# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat May  2 07:51:31 2020
#   Inital geometry file: a 120 line input string
#   Ligand name: [(1S)-1-{[(4'-methoxybiphenyl-4-yl)sulfonyl]amino}-2-methylpropyl]phosphonic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(cc1)c2ccc(cc2)[S](=O)(=O)N[C@H](C(C)C)[P](O)(O)=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 EIN  EIN  '[(1S)-1-{[(4'-methoxybiphenyl-4-yl)sulfonyl]amino}-2-methylpropyl]phosphonic acid'  ligand  48  26  .  2021-08-09  2021-08-09  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_EIN
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 EIN  C14   C  CR6   0   0.065   3.6097   0.2692   0.1956
 EIN  C15   C  CR16  0  -0.291   4.1533  -0.4267  -0.8809
 EIN  C16   C  CR16  0  -0.368   5.4604  -0.8920  -0.8652
 EIN  C17   C  CR6   0   0.379   6.2644  -0.6600   0.2487
 EIN  C1    C  CR16  0  -0.327   5.7343   0.0397   1.3361
 EIN  C2    C  CR16  0  -0.290   4.4303   0.4905   1.3063
 EIN  O1    O  O2    0  -0.467   7.5395  -1.0654   0.3634
 EIN  C3    C  CH3   0  -0.439   8.1351  -1.7488  -0.7230
 EIN  C4    C  CR6   0   0.112   2.2187   0.7513   0.1642
 EIN  C5    C  CR16  0  -0.301   1.4386   0.7697   1.3219
 EIN  C6    C  CR16  0  -0.216   0.1262   1.2109   1.2949
 EIN  C7    C  CR6   0  -0.230  -0.4210   1.6377   0.0932
 EIN  C8    C  CR16  0  -0.218   0.3353   1.6409  -1.0728
 EIN  C9    C  CR16  0  -0.302   1.6450   1.2026  -1.0292
 EIN  S1    S  S     0   1.379  -2.1279   2.0858   0.0121
 EIN  O2    O  OS    0  -0.651  -2.2960   3.1027  -1.0108
 EIN  O3    O  OS    0  -0.643  -2.5905   2.3188   1.3683
 EIN  N1    N  NC1   0  -0.740  -2.9285   0.7586  -0.5525
 EIN  C10   C  CH1   0  -0.390  -2.9263  -0.4937   0.2014
 EIN  C11   C  CH1   0  -0.237  -1.8820  -1.5068  -0.3069
 EIN  C12   C  CH3   0  -0.655  -1.5266  -2.5604   0.7370
 EIN  C13   C  CH3   0  -0.695  -2.2277  -2.1489  -1.6470
 EIN  P1    P  P     0   1.400  -4.7044  -0.9408   0.2509
 EIN  O4    O  O     0  -0.698  -5.5294  -0.0076   1.0488
 EIN  O5    O  OH1   0  -0.751  -5.2213  -0.9425  -1.2730
 EIN  O6    O  OH1   0  -0.736  -4.6789  -2.4667   0.7378
 EIN  H15   H  HCR6  0   0.262   3.5452  -0.6388  -1.7517
 EIN  H16   H  HCR6  0   0.283   5.8274  -1.4361  -1.7245
 EIN  H1    H  HCR6  0   0.267   6.3578   0.2348   2.1996
 EIN  H2    H  HCR6  0   0.259   4.0564   1.0470   2.1567
 EIN  H31   H  HCH3  0   0.262   9.1558  -1.9723  -0.4238
 EIN  H32   H  HCH3  0   0.231   7.6214  -2.6867  -0.9478
 EIN  H33   H  HCH3  0   0.231   8.1586  -1.1341  -1.6264
 EIN  H5    H  HCR6  0   0.269   1.8466   0.4144   2.2589
 EIN  H6    H  HCR6  0   0.288  -0.4579   1.2101   2.2052
 EIN  H8    H  HCR6  0   0.288  -0.0811   1.9859  -2.0099
 EIN  H9    H  HCR6  0   0.270   2.2347   1.2314  -1.9360
 EIN  HN1   H  HNC1  0   0.418  -2.8810   0.6682  -1.5612
 EIN  H10   H  HCH1  0   0.314  -2.6844  -0.2553   1.2421
 EIN  H11   H  HCH1  0   0.258  -0.9799  -0.9068  -0.4608
 EIN  H121  H  HCH3  0   0.236  -2.3186  -3.2941   0.8764
 EIN  H122  H  HCH3  0   0.238  -0.6314  -3.0969   0.4219
 EIN  H123  H  HCH3  0   0.232  -1.3113  -2.1058   1.7054
 EIN  H131  H  HCH3  0   0.223  -3.0450  -2.8672  -1.5582
 EIN  H132  H  HCH3  0   0.234  -2.4835  -1.4178  -2.4168
 EIN  H133  H  HCH3  0   0.260  -1.3676  -2.7029  -2.0219
 EIN  HO5   H  HOH1  0   0.492  -4.9005  -1.6568  -1.8384
 EIN  HO6   H  HOH1  0   0.500  -5.5487  -2.8331   0.9533

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 EIN  C14  C15   aromatic  1.392  0.020  1.392
 EIN  C14  C2    aromatic  1.399  0.020  1.399
 EIN  C14  C4    single    1.473  0.020  1.473
 EIN  C15  C16   aromatic  1.388  0.020  1.388
 EIN  C15  H15   single    0.930  0.020  1.080
 EIN  C16  C17   aromatic  1.393  0.020  1.393
 EIN  C16  H16   single    0.930  0.020  1.080
 EIN  C17  C1    aromatic  1.398  0.020  1.398
 EIN  C17  O1    single    1.343  0.020  1.343
 EIN  C1   C2    aromatic  1.380  0.020  1.380
 EIN  C1   H1    single    0.930  0.020  1.080
 EIN  C2   H2    single    0.930  0.020  1.080
 EIN  O1   C3    single    1.415  0.020  1.415
 EIN  C3   H31   single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C3   H32   single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C3   H33   single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C4   C5    aromatic  1.396  0.020  1.396
 EIN  C4   C9    aromatic  1.399  0.020  1.399
 EIN  C5   C6    aromatic  1.385  0.020  1.385
 EIN  C5   H5    single    0.930  0.020  1.080
 EIN  C6   C7    aromatic  1.388  0.020  1.388
 EIN  C6   H6    single    0.930  0.020  1.080
 EIN  C7   C8    aromatic  1.390  0.020  1.390
 EIN  C7   S1    single    1.767  0.020  1.767
 EIN  C8   C9    aromatic  1.382  0.020  1.382
 EIN  C8   H8    single    0.930  0.020  1.080
 EIN  C9   H9    single    0.930  0.020  1.080
 EIN  S1   O2    double    1.452  0.020  1.452
 EIN  S1   O3    double    1.452  0.020  1.452
 EIN  S1   N1    single    1.650  0.020  1.650
 EIN  N1   C10   single    1.462  0.020  1.462
 EIN  N1   HN1   single    0.890  0.020  1.040
 EIN  C10  C11   single    1.541  0.020  1.541
 EIN  C10  P1    single    1.834  0.020  1.834
 EIN  C10  H10   single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C11  C12   single    1.525  0.020  1.525
 EIN  C11  C13   single    1.526  0.020  1.526
 EIN  C11  H11   single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C12  H121  single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C12  H122  single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C12  H123  single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C13  H131  single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C13  H132  single    0.970  0.020  1.090
 EIN  C13  H133  single    0.970  0.020  1.090
 EIN  P1   O4    double    1.479  0.020  1.479
 EIN  P1   O5    single    1.609  0.020  1.609
 EIN  P1   O6    single    1.602  0.020  1.602
 EIN  O5   HO5   single    0.850  0.020  0.980
 EIN  O6   HO6   single    0.850  0.020  0.980

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 EIN  C4    C14  C2    121.29  3.000
 EIN  C4    C14  C15   121.06  3.000
 EIN  C2    C14  C15   117.65  3.000
 EIN  H15   C15  C16   118.19  3.000
 EIN  H15   C15  C14   120.02  3.000
 EIN  C16   C15  C14   121.78  3.000
 EIN  H16   C16  C17   121.55  3.000
 EIN  H16   C16  C15   118.65  3.000
 EIN  C17   C16  C15   119.79  3.000
 EIN  O1    C17  C1    116.41  3.000
 EIN  O1    C17  C16   124.47  3.000
 EIN  C1    C17  C16   119.12  3.000
 EIN  H1    C1   C2    120.16  3.000
 EIN  H1    C1   C17   119.49  3.000
 EIN  C2    C1   C17   120.34  3.000
 EIN  H2    C2   C1    118.50  3.000
 EIN  H2    C2   C14   120.16  3.000
 EIN  C1    C2   C14   121.32  3.000
 EIN  C3    O1   C17   118.68  3.000
 EIN  H33   C3   H32   108.83  3.000
 EIN  H33   C3   H31   108.85  3.000
 EIN  H32   C3   H31   108.76  3.000
 EIN  H33   C3   O1    111.85  3.000
 EIN  H32   C3   O1    112.00  3.000
 EIN  H31   C3   O1    106.46  3.000
 EIN  C9    C4   C5    118.29  3.000
 EIN  C9    C4   C14   120.74  3.000
 EIN  C5    C4   C14   120.96  3.000
 EIN  H5    C5   C6    118.61  3.000
 EIN  H5    C5   C4    120.21  3.000
 EIN  C6    C5   C4    121.17  3.000
 EIN  H6    C6   C7    121.07  3.000
 EIN  H6    C6   C5    119.68  3.000
 EIN  C7    C6   C5    119.25  3.000
 EIN  S1    C7   C8    119.12  3.000
 EIN  S1    C7   C6    119.92  3.000
 EIN  C8    C7   C6    120.84  3.000
 EIN  H8    C8   C9    119.56  3.000
 EIN  H8    C8   C7    121.19  3.000
 EIN  C9    C8   C7    119.25  3.000
 EIN  H9    C9   C8    118.79  3.000
 EIN  H9    C9   C4    120.00  3.000
 EIN  C8    C9   C4    121.19  3.000
 EIN  N1    S1   O3    107.11  3.000
 EIN  N1    S1   O2    105.44  3.000
 EIN  O3    S1   O2    120.58  3.000
 EIN  N1    S1   C7    106.29  3.000
 EIN  O3    S1   C7    107.80  3.000
 EIN  O2    S1   C7    108.77  3.000
 EIN  HN1   N1   C10   115.90  3.000
 EIN  HN1   N1   S1    112.92  3.000
 EIN  C10   N1   S1    120.80  3.000
 EIN  H10   C10  P1    103.99  3.000
 EIN  H10   C10  C11   107.88  3.000
 EIN  P1    C10  C11   120.37  3.000
 EIN  H10   C10  N1    107.70  3.000
 EIN  P1    C10  N1    102.79  3.000
 EIN  C11   C10  N1    113.21  3.000
 EIN  H11   C11  C13   107.10  3.000
 EIN  H11   C11  C12   106.43  3.000
 EIN  C13   C11  C12   111.30  3.000
 EIN  H11   C11  C10   104.16  3.000
 EIN  C13   C11  C10   114.38  3.000
 EIN  C12   C11  C10   112.72  3.000
 EIN  H123  C12  H122  107.43  3.000
 EIN  H123  C12  H121  108.10  3.000
 EIN  H122  C12  H121  107.62  3.000
 EIN  H123  C12  C11   111.45  3.000
 EIN  H122  C12  C11   109.48  3.000
 EIN  H121  C12  C11   112.56  3.000
 EIN  H133  C13  H132  106.43  3.000
 EIN  H133  C13  H131  106.53  3.000
 EIN  H132  C13  H131  108.81  3.000
 EIN  H133  C13  C11   109.72  3.000
 EIN  H132  C13  C11   112.98  3.000
 EIN  H131  C13  C11   112.03  3.000
 EIN  O6    P1   O5    106.97  3.000
 EIN  O6    P1   O4    116.48  3.000
 EIN  O5    P1   O4    109.41  3.000
 EIN  O6    P1   C10   103.00  3.000
 EIN  O5    P1   C10   106.63  3.000
 EIN  O4    P1   C10   113.67  3.000
 EIN  HO5   O5   P1    116.65  3.000
 EIN  HO6   O6   P1    114.45  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 EIN  CONST_01  C17   C16  C15  C14    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_02  C17   C1   C2   C14    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_03  C6    C5   C4   C14  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_04  C8    C9   C4   C14  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_05  C1    C2   C14  C15    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_08  C1    C17  C16  C15    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_09  C2    C14  C15  C16    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_10  C4    C14  C15  C16  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_11  C2    C1   C17  C16    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_12  C4    C14  C2   C1   180.00   0.0  0
 EIN  CONST_15  C7    C6   C5   C4     0.00   0.0  0
 EIN  CONST_16  C7    C8   C9   C4     0.00   0.0  0
 EIN  CONST_17  C8    C9   C4   C5     0.00   0.0  0
 EIN  CONST_18  C8    C7   C6   C5     0.00   0.0  0
 EIN  CONST_19  C9    C4   C5   C6     0.00   0.0  0
 EIN  CONST_20  C9    C8   C7   C6     0.00   0.0  0
 EIN  CONST_21  O1    C17  C16  C15  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_22  O1    C17  C1   C2   180.00   0.0  0
 EIN  CONST_23  S1    C7   C6   C5   180.00   0.0  0
 EIN  CONST_24  S1    C7   C8   C9   180.00   0.0  0
 EIN  CONST_25  H16   C16  C15  C14  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_26  H1    C1   C2   C14  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_27  H5    C5   C4   C14    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_28  H9    C9   C4   C14    0.00   0.0  0
 EIN  CONST_29  H2    C2   C14  C15  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_30  H15   C15  C16  C17  180.00   0.0  0
 EIN  CONST_31  H6    C6   C5   C4   180.00   0.0  0
 EIN  CONST_32  H8    C8   C9   C4   180.00   0.0  0
 EIN  Var_01    O2    S1   C7   C6   149.98  30.0  2
 EIN  Var_02    C10   N1   S1   C7    62.08  30.0  3
 EIN  Var_03    H31   C3   O1   C17  179.47  30.0  3
 EIN  Var_04    H121  C12  C11  C10   73.61  30.0  3
 EIN  Var_05    H131  C13  C11  C10  -72.31  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 EIN  chir_01  C10  N1  C11  P1  positiv

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 EIN  plan-1  C14  0.020
 EIN  plan-1  C15  0.020
 EIN  plan-1  C16  0.020
 EIN  plan-1  C17  0.020
 EIN  plan-1  C1   0.020
 EIN  plan-1  C2   0.020
 EIN  plan-1  O1   0.020
 EIN  plan-1  C4   0.020
 EIN  plan-1  H15  0.020
 EIN  plan-1  H16  0.020
 EIN  plan-1  H1   0.020
 EIN  plan-1  H2   0.020
 EIN  plan-2  C14  0.020
 EIN  plan-2  C4   0.020
 EIN  plan-2  C5   0.020
 EIN  plan-2  C6   0.020
 EIN  plan-2  C7   0.020
 EIN  plan-2  C8   0.020
 EIN  plan-2  C9   0.020
 EIN  plan-2  S1   0.020
 EIN  plan-2  H5   0.020
 EIN  plan-2  H6   0.020
 EIN  plan-2  H8   0.020
 EIN  plan-2  H9   0.020

