
 Q1J  BR6  BR  BR    0  -0.032  -2.6039   1.5270   2.3282
 Q1J  H1   H   HCR6  0   0.263   1.0561  -4.5082   0.6186
 Q1J  H2   H   HCR6  0   0.280   3.3296  -3.9382   1.2852
 Q1J  H3   H   HCR6  0   0.253  -1.1737  -4.1348   1.0507
 Q1J  H4   H   HCR6  0   0.258  -3.4580  -4.7036   0.3700
 Q1J  H5   H   HCR6  0   0.257  -4.3897  -3.8203  -1.7480
 Q1J  H6   H   HCR6  0   0.257  -2.9831  -2.3748  -3.1905
 Q1J  H7   H   HCR6  0   0.252  -0.6864  -1.8387  -2.5380
 Q1J  H8   H   HCH3  0   0.241   0.5819   2.4920  -3.6484
 Q1J  H9   H   HCH3  0   0.241   0.8027   4.1494  -3.0343
 Q1J  H10  H   HCH3  0   0.270   2.1924   3.2366  -3.6512
 Q1J  H11  H   HCR6  0   0.305   0.3337   1.1810   2.2123
 Q1J  H12  H   HCR6  0   0.296  -2.7218   2.6463  -0.4187
 Q1J  H13  H   HCR6  0   0.307  -1.0672   3.1121  -2.1189
 Q1J  H14  H   HCR6  0   0.254   0.5877  -0.6166  -1.1117
 Q1J  H15  H   HNC1  0   0.420   3.8924   0.3365  -0.8643
 Q1J  H16  H   HOH1  0   0.483   4.9626  -2.2975   1.2529

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 Q1J  C23  C24  aromatic  1.387  0.020  1.387
 Q1J  C23  C22  aromatic  1.389  0.020  1.389
 Q1J  O26  S02  double    1.455  0.020  1.455
 Q1J  O01  S02  double    1.451  0.020  1.451
 Q1J  BR6  C05  single    1.885  0.020  1.885
 Q1J  C24  C19  aromatic  1.396  0.020  1.396
 Q1J  C22  C21  aromatic  1.389  0.020  1.389
 Q1J  C04  C05  aromatic  1.384  0.020  1.384
 Q1J  C04  C03  aromatic  1.386  0.020  1.386
 Q1J  S02  C03  single    1.771  0.020  1.771
 Q1J  S02  N12  single    1.661  0.020  1.661
 Q1J  C05  C07  aromatic  1.386  0.020  1.386
 Q1J  C03  C09  aromatic  1.404  0.020  1.404
 Q1J  C19  C20  aromatic  1.396  0.020  1.396
 Q1J  C19  C18  single    1.476  0.020  1.476
 Q1J  C21  C20  aromatic  1.387  0.020  1.387
 Q1J  C25  C18  aromatic  1.393  0.020  1.393
 Q1J  C25  C13  aromatic  1.386  0.020  1.386
 Q1J  N12  C13  single    1.417  0.020  1.417
 Q1J  C07  C08  aromatic  1.385  0.020  1.385
 Q1J  C09  C08  aromatic  1.394  0.020  1.394
 Q1J  C09  O10  single    1.328  0.020  1.328
 Q1J  C18  C17  aromatic  1.395  0.020  1.395
 Q1J  C13  C14  aromatic  1.399  0.020  1.399
 Q1J  O10  C11  single    1.419  0.020  1.419
 Q1J  C17  C16  aromatic  1.385  0.020  1.385
 Q1J  C14  C16  aromatic  1.391  0.020  1.391
 Q1J  C14  O15  single    1.340  0.020  1.340
 Q1J  C17  H1   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C16  H2   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C20  H3   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C21  H4   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C22  H5   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C23  H6   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C24  H7   single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C11  H8   single    0.970  0.020  1.090
 Q1J  C11  H9   single    0.970  0.020  1.090
 Q1J  C11  H10  single    0.970  0.020  1.090
 Q1J  C04  H11  single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C07  H12  single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C08  H13  single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  C25  H14  single    0.930  0.020  1.080
 Q1J  N12  H15  single    0.890  0.020  1.040
 Q1J  O15  H16  single    0.850  0.020  0.980

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 Q1J  BR6  C05  C07  119.98  3.000
 Q1J  C07  C05  C04  120.32  3.000
 Q1J  BR6  C05  C04  119.69  3.000
 Q1J  N12  C13  C25  119.30  3.000
 Q1J  N12  C13  C14  120.67  3.000
 Q1J  C25  C13  C14  120.02  3.000
 Q1J  C25  C18  C19  120.91  3.000
 Q1J  C25  C18  C17  117.50  3.000
 Q1J  C19  C18  C17  121.59  3.000
 Q1J  H1   C17  C16  118.47  3.000
 Q1J  H1   C17  C18  119.99  3.000
 Q1J  C16  C17  C18  121.53  3.000
 Q1J  H2   C16  C14  119.98  3.000
 Q1J  H2   C16  C17  119.62  3.000
 Q1J  C14  C16  C17  120.40  3.000
 Q1J  C24  C19  C20  118.25  3.000
 Q1J  C20  C19  C18  120.86  3.000
 Q1J  C24  C19  C18  120.90  3.000
 Q1J  H3   C20  C21  119.22  3.000
 Q1J  H3   C20  C19  119.91  3.000
 Q1J  C21  C20  C19  120.87  3.000
 Q1J  H4   C21  C22  120.10  3.000
 Q1J  H4   C21  C20  119.60  3.000
 Q1J  C22  C21  C20  120.31  3.000
 Q1J  H5   C22  C23  120.35  3.000
 Q1J  H5   C22  C21  120.26  3.000
 Q1J  C23  C22  C21  119.39  3.000
 Q1J  H6   C23  C24  119.55  3.000
 Q1J  H6   C23  C22  120.19  3.000
 Q1J  C24  C23  C22  120.26  3.000
 Q1J  H7   C24  C23  119.08  3.000
 Q1J  H7   C24  C19  119.99  3.000
 Q1J  C23  C24  C19  120.92  3.000
 Q1J  H10  C11  H9   109.04  3.000
 Q1J  H10  C11  H8   109.12  3.000
 Q1J  H9   C11  H8   109.33  3.000
 Q1J  H10  C11  O10  106.13  3.000
 Q1J  H9   C11  O10  111.57  3.000
 Q1J  H8   C11  O10  111.56  3.000
 Q1J  S02  C03  C09  120.29  3.000
 Q1J  C09  C03  C04  121.44  3.000
 Q1J  S02  C03  C04  118.26  3.000
 Q1J  H11  C04  C03  119.80  3.000
 Q1J  H11  C04  C05  120.97  3.000
 Q1J  C03  C04  C05  119.22  3.000
 Q1J  H12  C07  C08  118.76  3.000
 Q1J  H12  C07  C05  120.94  3.000
 Q1J  C08  C07  C05  120.31  3.000
 Q1J  H13  C08  C09  121.11  3.000
 Q1J  H13  C08  C07  118.29  3.000
 Q1J  C09  C08  C07  120.60  3.000
 Q1J  O10  C09  C08  124.50  3.000
 Q1J  O10  C09  C03  117.40  3.000
 Q1J  C08  C09  C03  118.10  3.000
 Q1J  O15  C14  C16  123.49  3.000
 Q1J  O15  C14  C13  117.69  3.000
 Q1J  C16  C14  C13  118.82  3.000
 Q1J  H14  C25  C18  120.32  3.000
 Q1J  H14  C25  C13  117.96  3.000
 Q1J  C18  C25  C13  121.72  3.000
 Q1J  H15  N12  S02  111.56  3.000
 Q1J  H15  N12  C13  116.74  3.000
 Q1J  S02  N12  C13  117.28  3.000
 Q1J  C09  O10  C11  119.09  3.000
 Q1J  H16  O15  C14  110.59  3.000
 Q1J  O26  S02  O01  118.72  3.000
 Q1J  O01  S02  N12  106.54  3.000
 Q1J  O26  S02  N12  111.14  3.000
 Q1J  N12  S02  C03  101.51  3.000
 Q1J  O01  S02  C03  111.01  3.000
 Q1J  O26  S02  C03  106.60  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 Q1J  CONST_01  C09  C03  C04  C05    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_02  C09  C08  C07  C05    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_03  C19  C18  C25  C13  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_04  C17  C18  C25  C13    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_05  C17  C16  C14  C13    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_06  C23  C24  C19  C18  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_07  C21  C20  C19  C18  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_08  C14  C13  C25  C18    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_09  C14  C16  C17  C18    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_12  C19  C18  C17  C16  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_13  C25  C18  C17  C16    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_14  C25  C13  C14  C16    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_15  C22  C23  C24  C19    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_16  C22  C21  C20  C19    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_17  C23  C24  C19  C20    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_19  C23  C22  C21  C20    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_20  C24  C23  C22  C21    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_21  C24  C19  C20  C21    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_23  C07  C05  C04  C03    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_24  C07  C08  C09  C03    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_25  C08  C07  C05  C04    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_26  C08  C09  C03  C04    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_27  S02  C03  C04  C05  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_28  N12  C13  C25  C18  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_29  O15  C14  C16  C17  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_30  N12  C13  C14  C16  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_31  BR6  C05  C04  C03  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_32  O10  C09  C03  C04  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_33  O10  C09  C08  C07  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_34  BR6  C05  C07  C08  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_35  S02  C03  C09  C08  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_36  O15  C14  C13  C25  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_37  H13  C08  C07  C05  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_38  H2   C16  C14  C13  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_39  H7   C24  C19  C18    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_40  H3   C20  C19  C18    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_41  H14  C25  C18  C17  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_42  H6   C23  C24  C19  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_43  H4   C21  C20  C19  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_44  H1   C17  C18  C19    0.00   0.0  0
 Q1J  CONST_45  H5   C22  C21  C20  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_46  H12  C07  C05  C04  180.00   0.0  0
 Q1J  CONST_47  H11  C04  C05  C07  180.00   0.0  0
 Q1J  Var_01    C03  S02  N12  C13  -78.54  30.0  1
 Q1J  Var_02    C03  C09  O10  C11  178.12  30.0  1
 Q1J  Var_03    O26  S02  C03  C04   -1.63  30.0  2
 Q1J  Var_04    H8   C11  O10  C09  -60.54  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 Q1J  plan-1  C18  0.020
 Q1J  plan-1  C19  0.020
 Q1J  plan-1  C20  0.020
 Q1J  plan-1  C21  0.020
 Q1J  plan-1  C22  0.020
 Q1J  plan-1  C23  0.020
 Q1J  plan-1  C24  0.020
 Q1J  plan-1  H3   0.020
 Q1J  plan-1  H4   0.020
 Q1J  plan-1  H5   0.020
 Q1J  plan-1  H6   0.020
 Q1J  plan-1  H7   0.020
 Q1J  plan-2  C05  0.020
 Q1J  plan-2  C03  0.020
 Q1J  plan-2  C04  0.020
 Q1J  plan-2  C07  0.020
 Q1J  plan-2  C08  0.020
 Q1J  plan-2  C09  0.020
 Q1J  plan-2  O10  0.020
 Q1J  plan-2  S02  0.020
 Q1J  plan-2  BR6  0.020
 Q1J  plan-2  H11  0.020
 Q1J  plan-2  H12  0.020
 Q1J  plan-2  H13  0.020
 Q1J  plan-3  C13  0.020
 Q1J  plan-3  C18  0.020
 Q1J  plan-3  C17  0.020
 Q1J  plan-3  C16  0.020
 Q1J  plan-3  C19  0.020
 Q1J  plan-3  C14  0.020
 Q1J  plan-3  C25  0.020
 Q1J  plan-3  N12  0.020
 Q1J  plan-3  O15  0.020
 Q1J  plan-3  H1   0.020
 Q1J  plan-3  H2   0.020
 Q1J  plan-3  H14  0.020
 Q1J  plan-4  C13  0.020
 Q1J  plan-4  N12  0.020
 Q1J  plan-4  S02  0.020
 Q1J  plan-4  H15  0.020

