# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sun Jul 31 11:02:57 2022
#   Inital geometry file: a 61 line input string
#   Ligand name: tert-butylbenzene
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)(C)c1ccccc1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 I7E  I7E  "tert-butylbenzene"
  ligand  24  10  .  2022-08-10  2022-08-10
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as GRAND
;

data_comp_I7E
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 I7E  C01   C  CH3   0  -0.664  -5.9251  -6.6374  -11.9617
 I7E  C02   C  CT    0  -0.168  -5.0216  -5.4093  -11.8509
 I7E  C03   C  CH3   0  -0.631  -3.9297  -5.5224  -12.9229
 I7E  C04   C  CH3   0  -0.629  -4.3717  -5.4107  -10.4607
 I7E  C05   C  CR6   0   0.194  -5.7891  -4.1050  -12.0449
 I7E  C06   C  CR16  0  -0.337  -7.1675  -4.0626  -12.2436
 I7E  C07   C  CR16  0  -0.232  -7.8376  -2.8555  -12.4155
 I7E  C08   C  CR16  0  -0.277  -7.1422  -1.6574  -12.3937
 I7E  C09   C  CR16  0  -0.238  -5.7669  -1.6797  -12.1937
 I7E  C10   C  CR16  0  -0.312  -5.1054  -2.8854  -12.0219
 I7E  H013  H  HCH3  0   0.229  -6.7034  -6.6487  -11.1964
 I7E  H012  H  HCH3  0   0.229  -6.4098  -6.7014  -12.9374
 I7E  H011  H  HCH3  0   0.236  -5.3290  -7.5420  -11.8329
 I7E  H031  H  HCH3  0   0.228  -3.2181  -4.6984  -12.8687
 I7E  H033  H  HCH3  0   0.226  -3.3670  -6.4496  -12.7953
 I7E  H032  H  HCH3  0   0.227  -4.3619  -5.5283  -13.9252
 I7E  H041  H  HCH3  0   0.227  -5.1238  -5.3218   -9.6748
 I7E  H043  H  HCH3  0   0.225  -3.8258  -6.3425  -10.2988
 I7E  H042  H  HCH3  0   0.228  -3.6632  -4.5899  -10.3389
 I7E  H061  H  HCR6  0   0.248  -7.7446  -4.9770  -12.2681
 I7E  H071  H  HCR6  0   0.248  -8.9095  -2.8587  -12.5690
 I7E  H081  H  HCR6  0   0.249  -7.6616  -0.7174  -12.5295
 I7E  H091  H  HCR6  0   0.248  -5.2058  -0.7538  -12.1723
 I7E  H101  H  HCR6  0   0.246  -4.0331  -2.8685  -11.8673

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 I7E  C03  C02   single    1.534  0.020  1.534
 I7E  C08  C09   aromatic  1.390  0.020  1.390
 I7E  C08  C07   aromatic  1.386  0.020  1.386
 I7E  C09  C10   aromatic  1.386  0.020  1.386
 I7E  C07  C06   aromatic  1.391  0.020  1.391
 I7E  C10  C05   aromatic  1.398  0.020  1.398
 I7E  C01  C02   single    1.529  0.020  1.529
 I7E  C06  C05   aromatic  1.393  0.020  1.393
 I7E  C05  C02   single    1.526  0.020  1.526
 I7E  C02  C04   single    1.535  0.020  1.535
 I7E  C01  H013  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C01  H012  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C01  H011  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C03  H031  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C03  H033  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C03  H032  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C04  H041  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C04  H043  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C04  H042  single    0.970  0.020  1.090
 I7E  C06  H061  single    0.930  0.020  1.080
 I7E  C07  H071  single    0.930  0.020  1.080
 I7E  C08  H081  single    0.930  0.020  1.080
 I7E  C09  H091  single    0.930  0.020  1.080
 I7E  C10  H101  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 I7E  H011  C01  H012  107.43  3.000
 I7E  H011  C01  H013  107.36  3.000
 I7E  H012  C01  H013  108.03  3.000
 I7E  H011  C01  C02   109.55  3.000
 I7E  H012  C01  C02   111.99  3.000
 I7E  H013  C01  C02   112.26  3.000
 I7E  C05   C02  C04   109.21  3.000
 I7E  C04   C02  C03   109.36  3.000
 I7E  C05   C02  C03   109.40  3.000
 I7E  C04   C02  C01   108.37  3.000
 I7E  C05   C02  C01   112.35  3.000
 I7E  C03   C02  C01   108.10  3.000
 I7E  H032  C03  H033  107.86  3.000
 I7E  H032  C03  H031  107.96  3.000
 I7E  H033  C03  H031  107.43  3.000
 I7E  H032  C03  C02   111.11  3.000
 I7E  H033  C03  C02   110.34  3.000
 I7E  H031  C03  C02   111.97  3.000
 I7E  H042  C04  H043  107.50  3.000
 I7E  H042  C04  H041  107.81  3.000
 I7E  H043  C04  H041  107.89  3.000
 I7E  H042  C04  C02   112.05  3.000
 I7E  H043  C04  C02   110.29  3.000
 I7E  H041  C04  C02   111.12  3.000
 I7E  C10   C05  C06   117.35  3.000
 I7E  C06   C05  C02   122.81  3.000
 I7E  C10   C05  C02   119.84  3.000
 I7E  H061  C06  C07   118.28  3.000
 I7E  H061  C06  C05   120.36  3.000
 I7E  C07   C06  C05   121.37  3.000
 I7E  H071  C07  C08   120.10  3.000
 I7E  H071  C07  C06   119.46  3.000
 I7E  C08   C07  C06   120.44  3.000
 I7E  H081  C08  C09   120.45  3.000
 I7E  H081  C08  C07   120.54  3.000
 I7E  C09   C08  C07   119.01  3.000
 I7E  H091  C09  C10   119.61  3.000
 I7E  H091  C09  C08   120.12  3.000
 I7E  C10   C09  C08   120.27  3.000
 I7E  H101  C10  C09   118.45  3.000
 I7E  H101  C10  C05   119.99  3.000
 I7E  C09   C10  C05   121.56  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 I7E  CONST_01  C08   C09  C10  C05     0.00   0.0  0
 I7E  CONST_02  C08   C07  C06  C05     0.00   0.0  0
 I7E  CONST_03  C09   C08  C07  C06     0.00   0.0  0
 I7E  CONST_04  C09   C10  C05  C06     0.00   0.0  0
 I7E  CONST_05  C10   C09  C08  C07     0.00   0.0  0
 I7E  CONST_06  C10   C05  C06  C07     0.00   0.0  0
 I7E  CONST_07  C09   C10  C05  C02   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_08  C07   C06  C05  C02   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_09  H091  C09  C10  C05   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_10  H071  C07  C06  C05   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_11  H081  C08  C07  C06   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_12  H101  C10  C05  C06   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_13  H091  C09  C08  C07   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_14  H101  C10  C09  C08   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_15  H061  C06  C07  C08   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_16  H071  C07  C08  C09   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_17  H081  C08  C09  C10   180.00   0.0  0
 I7E  CONST_18  H061  C06  C05  C10   180.00   0.0  0
 I7E  Var_01    C10   C05  C02  C01  -177.75  30.0  2
 I7E  Var_02    C06   C05  C02  C01     2.49  30.0  2
 I7E  Var_03    C10   C05  C02  C03   -57.68  30.0  2
 I7E  Var_04    C06   C05  C02  C03   122.56  30.0  2
 I7E  Var_05    C10   C05  C02  C04    61.97  30.0  2
 I7E  Var_06    C06   C05  C02  C04  -117.78  30.0  2
 I7E  Var_07    H031  C03  C02  C05    60.12  30.0  3
 I7E  Var_08    H033  C03  C02  C05   179.73  30.0  3
 I7E  Var_09    H032  C03  C02  C05   -60.68  30.0  3
 I7E  Var_10    H013  C01  C02  C05   -61.77  30.0  3
 I7E  Var_11    H012  C01  C02  C05    59.96  30.0  3
 I7E  Var_12    H011  C01  C02  C05   179.05  30.0  3
 I7E  Var_13    H041  C04  C02  C05    59.79  30.0  3
 I7E  Var_14    H043  C04  C02  C05   179.39  30.0  3
 I7E  Var_15    H042  C04  C02  C05   -60.89  30.0  3
 I7E  Var_16    H031  C03  C02  C01  -177.24  30.0  3
 I7E  Var_17    H033  C03  C02  C01   -57.63  30.0  3
 I7E  Var_18    H032  C03  C02  C01    61.96  30.0  3
 I7E  Var_19    H041  C04  C02  C01   -62.90  30.0  3
 I7E  Var_20    H043  C04  C02  C01    56.70  30.0  3
 I7E  Var_21    H042  C04  C02  C01   176.42  30.0  3
 I7E  Var_22    H013  C01  C02  C03   177.41  30.0  3
 I7E  Var_23    H012  C01  C02  C03   -60.86  30.0  3
 I7E  Var_24    H011  C01  C02  C03    58.23  30.0  3
 I7E  Var_25    H041  C04  C02  C03   179.47  30.0  3
 I7E  Var_26    H043  C04  C02  C03   -60.93  30.0  3
 I7E  Var_27    H042  C04  C02  C03    58.79  30.0  3
 I7E  Var_28    H031  C03  C02  C04   -59.44  30.0  3
 I7E  Var_29    H033  C03  C02  C04    60.17  30.0  3
 I7E  Var_30    H032  C03  C02  C04   179.75  30.0  3
 I7E  Var_31    H013  C01  C02  C04    58.98  30.0  3
 I7E  Var_32    H012  C01  C02  C04  -179.28  30.0  3
 I7E  Var_33    H011  C01  C02  C04   -60.19  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 I7E  plan-1  C02   0.020
 I7E  plan-1  C05   0.020
 I7E  plan-1  C06   0.020
 I7E  plan-1  C07   0.020
 I7E  plan-1  C08   0.020
 I7E  plan-1  C09   0.020
 I7E  plan-1  C10   0.020
 I7E  plan-1  H061  0.020
 I7E  plan-1  H071  0.020
 I7E  plan-1  H081  0.020
 I7E  plan-1  H091  0.020
 I7E  plan-1  H101  0.020

