# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Apr 23 08:41:13 2020
#   Inital geometry file: a 135 line input string
#   Ligand name: 2-{[3-(aminomethyl)-2-(2-methylpropyl)-1-oxo-4-phenyl-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl]oxy}acetamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)CN1C(=O)c2ccc(OCC(N)=O)cc2C(=C1CN)c3ccccc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 LUI  LUI  2-{[3-(aminomethyl)-2-(2-methylpropyl)-1-oxo-4-phenyl-1,2-dihydroisoquinolin-6-yl]oxy}acetamide  ligand  53  28  .  2021-08-12  2021-08-12  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_LUI
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 LUI  C4    C  CR16  0  -0.464  -1.5142  -0.1730  -0.1390
 LUI  C5    C  CR6   0   0.361  -2.5272   0.7686  -0.1834
 LUI  C6    C  CR16  0  -0.322  -2.2291   2.1244  -0.3720
 LUI  C7    C  CR6   0   0.568   1.4941   2.0407  -0.5906
 LUI  C10   C  CR6   0  -0.064   0.9128  -0.7187  -0.2305
 LUI  C13   C  CR16  0  -0.274   0.1076  -4.3285  -1.0039
 LUI  C15   C  CR16  0  -0.226   0.1439  -4.0502   1.3803
 LUI  C20   C  CH1   0  -0.253   4.6514   1.6742   0.6255
 LUI  C21   C  CH3   0  -0.664   6.0158   2.2734   0.3006
 LUI  C22   C  CH3   0  -0.684   3.9172   2.5097   1.6680
 LUI  C26   C  C     0   0.460  -6.1317   0.4228   0.1945
 LUI  O28   O  O     0  -0.496  -6.1426  -0.7477   0.5141
 LUI  N27   N  NH2   0  -0.768  -7.2317   1.1692   0.0547
 LUI  C25   C  CH2   0  -0.303  -4.8483   1.1907  -0.0787
 LUI  O24   O  O2    0  -0.358  -3.7799   0.2913  -0.0320
 LUI  C1    C  CR16  0  -0.318  -0.9138   2.5098  -0.5001
 LUI  C3    C  CR66  0   0.217  -0.1783   0.2182  -0.2733
 LUI  C9    C  CR6   0   0.307   2.1925  -0.2776  -0.3516
 LUI  N18   N  NH2   0  -0.785   3.7562  -1.4363   1.1186
 LUI  N8    N  NR6   0  -0.549   2.4830   1.0663  -0.5244
 LUI  C19   C  CH2   0  -0.285   3.8582   1.5476  -0.6770
 LUI  O23   O  O     0  -0.552   1.7698   3.2153  -0.7673
 LUI  C2    C  CR66  0  -0.088   0.1198   1.5759  -0.4519
 LUI  C11   C  CR6   0   0.069   0.6019  -2.1609  -0.0570
 LUI  C16   C  CR16  0  -0.278   0.4508  -2.7063   1.2161
 LUI  C14   C  CR16  0  -0.280  -0.0230  -4.8647   0.2700
 LUI  C12   C  CR16  0  -0.300   0.4129  -2.9851  -1.1648
 LUI  H4    H  HCR6  0   0.258  -1.7679  -1.2152   0.0053
 LUI  H6    H  HCR6  0   0.296  -2.9991   2.8801  -0.4206
 LUI  H13   H  HCR6  0   0.247  -0.0276  -4.9575  -1.8736
 LUI  H15   H  HCR6  0   0.259   0.0297  -4.4583   2.3755
 LUI  H17   H  HCH2  0   0.270   2.9778  -2.2084  -0.7257
 LUI  H17A  H  HCH2  0   0.326   4.1810  -0.9577  -0.8468
 LUI  H20   H  HCH1  0   0.282   4.7974   0.6753   1.0448
 LUI  H21   H  HCH3  0   0.223   6.6402   2.3225   1.1925
 LUI  H21A  H  HCH3  0   0.210   6.5532   1.6774  -0.4397
 LUI  H21B  H  HCH3  0   0.239   5.9227   3.2876  -0.0949
 LUI  H22   H  HCH3  0   0.208   2.9750   2.0447   1.9599
 LUI  H22A  H  HCH3  0   0.240   4.5229   2.6080   2.5705
 LUI  H22B  H  HCH3  0   0.204   3.6968   3.5114   1.2966
 LUI  HN27  H  HNH2  0   0.406  -8.1382   0.7857   0.2568
 LUI  HN2A  H  HNH2  0   0.400  -7.2055   2.1397  -0.2003
 LUI  H25   H  HCH2  0   0.256  -4.9185   1.6885  -1.0537
 LUI  H25A  H  HCH2  0   0.201  -4.7533   1.9806   0.6777
 LUI  H1    H  HCR6  0   0.251  -0.6759   3.5549  -0.6411
 LUI  HN18  H  HNH2  0   0.363   3.0300  -1.8907   1.6565
 LUI  HN1A  H  HNH2  0   0.306   4.5628  -2.0458   1.1524
 LUI  H19   H  HCH2  0   0.284   3.7928   2.5245  -1.1523
 LUI  H19A  H  HCH2  0   0.254   4.3853   0.9028  -1.3798
 LUI  H16   H  HCR6  0   0.242   0.5473  -2.0653   2.0849
 LUI  H14   H  HCR6  0   0.264  -0.2606  -5.9123   0.3965
 LUI  H12   H  HCR6  0   0.251   0.5131  -2.5678  -2.1592
 LUI  C17   C  CH2   0  -0.411   3.3221  -1.2783  -0.2609

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 LUI  C4   C5    aromatic  1.384  0.020  1.384
 LUI  C4   C3    aromatic  1.398  0.020  1.398
 LUI  C5   C6    aromatic  1.401  0.020  1.401
 LUI  C5   O24   single    1.349  0.020  1.349
 LUI  C6   C1    aromatic  1.377  0.020  1.377
 LUI  C7   N8    single    1.390  0.020  1.390
 LUI  C7   O23   double    1.219  0.020  1.219
 LUI  C7   C2    single    1.457  0.020  1.457
 LUI  C10  C3    single    1.439  0.020  1.439
 LUI  C10  C9    double    1.359  0.020  1.359
 LUI  C10  C11   single    1.486  0.020  1.486
 LUI  C13  C14   aromatic  1.388  0.020  1.388
 LUI  C13  C12   aromatic  1.387  0.020  1.387
 LUI  C15  C16   aromatic  1.388  0.020  1.388
 LUI  C15  C14   aromatic  1.387  0.020  1.387
 LUI  C17  C9    single    1.512  0.020  1.512
 LUI  C17  N18   single    1.455  0.020  1.455
 LUI  C20  C21   single    1.525  0.020  1.525
 LUI  C20  C22   single    1.525  0.020  1.525
 LUI  C20  C19   single    1.530  0.020  1.530
 LUI  C26  O28   double    1.213  0.020  1.213
 LUI  C26  N27   single    1.337  0.020  1.337
 LUI  C26  C25   single    1.520  0.020  1.520
 LUI  C25  O24   single    1.397  0.020  1.397
 LUI  C1   C2    aromatic  1.394  0.020  1.394
 LUI  C3   C2    aromatic  1.402  0.020  1.402
 LUI  C9   N8    single    1.386  0.020  1.386
 LUI  N8   C19   single    1.465  0.020  1.465
 LUI  C11  C16   aromatic  1.393  0.020  1.393
 LUI  C11  C12   aromatic  1.394  0.020  1.394
 LUI  C4   H4    single    0.930  0.020  1.080
 LUI  C6   H6    single    0.930  0.020  1.080
 LUI  C13  H13   single    0.930  0.020  1.080
 LUI  C15  H15   single    0.930  0.020  1.080
 LUI  C17  H17   single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C17  H17A  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C20  H20   single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C21  H21   single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C21  H21A  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C21  H21B  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C22  H22   single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C22  H22A  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C22  H22B  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  N27  HN27  single    0.860  0.020  1.020
 LUI  N27  HN2A  single    0.860  0.020  1.020
 LUI  C25  H25   single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C25  H25A  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C1   H1    single    0.930  0.020  1.080
 LUI  N18  HN18  single    0.890  0.020  1.040
 LUI  N18  HN1A  single    0.890  0.020  1.040
 LUI  C19  H19   single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C19  H19A  single    0.970  0.020  1.090
 LUI  C16  H16   single    0.930  0.020  1.080
 LUI  C14  H14   single    0.930  0.020  1.080
 LUI  C12  H12   single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 LUI  H4    C4   C3    120.40  3.000
 LUI  H4    C4   C5    119.21  3.000
 LUI  C3    C4   C5    120.39  3.000
 LUI  O24   C5   C6    123.72  3.000
 LUI  O24   C5   C4    115.81  3.000
 LUI  C6    C5   C4    120.47  3.000
 LUI  H6    C6   C1    118.76  3.000
 LUI  H6    C6   C5    122.11  3.000
 LUI  C1    C6   C5    119.13  3.000
 LUI  C2    C7   O23   122.29  3.000
 LUI  C2    C7   N8    116.28  3.000
 LUI  O23   C7   N8    121.42  3.000
 LUI  C11   C10  C9    121.51  3.000
 LUI  C11   C10  C3    118.48  3.000
 LUI  C9    C10  C3    120.01  3.000
 LUI  H13   C13  C12   119.83  3.000
 LUI  H13   C13  C14   120.09  3.000
 LUI  C12   C13  C14   120.08  3.000
 LUI  H15   C15  C14   120.15  3.000
 LUI  H15   C15  C16   119.83  3.000
 LUI  C14   C15  C16   120.03  3.000
 LUI  H20   C20  C19   108.67  3.000
 LUI  H20   C20  C22   107.63  3.000
 LUI  C19   C20  C22   112.19  3.000
 LUI  H20   C20  C21   108.74  3.000
 LUI  C19   C20  C21   108.36  3.000
 LUI  C22   C20  C21   111.17  3.000
 LUI  H21B  C21  H21A  107.65  3.000
 LUI  H21B  C21  H21   107.65  3.000
 LUI  H21A  C21  H21   107.31  3.000
 LUI  H21B  C21  C20   111.44  3.000
 LUI  H21A  C21  C20   111.73  3.000
 LUI  H21   C21  C20   110.85  3.000
 LUI  H22B  C22  H22A  108.13  3.000
 LUI  H22B  C22  H22   107.94  3.000
 LUI  H22A  C22  H22   107.25  3.000
 LUI  H22B  C22  C20   111.57  3.000
 LUI  H22A  C22  C20   110.34  3.000
 LUI  H22   C22  C20   111.43  3.000
 LUI  C25   C26  N27   113.20  3.000
 LUI  C25   C26  O28   122.82  3.000
 LUI  N27   C26  O28   123.98  3.000
 LUI  HN2A  N27  HN27  116.34  3.000
 LUI  HN2A  N27  C26   123.03  3.000
 LUI  HN27  N27  C26   120.54  3.000
 LUI  H25A  C25  H25   106.95  3.000
 LUI  H25A  C25  O24   111.96  3.000
 LUI  H25   C25  O24   111.76  3.000
 LUI  H25A  C25  C26   108.22  3.000
 LUI  H25   C25  C26   109.56  3.000
 LUI  O24   C25  C26   108.32  3.000
 LUI  C25   O24  C5    118.58  3.000
 LUI  H1    C1   C2    119.28  3.000
 LUI  H1    C1   C6    119.54  3.000
 LUI  C2    C1   C6    121.18  3.000
 LUI  C2    C3   C10   118.25  3.000
 LUI  C2    C3   C4    119.11  3.000
 LUI  C10   C3   C4    122.65  3.000
 LUI  N8    C9   C17   119.53  3.000
 LUI  N8    C9   C10   121.55  3.000
 LUI  C17   C9   C10   118.91  3.000
 LUI  HN1A  N18  HN18  106.49  3.000
 LUI  HN1A  N18  C17   109.57  3.000
 LUI  HN18  N18  C17   109.81  3.000
 LUI  C19   N8   C9    121.90  3.000
 LUI  C19   N8   C7    115.63  3.000
 LUI  C9    N8   C7    122.46  3.000
 LUI  H19A  C19  H19   106.17  3.000
 LUI  H19A  C19  N8    109.07  3.000
 LUI  H19   C19  N8    106.50  3.000
 LUI  H19A  C19  C20   110.31  3.000
 LUI  H19   C19  C20   109.18  3.000
 LUI  N8    C19  C20   115.16  3.000
 LUI  C3    C2   C1    119.72  3.000
 LUI  C3    C2   C7    121.45  3.000
 LUI  C1    C2   C7    118.83  3.000
 LUI  C12   C11  C16   118.70  3.000
 LUI  C12   C11  C10   120.64  3.000
 LUI  C16   C11  C10   120.62  3.000
 LUI  H16   C16  C11   119.42  3.000
 LUI  H16   C16  C15   119.83  3.000
 LUI  C11   C16  C15   120.72  3.000
 LUI  H14   C14  C15   120.10  3.000
 LUI  H14   C14  C13   120.13  3.000
 LUI  C15   C14  C13   119.76  3.000
 LUI  H12   C12  C11   119.31  3.000
 LUI  H12   C12  C13   120.00  3.000
 LUI  C11   C12  C13   120.70  3.000
 LUI  H17A  C17  H17   105.66  3.000
 LUI  H17A  C17  N18   107.89  3.000
 LUI  H17   C17  N18   113.83  3.000
 LUI  H17A  C17  C9    111.25  3.000
 LUI  H17   C17  C9    107.56  3.000
 LUI  N18   C17  C9    110.59  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 LUI  CONST_01  C1    C6   C5   C4      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_02  C1    C2   C3   C4      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_03  C2    C3   C4   C5      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_04  C2    C1   C6   C5      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_05  C3    C4   C5   C6      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_06  C3    C2   C1   C6      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_07  C16   C15  C14  C13     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_08  C16   C11  C12  C13     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_09  C12   C11  C16  C15     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_10  C12   C13  C14  C15     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_11  C14   C15  C16  C11     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_12  C14   C13  C12  C11     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_13  C15   C16  C11  C10   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_14  C13   C12  C11  C10   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_15  C2    C7   N8   C9      0.00   0.0  0
 LUI  CONST_16  C3    C4   C5   O24   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_17  C1    C6   C5   O24   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_18  O23   C7   N8   C9    180.00   0.0  0
 LUI  CONST_19  C2    C7   N8   C19   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_20  H6    C6   C5   C4    180.00   0.0  0
 LUI  CONST_21  H1    C1   C6   C5    180.00   0.0  0
 LUI  CONST_22  H4    C4   C5   C6    180.00   0.0  0
 LUI  CONST_23  H16   C16  C11  C10     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_24  H12   C12  C11  C10     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_25  H15   C15  C14  C13   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_26  H13   C13  C14  C15   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_27  H14   C14  C15  C16   180.00   0.0  0
 LUI  CONST_28  O23   C7   N8   C19     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_29  HN27  N27  C26  O28     0.00   0.0  0
 LUI  CONST_30  HN2A  N27  C26  O28   180.00   0.0  0
 LUI  Var_01    C16   C11  C10  C3    -86.73  30.0  2
 LUI  Var_02    C20   C19  N8   C7    101.84  30.0  3
 LUI  Var_03    N18   C17  C9   C10   -89.38  30.0  2
 LUI  Var_04    C26   C25  O24  C5   -176.83  30.0  1
 LUI  Var_05    N8    C19  C20  C21  -176.16  30.0  3
 LUI  Var_06    HN18  N18  C17  C9     68.26  30.0  3
 LUI  Var_07    O24   C25  C26  O28     6.06  30.0  3
 LUI  Var_08    H22   C22  C20  C21  -175.64  30.0  3
 LUI  Var_09    H21   C21  C20  C22    59.90  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 LUI  plan-1  C10   0.020
 LUI  plan-1  C13   0.020
 LUI  plan-1  C15   0.020
 LUI  plan-1  C11   0.020
 LUI  plan-1  C16   0.020
 LUI  plan-1  C14   0.020
 LUI  plan-1  C12   0.020
 LUI  plan-1  H13   0.020
 LUI  plan-1  H15   0.020
 LUI  plan-1  H16   0.020
 LUI  plan-1  H14   0.020
 LUI  plan-1  H12   0.020
 LUI  plan-2  C4    0.020
 LUI  plan-2  C5    0.020
 LUI  plan-2  C6    0.020
 LUI  plan-2  C7    0.020
 LUI  plan-2  C10   0.020
 LUI  plan-2  O24   0.020
 LUI  plan-2  C1    0.020
 LUI  plan-2  C3    0.020
 LUI  plan-2  C9    0.020
 LUI  plan-2  N8    0.020
 LUI  plan-2  C19   0.020
 LUI  plan-2  O23   0.020
 LUI  plan-2  C2    0.020
 LUI  plan-2  C11   0.020
 LUI  plan-2  H4    0.020
 LUI  plan-2  H6    0.020
 LUI  plan-2  H1    0.020
 LUI  plan-2  C17   0.020
 LUI  plan-3  C26   0.020
 LUI  plan-3  O28   0.020
 LUI  plan-3  N27   0.020
 LUI  plan-3  C25   0.020
 LUI  plan-3  HN27  0.020
 LUI  plan-3  HN2A  0.020

