# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sun Apr 26 11:37:44 2020
#   Inital geometry file: a 143 line input string
#   Ligand name: N-(4-{[4-(pyrazin-2-yl)piperazin-1-yl]carbonyl}phenyl)quinoline-8-sulfonamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O=C(N1CCN(CC1)c2cnccn2)c3ccc(N[S](=O)(=O)c4cccc5cccnc45)cc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 NZT  NZT  N-(4-{[4-(pyrazin-2-yl)piperazin-1-yl]carbonyl}phenyl)quinoline-8-sulfonamide  ligand  56  34  .  2021-08-15  2021-08-15  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_NZT
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 NZT  CAI  C  CR16  0  -0.252   2.6359   1.3776   1.8293
 NZT  CAE  C  CR16  0  -0.246   1.9763   2.5898   1.5499
 NZT  CAO  C  CR16  0  -0.290   2.1548   3.2106   0.3454
 NZT  CBD  C  CR66  0   0.080   2.9923   2.6403  -0.6390
 NZT  CAN  C  CR16  0  -0.173   3.1978   3.2334  -1.9031
 NZT  CAD  C  CR16  0  -0.325   4.0090   2.6115  -2.8090
 NZT  CAF  C  CR16  0  -0.058   4.6086   1.3891  -2.4486
 NZT  NAW  N  N     0  -0.457   4.4470   0.8136  -1.2850
 NZT  CBE  C  CR66  0   0.299   3.6600   1.4219  -0.3735
 NZT  CBC  C  CR6   0  -0.256   3.4626   0.8160   0.8941
 NZT  S1   S  S     0   1.364   4.3099  -0.6942   1.2780
 NZT  OAB  O  OS    0  -0.644   5.7391  -0.5216   1.1066
 NZT  OAC  O  OS    0  -0.636   3.8026  -1.1641   2.5543
 NZT  NAX  N  NC1   0  -0.795   3.8353  -1.7866   0.1080
 NZT  CAZ  C  CR6   0   0.275   2.4463  -2.0042  -0.0711
 NZT  CAJ  C  CR16  0  -0.273   1.8219  -1.5631  -1.2338
 NZT  CAL  C  CR16  0  -0.252   0.4639  -1.7630  -1.4115
 NZT  CAK  C  CR16  0  -0.254   1.7065  -2.6739   0.8986
 NZT  CAM  C  CR16  0  -0.271   0.3488  -2.8738   0.7121
 NZT  CBA  C  CR6   0  -0.079  -0.2881  -2.4014  -0.4305
 NZT  CAY  C  C     0   0.521  -1.7407  -2.6899  -0.6330
 NZT  OAA  O  O     0  -0.481  -2.1491  -3.8382  -0.5298
 NZT  NBF  N  NT    0  -0.454  -2.5350  -1.6512  -0.9739
 NZT  CAQ  C  CH2   0  -0.325  -2.2405  -0.2525  -0.7223
 NZT  CAS  C  CH2   0  -0.288  -3.1387   0.2913   0.3771
 NZT  CAR  C  CH2   0  -0.318  -3.9287  -1.8604  -1.3098
 NZT  CAT  C  CH2   0  -0.304  -4.8514  -1.3290  -0.2252
 NZT  NBG  N  NT    0  -0.516  -4.5395   0.0562   0.0739
 NZT  CBB  C  CR6   0   0.503  -5.4878   0.9176   0.5468
 NZT  NAV  N  N     0  -0.435  -5.0792   2.0861   1.0351
 NZT  CAH  C  CR16  0  -0.098  -5.9943   2.9491   1.4518
 NZT  CAG  C  CR16  0  -0.151  -7.3455   2.6716   1.4052
 NZT  NAU  N  N     0  -0.343  -7.7697   1.4991   0.9359
 NZT  CAP  C  CR16  0  -0.172  -6.8757   0.6319   0.5174
 NZT  H1   H  HCR6  0   0.293   2.4804   0.9013   2.7871
 NZT  H2   H  HCR6  0   0.281   1.3292   3.0231   2.2994
 NZT  H3   H  HCR6  0   0.280   1.6535   4.1457   0.1289
 NZT  H4   H  HCR6  0   0.285   2.7102   4.1709  -2.1390
 NZT  H5   H  HCR6  0   0.283   4.1907   3.0310  -3.7883
 NZT  H6   H  HCR6  0   0.279   5.2428   0.8732  -3.1604
 NZT  H10  H  HCR6  0   0.270   2.3935  -1.0598  -2.0030
 NZT  H11  H  HCR6  0   0.276  -0.0059  -1.4115  -2.3215
 NZT  H12  H  HCR6  0   0.274   2.1886  -3.0539   1.7873
 NZT  H13  H  HCR6  0   0.268  -0.2171  -3.3996   1.4702
 NZT  H14  H  HCH2  0   0.275  -1.2062  -0.1200  -0.4165
 NZT  H15  H  HCH2  0   0.257  -2.3887   0.3187  -1.6428
 NZT  H16  H  HCH2  0   0.234  -2.8704  -0.1815   1.3310
 NZT  H17  H  HCH2  0   0.278  -2.9624   1.3581   0.4784
 NZT  H18  H  HCH2  0   0.259  -4.1373  -1.3369  -2.2469
 NZT  H19  H  HCH2  0   0.276  -4.1215  -2.9178  -1.4671
 NZT  H20  H  HCH2  0   0.271  -5.8686  -1.4254  -0.5953
 NZT  H21  H  HCH2  0   0.243  -4.7694  -1.9504   0.6757
 NZT  H22  H  HCR6  0   0.267  -5.6346   3.8946   1.8414
 NZT  H23  H  HCR6  0   0.265  -8.0856   3.3827   1.7487
 NZT  H24  H  HCR6  0   0.269  -7.2606  -0.3091   0.1485
 NZT  H7   H  HNC1  0   0.421   4.3168  -1.5607  -0.7597

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 NZT  CAN  CAD  aromatic  1.366  0.020  1.366
 NZT  CAN  CBD  aromatic  1.411  0.020  1.411
 NZT  CAD  CAF  aromatic  1.408  0.020  1.408
 NZT  CAO  CBD  aromatic  1.413  0.020  1.413
 NZT  CAO  CAE  aromatic  1.367  0.020  1.367
 NZT  CBD  CBE  aromatic  1.415  0.020  1.415
 NZT  CAG  CAH  aromatic  1.380  0.020  1.380
 NZT  CAG  NAU  aromatic  1.332  0.020  1.332
 NZT  CAE  CAI  aromatic  1.408  0.020  1.408
 NZT  CAH  NAV  aromatic  1.325  0.020  1.325
 NZT  CAF  NAW  aromatic  1.308  0.020  1.308
 NZT  NAU  CAP  aromatic  1.314  0.020  1.314
 NZT  CBE  NAW  aromatic  1.349  0.020  1.349
 NZT  CBE  CBC  aromatic  1.419  0.020  1.419
 NZT  CAI  CBC  aromatic  1.369  0.020  1.369
 NZT  NAV  CBB  aromatic  1.331  0.020  1.331
 NZT  CAP  CBB  aromatic  1.417  0.020  1.417
 NZT  CBB  NBG  single    1.366  0.020  1.366
 NZT  CAS  NBG  single    1.452  0.020  1.452
 NZT  CAS  CAQ  single    1.520  0.020  1.520
 NZT  S1   OAC  double    1.452  0.020  1.452
 NZT  S1   NAX  single    1.670  0.020  1.670
 NZT  S1   OAB  double    1.450  0.020  1.450
 NZT  NBG  CAT  single    1.451  0.020  1.451
 NZT  CAQ  NBF  single    1.451  0.020  1.451
 NZT  CAK  CAM  aromatic  1.385  0.020  1.385
 NZT  CAK  CAZ  aromatic  1.391  0.020  1.391
 NZT  NAX  CAZ  single    1.417  0.020  1.417
 NZT  CAM  CBA  aromatic  1.391  0.020  1.391
 NZT  CAZ  CAJ  aromatic  1.392  0.020  1.392
 NZT  CAT  CAR  single    1.520  0.020  1.520
 NZT  NBF  CAR  single    1.449  0.020  1.449
 NZT  NBF  CAY  single    1.351  0.020  1.351
 NZT  CBA  CAY  single    1.495  0.020  1.495
 NZT  CBA  CAL  aromatic  1.391  0.020  1.391
 NZT  CAJ  CAL  aromatic  1.384  0.020  1.384
 NZT  CAY  OAA  double    1.223  0.020  1.223
 NZT  S1   CBC  single    1.774  0.020  1.774
 NZT  CAI  H1   single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAE  H2   single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAO  H3   single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAN  H4   single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAD  H5   single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAF  H6   single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAJ  H10  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAL  H11  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAK  H12  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAM  H13  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAQ  H14  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAQ  H15  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAS  H16  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAS  H17  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAR  H18  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAR  H19  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAT  H20  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAT  H21  single    0.970  0.020  1.090
 NZT  CAH  H22  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAG  H23  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  CAP  H24  single    0.930  0.020  1.080
 NZT  NAX  H7   single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 NZT  H1   CAI  CBC  120.77  3.000
 NZT  H1   CAI  CAE  119.20  3.000
 NZT  CBC  CAI  CAE  120.04  3.000
 NZT  H2   CAE  CAO  120.48  3.000
 NZT  H2   CAE  CAI  119.21  3.000
 NZT  CAO  CAE  CAI  120.31  3.000
 NZT  H3   CAO  CBD  118.93  3.000
 NZT  H3   CAO  CAE  120.53  3.000
 NZT  CBD  CAO  CAE  120.54  3.000
 NZT  CBE  CBD  CAN  117.47  3.000
 NZT  CBE  CBD  CAO  119.79  3.000
 NZT  CAN  CBD  CAO  122.74  3.000
 NZT  H4   CAN  CAD  121.15  3.000
 NZT  H4   CAN  CBD  119.56  3.000
 NZT  CAD  CAN  CBD  119.29  3.000
 NZT  H5   CAD  CAF  119.81  3.000
 NZT  H5   CAD  CAN  121.61  3.000
 NZT  CAF  CAD  CAN  118.57  3.000
 NZT  H6   CAF  NAW  116.54  3.000
 NZT  H6   CAF  CAD  119.61  3.000
 NZT  NAW  CAF  CAD  123.84  3.000
 NZT  CBE  NAW  CAF  118.34  3.000
 NZT  CBC  CBE  NAW  119.49  3.000
 NZT  CBC  CBE  CBD  118.03  3.000
 NZT  NAW  CBE  CBD  122.48  3.000
 NZT  S1   CBC  CBE  119.38  3.000
 NZT  S1   CBC  CAI  119.34  3.000
 NZT  CBE  CBC  CAI  121.28  3.000
 NZT  NAX  S1   OAC  107.76  3.000
 NZT  NAX  S1   OAB  105.98  3.000
 NZT  OAC  S1   OAB  119.15  3.000
 NZT  OAB  S1   CBC  110.12  3.000
 NZT  NAX  S1   CBC  105.64  3.000
 NZT  OAC  S1   CBC  107.40  3.000
 NZT  H7   NAX  CAZ  112.95  3.000
 NZT  H7   NAX  S1   108.52  3.000
 NZT  CAZ  NAX  S1   117.88  3.000
 NZT  CAK  CAZ  CAJ  119.76  3.000
 NZT  CAJ  CAZ  NAX  119.78  3.000
 NZT  CAK  CAZ  NAX  120.45  3.000
 NZT  H10  CAJ  CAL  119.61  3.000
 NZT  H10  CAJ  CAZ  120.28  3.000
 NZT  CAL  CAJ  CAZ  120.12  3.000
 NZT  H11  CAL  CBA  120.47  3.000
 NZT  H11  CAL  CAJ  119.12  3.000
 NZT  CBA  CAL  CAJ  120.40  3.000
 NZT  H12  CAK  CAM  119.84  3.000
 NZT  H12  CAK  CAZ  120.36  3.000
 NZT  CAM  CAK  CAZ  119.79  3.000
 NZT  H13  CAM  CBA  120.07  3.000
 NZT  H13  CAM  CAK  119.23  3.000
 NZT  CBA  CAM  CAK  120.70  3.000
 NZT  CAY  CBA  CAM  119.39  3.000
 NZT  CAY  CBA  CAL  121.22  3.000
 NZT  CAM  CBA  CAL  119.19  3.000
 NZT  NBF  CAY  OAA  123.14  3.000
 NZT  OAA  CAY  CBA  119.62  3.000
 NZT  NBF  CAY  CBA  117.19  3.000
 NZT  CAR  NBF  CAQ  112.00  3.000
 NZT  CAR  NBF  CAY  120.86  3.000
 NZT  CAQ  NBF  CAY  125.29  3.000
 NZT  H15  CAQ  H14  107.59  3.000
 NZT  H15  CAQ  CAS  109.99  3.000
 NZT  H14  CAQ  CAS  108.37  3.000
 NZT  H15  CAQ  NBF  109.27  3.000
 NZT  H14  CAQ  NBF  111.07  3.000
 NZT  CAS  CAQ  NBF  110.50  3.000
 NZT  H17  CAS  H16  107.59  3.000
 NZT  H17  CAS  NBG  109.57  3.000
 NZT  H16  CAS  NBG  110.32  3.000
 NZT  H17  CAS  CAQ  108.84  3.000
 NZT  H16  CAS  CAQ  109.27  3.000
 NZT  NBG  CAS  CAQ  111.16  3.000
 NZT  H19  CAR  H18  107.94  3.000
 NZT  H19  CAR  CAT  109.62  3.000
 NZT  H18  CAR  CAT  109.17  3.000
 NZT  H19  CAR  NBF  110.17  3.000
 NZT  H18  CAR  NBF  108.25  3.000
 NZT  CAT  CAR  NBF  111.60  3.000
 NZT  H21  CAT  H20  107.42  3.000
 NZT  H21  CAT  NBG  110.81  3.000
 NZT  H20  CAT  NBG  110.86  3.000
 NZT  H21  CAT  CAR  110.03  3.000
 NZT  H20  CAT  CAR  107.11  3.000
 NZT  NBG  CAT  CAR  110.51  3.000
 NZT  CBB  NBG  CAT  121.62  3.000
 NZT  CAT  NBG  CAS  113.88  3.000
 NZT  CBB  NBG  CAS  119.70  3.000
 NZT  CAP  CBB  NAV  119.03  3.000
 NZT  CAP  CBB  NBG  123.07  3.000
 NZT  NAV  CBB  NBG  117.89  3.000
 NZT  CAH  NAV  CBB  118.38  3.000
 NZT  H22  CAH  CAG  120.82  3.000
 NZT  H22  CAH  NAV  116.87  3.000
 NZT  CAG  CAH  NAV  122.31  3.000
 NZT  H23  CAG  NAU  118.18  3.000
 NZT  H23  CAG  CAH  121.78  3.000
 NZT  NAU  CAG  CAH  120.04  3.000
 NZT  CAP  NAU  CAG  118.45  3.000
 NZT  H24  CAP  NAU  116.15  3.000
 NZT  H24  CAP  CBB  122.07  3.000
 NZT  NAU  CAP  CBB  121.78  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 NZT  CONST_01  CBD  CAO  CAE  CAI     0.00   0.0  0
 NZT  CONST_02  CBD  CBE  CBC  CAI     0.00   0.0  0
 NZT  CONST_03  NAW  CBE  CBC  CAI   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_04  CAN  CBD  CAO  CAE   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_05  CBE  CBD  CAO  CAE     0.00   0.0  0
 NZT  CONST_06  CBE  CBC  CAI  CAE     0.00   0.0  0
 NZT  CONST_07  CAD  CAN  CBD  CAO   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_08  NAW  CBE  CBD  CAO   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_09  CBC  CBE  CBD  CAO     0.00   0.0  0
 NZT  CONST_10  CBC  CAI  CAE  CAO     0.00   0.0  0
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 NZT  CONST_31  CAH  NAV  CBB  NBG   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_32  NAU  CAP  CBB  NBG   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_33  S1   CBC  CAI  CAE   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_34  S1   CBC  CBE  CBD   180.00   0.0  0
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 NZT  CONST_45  H5   CAD  CAN  CBD   180.00   0.0  0
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 NZT  CONST_49  H11  CAL  CAJ  CAZ   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_50  H12  CAK  CAZ  CAJ   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_51  H10  CAJ  CAZ  CAK   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_52  H24  CAP  CBB  NBG     0.00   0.0  0
 NZT  CONST_53  H22  CAH  NAV  CBB   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_54  H23  CAG  CAH  NAV   180.00   0.0  0
 NZT  CONST_56  CAR  NBF  CAY  OAA     0.00   0.0  0
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 NZT  Var_03    CBB  NBG  CAS  CAQ  -150.85  30.0  1
 NZT  Var_04    CAT  CAR  NBF  CAQ   -56.55  30.0  1
 NZT  Var_05    NAV  CBB  NBG  CAS    13.50  30.0  3
 NZT  Var_06    CAR  CAT  NBG  CAS   -52.46  30.0  1
 NZT  Var_07    CAR  NBF  CAQ  CAS    56.43  30.0  1
 NZT  Var_08    NBF  CAY  CBA  CAL   -53.75  30.0  2
 NZT  Var_09    OAC  S1   CBC  CAI     7.08  30.0  2
 NZT  Var_10    CAZ  NAX  S1   CBC   -54.78  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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