# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 24 14:59:01 2020
#   Inital geometry file: a 97 line input string
#   Ligand name: {5-chloro-2-[(pentabromobenzyl)carbamoyl]phenoxy}acetic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: OC(=O)COc1cc(Cl)ccc1C(=O)NCc2c(Br)c(Br)c(Br)c(Br)c2Br
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 DQP  DQP  '{5-chloro-2-[(pentabromobenzyl)carbamoyl]phenoxy}acetic acid'  ligand  35  27  .  2021-08-08  2021-08-08  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_DQP
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 DQP  C1   C   CR6    0   0.206   0.6191   0.1122   0.9152
 DQP  C2   C   CR6    0  -0.171   1.3765   1.2844   0.9621
 DQP  C3   C   CR6    0  -0.165   1.1476  -0.9741   0.2114
 DQP  C4   C   CR6    0  -0.047   2.6439   1.3586   0.3792
 DQP  C5   C   CR6    0  -0.048   2.4082  -0.9203  -0.3810
 DQP  C6   C   CR6    0  -0.095   3.1632   0.2496  -0.2873
 DQP  C7   C   CH2    0  -0.372  -0.7439   0.0106   1.5610
 DQP  N8   N   NH1    0  -0.616  -1.7794   0.1239   0.5633
 DQP  C9   C   C      0   0.531  -2.8781  -0.6581   0.5409
 DQP  C10  C   CR6    0  -0.179  -3.7439  -0.4442  -0.6586
 DQP  C11  C   CR6    0   0.402  -5.1150  -0.1749  -0.5160
 DQP  C12  C   CR16   0  -0.248  -3.1999  -0.5751  -1.9272
 DQP  C13  C   CR16   0  -0.344  -5.9087  -0.0568  -1.6570
 DQP  C14  C   CR16   0  -0.245  -3.9806  -0.4689  -3.0699
 DQP  C15  C   CR6    0  -0.023  -5.3283  -0.2105  -2.9074
 DQP  O16  O   O      0  -0.465  -3.1276  -1.4964   1.3881
 DQP  O17  O   O2     0  -0.437  -5.5701  -0.0181   0.7261
 DQP  C18  C   CH2    0  -0.344  -6.9457   0.2654   0.9250
 DQP  C19  C   C      0   0.386  -7.2562   0.4477   2.4200
 DQP  O20  O   O      0  -0.585  -6.3214   0.3892   3.2295
 DQP  O21  O   OC    -1  -0.621  -8.4644   0.6508   2.6483
 DQP  CL2  CL  CL     0  -0.119  -6.3381  -0.0649  -4.3076
 DQP  BR3  BR  BR     0   0.066   4.8616   0.3310  -1.0606
 DQP  BR4  BR  BR     0   0.047   0.1289  -2.5421   0.0510
 DQP  BR5  BR  BR     0   0.042   0.6778   2.8184   1.7961
 DQP  BR6  BR  BR     0   0.062   3.0897  -2.4002  -1.2946
 DQP  BR7  BR  BR     0   0.064   3.6443   2.9330   0.4838
 DQP  H1   H   HCH2   0   0.294  -0.8453  -0.9486   2.0654
 DQP  H2   H   HCH2   0   0.288  -0.8642   0.7641   2.3367
 DQP  H3   H   HNH1   0   0.411  -1.7170   0.8845  -0.0952
 DQP  H4   H   HCR6   0   0.270  -2.1426  -0.7829  -2.0358
 DQP  H5   H   HCR6   0   0.304  -6.9653   0.1566  -1.5854
 DQP  H6   H   HCR6   0   0.280  -3.5451  -0.5883  -4.0514
 DQP  H7   H   HCH2   0   0.235  -7.2285   1.1809   0.3915
 DQP  H8   H   HCH2   0   0.235  -7.5625  -0.5466   0.5230

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 DQP  BR6  C5   single    1.868  0.020  1.868
 DQP  BR4  C3   single    1.877  0.020  1.877
 DQP  C5   C3   aromatic  1.394  0.020  1.394
 DQP  C5   C6   aromatic  1.396  0.020  1.396
 DQP  BR3  C6   single    1.868  0.020  1.868
 DQP  C3   C1   aromatic  1.398  0.020  1.398
 DQP  C6   C4   aromatic  1.394  0.020  1.394
 DQP  O16  C9   double    1.218  0.020  1.218
 DQP  C12  C14  aromatic  1.388  0.020  1.388
 DQP  C12  C10  aromatic  1.387  0.020  1.387
 DQP  C1   C7   single    1.512  0.020  1.512
 DQP  C1   C2   aromatic  1.396  0.020  1.396
 DQP  C9   C10  single    1.495  0.020  1.495
 DQP  C9   N8   single    1.349  0.020  1.349
 DQP  C14  C15  aromatic  1.382  0.020  1.382
 DQP  C4   C2   aromatic  1.397  0.020  1.397
 DQP  C4   BR7  single    1.868  0.020  1.868
 DQP  C7   N8   single    1.442  0.020  1.442
 DQP  C10  C11  aromatic  1.404  0.020  1.404
 DQP  C2   BR5  single    1.881  0.020  1.881
 DQP  C15  CL2  single    1.732  0.020  1.732
 DQP  C15  C13  aromatic  1.387  0.020  1.387
 DQP  C11  C13  aromatic  1.395  0.020  1.395
 DQP  C11  O17  single    1.332  0.020  1.332
 DQP  O17  C18  single    1.419  0.020  1.419
 DQP  C18  C19  single    1.538  0.020  1.538
 DQP  O20  C19  deloc     1.238  0.020  1.238
 DQP  C19  O21  deloc     1.246  0.020  1.246
 DQP  C7   H1   single    0.970  0.020  1.090
 DQP  C7   H2   single    0.970  0.020  1.090
 DQP  N8   H3   single    0.860  0.020  1.020
 DQP  C12  H4   single    0.930  0.020  1.080
 DQP  C13  H5   single    0.930  0.020  1.080
 DQP  C14  H6   single    0.930  0.020  1.080
 DQP  C18  H7   single    0.970  0.020  1.090
 DQP  C18  H8   single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 DQP  C7   C1   C3   120.24  3.000
 DQP  C7   C1   C2   122.09  3.000
 DQP  C3   C1   C2   117.65  3.000
 DQP  BR5  C2   C4   118.60  3.000
 DQP  BR5  C2   C1   119.87  3.000
 DQP  C4   C2   C1   121.52  3.000
 DQP  BR4  C3   C5   119.13  3.000
 DQP  C5   C3   C1   121.72  3.000
 DQP  BR4  C3   C1   119.14  3.000
 DQP  BR7  C4   C6   119.85  3.000
 DQP  BR7  C4   C2   120.48  3.000
 DQP  C6   C4   C2   119.67  3.000
 DQP  BR6  C5   C6   119.98  3.000
 DQP  C6   C5   C3   119.54  3.000
 DQP  BR6  C5   C3   120.48  3.000
 DQP  BR3  C6   C5   120.04  3.000
 DQP  BR3  C6   C4   120.12  3.000
 DQP  C5   C6   C4   119.83  3.000
 DQP  H2   C7   H1   105.64  3.000
 DQP  H2   C7   N8   111.06  3.000
 DQP  H1   C7   N8   108.84  3.000
 DQP  H2   C7   C1   110.96  3.000
 DQP  H1   C7   C1   109.95  3.000
 DQP  N8   C7   C1   110.27  3.000
 DQP  H3   N8   C9   118.50  3.000
 DQP  H3   N8   C7   117.82  3.000
 DQP  C9   N8   C7   123.41  3.000
 DQP  O16  C9   C10  122.56  3.000
 DQP  C10  C9   N8   113.71  3.000
 DQP  O16  C9   N8   123.68  3.000
 DQP  C12  C10  C11  119.60  3.000
 DQP  C11  C10  C9   120.76  3.000
 DQP  C12  C10  C9   119.57  3.000
 DQP  O17  C11  C13  123.94  3.000
 DQP  O17  C11  C10  116.79  3.000
 DQP  C13  C11  C10  119.25  3.000
 DQP  H4   C12  C14  118.76  3.000
 DQP  H4   C12  C10  119.54  3.000
 DQP  C14  C12  C10  121.69  3.000
 DQP  H5   C13  C15  119.39  3.000
 DQP  H5   C13  C11  121.27  3.000
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 DQP  H6   C14  C12  120.85  3.000
 DQP  C15  C14  C12  117.78  3.000
 DQP  CL2  C15  C14  119.29  3.000
 DQP  CL2  C15  C13  118.39  3.000
 DQP  C14  C15  C13  122.33  3.000
 DQP  C18  O17  C11  119.05  3.000
 DQP  H8   C18  H7   107.15  3.000
 DQP  H8   C18  C19  109.32  3.000
 DQP  H7   C18  C19  108.78  3.000
 DQP  H8   C18  O17  110.26  3.000
 DQP  H7   C18  O17  110.40  3.000
 DQP  C19  C18  O17  110.84  3.000
 DQP  O21  C19  O20  128.32  3.000
 DQP  O21  C19  C18  113.15  3.000
 DQP  O20  C19  C18  118.53  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 DQP  CONST_01  C6   C5   C3   C1      0.00   0.0  0
 DQP  CONST_02  C6   C4   C2   C1      0.00   0.0  0
 DQP  CONST_03  C5   C3   C1   C2      0.00   0.0  0
 DQP  CONST_04  C5   C6   C4   C2      0.00   0.0  0
 DQP  CONST_05  C4   C6   C5   C3      0.00   0.0  0
 DQP  CONST_06  C4   C2   C1   C3      0.00   0.0  0
 DQP  CONST_07  C15  C14  C12  C10     0.00   0.0  0
 DQP  CONST_08  C15  C13  C11  C10     0.00   0.0  0
 DQP  CONST_09  C14  C12  C10  C11     0.00   0.0  0
 DQP  CONST_10  C14  C15  C13  C11     0.00   0.0  0
 DQP  CONST_11  C13  C15  C14  C12     0.00   0.0  0
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 DQP  CONST_13  BR6  C5   C3   C1    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_14  BR7  C4   C2   C1    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_15  BR4  C3   C1   C2    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_16  BR3  C6   C4   C2    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_17  BR3  C6   C5   C3    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_18  BR5  C2   C1   C3    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_19  BR6  C5   C6   C4    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_20  C7   C1   C2   C4    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_21  C7   C1   C3   C5    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_22  BR7  C4   C6   C5    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_23  BR4  C3   C5   C6    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_24  BR5  C2   C4   C6    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_25  C14  C12  C10  C9    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_26  C13  C11  C10  C9    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_27  CL2  C15  C13  C11   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_28  CL2  C15  C14  C12   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_29  O17  C11  C10  C12   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_30  O17  C11  C13  C15   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_31  H6   C14  C12  C10   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_32  H5   C13  C11  C10   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_33  H4   C12  C10  C11   180.00   0.0  0
 DQP  CONST_34  C10  C9   N8   C7    180.00   0.0  0
 DQP  CONST_35  H3   N8   C9   C10     0.00   0.0  0
 DQP  CONST_36  O16  C9   N8   C7      0.00   0.0  0
 DQP  Var_01    N8   C7   C1   C2    101.80  30.0  2
 DQP  Var_02    C12  C10  C9   N8     55.75  30.0  2
 DQP  Var_03    C9   N8   C7   C1    137.31  30.0  3
 DQP  Var_04    C19  C18  O17  C11  -178.41  30.0  3
 DQP  Var_05    O20  C19  C18  O17     2.94  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 DQP  plan-1  C1   0.020
 DQP  plan-1  C2   0.020
 DQP  plan-1  C3   0.020
 DQP  plan-1  C4   0.020
 DQP  plan-1  C5   0.020
 DQP  plan-1  C6   0.020
 DQP  plan-1  C7   0.020
 DQP  plan-1  BR3  0.020
 DQP  plan-1  BR4  0.020
 DQP  plan-1  BR5  0.020
 DQP  plan-1  BR6  0.020
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 DQP  plan-2  C9   0.020
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 DQP  plan-2  C11  0.020
 DQP  plan-2  C12  0.020
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 DQP  plan-2  C14  0.020
 DQP  plan-2  C15  0.020
 DQP  plan-2  O17  0.020
 DQP  plan-2  CL2  0.020
 DQP  plan-2  H4   0.020
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 DQP  plan-3  C7   0.020
 DQP  plan-3  N8   0.020
 DQP  plan-3  C9   0.020
 DQP  plan-3  C10  0.020
 DQP  plan-3  O16  0.020
 DQP  plan-3  H3   0.020
 DQP  plan-4  C18  0.020
 DQP  plan-4  C19  0.020
 DQP  plan-4  O20  0.020
 DQP  plan-4  O21  0.020

