# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Oct 31 10:54:43 2019
#
#   Ligand name: 1-O-phosphono-beta-D-fructopyranose
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O[C@@H]1CO[C@](O)(CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
F1P        F1P '1-O-phosphono-beta-D-fructopyranose' saccharide 27 16 .
2019-10-31 2019-10-31
;
CIF prepared directly in eLBOW
;
#
data_comp_F1P
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
F1P         C1     C   CH2    0    .       1.7207    0.3988   -0.3277
F1P         C2     C   CT     0    .       0.1936    0.3927   -0.3434
F1P         C3     C   CH1    0    .      -0.3149    0.4427    1.0970
F1P         C4     C   CH1    0    .      -1.7933    0.2799    1.1742
F1P         C5     C   CH1    0    .      -2.2614   -0.9441    0.4533
F1P         C6     C   CH2    0    .      -1.7463   -0.9941   -0.9928
F1P         O1     O   O2     0    .       2.2013    0.0948   -1.6055
F1P         O2     O   OH1    0    .      -0.2509    1.4921   -1.0055
F1P         O3     O   OH1    0    .       0.0424    1.7086    1.6708
F1P         O4     O   OH1    0    .      -2.1813    0.1786    2.5704
F1P         O5     O   OH1    0    .      -1.7914   -2.0978    1.1504
F1P         O6     O   O2     0    .      -0.2782   -0.8338   -1.0664
F1P         P1     P   P      0    .       3.8319    0.0225   -1.8347
F1P         O1P    O   O      0    .       4.1224   -0.4066   -3.2530
F1P         O2P    O   OP    -1    .       4.4315   -0.9762   -0.8739
F1P         O3P    O   OP    -1    .       4.4359    1.3842   -1.5872
F1P         H11    H   HCH2   0    .       2.0753    1.3804   -0.0320
F1P         H12    H   HCH2   0    .       2.0779   -0.3428    0.3789
F1P         H3     H   HCH1   0    .       0.1557   -0.3521    1.6631
F1P         H4     H   HCH1   0    .      -2.2658    1.1494    0.7335
F1P         H5     H   HCH1   0    .      -3.3446   -0.9508    0.4403
F1P         H61    H   HCH2   0    .      -2.0170   -1.9499   -1.4286
F1P         H62    H   HCH2   0    .      -2.2150   -0.1969   -1.5598
F1P         HO2    H   HOH1   0    .       0.0850    1.4853   -1.8882
F1P         HO3    H   HOH1   0    .       0.4253    1.5711    2.5230
F1P         HO4    H   HOH1   0    .      -2.8602    0.8085    2.7549
F1P         HO5    H   HOH1   0    .      -2.4788   -2.7442    1.1887
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
F1P   C1      C2    single        1.527 0.020     1.527
F1P   C1      O1    single        1.399 0.020     1.399
F1P   C1      H11   single        0.970 0.020     1.090
F1P   C1      H12   single        0.970 0.020     1.090
F1P   C2      C3    single        1.528 0.020     1.528
F1P   C2      O2    single        1.358 0.020     1.358
F1P   C2      O6    single        1.500 0.020     1.500
F1P   C3      C4    single        1.489 0.020     1.489
F1P   C3      O3    single        1.435 0.020     1.435
F1P   C3      H3    single        0.970 0.020     1.090
F1P   C4      C5    single        1.496 0.020     1.496
F1P   C4      O4    single        1.453 0.020     1.453
F1P   C4      H4    single        0.970 0.020     1.090
F1P   C5      C6    single        1.536 0.020     1.536
F1P   C5      O5    single        1.428 0.020     1.428
F1P   C5      H5    single        0.970 0.020     1.090
F1P   C6      O6    single        1.479 0.020     1.479
F1P   C6      H61   single        0.970 0.020     1.090
F1P   C6      H62   single        0.970 0.020     1.090
F1P   O1      P1    single        1.648 0.020     1.648
F1P   O2      HO2   single        0.850 0.020     0.980
F1P   O3      HO3   single        0.850 0.020     0.980
F1P   O4      HO4   single        0.850 0.020     0.980
F1P   O5      HO5   single        0.850 0.020     0.980
F1P   P1      O1P   deloc         1.510 0.020     1.510
F1P   P1      O2P   deloc         1.510 0.020     1.510
F1P   P1      O3P   deloc         1.510 0.020     1.510
#
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
F1P   H12     C1      H11         109.47 3.000
F1P   H12     C1      O1          109.47 3.000
F1P   H11     C1      O1          109.47 3.000
F1P   H12     C1      C2          109.47 3.000
F1P   H11     C1      C2          109.47 3.000
F1P   O1      C1      C2          109.47 3.000
F1P   O6      C2      O2          108.91 3.000
F1P   O6      C2      C3          112.11 3.000
F1P   O2      C2      C3          108.91 3.000
F1P   O6      C2      C1          108.83 3.000
F1P   O2      C2      C1          109.21 3.000
F1P   C3      C2      C1          108.83 3.000
F1P   H3      C3      O3          109.28 3.000
F1P   H3      C3      C4          108.90 3.000
F1P   O3      C3      C4          108.84 3.000
F1P   H3      C3      C2          108.90 3.000
F1P   O3      C3      C2          108.84 3.000
F1P   C4      C3      C2          112.06 3.000
F1P   H4      C4      O4          109.30 3.000
F1P   H4      C4      C5          108.92 3.000
F1P   O4      C4      C5          108.82 3.000
F1P   H4      C4      C3          108.92 3.000
F1P   O4      C4      C3          108.82 3.000
F1P   C5      C4      C3          112.03 3.000
F1P   H5      C5      O5          109.27 3.000
F1P   H5      C5      C6          108.89 3.000
F1P   O5      C5      C6          108.84 3.000
F1P   H5      C5      C4          108.89 3.000
F1P   O5      C5      C4          108.84 3.000
F1P   C6      C5      C4          112.06 3.000
F1P   H62     C6      H61         109.25 3.000
F1P   H62     C6      O6          108.86 3.000
F1P   H61     C6      O6          108.86 3.000
F1P   H62     C6      C5          108.86 3.000
F1P   H61     C6      C5          108.86 3.000
F1P   O6      C6      C5          112.10 3.000
F1P   P1      O1      C1          118.46 3.000
F1P   HO2     O2      C2          109.47 3.000
F1P   HO3     O3      C3          109.47 3.000
F1P   HO4     O4      C4          109.47 3.000
F1P   HO5     O5      C5          109.47 3.000
F1P   C6      O6      C2          112.15 3.000
F1P   O3P     P1      O2P         109.47 3.000
F1P   O3P     P1      O1P         109.47 3.000
F1P   O2P     P1      O1P         109.47 3.000
F1P   O3P     P1      O1          109.47 3.000
F1P   O2P     P1      O1          109.47 3.000
F1P   O1P     P1      O1          109.47 3.000
#
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
F1P Var_01         C5      C6      O6      C2          -52.97  30.0 1
F1P Var_02         O1P     P1      O1      C1          176.29  30.0 3
F1P Var_03         H11     C1      O1      P1           60.77  30.0 1
#
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
F1P chir_01   C2      C3      O2      O6    positiv
F1P chir_02   C3      O3      C2      C4    positiv
F1P chir_03   C4      O4      C3      C5    negativ
F1P chir_04   C5      O5      C4      C6    negativ
