# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu May  7 18:30:59 2020
#   Inital geometry file: a 113 line input string
#   Ligand name: 3-[2-tert-butyl-5-(pyridin-4-yl)-1H-imidazol-4-yl]quinoline
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)(C)c1[nH]c(c2ccncc2)c(n1)c3cnc4ccccc4c3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 IQ1  IQ1  3-[2-tert-butyl-5-(pyridin-4-yl)-1H-imidazol-4-yl]quinoline  ligand  45  25  .  2021-08-11  2021-08-11  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_IQ1
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 IQ1  C25   C  CH3   0  -0.633   4.3805  -2.0698   1.3650
 IQ1  C22   C  CT    0  -0.226   3.7676  -2.0700  -0.0429
 IQ1  C23   C  CH3   0  -0.643   4.8084  -1.5877  -1.0606
 IQ1  C24   C  CH3   0  -0.632   3.3224  -3.4848  -0.4058
 IQ1  C2    C  CR5   0   0.533   2.5776  -1.1514  -0.0577
 IQ1  N3    N  N     0  -0.459   1.3200  -1.5057  -0.1392
 IQ1  N1    N  NR15  0  -0.672   2.6807   0.1913   0.0430
 IQ1  C5    C  CR5   0   0.332   1.4201   0.7287   0.0493
 IQ1  C6    C  CR6   0   0.105   1.1952   2.1599   0.1931
 IQ1  C7    C  CR16  0  -0.388   0.1234   2.6621   0.9312
 IQ1  C8    C  CR16  0  -0.054  -0.0373   4.0330   1.0359
 IQ1  N9    N  N     0  -0.408   0.7842   4.9185   0.4815
 IQ1  C10   C  CR16  0  -0.058   1.8132   4.4406  -0.2081
 IQ1  C11   C  CR16  0  -0.378   2.0605   3.0889  -0.3843
 IQ1  C4    C  CR5   0   0.087   0.5817  -0.3576  -0.0798
 IQ1  C12   C  CR6   0  -0.074  -0.8744  -0.4132  -0.1880
 IQ1  C13   C  CR16  0  -0.128  -1.6067   0.5829  -0.8868
 IQ1  N14   N  N     0  -0.420  -2.9008   0.5814  -1.0334
 IQ1  C15   C  CR66  0   0.203  -3.6134  -0.4391  -0.4965
 IQ1  C16   C  CR16  0  -0.291  -5.0180  -0.4447  -0.6423
 IQ1  C21   C  CR16  0  -0.241  -1.5843  -1.4658   0.3321
 IQ1  C20   C  CR66  0   0.095  -2.9862  -1.5047   0.1947
 IQ1  C19   C  CR16  0  -0.314  -3.7775  -2.5515   0.7201
 IQ1  C18   C  CR16  0  -0.255  -5.1370  -2.5324   0.5660
 IQ1  C17   C  CR16  0  -0.260  -5.7614  -1.4694  -0.1207
 IQ1  H251  H  HCH3  0   0.229   4.7302  -1.0781   1.6568
 IQ1  H252  H  HCH3  0   0.237   3.6563  -2.4051   2.1088
 IQ1  H253  H  HCH3  0   0.238   5.2371  -2.7453   1.4014
 IQ1  H231  H  HCH3  0   0.241   5.6520  -2.2793  -1.0859
 IQ1  H232  H  HCH3  0   0.239   4.3873  -1.5382  -2.0659
 IQ1  H233  H  HCH3  0   0.227   5.2089  -0.6025  -0.8135
 IQ1  H241  H  HCH3  0   0.233   2.5756  -3.8658   0.2902
 IQ1  H242  H  HCH3  0   0.231   2.8980  -3.5253  -1.4093
 IQ1  H243  H  HCH3  0   0.231   4.1831  -4.1536  -0.3759
 IQ1  H1    H  HNR5  0   0.418   3.5322   0.7144   0.1823
 IQ1  H7    H  HCR6  0   0.273  -0.5681   2.0038   1.4387
 IQ1  H11   H  HCR6  0   0.271   2.9094   2.7778  -0.9793
 IQ1  H8    H  HCR6  0   0.268  -0.8682   4.4328   1.6064
 IQ1  H10   H  HCR6  0   0.268   2.4805   5.1695  -0.6545
 IQ1  H13   H  HCR6  0   0.261  -1.0710   1.4017  -1.3562
 IQ1  H21   H  HCR6  0   0.262  -1.0761  -2.2665   0.8559
 IQ1  H16   H  HCR6  0   0.262  -5.4873   0.3748  -1.1715
 IQ1  H17   H  HCR6  0   0.264  -6.8375  -1.4689  -0.2354
 IQ1  H19   H  HCR6  0   0.262  -3.2927  -3.3662   1.2441
 IQ1  H18   H  HCR6  0   0.264  -5.7399  -3.3344   0.9708

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 IQ1  C25  C22   single    1.535  0.020  1.535
 IQ1  C22  C23   single    1.533  0.020  1.533
 IQ1  C22  C24   single    1.527  0.020  1.527
 IQ1  C22  C2    single    1.503  0.020  1.503
 IQ1  C2   N3    aromatic  1.309  0.020  1.309
 IQ1  C2   N1    aromatic  1.350  0.020  1.350
 IQ1  N3   C4    aromatic  1.366  0.020  1.366
 IQ1  N1   C5    aromatic  1.370  0.020  1.370
 IQ1  C5   C6    single    1.456  0.020  1.456
 IQ1  C5   C4    aromatic  1.378  0.020  1.378
 IQ1  C6   C7    aromatic  1.395  0.020  1.395
 IQ1  C6   C11   aromatic  1.395  0.020  1.395
 IQ1  C7   C8    aromatic  1.384  0.020  1.384
 IQ1  C8   N9    aromatic  1.329  0.020  1.329
 IQ1  N9   C10   aromatic  1.328  0.020  1.328
 IQ1  C10  C11   aromatic  1.385  0.020  1.385
 IQ1  C4   C12   single    1.461  0.020  1.461
 IQ1  C12  C13   aromatic  1.420  0.020  1.420
 IQ1  C12  C21   aromatic  1.372  0.020  1.372
 IQ1  C13  N14   aromatic  1.302  0.020  1.302
 IQ1  N14  C15   aromatic  1.355  0.020  1.355
 IQ1  C15  C16   aromatic  1.412  0.020  1.412
 IQ1  C15  C20   aromatic  1.417  0.020  1.417
 IQ1  C16  C17   aromatic  1.369  0.020  1.369
 IQ1  C21  C20   aromatic  1.409  0.020  1.409
 IQ1  C20  C19   aromatic  1.414  0.020  1.414
 IQ1  C19  C18   aromatic  1.368  0.020  1.368
 IQ1  C18  C17   aromatic  1.411  0.020  1.411
 IQ1  C25  H251  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C25  H252  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C25  H253  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C23  H231  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C23  H232  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C23  H233  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C24  H241  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C24  H242  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  C24  H243  single    0.970  0.020  1.090
 IQ1  N1   H1    single    0.860  0.020  1.020
 IQ1  C7   H7    single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C11  H11   single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C8   H8    single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C10  H10   single    0.930  0.020  1.080
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 IQ1  C21  H21   single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C16  H16   single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C17  H17   single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C19  H19   single    0.930  0.020  1.080
 IQ1  C18  H18   single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 IQ1  H253  C25  H252  107.94  3.000
 IQ1  H253  C25  H251  107.58  3.000
 IQ1  H252  C25  H251  108.04  3.000
 IQ1  H253  C25  C22   110.10  3.000
 IQ1  H252  C25  C22   111.11  3.000
 IQ1  H251  C25  C22   111.91  3.000
 IQ1  C2    C22  C24   109.45  3.000
 IQ1  C2    C22  C23   109.79  3.000
 IQ1  C24   C22  C23   109.36  3.000
 IQ1  C2    C22  C25   108.96  3.000
 IQ1  C24   C22  C25   109.54  3.000
 IQ1  C23   C22  C25   109.73  3.000
 IQ1  H233  C23  H232  108.01  3.000
 IQ1  H233  C23  H231  107.07  3.000
 IQ1  H232  C23  H231  107.80  3.000
 IQ1  H233  C23  C22   112.49  3.000
 IQ1  H232  C23  C22   111.34  3.000
 IQ1  H231  C23  C22   109.93  3.000
 IQ1  H243  C24  H242  108.04  3.000
 IQ1  H243  C24  H241  108.00  3.000
 IQ1  H242  C24  H241  107.95  3.000
 IQ1  H243  C24  C22   109.37  3.000
 IQ1  H242  C24  C22   111.51  3.000
 IQ1  H241  C24  C22   111.84  3.000
 IQ1  N1    C2   N3    110.30  3.000
 IQ1  N1    C2   C22   123.12  3.000
 IQ1  N3    C2   C22   126.56  3.000
 IQ1  C4    N3   C2    106.80  3.000
 IQ1  H1    N1   C5    124.92  3.000
 IQ1  H1    N1   C2    126.16  3.000
 IQ1  C5    N1   C2    108.67  3.000
 IQ1  C4    C5   C6    133.64  3.000
 IQ1  C4    C5   N1    104.48  3.000
 IQ1  C6    C5   N1    121.87  3.000
 IQ1  C11   C6   C7    117.13  3.000
 IQ1  C11   C6   C5    121.20  3.000
 IQ1  C7    C6   C5    121.66  3.000
 IQ1  H7    C7   C8    119.55  3.000
 IQ1  H7    C7   C6    121.37  3.000
 IQ1  C8    C7   C6    119.06  3.000
 IQ1  H8    C8   N9    116.58  3.000
 IQ1  H8    C8   C7    119.60  3.000
 IQ1  N9    C8   C7    123.81  3.000
 IQ1  C10   N9   C8    117.12  3.000
 IQ1  H10   C10  C11   119.58  3.000
 IQ1  H10   C10  N9    116.67  3.000
 IQ1  C11   C10  N9    123.75  3.000
 IQ1  H11   C11  C10   119.36  3.000
 IQ1  H11   C11  C6    121.52  3.000
 IQ1  C10   C11  C6    119.11  3.000
 IQ1  C12   C4   C5    130.02  3.000
 IQ1  C12   C4   N3    120.22  3.000
 IQ1  C5    C4   N3    109.74  3.000
 IQ1  C21   C12  C13   117.25  3.000
 IQ1  C21   C12  C4    121.11  3.000
 IQ1  C13   C12  C4    121.57  3.000
 IQ1  H13   C13  N14   116.28  3.000
 IQ1  H13   C13  C12   119.18  3.000
 IQ1  N14   C13  C12   124.53  3.000
 IQ1  C15   N14  C13   118.60  3.000
 IQ1  C20   C15  C16   119.20  3.000
 IQ1  C20   C15  N14   121.79  3.000
 IQ1  C16   C15  N14   119.01  3.000
 IQ1  H16   C16  C17   121.15  3.000
 IQ1  H16   C16  C15   118.60  3.000
 IQ1  C17   C16  C15   120.25  3.000
 IQ1  H21   C21  C20   119.56  3.000
 IQ1  H21   C21  C12   120.50  3.000
 IQ1  C20   C21  C12   119.93  3.000
 IQ1  C19   C20  C21   122.76  3.000
 IQ1  C19   C20  C15   119.38  3.000
 IQ1  C21   C20  C15   117.86  3.000
 IQ1  H19   C19  C18   120.64  3.000
 IQ1  H19   C19  C20   119.10  3.000
 IQ1  C18   C19  C20   120.26  3.000
 IQ1  H18   C18  C17   119.59  3.000
 IQ1  H18   C18  C19   120.07  3.000
 IQ1  C17   C18  C19   120.33  3.000
 IQ1  H17   C17  C18   119.47  3.000
 IQ1  H17   C17  C16   119.95  3.000
 IQ1  C18   C17  C16   120.59  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 IQ1  CONST_01  C5    C4   N3   C2      0.00   0.0  0
 IQ1  CONST_02  C12   C4   N3   C2    180.00   0.0  0
 IQ1  CONST_03  C6    C5   N1   C2    180.00   0.0  0
 IQ1  CONST_04  C4    C5   N1   C2      0.00   0.0  0
 IQ1  CONST_05  C5    N1   C2   N3      0.00   0.0  0
 IQ1  CONST_06  N1    C5   C4   N3      0.00   0.0  0
 IQ1  CONST_07  C6    C5   C4   N3    180.00   0.0  0
 IQ1  CONST_10  C4    N3   C2   N1      0.00   0.0  0
 IQ1  CONST_13  C12   C4   C5   N1    180.00   0.0  0
 IQ1  CONST_14  C8    C7   C6   C5    180.00   0.0  0
 IQ1  CONST_15  C10   C11  C6   C5    180.00   0.0  0
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 IQ1  CONST_19  N9    C8   C7   C6      0.00   0.0  0
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loop_
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