# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Mar 18 18:33:18 2022
#   Inital geometry file: a 61 line input string
#   Ligand name: 2-morpholin-4-ium-4-ylethanesulfonate
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: [O-][S](=O)(=O)CC[NH+]1CCOCC1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 MES  MES  2-morpholin-4-ium-4-ylethanesulfonate  ligand  25  12  .  2009-11-09  2022-03-22
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_MES
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 MES  O1   O  O2     0  -0.460   9.0173  45.4143  48.0628
 MES  C2   C  CH2    0  -0.208   7.7097  45.4461  48.5755
 MES  C3   C  CH2    0  -0.335   6.9684  46.6908  48.1311
 MES  N4   N  NT1    1  -0.535   7.7165  47.9174  48.5480
 MES  C5   C  CH2    0  -0.342   9.1304  47.8324  48.0703
 MES  C6   C  CH2    0  -0.203   9.7558  46.5224  48.5095
 MES  C7   C  CH2    0  -0.291   7.0114  49.1513  48.0802
 MES  C8   C  CH2    0  -0.676   7.6187  50.4171  48.6446
 MES  S    S  S      0   1.408   6.5945  51.8564  48.2316
 MES  O1S  O  OS     0  -0.752   6.5943  51.9067  46.7587
 MES  O2S  O  OS     0  -0.742   7.2819  52.9896  48.8702
 MES  O3S  O  OS    -1  -0.751   5.2688  51.5651  48.8064
 MES  H21  H  HCH2   0   0.277   7.1756  44.5737  48.1996
 MES  H22  H  HCH2   0   0.235   7.7145  45.3884  49.6729
 MES  H31  H  HCH2   0   0.302   6.8686  46.7339  47.0461
 MES  H32  H  HCH2   0   0.311   5.9789  46.7341  48.5827
 MES  HN4  H  HNT1   0   0.462   7.7275  47.9407  49.5729
 MES  H51  H  HCH2   0   0.302   9.1028  47.9219  46.9837
 MES  H52  H  HCH2   0   0.312   9.6890  48.6698  48.4830
 MES  H61  H  HCH2   0   0.235   9.8600  46.5113  49.6033
 MES  H62  H  HCH2   0   0.276  10.7554  46.4595  48.0800
 MES  H71  H  HCH2   0   0.302   7.0411  49.1380  46.9914
 MES  H72  H  HCH2   0   0.301   5.9766  49.0495  48.4047
 MES  H81  H  HCH2   0   0.283   7.6879  50.3657  49.7334
 MES  H82  H  HCH2   0   0.287   8.6139  50.6117  48.2440

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 MES  O1  C2   single  1.405  0.020  1.405
 MES  O1  C6   single  1.405  0.020  1.405
 MES  C2  C3   single  1.515  0.020  1.515
 MES  C2  H21  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C2  H22  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C3  N4   single  1.496  0.020  1.496
 MES  C3  H31  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C3  H32  single  0.970  0.020  1.090
 MES  N4  C5   single  1.495  0.020  1.495
 MES  N4  C7   single  1.496  0.020  1.496
 MES  N4  HN4  single  0.890  0.020  1.040
 MES  C5  C6   single  1.517  0.020  1.517
 MES  C5  H51  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C5  H52  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C6  H61  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C6  H62  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C7  C8   single  1.513  0.020  1.513
 MES  C7  H71  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C7  H72  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C8  S    single  1.814  0.020  1.814
 MES  C8  H81  single  0.970  0.020  1.090
 MES  C8  H82  single  0.970  0.020  1.090
 MES  S   O1S  deloc   1.474  0.020  1.474
 MES  S   O2S  deloc   1.471  0.020  1.471
 MES  S   O3S  deloc   1.474  0.020  1.474

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 MES  C6   O1  C2   110.82  3.000
 MES  H22  C2  H21  107.73  3.000
 MES  H22  C2  C3   109.76  3.000
 MES  H21  C2  C3   108.46  3.000
 MES  H22  C2  O1   111.05  3.000
 MES  H21  C2  O1   108.19  3.000
 MES  C3   C2  O1   111.52  3.000
 MES  H32  C3  H31  109.15  3.000
 MES  H32  C3  N4   107.84  3.000
 MES  H31  C3  N4   106.90  3.000
 MES  H32  C3  C2   110.83  3.000
 MES  H31  C3  C2   111.65  3.000
 MES  N4   C3  C2   110.31  3.000
 MES  HN4  N4  C7   107.39  3.000
 MES  HN4  N4  C5   108.10  3.000
 MES  C7   N4  C5   113.12  3.000
 MES  HN4  N4  C3   107.62  3.000
 MES  C7   N4  C3   110.69  3.000
 MES  C5   N4  C3   109.71  3.000
 MES  H52  C5  H51  109.14  3.000
 MES  H52  C5  C6   110.08  3.000
 MES  H51  C5  C6   111.70  3.000
 MES  H52  C5  N4   108.70  3.000
 MES  H51  C5  N4   106.84  3.000
 MES  C6   C5  N4   110.28  3.000
 MES  H62  C6  H61  107.74  3.000
 MES  H62  C6  C5   108.30  3.000
 MES  H61  C6  C5   109.64  3.000
 MES  H62  C6  O1   108.14  3.000
 MES  H61  C6  O1   111.01  3.000
 MES  C5   C6  O1   111.87  3.000
 MES  H72  C7  H71  108.82  3.000
 MES  H72  C7  C8   110.39  3.000
 MES  H71  C7  C8   111.85  3.000
 MES  H72  C7  N4   106.10  3.000
 MES  H71  C7  N4   106.83  3.000
 MES  C8   C7  N4   112.59  3.000
 MES  H82  C8  H81  108.47  3.000
 MES  H82  C8  S    106.86  3.000
 MES  H81  C8  S    107.46  3.000
 MES  H82  C8  C7   112.25  3.000
 MES  H81  C8  C7   110.97  3.000
 MES  S    C8  C7   110.62  3.000
 MES  O3S  S   O2S  113.78  3.000
 MES  O3S  S   O1S  113.35  3.000
 MES  O2S  S   O1S  114.05  3.000
 MES  O3S  S   C8   105.20  3.000
 MES  O2S  S   C8   104.39  3.000
 MES  O1S  S   C8   104.75  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 MES  Var_01  N4   C3  C2  O1   -57.21  30.0  1
 MES  Var_02  N4   C5  C6  O1    56.54  30.0  1
 MES  Var_03  C5   C6  O1  C2   -60.28  30.0  1
 MES  Var_04  S    C8  C7  N4  -172.26  30.0  3
 MES  Var_05  O1S  S   C8  C7   -61.35  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 MES  chir_01  N4  C3  C5  C7  negativ

