# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue Apr 21 15:44:08 2020
#   Inital geometry file: a 66 line input string
#   Ligand name: 2-phenyl-5-(1H-pyrazol-3-yl)-1,3-thiazole
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: [nH]1ccc(n1)c2sc(nc2)c3ccccc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 D26  D26  2-phenyl-5-(1H-pyrazol-3-yl)-1,3-thiazole  ligand  25  16  .  2021-08-08  2021-08-08  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_D26
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 D26  C1   C  CR15  0  -0.542  11.8422  5.1326  21.5586
 D26  C2   C  CR5   0   0.321  13.0553  4.5722  22.0094
 D26  C3   C  CR5   0  -0.284  13.6742  4.7024  23.3093
 D26  C6   C  CR15  0   0.037  11.7311  4.6956  20.2614
 D26  N11  N  N     0  -0.392  14.0348  5.3037  25.5071
 D26  C12  C  CR5   0   0.030  15.1148  4.6220  25.2715
 D26  C13  C  CR6   0   0.097  16.1680  4.3895  26.2577
 D26  C14  C  CR16  0  -0.283  15.9412  4.7266  27.5944
 D26  C15  C  CR16  0  -0.237  16.9240  4.5130  28.5463
 D26  C16  C  CR16  0  -0.258  18.1467  3.9617  28.1819
 D26  C17  C  CR16  0  -0.236  18.3805  3.6274  26.8547
 D26  C18  C  CR16  0  -0.320  17.3999  3.8409  25.8985
 D26  N6   N  N     0  -0.297  13.6318  3.8526  21.0573
 D26  S3   S  S2    0   0.248  15.1970  3.9817  23.6613
 D26  C4   C  CR15  0  -0.038  13.2251  5.3560  24.4198
 D26  N10  N  NR15  0  -0.419  12.8170  3.9436  20.0190
 D26  H1   H  HCR5  0   0.268  11.1550  5.7614  22.0991
 D26  H6   H  HCR5  0   0.297  10.9762  4.8650  19.5119
 D26  H4   H  HCR5  0   0.271  12.2901  5.8964  24.4754
 D26  H10  H  HNR5  0   0.427  13.0437  3.4639  19.1623
 D26  H14  H  HCR6  0   0.260  14.9898  5.1505  27.8860
 D26  H18  H  HCR6  0   0.257  17.6119  3.5849  24.8670
 D26  H15  H  HCR6  0   0.264  16.7327  4.7744  29.5787
 D26  H16  H  HCR6  0   0.264  18.9119  3.7941  28.9282
 D26  H17  H  HCR6  0   0.265  19.3300  3.2021  26.5584

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 D26  C1   C2   aromatic  1.410  0.020  1.410
 D26  C1   C6   aromatic  1.373  0.020  1.373
 D26  C2   C3   single    1.446  0.020  1.446
 D26  C2   N6   aromatic  1.325  0.020  1.325
 D26  C3   S3   aromatic  1.721  0.020  1.721
 D26  C3   C4   aromatic  1.365  0.020  1.365
 D26  C6   N10  aromatic  1.343  0.020  1.343
 D26  N11  C12  aromatic  1.299  0.020  1.299
 D26  N11  C4   aromatic  1.357  0.020  1.357
 D26  C12  C13  single    1.461  0.020  1.461
 D26  C12  S3   aromatic  1.735  0.020  1.735
 D26  C13  C14  aromatic  1.397  0.020  1.397
 D26  C13  C18  aromatic  1.396  0.020  1.396
 D26  C14  C15  aromatic  1.385  0.020  1.385
 D26  C15  C16  aromatic  1.390  0.020  1.390
 D26  C16  C17  aromatic  1.388  0.020  1.388
 D26  C17  C18  aromatic  1.386  0.020  1.386
 D26  N6   N10  aromatic  1.323  0.020  1.323
 D26  C1   H1   single    0.930  0.020  1.080
 D26  C6   H6   single    0.930  0.020  1.080
 D26  C4   H4   single    0.930  0.020  1.080
 D26  N10  H10  single    0.860  0.020  1.020
 D26  C14  H14  single    0.930  0.020  1.080
 D26  C18  H18  single    0.930  0.020  1.080
 D26  C15  H15  single    0.930  0.020  1.080
 D26  C16  H16  single    0.930  0.020  1.080
 D26  C17  H17  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 D26  H1   C1   C6   127.46  3.000
 D26  H1   C1   C2   128.35  3.000
 D26  C6   C1   C2   104.19  3.000
 D26  N6   C2   C3   120.57  3.000
 D26  N6   C2   C1   111.12  3.000
 D26  C3   C2   C1   128.31  3.000
 D26  C4   C3   S3   108.99  3.000
 D26  C4   C3   C2   129.35  3.000
 D26  S3   C3   C2   121.67  3.000
 D26  H6   C6   N10  121.94  3.000
 D26  H6   C6   C1   131.60  3.000
 D26  N10  C6   C1   106.45  3.000
 D26  C4   N11  C12  111.78  3.000
 D26  S3   C12  C13  122.25  3.000
 D26  S3   C12  N11  113.68  3.000
 D26  C13  C12  N11  124.08  3.000
 D26  C18  C13  C14  118.98  3.000
 D26  C18  C13  C12  121.66  3.000
 D26  C14  C13  C12  119.36  3.000
 D26  H14  C14  C15  119.96  3.000
 D26  H14  C14  C13  119.69  3.000
 D26  C15  C14  C13  120.35  3.000
 D26  H15  C15  C16  120.10  3.000
 D26  H15  C15  C14  119.54  3.000
 D26  C16  C15  C14  120.35  3.000
 D26  H16  C16  C17  120.20  3.000
 D26  H16  C16  C15  120.18  3.000
 D26  C17  C16  C15  119.62  3.000
 D26  H17  C17  C18  119.51  3.000
 D26  H17  C17  C16  120.28  3.000
 D26  C18  C17  C16  120.21  3.000
 D26  H18  C18  C17  118.80  3.000
 D26  H18  C18  C13  120.71  3.000
 D26  C17  C18  C13  120.49  3.000
 D26  N10  N6   C2   104.99  3.000
 D26  C12  S3   C3    89.62  3.000
 D26  H4   C4   N11  119.61  3.000
 D26  H4   C4   C3   124.45  3.000
 D26  N11  C4   C3   115.93  3.000
 D26  H10  N10  N6   119.74  3.000
 D26  H10  N10  C6   127.01  3.000
 D26  N6   N10  C6   113.25  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 D26  CONST_01  S3   C3   C2   C1   180.00  0.0  0
 D26  CONST_02  C4   C3   C2   C1     0.00  0.0  0
 D26  CONST_03  N10  N6   C2   C1     0.00  0.0  0
 D26  CONST_04  N6   N10  C6   C1     0.00  0.0  0
 D26  CONST_05  N10  C6   C1   C2     0.00  0.0  0
 D26  CONST_06  C12  S3   C3   C2   180.00  0.0  0
 D26  CONST_07  N11  C4   C3   C2   180.00  0.0  0
 D26  CONST_08  C6   N10  N6   C2     0.00  0.0  0
 D26  CONST_09  C6   C1   C2   C3   180.00  0.0  0
 D26  CONST_10  N10  N6   C2   C3   180.00  0.0  0
 D26  CONST_11  N11  C12  S3   C3     0.00  0.0  0
 D26  CONST_12  C13  C12  S3   C3   180.00  0.0  0
 D26  CONST_13  C12  N11  C4   C3     0.00  0.0  0
 D26  CONST_14  N6   C2   C1   C6     0.00  0.0  0
 D26  CONST_15  C14  C13  C12  N11    0.00  0.0  0
 D26  CONST_16  C18  C13  C12  N11  180.00  0.0  0
 D26  CONST_17  S3   C3   C4   N11    0.00  0.0  0
 D26  CONST_18  C15  C14  C13  C12  180.00  0.0  0
 D26  CONST_19  C17  C18  C13  C12  180.00  0.0  0
 D26  CONST_20  C4   C3   S3   C12    0.00  0.0  0
 D26  CONST_21  C4   N11  C12  C13  180.00  0.0  0
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 D26  CONST_23  C16  C17  C18  C13    0.00  0.0  0
 D26  CONST_24  S3   C12  C13  C14  180.00  0.0  0
 D26  CONST_25  C17  C18  C13  C14    0.00  0.0  0
 D26  CONST_26  C17  C16  C15  C14    0.00  0.0  0
 D26  CONST_27  C18  C13  C14  C15    0.00  0.0  0
 D26  CONST_28  C18  C17  C16  C15    0.00  0.0  0
 D26  CONST_29  S3   C12  C13  C18    0.00  0.0  0
 D26  CONST_30  S3   C3   C2   N6     0.00  0.0  0
 D26  CONST_31  C4   C3   C2   N6   180.00  0.0  0
 D26  CONST_32  C4   N11  C12  S3     0.00  0.0  0
 D26  CONST_33  H10  N10  C6   C1   180.00  0.0  0
 D26  CONST_34  H6   C6   C1   C2   180.00  0.0  0
 D26  CONST_35  H4   C4   C3   C2     0.00  0.0  0
 D26  CONST_36  H1   C1   C2   C3     0.00  0.0  0
 D26  CONST_37  H14  C14  C13  C12    0.00  0.0  0
 D26  CONST_38  H18  C18  C13  C12    0.00  0.0  0
 D26  CONST_39  H15  C15  C14  C13  180.00  0.0  0
 D26  CONST_40  H17  C17  C18  C13  180.00  0.0  0
 D26  CONST_41  H16  C16  C15  C14  180.00  0.0  0

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 D26  plan-1  C1   0.020
 D26  plan-1  C2   0.020
 D26  plan-1  C3   0.020
 D26  plan-1  C6   0.020
 D26  plan-1  N6   0.020
 D26  plan-1  N10  0.020
 D26  plan-1  H1   0.020
 D26  plan-1  H6   0.020
 D26  plan-1  H10  0.020
 D26  plan-2  C2   0.020
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 D26  plan-2  S3   0.020
 D26  plan-2  C4   0.020
 D26  plan-2  H4   0.020
 D26  plan-3  C12  0.020
 D26  plan-3  C13  0.020
 D26  plan-3  C14  0.020
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 D26  plan-3  C16  0.020
 D26  plan-3  C17  0.020
 D26  plan-3  C18  0.020
 D26  plan-3  H14  0.020
 D26  plan-3  H18  0.020
 D26  plan-3  H15  0.020
 D26  plan-3  H16  0.020
 D26  plan-3  H17  0.020

