# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Wed Apr 29 13:00:04 2020
#   Inital geometry file: a 116 line input string
#   Ligand name: ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-[(1-methyl-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]carbamoyl]amino]ethanoate
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CCOC(=O)CNC(=O)N(Cc1ccc(N)cc1)Cc2cn(C)nn2
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 F1E  F1E  'ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-[(1-methyl-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]carbamoyl]amino]ethanoate'  ligand  47  25  .  2021-08-09  2021-08-09  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_F1E
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 F1E  O1   O  O     0  -0.444   3.6433  -0.8136   1.2800
 F1E  C2   C  C     0   0.568   3.6865  -1.3820   0.2195
 F1E  O    O  O2    0  -0.456   4.7111  -2.1018  -0.2034
 F1E  C1   C  CH2   0  -0.180   5.8556  -2.2282   0.6582
 F1E  C    C  CH3   0  -0.690   6.8918  -3.0454  -0.0734
 F1E  C3   C  CH2   0  -0.380   2.5873  -1.3690  -0.8164
 F1E  N    N  NH1   0  -0.706   1.4834  -0.5686  -0.3683
 F1E  C4   C  C     0   0.755   0.2687  -0.7036  -0.9751
 F1E  O2   O  O     0  -0.546   0.0818  -1.5095  -1.8822
 F1E  N1   N  NT    0  -0.474  -0.7273   0.0947  -0.4913
 F1E  C12  C  CH2   0  -0.452  -0.6214   0.8314   0.7536
 F1E  C13  C  CR5   0   0.207  -0.0481   2.1983   0.5826
 F1E  C14  C  CR15  0  -0.077  -0.6557   3.4269   0.5569
 F1E  N3   N  NR5   0  -0.245   0.3493   4.2874   0.3240
 F1E  C15  C  CH3   0  -0.513   0.2947   5.7313   0.2494
 F1E  N4   N  N     0  -0.081   1.5000   3.6525   0.2150
 F1E  N5   N  N     0  -0.338   1.2705   2.3940   0.3691
 F1E  C5   C  CH2   0  -0.395  -1.9780   0.2270  -1.2166
 F1E  C6   C  CR6   0   0.094  -3.1249  -0.4902  -0.5552
 F1E  C7   C  CR16  0  -0.305  -4.2315   0.1988  -0.0733
 F1E  C8   C  CR16  0  -0.317  -5.2887  -0.4596   0.5387
 F1E  C9   C  CR6   0   0.292  -5.2673  -1.8487   0.6939
 F1E  N2   N  NH2   0  -0.859  -6.2832  -2.5097   1.3520
 F1E  C10  C  CR16  0  -0.311  -4.1524  -2.5469   0.2077
 F1E  C11  C  CR16  0  -0.287  -3.1085  -1.8763  -0.4019
 F1E  H1   H  HCH2  0   0.238   6.2413  -1.2373   0.9039
 F1E  H2   H  HCH2  0   0.238   5.5585  -2.7145   1.5892
 F1E  H3   H  HCH3  0   0.237   7.2025  -2.5601  -0.9984
 F1E  H4   H  HCH3  0   0.241   7.7722  -3.1544   0.5591
 F1E  H5   H  HCH3  0   0.238   6.5233  -4.0437  -0.3088
 F1E  H6   H  HCH2  0   0.271   3.0114  -1.0244  -1.7673
 F1E  H7   H  HCH2  0   0.289   2.2610  -2.3970  -0.9828
 F1E  H8   H  HNH1  0   0.410   1.7244   0.3297   0.0341
 F1E  H9   H  HCH2  0   0.286  -1.6195   0.9050   1.1889
 F1E  H10  H  HCH2  0   0.285  -0.0257   0.2622   1.4694
 F1E  H11  H  HCR5  0   0.311  -1.6789   3.7369   0.6846
 F1E  H12  H  HCH3  0   0.273   0.5441   6.1714   1.2126
 F1E  H13  H  HCH3  0   0.276   0.9987   6.0770  -0.5016
 F1E  H14  H  HCH3  0   0.271  -0.7082   6.0336  -0.0350
 F1E  H15  H  HCH2  0   0.254  -2.2164   1.2915  -1.3088
 F1E  H16  H  HCH2  0   0.269  -1.8267  -0.1420  -2.2295
 F1E  H17  H  HCR6  0   0.245  -4.2795   1.2773  -0.1795
 F1E  H18  H  HCR6  0   0.253  -6.1365   0.1080   0.9048
 F1E  H19  H  HNH2  0   0.377  -7.1729  -2.0373   1.3669
 F1E  H20  H  HNH2  0   0.378  -6.3857  -3.4864   1.1271
 F1E  H21  H  HCR6  0   0.253  -4.1112  -3.6253   0.3097
 F1E  H22  H  HCR6  0   0.247  -2.2635  -2.4428  -0.7750

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 F1E  N2   C9   single    1.379  0.020  1.379
 F1E  C9   C8   aromatic  1.398  0.020  1.398
 F1E  C9   C10  aromatic  1.402  0.020  1.402
 F1E  C8   C7   aromatic  1.388  0.020  1.388
 F1E  C10  C11  aromatic  1.382  0.020  1.382
 F1E  C7   C6   aromatic  1.390  0.020  1.390
 F1E  C11  C6   aromatic  1.395  0.020  1.395
 F1E  C6   C5   single    1.506  0.020  1.506
 F1E  C5   N1   single    1.452  0.020  1.452
 F1E  O2   C4   double    1.228  0.020  1.228
 F1E  N1   C4   single    1.365  0.020  1.365
 F1E  N1   C12  single    1.450  0.020  1.450
 F1E  C4   N    single    1.364  0.020  1.364
 F1E  O1   C2   double    1.204  0.020  1.204
 F1E  C1   C    single    1.509  0.020  1.509
 F1E  C1   O    single    1.438  0.020  1.438
 F1E  C12  C13  single    1.492  0.020  1.492
 F1E  C14  C13  aromatic  1.371  0.020  1.371
 F1E  C14  N3   aromatic  1.343  0.020  1.343
 F1E  C2   O    single    1.322  0.020  1.322
 F1E  C2   C3   single    1.510  0.020  1.510
 F1E  C13  N5   aromatic  1.350  0.020  1.350
 F1E  N    C3   single    1.435  0.020  1.435
 F1E  N3   C15  single    1.447  0.020  1.447
 F1E  N3   N4   aromatic  1.319  0.020  1.319
 F1E  N5   N4   aromatic  1.289  0.020  1.289
 F1E  C1   H1   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C1   H2   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C    H3   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C    H4   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C    H5   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C3   H6   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C3   H7   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  N    H8   single    0.890  0.020  1.040
 F1E  C12  H9   single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C12  H10  single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C14  H11  single    0.930  0.020  1.080
 F1E  C15  H12  single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C15  H13  single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C15  H14  single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C5   H15  single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C5   H16  single    0.970  0.020  1.090
 F1E  C7   H17  single    0.930  0.020  1.080
 F1E  C8   H18  single    0.930  0.020  1.080
 F1E  N2   H19  single    0.890  0.020  1.040
 F1E  N2   H20  single    0.890  0.020  1.040
 F1E  C10  H21  single    0.930  0.020  1.080
 F1E  C11  H22  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 F1E  C3   C2   O    110.45  3.000
 F1E  C3   C2   O1   125.02  3.000
 F1E  O    C2   O1   124.53  3.000
 F1E  C1   O    C2   118.24  3.000
 F1E  H2   C1   H1   107.98  3.000
 F1E  H2   C1   C    111.05  3.000
 F1E  H1   C1   C    110.99  3.000
 F1E  H2   C1   O    109.48  3.000
 F1E  H1   C1   O    109.65  3.000
 F1E  C    C1   O    107.68  3.000
 F1E  H5   C    H4   107.88  3.000
 F1E  H5   C    H3   108.72  3.000
 F1E  H4   C    H3   107.88  3.000
 F1E  H5   C    C1   111.63  3.000
 F1E  H4   C    C1   109.12  3.000
 F1E  H3   C    C1   111.47  3.000
 F1E  H7   C3   H6   106.22  3.000
 F1E  H7   C3   N    110.06  3.000
 F1E  H6   C3   N    113.13  3.000
 F1E  H7   C3   C2   108.30  3.000
 F1E  H6   C3   C2   108.42  3.000
 F1E  N    C3   C2   110.51  3.000
 F1E  H8   N    C4   118.43  3.000
 F1E  H8   N    C3   115.81  3.000
 F1E  C4   N    C3   119.39  3.000
 F1E  N1   C4   O2   122.32  3.000
 F1E  N1   C4   N    115.73  3.000
 F1E  O2   C4   N    121.94  3.000
 F1E  C5   N1   C12  116.46  3.000
 F1E  C12  N1   C4   123.22  3.000
 F1E  C5   N1   C4   120.31  3.000
 F1E  H10  C12  H9   105.83  3.000
 F1E  H10  C12  C13  110.07  3.000
 F1E  H9   C12  C13  109.59  3.000
 F1E  H10  C12  N1   109.75  3.000
 F1E  H9   C12  N1   108.04  3.000
 F1E  C13  C12  N1   113.26  3.000
 F1E  N5   C13  C14  107.45  3.000
 F1E  N5   C13  C12  121.75  3.000
 F1E  C14  C13  C12  130.76  3.000
 F1E  H11  C14  N3   123.17  3.000
 F1E  H11  C14  C13  132.60  3.000
 F1E  N3   C14  C13  104.23  3.000
 F1E  N4   N3   C15  120.61  3.000
 F1E  N4   N3   C14  111.02  3.000
 F1E  C15  N3   C14  128.31  3.000
 F1E  H14  C15  H13  109.22  3.000
 F1E  H14  C15  H12  109.34  3.000
 F1E  H13  C15  H12  109.57  3.000
 F1E  H14  C15  N3   109.04  3.000
 F1E  H13  C15  N3   109.20  3.000
 F1E  H12  C15  N3   110.45  3.000
 F1E  N5   N4   N3   107.75  3.000
 F1E  N4   N5   C13  109.54  3.000
 F1E  H16  C5   H15  106.36  3.000
 F1E  H16  C5   C6   110.68  3.000
 F1E  H15  C5   C6   109.52  3.000
 F1E  H16  C5   N1   108.32  3.000
 F1E  H15  C5   N1   108.56  3.000
 F1E  C6   C5   N1   113.16  3.000
 F1E  C11  C6   C7   117.64  3.000
 F1E  C11  C6   C5   120.85  3.000
 F1E  C7   C6   C5   121.51  3.000
 F1E  H17  C7   C8   118.77  3.000
 F1E  H17  C7   C6   119.61  3.000
 F1E  C8   C7   C6   121.62  3.000
 F1E  H18  C8   C9   119.66  3.000
 F1E  H18  C8   C7   119.75  3.000
 F1E  C9   C8   C7   120.58  3.000
 F1E  C10  C9   N2   120.83  3.000
 F1E  C10  C9   C8   117.93  3.000
 F1E  N2   C9   C8   121.19  3.000
 F1E  H20  N2   H19  111.60  3.000
 F1E  H20  N2   C9   115.66  3.000
 F1E  H19  N2   C9   115.65  3.000
 F1E  H21  C10  C11  119.69  3.000
 F1E  H21  C10  C9   119.53  3.000
 F1E  C11  C10  C9   120.78  3.000
 F1E  H22  C11  C10  119.15  3.000
 F1E  H22  C11  C6   119.40  3.000
 F1E  C10  C11  C6   121.45  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 F1E  CONST_01  N4   N3   C14  C13     0.00   0.0  0
 F1E  CONST_02  N3   N4   N5   C13     0.00   0.0  0
 F1E  CONST_03  N4   N5   C13  C14     0.00   0.0  0
 F1E  CONST_04  N5   N4   N3   C14     0.00   0.0  0
 F1E  CONST_05  N5   C13  C14  N3      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_06  C9   C8   C7   C6      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_07  C9   C10  C11  C6      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_08  C10  C9   C8   C7      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_09  C10  C11  C6   C7      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_10  C11  C10  C9   C8      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_11  C11  C6   C7   C8      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_12  N3   C14  C13  C12   180.00   0.0  0
 F1E  CONST_13  N4   N5   C13  C12   180.00   0.0  0
 F1E  CONST_14  C15  N3   C14  C13   180.00   0.0  0
 F1E  CONST_15  N5   N4   N3   C15   180.00   0.0  0
 F1E  CONST_16  C8   C7   C6   C5    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_17  C10  C11  C6   C5    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_18  N2   C9   C8   C7    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_19  C11  C10  C9   N2    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_20  H11  C14  N3   N4    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_21  H18  C8   C7   C6    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_22  H21  C10  C11  C6    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_23  H22  C11  C6   C7    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_24  H17  C7   C8   C9    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_27  O2   C4   N    C3      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_28  C5   N1   C4   O2      0.00   0.0  0
 F1E  CONST_29  C12  N1   C4   O2    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_30  N1   C4   N    C3    180.00   0.0  0
 F1E  CONST_31  C5   N1   C4   N     180.00   0.0  0
 F1E  CONST_32  C12  N1   C4   N       0.00   0.0  0
 F1E  Var_01    C7   C6   C5   N1    116.70  30.0  2
 F1E  Var_02    C14  C13  C12  N1    102.35  30.0  2
 F1E  Var_03    H12  C15  N3   C14    94.72  30.0  2
 F1E  Var_04    C6   C5   N1   C4    107.18  30.0  2
 F1E  Var_05    C13  C12  N1   C4     89.88  30.0  3
 F1E  Var_06    N    C3   C2   O1      0.69  30.0  3
 F1E  Var_07    C    C1   O    C2   -177.88  30.0  1
 F1E  Var_08    C4   N    C3   C2   -162.90  30.0  2
 F1E  Var_09    C3   C2   O    C1   -179.92  30.0  1
 F1E  Var_10    H3   C    C1   O      60.84  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 F1E  plan-1  C12  0.020
 F1E  plan-1  C13  0.020
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 F1E  plan-3  C3   0.020
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 F1E  plan-5  C2   0.020
 F1E  plan-5  O    0.020
 F1E  plan-5  C3   0.020

