# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Wed Apr 29 15:59:26 2020
#   Inital geometry file: a 53 line input string
#   Ligand name: methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COC(=O)c1[nH]c2ccoc2c1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 F4E  F4E  'methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate'  ligand  19  12  .  2021-08-09  2021-08-09  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_F4E
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 F4E  C10  C  CR15  0  -0.367  -2.7167   1.3497   0.0128
 F4E  N12  N  NR15  0  -0.703  -0.0990   0.9546   0.0093
 F4E  C01  C  CH3   0  -0.420   4.0363   0.7227   0.0062
 F4E  C03  C  C     0   0.548   1.9788  -0.4268  -0.0110
 F4E  C05  C  CR5   0   0.172   0.5339  -0.2694  -0.0074
 F4E  C06  C  CR15  0  -0.402  -0.4065  -1.2926  -0.0208
 F4E  C07  C  CR55  0   0.273  -1.6338  -0.6275  -0.0109
 F4E  C09  C  CR15  0   0.004  -3.5803   0.3013  -0.0007
 F4E  C11  C  CR55  0   0.259  -1.4304   0.7365   0.0073
 F4E  O02  O  O2    0  -0.471   2.6094   0.7423   0.0074
 F4E  O04  O  O     0  -0.459   2.5393  -1.4994  -0.0291
 F4E  O08  O  O     0  -0.425  -2.9539  -0.9077  -0.0159
 F4E  H1   H  HCR5  0   0.276  -2.9836   2.3931   0.0280
 F4E  H2   H  HNR5  0   0.418   0.3620   1.8502   0.0206
 F4E  H3   H  HCH3  0   0.240   4.4277   0.2159   0.8880
 F4E  H4   H  HCH3  0   0.240   4.4269   0.2404  -0.8895
 F4E  H5   H  HCH3  0   0.254   4.3477   1.7628   0.0201
 F4E  H6   H  HCR5  0   0.274  -0.1939  -2.3489  -0.0351
 F4E  H7   H  HCR5  0   0.287  -4.6581   0.2744  -0.0029

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 F4E  C10  C09  aromatic  1.358  0.020  1.358
 F4E  C10  C11  aromatic  1.425  0.020  1.425
 F4E  C09  O08  aromatic  1.362  0.020  1.362
 F4E  C11  N12  aromatic  1.349  0.020  1.349
 F4E  C11  C07  aromatic  1.379  0.020  1.379
 F4E  O08  C07  aromatic  1.350  0.020  1.350
 F4E  N12  C05  aromatic  1.378  0.020  1.378
 F4E  C07  C06  aromatic  1.396  0.020  1.396
 F4E  C05  C06  aromatic  1.390  0.020  1.390
 F4E  C05  C03  single    1.454  0.020  1.454
 F4E  C03  O02  single    1.328  0.020  1.328
 F4E  C03  O04  double    1.210  0.020  1.210
 F4E  O02  C01  single    1.427  0.020  1.427
 F4E  C10  H1   single    0.930  0.020  1.080
 F4E  N12  H2   single    0.860  0.020  1.020
 F4E  C01  H3   single    0.970  0.020  1.090
 F4E  C01  H4   single    0.970  0.020  1.090
 F4E  C01  H5   single    0.970  0.020  1.090
 F4E  C06  H6   single    0.930  0.020  1.080
 F4E  C09  H7   single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 F4E  H1   C10  C11  129.83  3.000
 F4E  H1   C10  C09  126.18  3.000
 F4E  C11  C10  C09  103.99  3.000
 F4E  H2   N12  C11  126.54  3.000
 F4E  H2   N12  C05  125.43  3.000
 F4E  C11  N12  C05  108.03  3.000
 F4E  H5   C01  H4   109.37  3.000
 F4E  H5   C01  H3   109.40  3.000
 F4E  H4   C01  H3   109.30  3.000
 F4E  H5   C01  O02  105.88  3.000
 F4E  H4   C01  O02  111.42  3.000
 F4E  H3   C01  O02  111.40  3.000
 F4E  O04  C03  O02  124.08  3.000
 F4E  O04  C03  C05  123.81  3.000
 F4E  O02  C03  C05  112.12  3.000
 F4E  C06  C05  C03  126.36  3.000
 F4E  C03  C05  N12  123.56  3.000
 F4E  C06  C05  N12  110.08  3.000
 F4E  H6   C06  C07  129.84  3.000
 F4E  H6   C06  C05  126.04  3.000
 F4E  C07  C06  C05  104.12  3.000
 F4E  O08  C07  C11  110.47  3.000
 F4E  O08  C07  C06  139.56  3.000
 F4E  C11  C07  C06  109.98  3.000
 F4E  H7   C09  O08  115.95  3.000
 F4E  H7   C09  C10  130.91  3.000
 F4E  O08  C09  C10  113.14  3.000
 F4E  C07  C11  N12  107.79  3.000
 F4E  C07  C11  C10  107.00  3.000
 F4E  N12  C11  C10  145.21  3.000
 F4E  C03  O02  C01  117.55  3.000
 F4E  C09  O08  C07  105.40  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 F4E  CONST_01  C07  O08  C09  C10    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_02  C05  N12  C11  C10  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_03  O08  C07  C11  C10    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_04  C06  C07  C11  C10  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_05  C09  C10  C11  N12  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_06  O08  C07  C11  N12  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_07  C06  C07  C11  N12    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_08  C07  C06  C05  N12    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_09  C07  C11  N12  C05    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_10  C11  C07  C06  C05    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_11  O08  C07  C06  C05  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_12  C09  O08  C07  C06  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_13  C11  N12  C05  C06    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_14  C09  C10  C11  C07    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_15  C11  C07  O08  C09    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_16  O08  C09  C10  C11    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_17  C11  N12  C05  C03  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_18  C07  C06  C05  C03  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_19  H2   N12  C11  C10    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_20  H1   C10  C11  N12    0.00   0.0  0
 F4E  CONST_21  H6   C06  C05  N12  180.00   0.0  0
 F4E  CONST_22  H7   C09  O08  C07  180.00   0.0  0
 F4E  Var_01    O02  C03  C05  N12    0.18  30.0  2
 F4E  Var_02    C05  C03  O02  C01  179.99  30.0  1
 F4E  Var_03    H3   C01  O02  C03  -61.31  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 F4E  plan-1  C10  0.020
 F4E  plan-1  N12  0.020
 F4E  plan-1  C03  0.020
 F4E  plan-1  C05  0.020
 F4E  plan-1  C06  0.020
 F4E  plan-1  C07  0.020
 F4E  plan-1  C09  0.020
 F4E  plan-1  C11  0.020
 F4E  plan-1  O08  0.020
 F4E  plan-1  H1   0.020
 F4E  plan-1  H2   0.020
 F4E  plan-1  H6   0.020
 F4E  plan-1  H7   0.020
 F4E  plan-2  C03  0.020
 F4E  plan-2  C05  0.020
 F4E  plan-2  O02  0.020
 F4E  plan-2  O04  0.020

