# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Wed Apr 29 06:27:01 2020
#   Inital geometry file: a 83 line input string
#   Ligand name: 4-[(~{Z})-2-[3,5-bis(oxidanyl)phenyl]ethenyl]benzene-1,3-diol
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Oc1ccc(\C=C/c2cc(O)cc(O)c2)c(O)c1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 EZH  EZH  4-[(~{Z})-2-[3,5-bis(oxidanyl)phenyl]ethenyl]benzene-1,3-diol  ligand  30  18  .  2021-08-08  2021-08-08  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_EZH
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 EZH  C4   C  CR16  0  -0.247  -1.2248   0.1679  -1.1603
 EZH  C5   C  CR6   0  -0.095  -1.4849  -0.9709  -0.4020
 EZH  C6   C  C1    0  -0.226  -0.5636  -2.1135  -0.3732
 EZH  C7   C  C1    0  -0.263   0.7668  -2.0938  -0.2270
 EZH  C8   C  CR6   0   0.109   1.6464  -0.9578   0.0857
 EZH  C10  C  CR6   0   0.387   3.8203   0.0678  -0.1356
 EZH  C13  C  CR6   0   0.393   2.1296   1.1158   1.2075
 EZH  C15  C  CR16  0  -0.408   1.2430   0.0842   0.9161
 EZH  O1   O  OH1   0  -0.630  -4.2093   2.1622  -0.5234
 EZH  C2   C  CR6   0   0.359  -3.3013   1.1687  -0.5122
 EZH  C3   C  CR16  0  -0.401  -2.1069   1.2323  -1.2270
 EZH  C9   C  CR16  0  -0.478   2.9449  -0.9722  -0.4278
 EZH  O11  O  OH1   0  -0.633   5.0796   0.1064  -0.6142
 EZH  C12  C  CR16  0  -0.484   3.4176   1.1189   0.6822
 EZH  O14  O  OH1   0  -0.635   1.6923   2.0973   2.0215
 EZH  C16  C  CR6   0   0.348  -2.6999  -1.0181   0.2955
 EZH  O17  O  OH1   0  -0.621  -2.9474  -2.1232   1.0233
 EZH  C18  C  CR16  0  -0.471  -3.5971   0.0419   0.2480
 EZH  H21  H  HCR6  0   0.258  -0.3044   0.2159  -1.7283
 EZH  H22  H  H     0   0.251  -1.0124  -3.0897  -0.5306
 EZH  H23  H  H     0   0.251   1.2814  -3.0415  -0.3518
 EZH  H28  H  HCR6  0   0.257   0.2511   0.0978   1.3464
 EZH  H19  H  HOH1  0   0.476  -3.8988   2.8942  -1.0680
 EZH  H20  H  HCR6  0   0.267  -1.8727   2.0954  -1.8389
 EZH  H24  H  HCR6  0   0.263   3.2666  -1.7957  -1.0563
 EZH  H25  H  HOH1  0   0.474   5.2493  -0.6625  -1.1697
 EZH  H26  H  HCR6  0   0.274   4.1118   1.9200   0.9117
 EZH  H27  H  HOH1  0   0.474   2.3889   2.7456   2.1731
 EZH  H29  H  HOH1  0   0.477  -3.8155  -2.0677   1.4385
 EZH  H30  H  HCR6  0   0.274  -4.5269   0.0015   0.8057

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 EZH  O14  C13  single    1.348  0.020  1.348
 EZH  O1   C2   single    1.346  0.020  1.346
 EZH  C3   C2   aromatic  1.393  0.020  1.393
 EZH  C3   C4   aromatic  1.384  0.020  1.384
 EZH  C2   C18  aromatic  1.391  0.020  1.391
 EZH  C13  C15  aromatic  1.391  0.020  1.391
 EZH  C13  C12  aromatic  1.391  0.020  1.391
 EZH  C15  C8   aromatic  1.392  0.020  1.392
 EZH  C4   C5   aromatic  1.393  0.020  1.393
 EZH  C18  C16  aromatic  1.390  0.020  1.390
 EZH  C12  C10  aromatic  1.391  0.020  1.391
 EZH  C5   C16  aromatic  1.402  0.020  1.402
 EZH  C5   C6   single    1.468  0.020  1.468
 EZH  C16  O17  single    1.346  0.020  1.346
 EZH  C8   C7   single    1.470  0.020  1.470
 EZH  C8   C9   aromatic  1.396  0.020  1.396
 EZH  C6   C7   double    1.339  0.020  1.339
 EZH  C10  C9   aromatic  1.390  0.020  1.390
 EZH  C10  O11  single    1.348  0.020  1.348
 EZH  C4   H21  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  C6   H22  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  C7   H23  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  C15  H28  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  O1   H19  single    0.850  0.020  0.980
 EZH  C3   H20  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  C9   H24  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  O11  H25  single    0.850  0.020  0.980
 EZH  C12  H26  single    0.930  0.020  1.080
 EZH  O14  H27  single    0.850  0.020  0.980
 EZH  O17  H29  single    0.850  0.020  0.980
 EZH  C18  H30  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 EZH  H21  C4   C3   118.85  3.000
 EZH  H21  C4   C5   118.73  3.000
 EZH  C3   C4   C5   122.42  3.000
 EZH  C16  C5   C6   120.53  3.000
 EZH  C6   C5   C4   122.00  3.000
 EZH  C16  C5   C4   117.41  3.000
 EZH  H22  C6   C7   116.09  3.000
 EZH  H22  C6   C5   115.94  3.000
 EZH  C7   C6   C5   127.91  3.000
 EZH  H23  C7   C8   114.54  3.000
 EZH  H23  C7   C6   116.47  3.000
 EZH  C8   C7   C6   128.99  3.000
 EZH  C9   C8   C15  119.77  3.000
 EZH  C9   C8   C7   118.04  3.000
 EZH  C15  C8   C7   122.13  3.000
 EZH  C12  C10  O11  117.23  3.000
 EZH  O11  C10  C9   122.35  3.000
 EZH  C12  C10  C9   120.42  3.000
 EZH  O14  C13  C12  121.78  3.000
 EZH  C12  C13  C15  120.84  3.000
 EZH  O14  C13  C15  117.37  3.000
 EZH  H28  C15  C13  119.47  3.000
 EZH  H28  C15  C8   120.84  3.000
 EZH  C13  C15  C8   119.69  3.000
 EZH  H19  O1   C2   110.37  3.000
 EZH  C18  C2   C3   119.97  3.000
 EZH  C18  C2   O1   117.33  3.000
 EZH  C3   C2   O1   122.70  3.000
 EZH  H20  C3   C2   120.75  3.000
 EZH  H20  C3   C4   120.14  3.000
 EZH  C2   C3   C4   119.11  3.000
 EZH  H24  C9   C10  120.19  3.000
 EZH  H24  C9   C8   119.79  3.000
 EZH  C10  C9   C8   120.03  3.000
 EZH  H25  O11  C10  110.27  3.000
 EZH  H26  C12  C13  120.96  3.000
 EZH  H26  C12  C10  119.81  3.000
 EZH  C13  C12  C10  119.23  3.000
 EZH  H27  O14  C13  110.51  3.000
 EZH  C18  C16  O17  121.73  3.000
 EZH  O17  C16  C5   117.13  3.000
 EZH  C18  C16  C5   121.13  3.000
 EZH  H29  O17  C16  110.56  3.000
 EZH  H30  C18  C16  120.49  3.000
 EZH  H30  C18  C2   119.56  3.000
 EZH  C16  C18  C2   119.95  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 EZH  CONST_01  C18  C2   C3   C4     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_02  C18  C16  C5   C4     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_03  C2   C3   C4   C5     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_04  C2   C18  C16  C5     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_05  C12  C13  C15  C8     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_06  C12  C10  C9   C8     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_07  C15  C13  C12  C10    0.00   0.0  0
 EZH  CONST_08  C15  C8   C9   C10    0.00   0.0  0
 EZH  CONST_09  C9   C8   C15  C13    0.00   0.0  0
 EZH  CONST_10  C9   C10  C12  C13    0.00   0.0  0
 EZH  CONST_11  C16  C18  C2   C3     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_12  C16  C5   C4   C3     0.00   0.0  0
 EZH  CONST_13  O1   C2   C3   C4   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_14  O17  C16  C5   C4   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_15  C3   C4   C5   C6   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_16  C18  C16  C5   C6   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_17  C13  C15  C8   C7   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_18  C10  C9   C8   C7   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_19  O14  C13  C15  C8   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_20  O11  C10  C9   C8   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_21  O14  C13  C12  C10  180.00   0.0  0
 EZH  CONST_22  O11  C10  C12  C13  180.00   0.0  0
 EZH  CONST_23  C16  C18  C2   O1   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_24  O17  C16  C18  C2   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_25  H20  C3   C4   C5   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_26  H30  C18  C16  C5   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_27  H26  C12  C13  C15  180.00   0.0  0
 EZH  CONST_28  H24  C9   C8   C15  180.00   0.0  0
 EZH  CONST_29  H21  C4   C3   C2   180.00   0.0  0
 EZH  CONST_30  H28  C15  C8   C9   180.00   0.0  0
 EZH  Var_01    C8   C7   C6   C5     7.27   0.0  2
 EZH  Var_02    C7   C6   C5   C4    46.11  30.0  2
 EZH  Var_03    C15  C8   C7   C6    33.88  30.0  2

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 EZH  plan-1  C7   0.020
 EZH  plan-1  C8   0.020
 EZH  plan-1  C10  0.020
 EZH  plan-1  C13  0.020
 EZH  plan-1  C15  0.020
 EZH  plan-1  C9   0.020
 EZH  plan-1  O11  0.020
 EZH  plan-1  C12  0.020
 EZH  plan-1  O14  0.020
 EZH  plan-1  H28  0.020
 EZH  plan-1  H24  0.020
 EZH  plan-1  H26  0.020
 EZH  plan-2  C4   0.020
 EZH  plan-2  C5   0.020
 EZH  plan-2  C6   0.020
 EZH  plan-2  O1   0.020
 EZH  plan-2  C2   0.020
 EZH  plan-2  C3   0.020
 EZH  plan-2  C16  0.020
 EZH  plan-2  O17  0.020
 EZH  plan-2  C18  0.020
 EZH  plan-2  H21  0.020
 EZH  plan-2  H20  0.020
 EZH  plan-2  H30  0.020
 EZH  plan-3  C5   0.020
 EZH  plan-3  C6   0.020
 EZH  plan-3  C7   0.020
 EZH  plan-3  C8   0.020
 EZH  plan-3  H22  0.020
 EZH  plan-3  H23  0.020

