# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat May  2 09:43:00 2020
#   Inital geometry file: a 186 line input string
#   Ligand name: (3aS,4S,7aR)-hexahydro-4H-furo[2,3-b]pyran-4-yl [(2S,3R)-1-(3,5-difluorophenyl)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}butan-2-yl]carbamate
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(cc1)[S](=O)(=O)N(CC(C)C)C[C@@H](O)[C@H](Cc2cc(F)cc(F)c2)NC(=O)O[C@H]3CCO[C@H]4OCC[C@@H]34
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 FQ1  FQ1  '(3aS,4S,7aR)-hexahydro-4H-furo[2,3-b]pyran-4-yl [(2S,3R)-1-(3,5-difluorophenyl)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}butan-2-yl]carbamate'  ligand  80  42  .  2021-08-09  2021-08-09  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_FQ1
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 FQ1  C2   C  CR6   0   0.407  -3.9733  -3.1522  -1.8656
 FQ1  C3   C  CR16  0  -0.332  -3.7416  -1.9471  -2.5381
 FQ1  C4   C  CR16  0  -0.269  -4.1661  -0.7515  -1.9930
 FQ1  C5   C  CR6   0  -0.210  -4.8139  -0.7440  -0.7596
 FQ1  C15  C  CH3   0  -0.651  -4.9100   3.3106   2.8457
 FQ1  C16  C  CH2   0  -0.336  -2.7233   1.4866   0.4571
 FQ1  O9   O  OS    0  -0.651  -6.4330   0.5717   0.8230
 FQ1  C19  C  CH1   0  -0.083  -0.2762   0.9373   0.1557
 FQ1  C17  C  CH1   0  -0.001  -1.5934   0.5270   0.8321
 FQ1  C14  C  CH3   0  -0.652  -3.9538   1.9546   4.7390
 FQ1  C7   C  CR16  0  -0.373  -4.6372  -3.1377  -0.6369
 FQ1  C6   C  CR16  0  -0.208  -5.0496  -1.9351  -0.0885
 FQ1  C12  C  CH2   0  -0.280  -4.1087   0.9471   2.4743
 FQ1  C01  C  CH2   0  -0.491   4.6022   0.0660   2.7336
 FQ1  C02  C  CH2   0  -0.204   6.1134   0.1556   2.8758
 FQ1  C04  C  CH3   0  -0.442  -3.7458  -5.5135  -1.8444
 FQ1  C06  C  CR16  0  -0.482   1.9302   0.1593  -2.2318
 FQ1  C07  C  CR6   0   0.167   1.0038   1.1709  -1.9973
 FQ1  C08  C  CR16  0  -0.460   1.3437   2.4931  -2.2667
 FQ1  C09  C  CR16  0  -0.569   3.5549   1.7976  -2.9820
 FQ1  C24  C  CH1   0   0.049   4.2712  -0.1303   1.2652
 FQ1  C27  C  CR15  0   0.301   6.5494  -1.2179   1.0158
 FQ1  C29  C  CH2   0  -0.164   6.0062  -3.4475   0.7684
 FQ1  C30  C  CH2   0  -0.500   4.7165  -2.6921   1.0873
 FQ1  C31  C  CR15  0  -0.362   5.0648  -1.2713   0.6502
 FQ1  C33  C  CR6   0   0.561   3.1797   0.4964  -2.7132
 FQ1  C34  C  CR6   0   0.559   2.6040   2.7738  -2.7515
 FQ1  F01  F  F     0  -0.313   4.0744  -0.4799  -2.9284
 FQ1  F02  F  F     0  -0.311   2.9287   4.0479  -3.0118
 FQ1  N11  N  N     0  -0.583  -4.0065   1.1262   1.0333
 FQ1  N20  N  NH1   0  -0.666   0.7862   0.1135   0.6821
 FQ1  O01  O  O2    0  -0.489   6.7387  -1.0166   2.3961
 FQ1  O03  O  O2    0  -0.458  -3.5339  -4.2590  -2.4702
 FQ1  O10  O  OS    0  -0.655  -5.2674   1.7976  -1.0317
 FQ1  O18  O  OH1   0  -0.649  -1.9083  -0.8255   0.6146
 FQ1  O22  O  O     0  -0.502   2.3424   1.7580   0.9311
 FQ1  O23  O  O2    0  -0.493   2.8890  -0.4273   1.0643
 FQ1  O28  O  O     0  -0.501   7.0501  -2.4683   0.7053
 FQ1  S8   S  S     0   1.375  -5.2435   0.7840   0.0135
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 FQ1  C13  C  CH1   0  -0.256  -3.8929   2.2500   3.2447
 FQ1  C21  C  C     0   0.765   2.0344   0.5869   0.8890

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 FQ1  O01  C27  single    1.408  0.020  1.408
 FQ1  O01  C02  single    1.413  0.020  1.413
 FQ1  C27  O28  single    1.382  0.020  1.382
 FQ1  C27  C31  single    1.530  0.020  1.530
 FQ1  C02  C01  single    1.520  0.020  1.520
 FQ1  O28  C29  single    1.433  0.020  1.433
 FQ1  C01  C24  single    1.518  0.020  1.518
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 FQ1  C31  C24  single    1.520  0.020  1.520
 FQ1  C29  C30  single    1.528  0.020  1.528
 FQ1  C24  O23  single    1.428  0.020  1.428
 FQ1  O23  C21  single    1.338  0.020  1.338
 FQ1  F02  C34  single    1.340  0.020  1.340
 FQ1  C21  O22  double    1.212  0.020  1.212
 FQ1  C21  N20  single    1.351  0.020  1.351
 FQ1  C34  C09  aromatic  1.382  0.020  1.382
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 FQ1  N20  C19  single    1.444  0.020  1.444
 FQ1  C09  C33  aromatic  1.381  0.020  1.381
 FQ1  C08  C07  aromatic  1.391  0.020  1.391
 FQ1  C33  F01  single    1.342  0.020  1.342
 FQ1  C33  C06  aromatic  1.381  0.020  1.381
 FQ1  C15  C13  single    1.523  0.020  1.523
 FQ1  C07  C06  aromatic  1.392  0.020  1.392
 FQ1  C07  C32  single    1.501  0.020  1.501
 FQ1  C19  C17  single    1.537  0.020  1.537
 FQ1  C19  C32  single    1.544  0.020  1.544
 FQ1  O18  C17  single    1.406  0.020  1.406
 FQ1  C17  C16  single    1.529  0.020  1.529
 FQ1  C14  C13  single    1.524  0.020  1.524
 FQ1  C13  C12  single    1.529  0.020  1.529
 FQ1  C16  N11  single    1.452  0.020  1.452
 FQ1  N11  C12  single    1.456  0.020  1.456
 FQ1  N11  S8   single    1.639  0.020  1.639
 FQ1  O10  S8   double    1.456  0.020  1.456
 FQ1  O9   S8   double    1.454  0.020  1.454
 FQ1  S8   C5   single    1.765  0.020  1.765
 FQ1  C5   C6   aromatic  1.387  0.020  1.387
 FQ1  C5   C4   aromatic  1.393  0.020  1.393
 FQ1  C6   C7   aromatic  1.385  0.020  1.385
 FQ1  C4   C3   aromatic  1.381  0.020  1.381
 FQ1  C7   C2   aromatic  1.397  0.020  1.397
 FQ1  C3   C2   aromatic  1.399  0.020  1.399
 FQ1  C2   O03  single    1.336  0.020  1.336
 FQ1  O03  C04  single    1.418  0.020  1.418
 FQ1  C3   H1   single    0.930  0.020  1.080
 FQ1  C4   H2   single    0.930  0.020  1.080
 FQ1  C15  H3   single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  C15  H4   single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  C15  H5   single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  C16  H6   single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  C16  H7   single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  C19  H8   single    0.970  0.020  1.090
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 FQ1  C04  H24  single    0.970  0.020  1.090
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 FQ1  C27  H29  single    0.970  0.020  1.090
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 FQ1  C32  H35  single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  C32  H36  single    0.970  0.020  1.090
 FQ1  N20  H37  single    0.890  0.020  1.040
 FQ1  O18  H38  single    0.850  0.020  0.980

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 FQ1  O03  C2   C7   124.29  3.000
 FQ1  O03  C2   C3   116.21  3.000
 FQ1  C7   C2   C3   119.50  3.000
 FQ1  H1   C3   C4   120.07  3.000
 FQ1  H1   C3   C2   119.60  3.000
 FQ1  C4   C3   C2   120.33  3.000
 FQ1  H2   C4   C5   121.03  3.000
 FQ1  H2   C4   C3   119.17  3.000
 FQ1  C5   C4   C3   119.81  3.000
 FQ1  S8   C5   C6   119.33  3.000
 FQ1  C6   C5   C4   120.17  3.000
 FQ1  S8   C5   C4   120.37  3.000
 FQ1  H5   C15  H4   107.57  3.000
 FQ1  H5   C15  H3   107.76  3.000
 FQ1  H4   C15  H3   107.75  3.000
 FQ1  H5   C15  C13  111.96  3.000
 FQ1  H4   C15  C13  110.78  3.000
 FQ1  H3   C15  C13  110.83  3.000
 FQ1  H7   C16  H6   105.06  3.000
 FQ1  H7   C16  N11  108.69  3.000
 FQ1  H6   C16  N11  109.97  3.000
 FQ1  H7   C16  C17  110.85  3.000
 FQ1  H6   C16  C17  108.36  3.000
 FQ1  N11  C16  C17  113.57  3.000
 FQ1  H8   C19  N20  107.82  3.000
 FQ1  H8   C19  C32  108.80  3.000
 FQ1  N20  C19  C32  110.82  3.000
 FQ1  H8   C19  C17  107.40  3.000
 FQ1  C32  C19  C17  113.28  3.000
 FQ1  N20  C19  C17  108.53  3.000
 FQ1  H9   C17  O18  105.08  3.000
 FQ1  H9   C17  C19  105.87  3.000
 FQ1  O18  C17  C19  112.39  3.000
 FQ1  H9   C17  C16  108.38  3.000
 FQ1  O18  C17  C16  113.60  3.000
 FQ1  C19  C17  C16  110.97  3.000
 FQ1  H12  C14  H11  107.72  3.000
 FQ1  H12  C14  H10  107.75  3.000
 FQ1  H11  C14  H10  107.78  3.000
 FQ1  H12  C14  C13  110.97  3.000
 FQ1  H11  C14  C13  111.58  3.000
 FQ1  H10  C14  C13  110.88  3.000
 FQ1  H13  C7   C6   118.59  3.000
 FQ1  H13  C7   C2   121.47  3.000
 FQ1  C6   C7   C2   119.94  3.000
 FQ1  H14  C6   C7   118.85  3.000
 FQ1  H14  C6   C5   120.92  3.000
 FQ1  C7   C6   C5   120.23  3.000
 FQ1  H17  C12  H16  106.33  3.000
 FQ1  H17  C12  N11  108.95  3.000
 FQ1  H16  C12  N11  109.58  3.000
 FQ1  H17  C12  C13  109.00  3.000
 FQ1  H16  C12  C13  110.19  3.000
 FQ1  N11  C12  C13  112.59  3.000
 FQ1  H19  C01  H18  107.64  3.000
 FQ1  H19  C01  C24  110.34  3.000
 FQ1  H18  C01  C24  110.95  3.000
 FQ1  H19  C01  C02  109.60  3.000
 FQ1  H18  C01  C02  109.96  3.000
 FQ1  C24  C01  C02  108.35  3.000
 FQ1  H21  C02  H20  107.32  3.000
 FQ1  H21  C02  O01  107.02  3.000
 FQ1  H20  C02  O01  110.72  3.000
 FQ1  H21  C02  C01  110.83  3.000
 FQ1  H20  C02  C01  109.80  3.000
 FQ1  O01  C02  C01  111.06  3.000
 FQ1  H24  C04  H23  108.92  3.000
 FQ1  H24  C04  H22  108.93  3.000
 FQ1  H23  C04  H22  109.15  3.000
 FQ1  H24  C04  O03  106.31  3.000
 FQ1  H23  C04  O03  111.71  3.000
 FQ1  H22  C04  O03  111.72  3.000
 FQ1  H25  C06  C33  120.08  3.000
 FQ1  H25  C06  C07  121.00  3.000
 FQ1  C33  C06  C07  118.93  3.000
 FQ1  C32  C07  C08  120.01  3.000
 FQ1  C32  C07  C06  120.20  3.000
 FQ1  C08  C07  C06  119.70  3.000
 FQ1  H26  C08  C34  120.13  3.000
 FQ1  H26  C08  C07  120.87  3.000
 FQ1  C34  C08  C07  118.99  3.000
 FQ1  H27  C09  C34  121.70  3.000
 FQ1  H27  C09  C33  121.79  3.000
 FQ1  C34  C09  C33  116.50  3.000
 FQ1  H28  C24  O23  109.53  3.000
 FQ1  H28  C24  C31  108.03  3.000
 FQ1  O23  C24  C31  107.00  3.000
 FQ1  H28  C24  C01  108.24  3.000
 FQ1  O23  C24  C01  111.97  3.000
 FQ1  C31  C24  C01  112.00  3.000
 FQ1  H29  C27  O28  109.02  3.000
 FQ1  H29  C27  O01  109.82  3.000
 FQ1  O28  C27  O01  107.51  3.000
 FQ1  H29  C27  C31  113.06  3.000
 FQ1  O28  C27  C31  105.44  3.000
 FQ1  O01  C27  C31  111.71  3.000
 FQ1  H31  C29  H30  107.93  3.000
 FQ1  H31  C29  O28  108.19  3.000
 FQ1  H30  C29  O28  109.93  3.000
 FQ1  H31  C29  C30  111.55  3.000
 FQ1  H30  C29  C30  112.52  3.000
 FQ1  O28  C29  C30  106.64  3.000
 FQ1  H33  C30  H32  107.71  3.000
 FQ1  H33  C30  C31  111.74  3.000
 FQ1  H32  C30  C31  112.62  3.000
 FQ1  H33  C30  C29  111.04  3.000
 FQ1  H32  C30  C29  111.76  3.000
 FQ1  C31  C30  C29  101.98  3.000
 FQ1  H34  C31  C30  109.23  3.000
 FQ1  H34  C31  C27  107.69  3.000
 FQ1  C30  C31  C27  100.69  3.000
 FQ1  H34  C31  C24  108.50  3.000
 FQ1  C30  C31  C24  117.62  3.000
 FQ1  C27  C31  C24  112.57  3.000
 FQ1  F01  C33  C09  118.26  3.000
 FQ1  F01  C33  C06  118.79  3.000
 FQ1  C09  C33  C06  122.95  3.000
 FQ1  F02  C34  C09  118.19  3.000
 FQ1  C09  C34  C08  122.93  3.000
 FQ1  F02  C34  C08  118.88  3.000
 FQ1  S8   N11  C12  122.50  3.000
 FQ1  S8   N11  C16  118.15  3.000
 FQ1  C12  N11  C16  119.04  3.000
 FQ1  H37  N20  C19  116.72  3.000
 FQ1  H37  N20  C21  117.64  3.000
 FQ1  C19  N20  C21  122.40  3.000
 FQ1  C27  O01  C02  113.09  3.000
 FQ1  C04  O03  C2   118.96  3.000
 FQ1  H38  O18  C17  110.51  3.000
 FQ1  C24  O23  C21  118.62  3.000
 FQ1  C29  O28  C27  110.14  3.000
 FQ1  O10  S8   N11  108.28  3.000
 FQ1  O10  S8   O9   119.19  3.000
 FQ1  N11  S8   O9   107.54  3.000
 FQ1  O9   S8   C5   108.44  3.000
 FQ1  O10  S8   C5   106.98  3.000
 FQ1  N11  S8   C5   105.64  3.000
 FQ1  H36  C32  H35  107.24  3.000
 FQ1  H36  C32  C07  109.33  3.000
 FQ1  H35  C32  C07  109.16  3.000
 FQ1  H36  C32  C19  109.70  3.000
 FQ1  H35  C32  C19  109.90  3.000
 FQ1  C07  C32  C19  111.42  3.000
 FQ1  H15  C13  C12  108.79  3.000
 FQ1  H15  C13  C14  107.68  3.000
 FQ1  C12  C13  C14  108.86  3.000
 FQ1  H15  C13  C15  108.44  3.000
 FQ1  C12  C13  C15  111.55  3.000
 FQ1  C14  C13  C15  111.42  3.000
 FQ1  O23  C21  O22  124.46  3.000
 FQ1  O22  C21  N20  125.37  3.000
 FQ1  O23  C21  N20  110.16  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 FQ1  CONST_01  C5   C6   C7   C2      0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_02  C5   C4   C3   C2      0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_03  C6   C5   C4   C3      0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_04  C6   C7   C2   C3      0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_05  C7   C6   C5   C4      0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_06  C7   C2   C3   C4      0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_07  C34  C09  C33  C06     0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_08  C34  C08  C07  C06     0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_09  C09  C34  C08  C07     0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_10  C09  C33  C06  C07     0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_11  C33  C09  C34  C08     0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_12  C33  C06  C07  C08     0.00   0.0  0
 FQ1  CONST_13  S8   C5   C4   C3    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_14  O03  C2   C3   C4    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_15  S8   C5   C6   C7    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_16  O03  C2   C7   C6    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_17  F02  C34  C08  C07   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_18  F01  C33  C06  C07   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_19  C34  C08  C07  C32   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_20  C33  C06  C07  C32   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_21  F02  C34  C09  C33   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_22  F01  C33  C09  C34   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_23  H14  C6   C7   C2    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_24  H2   C4   C3   C2    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_25  H13  C7   C2   C3    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_26  H1   C3   C4   C5    180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_27  H27  C09  C33  C06   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_28  H26  C08  C07  C06   180.00   0.0  0
 FQ1  CONST_29  H25  C06  C07  C08   180.00   0.0  0
 FQ1  Var_01    O01  C02  C01  C24   -59.29  30.0  1
 FQ1  Var_02    C30  C29  O28  C27     3.00  30.0  1
 FQ1  Var_03    O28  C29  C30  C31    21.11  30.0  1
 FQ1  Var_04    N11  S8   C5   C4    -94.47  30.0  3
 FQ1  Var_05    C08  C07  C32  C19   -86.27  30.0  2
 FQ1  Var_06    C16  N11  S8   C5     69.22  30.0  2
 FQ1  Var_07    O22  C21  O23  C24    -2.52  30.0  3
 FQ1  Var_08    H22  C04  O03  C2    -62.41  30.0  3
 FQ1  Var_09    N11  C12  C13  C15    59.23  30.0  3
 FQ1  Var_10    C13  C12  N11  C16    66.45  30.0  3
 FQ1  Var_11    O23  C21  N20  C19  -165.04  30.0  1
 FQ1  Var_12    H10  C14  C13  C15    60.36  30.0  3
 FQ1  Var_13    H3   C15  C13  C14   -59.90  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 FQ1  chir_01  C19  N20  C17  C32  positiv
 FQ1  chir_02  C17  O18  C19  C16  negativ
 FQ1  chir_03  C24  O23  C01  C31  negativ
 FQ1  chir_04  C27  O01  O28  C31  negativ
 FQ1  chir_05  C31  C24  C30  C27  positiv

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 FQ1  plan-1  C2   0.020
 FQ1  plan-1  C3   0.020
 FQ1  plan-1  C4   0.020
 FQ1  plan-1  C5   0.020
 FQ1  plan-1  C7   0.020
 FQ1  plan-1  C6   0.020
 FQ1  plan-1  O03  0.020
 FQ1  plan-1  S8   0.020
 FQ1  plan-1  H1   0.020
 FQ1  plan-1  H2   0.020
 FQ1  plan-1  H13  0.020
 FQ1  plan-1  H14  0.020
 FQ1  plan-2  C06  0.020
 FQ1  plan-2  C07  0.020
 FQ1  plan-2  C08  0.020
 FQ1  plan-2  C09  0.020
 FQ1  plan-2  C33  0.020
 FQ1  plan-2  C34  0.020
 FQ1  plan-2  F01  0.020
 FQ1  plan-2  F02  0.020
 FQ1  plan-2  H25  0.020
 FQ1  plan-2  H26  0.020
 FQ1  plan-2  H27  0.020
 FQ1  plan-2  C32  0.020
 FQ1  plan-3  N20  0.020
 FQ1  plan-3  O22  0.020
 FQ1  plan-3  O23  0.020
 FQ1  plan-3  C21  0.020

