# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue May 12 07:17:34 2020
#   Inital geometry file: a 71 line input string
#   Ligand name: 1-[5-(3,5-dichlorophenyl)furan-2-yl]-N-methylmethanamine
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CNCc1oc(cc1)c2cc(Cl)cc(Cl)c2
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 KWA  KWA  1-[5-(3,5-dichlorophenyl)furan-2-yl]-N-methylmethanamine  ligand  27  16  .  2021-08-12  2021-08-12  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_KWA
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 KWA  C10  C   CR6   0  -0.025   1.8057  -1.4553  -0.1895
 KWA  C15  C   CH2   0  -0.370  -4.4547   0.1417   0.4847
 KWA  C01  C   CR5   0   0.397  -0.9832   0.9922   0.2568
 KWA  C03  C   CR6   0  -0.009   0.3428   0.4230   0.1053
 KWA  C04  C   CR15  0  -0.357  -1.4321   2.2715   0.3830
 KWA  C05  C   CR5   0   0.369  -3.1616   0.8678   0.4222
 KWA  C06  C   CR15  0  -0.372  -2.8478   2.1868   0.4878
 KWA  C07  C   CR16  0  -0.259   0.5243  -0.9532  -0.0438
 KWA  C08  C   CR16  0  -0.278   1.4571   1.2655   0.1067
 KWA  C09  C   CR6   0  -0.020   2.7195   0.7252  -0.0404
 KWA  C11  C   CR16  0  -0.191   2.9242  -0.6385  -0.1916
 KWA  C16  C   CH3   0  -0.520  -5.9124  -1.4159  -0.6279
 KWA  N14  N   NH1   0  -0.591  -4.6819  -0.6540  -0.7066
 KWA  O02  O   O     0  -0.437  -2.0327   0.1421   0.2818
 KWA  CL2  CL  CL    0  -0.110   2.0208  -3.1620  -0.3762
 KWA  CL3  CL  CL    0  -0.109   4.0922   1.7775  -0.0354
 KWA  H1   H   HCH2  0   0.249  -4.4555  -0.5329   1.3484
 KWA  H2   H   HCH2  0   0.227  -5.2414   0.8859   0.6773
 KWA  H3   H   HCR5  0   0.267  -0.8339   3.1687   0.3942
 KWA  H4   H   HCR5  0   0.269  -3.5457   3.0015   0.5944
 KWA  H5   H   HCR6  0   0.283  -0.3186  -1.6293  -0.0498
 KWA  H6   H   HCR6  0   0.279   1.3387   2.3340   0.2215
 KWA  H7   H   HCR6  0   0.303   3.9181  -1.0467  -0.3071
 KWA  H8   H   HCH3  0   0.236  -6.0662  -1.9577  -1.5607
 KWA  H9   H   HCH3  0   0.225  -5.8395  -2.1521   0.1745
 KWA  H10  H   HCH3  0   0.197  -6.8089  -0.8095  -0.4382
 KWA  H11  H   HNH1  0   0.348  -4.7239  -0.0386  -1.5094

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 KWA  CL3  C09  single    1.730  0.020  1.730
 KWA  C11  C09  aromatic  1.387  0.020  1.387
 KWA  C11  C10  aromatic  1.385  0.020  1.385
 KWA  C09  C08  aromatic  1.381  0.020  1.381
 KWA  CL2  C10  single    1.730  0.020  1.730
 KWA  C10  C07  aromatic  1.384  0.020  1.384
 KWA  C08  C03  aromatic  1.397  0.020  1.397
 KWA  C07  C03  aromatic  1.396  0.020  1.396
 KWA  C03  C01  single    1.451  0.020  1.451
 KWA  C01  C04  aromatic  1.362  0.020  1.362
 KWA  C01  O02  aromatic  1.351  0.020  1.351
 KWA  C04  C06  aromatic  1.422  0.020  1.422
 KWA  O02  C05  aromatic  1.349  0.020  1.349
 KWA  C06  C05  aromatic  1.357  0.020  1.357
 KWA  C05  C15  single    1.484  0.020  1.484
 KWA  C15  N14  single    1.451  0.020  1.451
 KWA  N14  C16  single    1.449  0.020  1.449
 KWA  C15  H1   single    0.970  0.020  1.090
 KWA  C15  H2   single    0.970  0.020  1.090
 KWA  C04  H3   single    0.930  0.020  1.080
 KWA  C06  H4   single    0.930  0.020  1.080
 KWA  C07  H5   single    0.930  0.020  1.080
 KWA  C08  H6   single    0.930  0.020  1.080
 KWA  C11  H7   single    0.930  0.020  1.080
 KWA  C16  H8   single    0.970  0.020  1.090
 KWA  C16  H9   single    0.970  0.020  1.090
 KWA  C16  H10  single    0.970  0.020  1.090
 KWA  N14  H11  single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 KWA  CL2  C10  C11  118.76  3.000
 KWA  CL2  C10  C07  118.97  3.000
 KWA  C11  C10  C07  122.27  3.000
 KWA  H2   C15  H1   106.14  3.000
 KWA  H2   C15  N14  113.76  3.000
 KWA  H1   C15  N14  108.03  3.000
 KWA  H2   C15  C05  107.42  3.000
 KWA  H1   C15  C05  109.57  3.000
 KWA  N14  C15  C05  111.73  3.000
 KWA  O02  C01  C04  109.48  3.000
 KWA  O02  C01  C03  117.72  3.000
 KWA  C04  C01  C03  132.80  3.000
 KWA  C08  C03  C07  119.40  3.000
 KWA  C07  C03  C01  121.11  3.000
 KWA  C08  C03  C01  119.49  3.000
 KWA  H3   C04  C06  126.94  3.000
 KWA  H3   C04  C01  126.85  3.000
 KWA  C06  C04  C01  106.20  3.000
 KWA  O02  C05  C06  109.52  3.000
 KWA  C06  C05  C15  132.43  3.000
 KWA  O02  C05  C15  118.04  3.000
 KWA  H4   C06  C05  126.12  3.000
 KWA  H4   C06  C04  127.36  3.000
 KWA  C05  C06  C04  106.53  3.000
 KWA  H5   C07  C03  121.06  3.000
 KWA  H5   C07  C10  119.65  3.000
 KWA  C03  C07  C10  119.29  3.000
 KWA  H6   C08  C09  119.87  3.000
 KWA  H6   C08  C03  120.59  3.000
 KWA  C09  C08  C03  119.54  3.000
 KWA  CL3  C09  C11  118.77  3.000
 KWA  C11  C09  C08  122.08  3.000
 KWA  CL3  C09  C08  119.15  3.000
 KWA  H7   C11  C09  121.24  3.000
 KWA  H7   C11  C10  121.34  3.000
 KWA  C09  C11  C10  117.42  3.000
 KWA  H10  C16  H9   107.45  3.000
 KWA  H10  C16  H8   107.89  3.000
 KWA  H9   C16  H8   107.66  3.000
 KWA  H10  C16  N14  114.32  3.000
 KWA  H9   C16  N14  109.74  3.000
 KWA  H8   C16  N14  109.55  3.000
 KWA  H11  N14  C16  109.11  3.000
 KWA  H11  N14  C15  108.93  3.000
 KWA  C16  N14  C15  112.13  3.000
 KWA  C05  O02  C01  108.27  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 KWA  CONST_01  C08  C09  C11  C10    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_02  C08  C03  C07  C10    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_03  C01  C03  C07  C10  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_04  C09  C08  C03  C01  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_05  C05  C06  C04  C01    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_06  C06  C05  O02  C01    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_07  C11  C09  C08  C03    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_08  C11  C10  C07  C03    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_09  C06  C04  C01  C03  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_10  C05  O02  C01  C03  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_11  C08  C03  C01  C04    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_12  C07  C03  C01  C04  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_13  C05  O02  C01  C04    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_14  O02  C05  C06  C04    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_15  O02  C01  C04  C06    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_16  C09  C11  C10  C07    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_17  C09  C08  C03  C07    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_18  O02  C01  C03  C07    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_19  O02  C01  C03  C08  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_20  CL3  C09  C11  C10  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_21  C01  O02  C05  C15  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_22  C04  C06  C05  C15  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_23  CL3  C09  C08  C03  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_24  CL2  C10  C07  C03  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_25  CL2  C10  C11  C09  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_26  H6   C08  C03  C01    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_27  H5   C07  C03  C01    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_28  H4   C06  C04  C01  180.00   0.0  0
 KWA  CONST_29  H3   C04  C01  C03    0.00   0.0  0
 KWA  CONST_30  H7   C11  C10  C07  180.00   0.0  0
 KWA  Var_01    N14  C15  C05  C06  121.58  30.0  2
 KWA  Var_02    C16  N14  C15  C05  177.29  30.0  3
 KWA  Var_03    H8   C16  N14  C15  177.22  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 KWA  plan-1  C15  0.020
 KWA  plan-1  C01  0.020
 KWA  plan-1  C03  0.020
 KWA  plan-1  C04  0.020
 KWA  plan-1  C05  0.020
 KWA  plan-1  C06  0.020
 KWA  plan-1  O02  0.020
 KWA  plan-1  H3   0.020
 KWA  plan-1  H4   0.020
 KWA  plan-2  C10  0.020
 KWA  plan-2  C01  0.020
 KWA  plan-2  C03  0.020
 KWA  plan-2  C07  0.020
 KWA  plan-2  C08  0.020
 KWA  plan-2  C09  0.020
 KWA  plan-2  C11  0.020
 KWA  plan-2  CL2  0.020
 KWA  plan-2  CL3  0.020
 KWA  plan-2  H5   0.020
 KWA  plan-2  H6   0.020
 KWA  plan-2  H7   0.020

