# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Mar 19 04:57:28 2022
#   Inital geometry file: a 53 line input string
#   Ligand name: quinolin-2(1H)-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O=C1Nc2ccccc2C=C1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 OCH  OCH  'quinolin-2(1H)-one       '  ligand  18  11  .  2022-03-23  2022-03-23
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_OCH
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 OCH  O1   O  OC    0  -0.494  -3.2463   0.7683  -0.0515
 OCH  N2   N  NR16  0  -0.750  -1.0022   1.0554  -0.0464
 OCH  C3   C  CR66  0   0.392   0.2927   0.6034  -0.0374
 OCH  C4   C  CR16  0  -0.313   1.3671   1.4977  -0.0393
 OCH  C5   C  CR16  0  -0.256   2.6569   1.0100  -0.0300
 OCH  C6   C  CR16  0  -0.261   2.9069  -0.3664  -0.0189
 OCH  C7   C  CR16  0  -0.317   1.8489  -1.2486  -0.0162
 OCH  C8   C  CR66  0   0.018   0.5286  -0.7797  -0.0258
 OCH  C9   C  CR16  0  -0.131  -0.6105  -1.6480  -0.0237
 OCH  C10  C  CR16  0  -0.455  -1.8659  -1.1595  -0.0323
 OCH  C1   C  CR6   0   0.522  -2.1267   0.2706  -0.0441
 OCH  HN2  H  HNR6  0   0.414  -1.1524   2.0562  -0.0532
 OCH  H4   H  HCR6  0   0.277   1.1838   2.5649  -0.0478
 OCH  H5   H  HCR6  0   0.269   3.4844   1.7069  -0.0305
 OCH  H6   H  HCR6  0   0.262   3.9245  -0.7324  -0.0122
 OCH  H7   H  HCR6  0   0.265   2.0225  -2.3176  -0.0070
 OCH  H9   H  HCR6  0   0.279  -0.4455  -2.7189  -0.0152
 OCH  H10  H  HCR6  0   0.278  -2.7234  -1.8179  -0.0310

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 OCH  O1   C1   double    1.225  0.020  1.225
 OCH  N2   C3   aromatic  1.372  0.020  1.372
 OCH  N2   C1   aromatic  1.371  0.020  1.371
 OCH  N2   HN2  single    0.860  0.020  1.020
 OCH  C3   C4   aromatic  1.398  0.020  1.398
 OCH  C3   C8   aromatic  1.403  0.020  1.403
 OCH  C4   C5   aromatic  1.379  0.020  1.379
 OCH  C4   H4   single    0.930  0.020  1.080
 OCH  C5   C6   aromatic  1.399  0.020  1.399
 OCH  C5   H5   single    0.930  0.020  1.080
 OCH  C6   C7   aromatic  1.377  0.020  1.377
 OCH  C6   H6   single    0.930  0.020  1.080
 OCH  C7   C8   aromatic  1.401  0.020  1.401
 OCH  C7   H7   single    0.930  0.020  1.080
 OCH  C8   C9   aromatic  1.432  0.020  1.432
 OCH  C9   C10  aromatic  1.347  0.020  1.347
 OCH  C9   H9   single    0.930  0.020  1.080
 OCH  C10  C1   aromatic  1.454  0.020  1.454
 OCH  C10  H10  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 OCH  HN2  N2   C1   116.38  3.000
 OCH  HN2  N2   C3   117.78  3.000
 OCH  C1   N2   C3   125.84  3.000
 OCH  C8   C3   C4   120.10  3.000
 OCH  C8   C3   N2   118.92  3.000
 OCH  C4   C3   N2   120.98  3.000
 OCH  H4   C4   C5   120.45  3.000
 OCH  H4   C4   C3   120.03  3.000
 OCH  C5   C4   C3   119.51  3.000
 OCH  H5   C5   C6   119.81  3.000
 OCH  H5   C5   C4   119.19  3.000
 OCH  C6   C5   C4   121.01  3.000
 OCH  H6   C6   C7   120.40  3.000
 OCH  H6   C6   C5   120.07  3.000
 OCH  C7   C6   C5   119.53  3.000
 OCH  H7   C7   C8   118.77  3.000
 OCH  H7   C7   C6   120.60  3.000
 OCH  C8   C7   C6   120.63  3.000
 OCH  C9   C8   C7   123.13  3.000
 OCH  C9   C8   C3   117.64  3.000
 OCH  C7   C8   C3   119.23  3.000
 OCH  H9   C9   C10  120.02  3.000
 OCH  H9   C9   C8   118.56  3.000
 OCH  C10  C9   C8   121.42  3.000
 OCH  H10  C10  C1   117.18  3.000
 OCH  H10  C10  C9   121.22  3.000
 OCH  C1   C10  C9   121.60  3.000
 OCH  C10  C1   N2   114.58  3.000
 OCH  C10  C1   O1   124.30  3.000
 OCH  N2   C1   O1   121.12  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 OCH  CONST_01  C5   C4   C3  N2  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_02  C7   C8   C3  N2  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_03  C9   C8   C3  N2    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_04  C9   C10  C1  N2    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_05  C10  C1   N2  C3    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_06  C6   C5   C4  C3    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_07  C6   C7   C8  C3    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_08  C10  C9   C8  C3    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_09  C1   N2   C3  C4  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_10  C7   C8   C3  C4    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_11  C9   C8   C3  C4  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_12  C7   C6   C5  C4    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_13  C8   C3   C4  C5    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_14  C8   C7   C6  C5    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_15  C9   C8   C7  C6  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_16  C10  C9   C8  C7  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_17  C1   N2   C3  C8    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_18  C1   C10  C9  C8    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_19  C3   N2   C1  O1  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_20  C9   C10  C1  O1  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_21  H4   C4   C3  N2    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_22  H10  C10  C1  N2  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_23  H5   C5   C4  C3  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_24  H7   C7   C8  C3  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_25  H9   C9   C8  C3  180.00  0.0  0
 OCH  CONST_26  HN2  N2   C3  C4    0.00  0.0  0
 OCH  CONST_27  H6   C6   C5  C4  180.00  0.0  0

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 OCH  plan-1  O1   0.020
 OCH  plan-1  N2   0.020
 OCH  plan-1  C3   0.020
 OCH  plan-1  C4   0.020
 OCH  plan-1  C5   0.020
 OCH  plan-1  C6   0.020
 OCH  plan-1  C7   0.020
 OCH  plan-1  C8   0.020
 OCH  plan-1  C9   0.020
 OCH  plan-1  C10  0.020
 OCH  plan-1  C1   0.020
 OCH  plan-1  HN2  0.020
 OCH  plan-1  H4   0.020
 OCH  plan-1  H5   0.020
 OCH  plan-1  H6   0.020
 OCH  plan-1  H7   0.020
 OCH  plan-1  H9   0.020
 OCH  plan-1  H10  0.020

