# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Apr 30 04:22:50 2020
#   Inital geometry file: a 98 line input string
#   Ligand name: 1-[3-(2,4-diamino-6-methylquinazolin-7-yl)phenyl]ethanone
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(=O)c1cccc(c1)c2cc3nc(N)nc(N)c3cc2C
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 Q19  Q19  1-[3-(2,4-diamino-6-methylquinazolin-7-yl)phenyl]ethanone  ligand  38  22  .  2021-08-20  2021-08-20  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_Q19
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 Q19  C1    C  CR6   0   0.481  -4.0592   0.4880   0.3734
 Q19  N2    N  N     0  -0.510  -4.6815  -0.6194   0.0302
 Q19  C3    C  CR6   0   0.513  -3.9442  -1.6289  -0.4771
 Q19  N4    N  N     0  -0.531  -2.6430  -1.6377  -0.6724
 Q19  C5    C  CR66  0   0.263  -1.9851  -0.5063  -0.3289
 Q19  C6    C  CR66  0  -0.028  -2.6335   0.6208   0.2078
 Q19  C7    C  CR16  0  -0.374  -0.5895  -0.4353  -0.5108
 Q19  C8    C  CR6   0   0.050   0.1283   0.6930  -0.1843
 Q19  C9    C  CR6   0   0.069  -0.5260   1.8264   0.3664
 Q19  C10   C  CR16  0  -0.349  -1.8886   1.7597   0.5499
 Q19  N11   N  NH2   0  -0.826  -4.7942   1.4817   0.8785
 Q19  N12   N  NH2   0  -0.825  -4.6475  -2.7253  -0.8470
 Q19  C13   C  CH3   0  -0.742   0.2313   3.0554   0.7812
 Q19  C14   C  CR6   0   0.064   1.5942   0.6832  -0.4053
 Q19  C15   C  CR16  0  -0.285   2.2049   1.6109  -1.2508
 Q19  C16   C  CR16  0  -0.223   3.5711   1.5664  -1.4765
 Q19  C17   C  CR16  0  -0.297   4.3494   0.5975  -0.8602
 Q19  C18   C  CR6   0  -0.006   3.7591  -0.3386  -0.0143
 Q19  C19   C  CR16  0  -0.317   2.3817  -0.2862   0.2023
 Q19  C20   C  C     0   0.366   4.5564  -1.3992   0.6672
 Q19  O21   O  O     0  -0.394   4.0139  -2.1992   1.4008
 Q19  C22   C  CH3   0  -0.801   6.0381  -1.4473   0.4163
 Q19  H7    H  HCR6  0   0.249  -0.0868  -1.2971  -0.9329
 Q19  H10   H  HCR6  0   0.243  -2.3800   2.6230   0.9830
 Q19  HN11  H  HNH2  0   0.403  -5.7866   1.3588   0.9835
 Q19  HN1A  H  HNH2  0   0.417  -4.4021   2.3560   1.1748
 Q19  HN12  H  HNH2  0   0.388  -5.5796  -2.8329  -0.4862
 Q19  HN1B  H  HNH2  0   0.387  -4.1362  -3.5741  -1.0166
 Q19  H13   H  HCH3  0   0.247   0.5892   3.6302  -0.0742
 Q19  H13A  H  HCH3  0   0.252  -0.4039   3.7163   1.3693
 Q19  H13B  H  HCH3  0   0.244   1.1050   2.8076   1.3853
 Q19  H15   H  HCR6  0   0.267   1.6064   2.3619  -1.7502
 Q19  H16   H  HCR6  0   0.267   4.0319   2.2859  -2.1400
 Q19  H17   H  HCR6  0   0.266   5.4141   0.5817  -1.0502
 Q19  H19   H  HCR6  0   0.262   1.9175  -1.0080   0.8624
 Q19  H22   H  HCH3  0   0.269   6.5152  -0.5129   0.7159
 Q19  H22A  H  HCH3  0   0.272   6.4880  -2.2652   0.9739
 Q19  H22B  H  HCH3  0   0.269   6.2480  -1.5876  -0.6453

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 Q19  C1   N2    aromatic  1.316  0.020  1.316
 Q19  C1   C6    aromatic  1.441  0.020  1.441
 Q19  C1   N11   single    1.335  0.020  1.335
 Q19  N2   C3    aromatic  1.349  0.020  1.349
 Q19  C3   N4    aromatic  1.316  0.020  1.316
 Q19  C3   N12   single    1.354  0.020  1.354
 Q19  N4   C5    aromatic  1.353  0.020  1.353
 Q19  C5   C6    aromatic  1.407  0.020  1.407
 Q19  C5   C7    aromatic  1.409  0.020  1.409
 Q19  C6   C10   aromatic  1.403  0.020  1.403
 Q19  C7   C8    aromatic  1.377  0.020  1.377
 Q19  C8   C9    aromatic  1.420  0.020  1.420
 Q19  C8   C14   single    1.483  0.020  1.483
 Q19  C9   C10   aromatic  1.376  0.020  1.376
 Q19  C9   C13   single    1.502  0.020  1.502
 Q19  C14  C15   aromatic  1.396  0.020  1.396
 Q19  C14  C19   aromatic  1.389  0.020  1.389
 Q19  C15  C16   aromatic  1.385  0.020  1.385
 Q19  C16  C17   aromatic  1.387  0.020  1.387
 Q19  C17  C18   aromatic  1.393  0.020  1.393
 Q19  C18  C19   aromatic  1.395  0.020  1.395
 Q19  C18  C20   single    1.492  0.020  1.492
 Q19  C20  O21   double    1.213  0.020  1.213
 Q19  C20  C22   single    1.504  0.020  1.504
 Q19  C7   H7    single    0.930  0.020  1.080
 Q19  C10  H10   single    0.930  0.020  1.080
 Q19  N11  HN11  single    0.860  0.020  1.020
 Q19  N11  HN1A  single    0.860  0.020  1.020
 Q19  N12  HN12  single    0.890  0.020  1.040
 Q19  N12  HN1B  single    0.890  0.020  1.040
 Q19  C13  H13   single    0.970  0.020  1.090
 Q19  C13  H13A  single    0.970  0.020  1.090
 Q19  C13  H13B  single    0.970  0.020  1.090
 Q19  C15  H15   single    0.930  0.020  1.080
 Q19  C16  H16   single    0.930  0.020  1.080
 Q19  C17  H17   single    0.930  0.020  1.080
 Q19  C19  H19   single    0.930  0.020  1.080
 Q19  C22  H22   single    0.970  0.020  1.090
 Q19  C22  H22A  single    0.970  0.020  1.090
 Q19  C22  H22B  single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 Q19  N11   C1   C6    121.28  3.000
 Q19  N11   C1   N2    117.69  3.000
 Q19  C6    C1   N2    121.02  3.000
 Q19  C3    N2   C1    117.99  3.000
 Q19  N12   C3   N4    117.89  3.000
 Q19  N12   C3   N2    115.14  3.000
 Q19  N4    C3   N2    126.96  3.000
 Q19  C5    N4   C3    115.95  3.000
 Q19  C7    C5   C6    117.73  3.000
 Q19  C7    C5   N4    119.40  3.000
 Q19  C6    C5   N4    122.87  3.000
 Q19  C10   C6   C5    119.91  3.000
 Q19  C10   C6   C1    124.88  3.000
 Q19  C5    C6   C1    115.20  3.000
 Q19  H7    C7   C8    120.16  3.000
 Q19  H7    C7   C5    118.02  3.000
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 Q19  C14   C8   C9    121.25  3.000
 Q19  C14   C8   C7    118.35  3.000
 Q19  C9    C8   C7    120.39  3.000
 Q19  C13   C9   C10   120.13  3.000
 Q19  C13   C9   C8    121.86  3.000
 Q19  C10   C9   C8    117.99  3.000
 Q19  H10   C10  C9    117.62  3.000
 Q19  H10   C10  C6    120.22  3.000
 Q19  C9    C10  C6    122.16  3.000
 Q19  HN1A  N11  HN11  117.48  3.000
 Q19  HN1A  N11  C1    123.05  3.000
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 Q19  HN1B  N12  C3    117.75  3.000
 Q19  HN12  N12  C3    118.05  3.000
 Q19  H13B  C13  H13A  107.82  3.000
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 Q19  H13A  C13  H13   107.16  3.000
 Q19  H13B  C13  C9    111.77  3.000
 Q19  H13A  C13  C9    110.58  3.000
 Q19  H13   C13  C9    112.33  3.000
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 Q19  C19   C14  C8    120.00  3.000
 Q19  C15   C14  C8    121.23  3.000
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 Q19  H16   C16  C15   119.91  3.000
 Q19  C17   C16  C15   120.22  3.000
 Q19  H17   C17  C18   120.93  3.000
 Q19  H17   C17  C16   118.97  3.000
 Q19  C18   C17  C16   120.09  3.000
 Q19  C20   C18  C19   118.91  3.000
 Q19  C20   C18  C17   121.92  3.000
 Q19  C19   C18  C17   119.17  3.000
 Q19  H19   C19  C18   119.53  3.000
 Q19  H19   C19  C14   119.27  3.000
 Q19  C18   C19  C14   121.20  3.000
 Q19  C22   C20  O21   121.35  3.000
 Q19  C22   C20  C18   118.25  3.000
 Q19  O21   C20  C18   120.40  3.000
 Q19  H22B  C22  H22A  108.82  3.000
 Q19  H22B  C22  H22   107.04  3.000
 Q19  H22A  C22  H22   108.81  3.000
 Q19  H22B  C22  C20   110.86  3.000
 Q19  H22A  C22  C20   110.26  3.000
 Q19  H22   C22  C20   110.96  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 Q19  CONST_01  N4    C3   N2   C1     0.00   0.0  0
 Q19  CONST_02  N4    C5   C6   C1     0.00   0.0  0
 Q19  CONST_03  C7    C5   C6   C1   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_04  C9    C10  C6   C1   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_05  C5    C6   C1   N2     0.00   0.0  0
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 Q19  CONST_08  C6    C1   N2   C3     0.00   0.0  0
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 Q19  CONST_10  C7    C5   N4   C3   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_11  C10   C6   C5   N4   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_12  C8    C7   C5   N4   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_13  C9    C10  C6   C5     0.00   0.0  0
 Q19  CONST_14  C9    C8   C7   C5     0.00   0.0  0
 Q19  CONST_15  C14   C8   C7   C5   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_16  C8    C7   C5   C6     0.00   0.0  0
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 Q19  CONST_18  C10   C6   C5   C7     0.00   0.0  0
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 Q19  CONST_22  C16   C15  C14  C8   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_23  C18   C19  C14  C8   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_26  C14   C8   C9   C10  180.00   0.0  0
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 Q19  CONST_36  N11   C1   C6   C5   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_37  C13   C9   C10  C6   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_38  C13   C9   C8   C7   180.00   0.0  0
 Q19  CONST_39  N11   C1   C6   C10    0.00   0.0  0
 Q19  CONST_40  C14   C8   C9   C13    0.00   0.0  0
 Q19  CONST_41  C20   C18  C19  C14  180.00   0.0  0
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 Q19  Var_03    H22   C22  C20  C18   59.37  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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