# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Mar 19 22:48:45 2022
#   Inital geometry file: a 397 line input string
#   Ligand name: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77,80-heptacosaoxadooctacontan-82-ol
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCO
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 PEU  PEU  2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77,80-heptacosaoxadooctacontan-82-ol  ligand  195  83  .  2022-03-23  2022-03-23
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as GRAND
;

data_comp_PEU
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 PEU  CAA   C  CH3   0  -0.395  -33.1586   6.2463  -1.5259
 PEU  OAB   O  O2    0  -0.484  -32.8355   4.9024  -1.7701
 PEU  CAC   C  CH2   0  -0.168  -32.2761   4.2719  -0.6469
 PEU  CAD   C  CH2   0  -0.169  -31.9432   2.8390  -0.9742
 PEU  OAE   O  O2    0  -0.485  -30.9302   2.7946  -1.9462
 PEU  CAF   C  CH2   0  -0.169  -30.5430   1.4831  -2.2664
 PEU  CAG   C  CH2   0  -0.170  -29.4632   1.5105  -3.3170
 PEU  OAH   O  O2    0  -0.485  -28.3130   2.1292  -2.7992
 PEU  CAI   C  CH2   0  -0.170  -27.2499   2.1512  -3.7170
 PEU  CAJ   C  CH2   0  -0.168  -26.0952   2.9308  -3.1433
 PEU  OAK   O  O2    0  -0.485  -25.5946   2.2797  -2.0038
 PEU  CAL   C  CH2   0  -0.169  -24.5079   2.9600  -1.4294
 PEU  CAM   C  CH2   0  -0.169  -24.0726   2.2640  -0.1660
 PEU  OAN   O  O2    0  -0.485  -23.5685   0.9882  -0.4684
 PEU  CAO   C  CH2   0  -0.169  -23.0977   0.3116   0.6694
 PEU  CAP   C  CH2   0  -0.169  -22.5504  -1.0360   0.2761
 PEU  OAQ   O  O2    0  -0.485  -21.4152  -0.8675  -0.5341
 PEU  CAR   C  CH2   0  -0.170  -20.7966  -2.0847  -0.8634
 PEU  CAS   C  CH2   0  -0.169  -19.6148  -1.8293  -1.7627
 PEU  OAT   O  O2    0  -0.485  -18.6505  -1.0734  -1.0757
 PEU  CAU   C  CH2   0  -0.171  -17.5118  -0.8090  -1.8549
 PEU  CAV   C  CH2   0  -0.168  -16.5751   0.0945  -1.0965
 PEU  OAW   O  O2    0  -0.486  -16.0747  -0.5707   0.0354
 PEU  CAX   C  CH2   0  -0.169  -15.2471   0.2519   0.8177
 PEU  CAY   C  CH2   0  -0.170  -14.7392  -0.5102   2.0138
 PEU  OAZ   O  O2    0  -0.485  -13.8829  -1.5416   1.5938
 PEU  CBA   C  CH2   0  -0.169  -13.2918  -2.2260   2.6687
 PEU  CBB   C  CH2   0  -0.169  -12.3711  -3.2985   2.1462
 PEU  OBC   O  O2    0  -0.485  -11.3109  -2.7092   1.4382
 PEU  CCG   C  CH2   0  -0.169  -10.3920  -3.6518   0.9480
 PEU  CCF   C  CH2   0  -0.168   -9.3429  -2.9555   0.1203
 PEU  OCE   O  O2    0  -0.486   -8.5666  -2.1151   0.9361
 PEU  CCD   C  CH2   0  -0.169   -7.5988  -1.4031   0.2086
 PEU  CCC   C  CH2   0  -0.170   -6.8020  -0.5219   1.1353
 PEU  OCB   O  O2    0  -0.485   -6.0472  -1.3127   2.0179
 PEU  CCA   C  CH2   0  -0.169   -5.2203  -0.5456   2.8550
 PEU  CBZ   C  CH2   0  -0.170   -4.4358  -1.4495   3.7708
 PEU  OBY   O  O2    0  -0.484   -3.5731  -2.2600   3.0150
 PEU  CBX   C  CH2   0  -0.170   -2.7495  -3.0688   3.8157
 PEU  CBW   C  CH2   0  -0.170   -1.9047  -3.9613   2.9433
 PEU  OBV   O  O2    0  -0.484   -1.0412  -3.1808   2.1572
 PEU  CBU   C  CH2   0  -0.170   -0.1872  -3.9567   1.3562
 PEU  CBT   C  CH2   0  -0.169    0.6441  -3.0580   0.4773
 PEU  OBS   O  O2    0  -0.485    1.4877  -2.2620   1.2697
 PEU  CBR   C  CH2   0  -0.170    2.2862  -1.3950   0.5055
 PEU  CBQ   C  CH2   0  -0.169    3.1166  -0.5275   1.4158
 PEU  OBP   O  O2    0  -0.485    4.0443  -1.3176   2.1144
 PEU  CBO   C  CH2   0  -0.169    4.8514  -0.5648   2.9834
 PEU  CBN   C  CH2   0  -0.169    5.8694  -1.4607   3.6409
 PEU  OBM   O  O2    0  -0.485    6.7629  -1.9466   2.6720
 PEU  CBL   C  CH2   0  -0.169    7.7775  -2.7516   3.2148
 PEU  CBK   C  CH2   0  -0.168    8.6723  -3.2488   2.1084
 PEU  OBJ   O  O2    0  -0.485    9.3299  -2.1611   1.5108
 PEU  CBI   C  CH2   0  -0.169   10.0937  -2.5281   0.3908
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 PEU  OBG   O  O2    0  -0.486   11.6900  -0.7840   0.6739
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 PEU  CCH   C  CH2   0  -0.169   15.4385   0.2232   2.0865
 PEU  CCI   C  CH2   0  -0.169   16.4996  -0.8465   2.0867
 PEU  OCJ   O  O2    0  -0.485   17.1228  -0.8957   0.8286
 PEU  CCK   C  CH2   0  -0.169   18.1312  -1.8711   0.7591
 PEU  CCL   C  CH2   0  -0.169   18.7678  -1.8484  -0.6066
 PEU  OCM   O  O2    0  -0.485   19.4408  -0.6300  -0.7946
 PEU  CCN   C  CH2   0  -0.169   20.0646  -0.5388  -2.0497
 PEU  CCO   C  CH2   0  -0.169   20.7242   0.8088  -2.1905
 PEU  OCP   O  O2    0  -0.486   21.7680   0.9247  -1.2577
 PEU  CCQ   C  CH2   0  -0.169   22.3970   2.1802  -1.2975
 PEU  CCR   C  CH2   0  -0.169   23.4889   2.2333  -0.2607
 PEU  OCS   O  O2    0  -0.485   24.5115   1.3329  -0.6032
 PEU  CCT   C  CH2   0  -0.169   25.5641   1.3270   0.3268
 PEU  CCU   C  CH2   0  -0.169   26.6454   0.3837  -0.1331
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 PEU  CCX   C  CH2   0  -0.169   28.8050   0.6197  -3.0786
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 PEU  HAA1  H  HCH3  0   0.233  -33.5583   6.6709  -2.4463
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 PEU  HAC1  H  HCH2  0   0.203  -31.3713   4.7987  -0.3098
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 PEU  HAD2  H  HCH2  0   0.204  -32.8451   2.3124  -1.3186
 PEU  HAF1  H  HCH2  0   0.204  -30.1833   0.9491  -1.3746
 PEU  HAF2  H  HCH2  0   0.207  -31.3895   0.9040  -2.6613
 PEU  HAG1  H  HCH2  0   0.207  -29.2568   0.4738  -3.6178
 PEU  HAG2  H  HCH2  0   0.205  -29.8209   2.0366  -4.2139
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 PEU  HAI2  H  HCH2  0   0.207  -27.5477   2.6349  -4.6578
 PEU  HAJ1  H  HCH2  0   0.207  -25.3243   3.0181  -3.9217
 PEU  HAJ2  H  HCH2  0   0.204  -26.4192   3.9534  -2.9008
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 PEU  HAL2  H  HCH2  0   0.207  -24.7818   3.9917  -1.1680
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 PEU  HAP2  H  HCH2  0   0.205  -23.3227  -1.6225  -0.2424
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 PEU  HAV2  H  HCH2  0   0.204  -17.1008   1.0172  -0.8103
 PEU  HAX1  H  HCH2  0   0.204  -14.3970   0.6301   0.2314
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 PEU  HAY1  H  HCH2  0   0.207  -14.2109   0.1997   2.6656
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 PEU  HBB2  H  HCH2  0   0.205  -12.9322  -3.9961   1.5076
 PEU  HCG1  H  HCH2  0   0.205   -9.9183  -4.2078   1.7703
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 PEU  HCF2  H  HCH2  0   0.204   -9.8252  -2.3849  -0.6864
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 PEU  HCD2  H  HCH2  0   0.207   -8.0692  -0.7615  -0.5499
 PEU  HCC1  H  HCH2  0   0.207   -6.1501   0.1129   0.5192
 PEU  HCC2  H  HCH2  0   0.205   -7.4746   0.1522   1.6851
 PEU  HCA1  H  HCH2  0   0.205   -4.5321   0.0758   2.2640
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 PEU  HBX1  H  HCH2  0   0.205   -2.1053  -2.4554   4.4622
 PEU  HBX2  H  HCH2  0   0.207   -3.3460  -3.7111   4.4785
 PEU  HBW1  H  HCH2  0   0.207   -1.3418  -4.6404   3.5988
 PEU  HBW2  H  HCH2  0   0.205   -2.5498  -4.5901   2.3127
 PEU  HBU1  H  HCH2  0   0.205    0.4659  -4.5896   1.9743
 PEU  HBU2  H  HCH2  0   0.207   -0.7588  -4.6315   0.7039
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 PEU  HBT2  H  HCH2  0   0.205   -0.0126  -2.4345  -0.1465
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 PEU  HBR2  H  HCH2  0   0.207    1.6673  -0.7359  -0.1190
 PEU  HBQ1  H  HCH2  0   0.207    3.6258   0.2252   0.7973
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 PEU  HBO2  H  HCH2  0   0.207    4.2503  -0.0893   3.7709
 PEU  HBN1  H  HCH2  0   0.207    6.3949  -0.8726   4.4065
 PEU  HBN2  H  HCH2  0   0.205    5.3658  -2.2865   4.1645
 PEU  HBL1  H  HCH2  0   0.205    8.3701  -2.1949   3.9553
 PEU  HBL2  H  HCH2  0   0.207    7.3588  -3.6244   3.7348
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 PEU  HDC2  H  HCH2  0   0.204   31.4234   5.5085  -1.8429
 PEU  HDD1  H  HCH2  0   0.201   33.6303   5.6351  -1.0315
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 PEU  HDE   H  HOH1  0   0.455   35.0791   3.8470  -1.4730

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
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 PEU  OAT  CAU   single  1.405  0.020  1.405
 PEU  CAU  CAV   single  1.506  0.020  1.506
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loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
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 PEU  HBE2  CBE  HBE1  106.74  3.000
 PEU  HBE2  CBE  OBD   111.07  3.000
 PEU  HBE1  CBE  OBD   111.16  3.000
 PEU  HBE2  CBE  CBF   109.97  3.000
 PEU  HBE1  CBE  CBF   108.12  3.000
 PEU  OBD   CBE  CBF   109.70  3.000
 PEU  CCH   OBD  CBE   112.77  3.000
 PEU  HCH2  CCH  HCH1  106.76  3.000
 PEU  HCH2  CCH  CCI   108.22  3.000
 PEU  HCH1  CCH  CCI   109.97  3.000
 PEU  HCH2  CCH  OBD   111.07  3.000
 PEU  HCH1  CCH  OBD   111.07  3.000
 PEU  CCI   CCH  OBD   109.67  3.000
 PEU  HCI2  CCI  HCI1  106.75  3.000
 PEU  HCI2  CCI  OCJ   111.04  3.000
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 PEU  HCI2  CCI  CCH   109.92  3.000
 PEU  HCI1  CCI  CCH   108.27  3.000
 PEU  OCJ   CCI  CCH   109.70  3.000
 PEU  CCK   OCJ  CCI   112.77  3.000
 PEU  HCK2  CCK  HCK1  106.78  3.000
 PEU  HCK2  CCK  CCL   108.13  3.000
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 PEU  HCL2  CCL  HCL1  106.83  3.000
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 PEU  HCL1  CCL  OCM   111.19  3.000
 PEU  HCL2  CCL  CCK   109.93  3.000
 PEU  HCL1  CCL  CCK   108.10  3.000
 PEU  OCM   CCL  CCK   109.68  3.000
 PEU  CCN   OCM  CCL   112.88  3.000
 PEU  HCN2  CCN  HCN1  106.82  3.000
 PEU  HCN2  CCN  CCO   108.11  3.000
 PEU  HCN1  CCN  CCO   109.96  3.000
 PEU  HCN2  CCN  OCM   111.14  3.000
 PEU  HCN1  CCN  OCM   111.09  3.000
 PEU  CCO   CCN  OCM   109.63  3.000
 PEU  HCO2  CCO  HCO1  106.80  3.000
 PEU  HCO2  CCO  OCP   111.02  3.000
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 PEU  HCO1  CCO  CCN   108.23  3.000
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 PEU  CCQ   OCP  CCO   112.80  3.000
 PEU  HCQ2  CCQ  HCQ1  106.74  3.000
 PEU  HCQ2  CCQ  CCR   108.27  3.000
 PEU  HCQ1  CCQ  CCR   109.94  3.000
 PEU  HCQ2  CCQ  OCP   111.05  3.000
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 PEU  CCR   CCQ  OCP   109.66  3.000
 PEU  HCR2  CCR  HCR1  106.76  3.000
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 PEU  OCS   CCR  CCQ   109.70  3.000
 PEU  CCT   OCS  CCR   112.75  3.000
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 PEU  HCU2  CCU  OCV   111.07  3.000
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 PEU  HCW2  CCW  HCW1  106.81  3.000
 PEU  HCW2  CCW  CCX   108.16  3.000
 PEU  HCW1  CCW  CCX   109.98  3.000
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 PEU  HCX1  CCX  CCW   108.23  3.000
 PEU  OCY   CCX  CCW   109.67  3.000
 PEU  CCZ   OCY  CCX   112.86  3.000
 PEU  HCZ2  CCZ  HCZ1  106.76  3.000
 PEU  HCZ2  CCZ  CDA   108.08  3.000
 PEU  HCZ1  CCZ  CDA   110.04  3.000
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 PEU  CDA   CCZ  OCY   109.68  3.000
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 PEU  HDC2  CDC  HDC1  106.73  3.000
 PEU  HDC2  CDC  CDD   108.13  3.000
 PEU  HDC1  CDC  CDD   109.88  3.000
 PEU  HDC2  CDC  ODB   110.97  3.000
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 PEU  CDD   CDC  ODB   110.01  3.000
 PEU  HDD2  CDD  HDD1  106.76  3.000
 PEU  HDD2  CDD  ODE   111.79  3.000
 PEU  HDD1  CDD  ODE   111.92  3.000
 PEU  HDD2  CDD  CDC   109.31  3.000
 PEU  HDD1  CDD  CDC   107.31  3.000
 PEU  ODE   CDD  CDC   109.60  3.000
 PEU  HDE   ODE  CDD   108.03  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 PEU  Var_01  CAD   CAC  OAB  CAA  -179.61  30.0  3
 PEU  Var_02  OAE   CAD  CAC  OAB    65.41  30.0  3
 PEU  Var_03  CAG   CAF  OAE  CAD   179.66  30.0  3
 PEU  Var_04  OAH   CAG  CAF  OAE    64.28  30.0  3
 PEU  Var_05  CAJ   CAI  OAH  CAG   175.10  30.0  3
 PEU  Var_06  OAK   CAJ  CAI  OAH    64.27  30.0  3
 PEU  Var_07  CAM   CAL  OAK  CAJ   176.40  30.0  3
 PEU  Var_08  OAN   CAM  CAL  OAK    65.38  30.0  3
 PEU  Var_09  CAP   CAO  OAN  CAM  -179.03  30.0  3
 PEU  Var_10  OAQ   CAP  CAO  OAN    65.37  30.0  3
 PEU  Var_11  CAS   CAR  OAQ  CAP   178.38  30.0  3
 PEU  Var_12  OAT   CAS  CAR  OAQ    63.66  30.0  3
 PEU  Var_13  CAV   CAU  OAT  CAS   175.46  30.0  3
 PEU  Var_14  OAW   CAV  CAU  OAT    65.75  30.0  3
 PEU  Var_15  CAY   CAX  OAW  CAV  -179.96  30.0  3
 PEU  Var_16  OAZ   CAY  CAX  OAW    66.35  30.0  3
 PEU  Var_17  CBB   CBA  OAZ  CAY  -179.02  30.0  3
 PEU  Var_18  OBC   CBB  CBA  OAZ    64.11  30.0  3
 PEU  Var_19  CCF   CCG  OBC  CBB   175.97  30.0  3
 PEU  Var_20  OCE   CCF  CCG  OBC    66.14  30.0  3
 PEU  Var_21  CCC   CCD  OCE  CCF   179.96  30.0  3
 PEU  Var_22  OCB   CCC  CCD  OCE    66.13  30.0  3
 PEU  Var_23  CBZ   CCA  OCB  CCC  -179.78  30.0  3
 PEU  Var_24  OBY   CBZ  CCA  OCB    63.85  30.0  3
 PEU  Var_25  CBW   CBX  OBY  CBZ   177.03  30.0  3
 PEU  Var_26  OBV   CBW  CBX  OBY    63.57  30.0  3
 PEU  Var_27  CBT   CBU  OBV  CBW   176.31  30.0  3
 PEU  Var_28  OBS   CBT  CBU  OBV    64.23  30.0  3
 PEU  Var_29  CBQ   CBR  OBS  CBT   177.34  30.0  3
 PEU  Var_30  OBP   CBQ  CBR  OBS    66.11  30.0  3
 PEU  Var_31  CBN   CBO  OBP  CBQ  -176.92  30.0  3
 PEU  Var_32  OBM   CBN  CBO  OBP    66.04  30.0  3
 PEU  Var_33  CBK   CBL  OBM  CBN   178.97  30.0  3
 PEU  Var_34  OBJ   CBK  CBL  OBM    64.52  30.0  3
 PEU  Var_35  CBH   CBI  OBJ  CBK   178.33  30.0  3
 PEU  Var_36  OBG   CBH  CBI  OBJ    67.48  30.0  3
 PEU  Var_37  CBE   CBF  OBG  CBH  -176.90  30.0  3
 PEU  Var_38  OBD   CBE  CBF  OBG    66.18  30.0  3
 PEU  Var_39  CCI   CCH  OBD  CBE   179.75  30.0  3
 PEU  Var_40  OCJ   CCI  CCH  OBD    65.60  30.0  3
 PEU  Var_41  CCL   CCK  OCJ  CCI  -179.01  30.0  3
 PEU  Var_42  OCM   CCL  CCK  OCJ    65.64  30.0  3
 PEU  Var_43  CCO   CCN  OCM  CCL   178.19  30.0  3
 PEU  Var_44  OCP   CCO  CCN  OCM    65.25  30.0  3
 PEU  Var_45  CCR   CCQ  OCP  CCO   179.27  30.0  3
 PEU  Var_46  OCS   CCR  CCQ  OCP    66.51  30.0  3
 PEU  Var_47  CCU   CCT  OCS  CCR  -177.70  30.0  3
 PEU  Var_48  OCV   CCU  CCT  OCS    65.50  30.0  3
 PEU  Var_49  CCX   CCW  OCV  CCU   179.33  30.0  3
 PEU  Var_50  OCY   CCX  CCW  OCV    64.44  30.0  3
 PEU  Var_51  CDA   CCZ  OCY  CCX   177.59  30.0  3
 PEU  Var_52  ODB   CDA  CCZ  OCY    65.95  30.0  3
 PEU  Var_53  CDD   CDC  ODB  CDA   179.10  30.0  3
 PEU  Var_54  ODE   CDD  CDC  ODB    65.92  30.0  3
 PEU  Var_55  HAA1  CAA  OAB  CAC   178.43  30.0  3

