# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Oct 31 11:18:46 2019
#
#   Ligand name: 1-O-phosphono-beta-D-fructofuranose
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: OC[C@H]1O[C@](O)(CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
F1X        F1X '1-O-phosphono-beta-D-fructofuranose' ligand 27 16 .
2019-10-31 2019-10-31
;
CIF prepared directly in eLBOW
;
#
data_comp_F1X
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
F1X         C1     C   CH2    0    .       1.8638   -0.0625    0.4567
F1X         O1     O   O2     0    .       2.3534    1.1678    0.9399
F1X         P1     P   P      0    .       3.9975    1.3615    1.0887
F1X         C2     C   CT     0    .       0.3194   -0.0416    0.4592
F1X         O2     O   OH1    0    .      -0.1708   -0.0211    1.7708
F1X         C3     C   CH1    0    .      -0.2447   -1.2968   -0.3098
F1X         O3     O   OH1    0    .      -0.8087   -2.1417    0.5443
F1X         C4     C   CH1    0    .      -1.3259   -0.7301   -1.3063
F1X         O4     O   OH1    0    .      -0.8026   -0.7617   -2.7006
F1X         C5     C   CH1    0    .      -1.5270    0.4856   -0.9371
F1X         O5     O   O2     0    .      -0.1146    0.9874   -0.1961
F1X         C6     C   CH2    0    .      -2.6899    0.5496    0.0507
F1X         O6     O   OH1    0    .      -3.8436    0.9828   -0.6127
F1X         O1P    O   OP    -1    .       4.2900    2.4034    2.1552
F1X         O2P    O   OP    -1    .       4.5685    1.8158   -0.2216
F1X         O3P    O   O      0    .       4.6277    0.0437    1.4843
F1X         H1     H   HCH2   0    .       2.2191   -0.2198   -0.5514
F1X         H1A    H   HCH2   0    .       2.2190   -0.8731    1.0990
F1X         HO2    H   HOH1   0    .       0.2217    0.7111    2.2476
F1X         H3     H   HCH1   0    .       0.5627   -1.7932   -0.8691
F1X         HO3    H   HOH1   0    .      -0.6068   -3.0339    0.2879
F1X         H4     H   HCH1   0    .      -2.2613   -1.3151   -1.2274
F1X         HO4    H   HOH1   0    .      -1.2916   -1.3839   -3.2035
F1X         H5     H   HCH1   0    .      -1.7326    1.1109   -1.8067
F1X         H6     H   HCH2   0    .      -2.4477    1.2486    0.8537
F1X         H6A    H   HCH2   0    .      -2.8618   -0.4314    0.4675
F1X         HO6    H   HOH1   0    .      -4.5131    1.2379    0.0367
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
F1X   O1      C1    single        1.409 0.020     1.409
F1X   C1      C2    single        1.545 0.020     1.545
F1X   C1      H1    single        0.970 0.020     1.090
F1X   C1      H1A   single        0.970 0.020     1.090
F1X   P1      O1    single        1.662 0.020     1.662
F1X   O3P     P1    deloc         1.513 0.020     1.513
F1X   P1      O2P   deloc         1.500 0.020     1.500
F1X   P1      O1P   deloc         1.519 0.020     1.519
F1X   O2      C2    single        1.400 0.020     1.400
F1X   C2      O5    single        1.295 0.020     1.295
F1X   C2      C3    single        1.576 0.020     1.576
F1X   O2      HO2   single        0.850 0.020     0.980
F1X   O3      C3    single        1.327 0.020     1.327
F1X   C3      C4    single        1.576 0.020     1.576
F1X   C3      H3    single        0.970 0.020     1.090
F1X   O3      HO3   single        0.850 0.020     0.980
F1X   C5      C4    single        1.286 0.020     1.286
F1X   C4      O4    single        1.490 0.020     1.490
F1X   C4      H4    single        0.970 0.020     1.090
F1X   O4      HO4   single        0.850 0.020     0.980
F1X   O5      C5    single        1.672 0.020     1.672
F1X   C5      C6    single        1.527 0.020     1.527
F1X   C5      H5    single        0.970 0.020     1.090
F1X   C6      O6    single        1.400 0.020     1.400
F1X   C6      H6    single        0.970 0.020     1.090
F1X   C6      H6A   single        0.970 0.020     1.090
F1X   O6      HO6   single        0.850 0.020     0.980
#
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
F1X   H1A     C1      H1          109.47 3.000
F1X   H1A     C1      C2          109.50 3.000
F1X   H1      C1      C2          109.41 3.000
F1X   H1A     C1      O1          109.44 3.000
F1X   H1      C1      O1          109.44 3.000
F1X   C2      C1      O1          109.57 3.000
F1X   P1      O1      C1          118.43 3.000
F1X   O3P     P1      O2P         109.49 3.000
F1X   O2P     P1      O1P         109.40 3.000
F1X   O3P     P1      O1P         109.48 3.000
F1X   O1P     P1      O1          109.46 3.000
F1X   O2P     P1      O1          109.49 3.000
F1X   O3P     P1      O1          109.50 3.000
F1X   O5      C2      C3          105.43 3.000
F1X   C3      C2      O2          110.08 3.000
F1X   O5      C2      O2          110.19 3.000
F1X   C3      C2      C1          110.26 3.000
F1X   O5      C2      C1          110.19 3.000
F1X   O2      C2      C1          110.59 3.000
F1X   HO2     O2      C2          109.51 3.000
F1X   H3      C3      C4          110.13 3.000
F1X   H3      C3      O3          110.59 3.000
F1X   C4      C3      O3          110.14 3.000
F1X   H3      C3      C2          110.15 3.000
F1X   C4      C3      C2          105.53 3.000
F1X   O3      C3      C2          110.19 3.000
F1X   HO3     O3      C3          109.51 3.000
F1X   H4      C4      C5          110.32 3.000
F1X   H4      C4      O4          110.65 3.000
F1X   C5      C4      O4          110.09 3.000
F1X   H4      C4      C3          110.18 3.000
F1X   O4      C4      C3          110.07 3.000
F1X   C5      C4      C3          105.40 3.000
F1X   HO4     O4      C4          109.44 3.000
F1X   H5      C5      C6          110.37 3.000
F1X   H5      C5      O5          109.91 3.000
F1X   C6      C5      O5          110.12 3.000
F1X   H5      C5      C4          110.03 3.000
F1X   C6      C5      C4          110.13 3.000
F1X   O5      C5      C4          106.19 3.000
F1X   C5      O5      C2          105.60 3.000
F1X   H6A     C6      H6          109.46 3.000
F1X   H6A     C6      O6          109.45 3.000
F1X   H6      C6      O6          109.47 3.000
F1X   H6A     C6      C5          109.45 3.000
F1X   H6      C6      C5          109.48 3.000
F1X   O6      C6      C5          109.52 3.000
F1X   HO6     O6      C6          109.52 3.000
#
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
F1X Var_01         C2      C1      O1      P1          177.55  30.0 3
F1X Var_02         O3P     P1      O1      C1          -34.32  30.0 2
#
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
F1X chir_01   C2      O2      O5      C3    positiv
F1X chir_02   C3      O3      C2      C4    positiv
F1X chir_03   C4      O4      C5      C3    positiv
F1X chir_04   C5      O5      C4      C6    negativ
