# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue Apr 21 15:35:50 2020
#   Inital geometry file: a 66 line input string
#   Ligand name: 3-phenyl-5-(1H-pyrazol-3-yl)isoxazole
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: [nH]1ccc(n1)c2onc(c2)c3ccccc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 D25  D25  3-phenyl-5-(1H-pyrazol-3-yl)isoxazole  ligand  25  16  .  2021-08-08  2021-08-08  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_D25
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 D25  C1   C  CR15  0  -0.483  -32.6769  17.9980  24.4286
 D25  C2   C  CR5   0   0.162  -32.8162  16.6036  24.2849
 D25  C3   C  CR5   0   0.458  -32.0501  15.5516  24.9128
 D25  C4   C  CR15  0  -0.518  -32.0908  14.1985  24.8362
 D25  C6   C  CR15  0   0.020  -33.6558  18.5142  23.6151
 D25  O10  O  O     0  -0.343  -31.0848  15.9182  25.7589
 D25  N11  N  N     0  -0.177  -30.4682  14.8155  26.2592
 D25  C12  C  CR5   0   0.261  -31.0572  13.7835  25.7157
 D25  C13  C  CR6   0   0.051  -30.6337  12.4158  26.0315
 D25  C14  C  CR16  0  -0.285  -29.4889  12.1797  26.7951
 D25  C15  C  CR16  0  -0.238  -29.0988  10.8834  27.0888
 D25  C16  C  CR16  0  -0.257  -29.8439   9.8055  26.6254
 D25  C17  C  CR16  0  -0.236  -30.9832  10.0328  25.8660
 D25  C18  C  CR16  0  -0.322  -31.3757  11.3301  25.5698
 D25  N6   N  N     0  -0.285  -33.8007  16.2983  23.4512
 D25  N10  N  NR15  0  -0.408  -34.2855  17.4621  23.0651
 D25  H1   H  HCR5  0   0.276  -31.9718  18.5443  25.0312
 D25  H6   H  HCR5  0   0.301  -33.9419  19.5289  23.3955
 D25  H4   H  HCR5  0   0.286  -32.7496  13.5933  24.2383
 D25  H10  H  HNR5  0   0.430  -35.0599  17.4899  22.4205
 D25  H14  H  HCR6  0   0.259  -28.8979  13.0113  27.1560
 D25  H18  H  HCR6  0   0.259  -32.2676  11.4897  24.9775
 D25  H15  H  HCR6  0   0.263  -28.2079  10.7136  27.6789
 D25  H16  H  HCR6  0   0.263  -29.5355   8.7938  26.8535
 D25  H17  H  HCR6  0   0.263  -31.5706   9.1997  25.5031

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 D25  C1   C2   aromatic  1.409  0.020  1.409
 D25  C1   C6   aromatic  1.374  0.020  1.374
 D25  C2   C3   single    1.445  0.020  1.445
 D25  C2   N6   aromatic  1.326  0.020  1.326
 D25  C3   C4   aromatic  1.356  0.020  1.356
 D25  C3   O10  aromatic  1.335  0.020  1.335
 D25  C4   C12  aromatic  1.419  0.020  1.419
 D25  C6   N10  aromatic  1.344  0.020  1.344
 D25  O10  N11  aromatic  1.359  0.020  1.359
 D25  N11  C12  aromatic  1.307  0.020  1.307
 D25  C12  C13  single    1.466  0.020  1.466
 D25  C13  C14  aromatic  1.396  0.020  1.396
 D25  C13  C18  aromatic  1.394  0.020  1.394
 D25  C14  C15  aromatic  1.385  0.020  1.385
 D25  C15  C16  aromatic  1.390  0.020  1.390
 D25  C16  C17  aromatic  1.388  0.020  1.388
 D25  C17  C18  aromatic  1.387  0.020  1.387
 D25  N6   N10  aromatic  1.318  0.020  1.318
 D25  C1   H1   single    0.930  0.020  1.080
 D25  C6   H6   single    0.930  0.020  1.080
 D25  C4   H4   single    0.930  0.020  1.080
 D25  N10  H10  single    0.860  0.020  1.020
 D25  C14  H14  single    0.930  0.020  1.080
 D25  C18  H18  single    0.930  0.020  1.080
 D25  C15  H15  single    0.930  0.020  1.080
 D25  C16  H16  single    0.930  0.020  1.080
 D25  C17  H17  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 D25  H1   C1   C6   127.42  3.000
 D25  H1   C1   C2   128.62  3.000
 D25  C6   C1   C2   103.96  3.000
 D25  N6   C2   C3   119.96  3.000
 D25  N6   C2   C1   111.44  3.000
 D25  C3   C2   C1   128.60  3.000
 D25  O10  C3   C4   109.37  3.000
 D25  O10  C3   C2   117.31  3.000
 D25  C4   C3   C2   133.32  3.000
 D25  H4   C4   C12  128.74  3.000
 D25  H4   C4   C3   127.67  3.000
 D25  C12  C4   C3   103.59  3.000
 D25  H6   C6   N10  121.99  3.000
 D25  H6   C6   C1   131.62  3.000
 D25  N10  C6   C1   106.38  3.000
 D25  N11  O10  C3   109.79  3.000
 D25  C12  N11  O10  106.45  3.000
 D25  C13  C12  N11  121.13  3.000
 D25  C13  C12  C4   128.07  3.000
 D25  N11  C12  C4   110.80  3.000
 D25  C18  C13  C14  119.07  3.000
 D25  C18  C13  C12  120.10  3.000
 D25  C14  C13  C12  120.83  3.000
 D25  H14  C14  C15  119.65  3.000
 D25  H14  C14  C13  120.01  3.000
 D25  C15  C14  C13  120.34  3.000
 D25  H15  C15  C16  120.10  3.000
 D25  H15  C15  C14  119.63  3.000
 D25  C16  C15  C14  120.27  3.000
 D25  H16  C16  C17  120.16  3.000
 D25  H16  C16  C15  120.14  3.000
 D25  C17  C16  C15  119.70  3.000
 D25  H17  C17  C18  119.65  3.000
 D25  H17  C17  C16  120.20  3.000
 D25  C18  C17  C16  120.15  3.000
 D25  H18  C18  C17  119.20  3.000
 D25  H18  C18  C13  120.33  3.000
 D25  C17  C18  C13  120.47  3.000
 D25  N10  N6   C2   104.71  3.000
 D25  H10  N10  N6   119.61  3.000
 D25  H10  N10  C6   126.88  3.000
 D25  N6   N10  C6   113.51  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 D25  CONST_01  C4   C3   C2   C1   180.00  0.0  0
 D25  CONST_02  O10  C3   C2   C1     0.00  0.0  0
 D25  CONST_03  N10  N6   C2   C1     0.00  0.0  0
 D25  CONST_04  N6   N10  C6   C1     0.00  0.0  0
 D25  CONST_05  N10  C6   C1   C2     0.00  0.0  0
 D25  CONST_06  C12  C4   C3   C2   180.00  0.0  0
 D25  CONST_07  N11  O10  C3   C2   180.00  0.0  0
 D25  CONST_08  C6   N10  N6   C2     0.00  0.0  0
 D25  CONST_09  C6   C1   C2   C3   180.00  0.0  0
 D25  CONST_10  N10  N6   C2   C3   180.00  0.0  0
 D25  CONST_11  N11  C12  C4   C3     0.00  0.0  0
 D25  CONST_12  C13  C12  C4   C3   180.00  0.0  0
 D25  CONST_13  C12  N11  O10  C3     0.00  0.0  0
 D25  CONST_14  N6   C2   C3   C4     0.00  0.0  0
 D25  CONST_15  N11  O10  C3   C4     0.00  0.0  0
 D25  CONST_16  O10  N11  C12  C4     0.00  0.0  0
 D25  CONST_17  C14  C13  C12  C4   180.00  0.0  0
 D25  CONST_18  C18  C13  C12  C4     0.00  0.0  0
 D25  CONST_19  N6   C2   C1   C6     0.00  0.0  0
 D25  CONST_20  N6   C2   C3   O10  180.00  0.0  0
 D25  CONST_21  C12  C4   C3   O10    0.00  0.0  0
 D25  CONST_22  C13  C12  N11  O10  180.00  0.0  0
 D25  CONST_23  C14  C13  C12  N11    0.00  0.0  0
 D25  CONST_24  C18  C13  C12  N11  180.00  0.0  0
 D25  CONST_25  C15  C14  C13  C12  180.00  0.0  0
 D25  CONST_26  C17  C18  C13  C12  180.00  0.0  0
 D25  CONST_27  C16  C15  C14  C13    0.00  0.0  0
 D25  CONST_28  C16  C17  C18  C13    0.00  0.0  0
 D25  CONST_29  C17  C18  C13  C14    0.00  0.0  0
 D25  CONST_30  C17  C16  C15  C14    0.00  0.0  0
 D25  CONST_31  C18  C13  C14  C15    0.00  0.0  0
 D25  CONST_32  C18  C17  C16  C15    0.00  0.0  0
 D25  CONST_33  H10  N10  C6   C1   180.00  0.0  0
 D25  CONST_34  H6   C6   C1   C2   180.00  0.0  0
 D25  CONST_35  H4   C4   C3   C2     0.00  0.0  0
 D25  CONST_36  H1   C1   C2   C3     0.00  0.0  0
 D25  CONST_37  H14  C14  C13  C12    0.00  0.0  0
 D25  CONST_38  H18  C18  C13  C12    0.00  0.0  0
 D25  CONST_39  H15  C15  C14  C13  180.00  0.0  0
 D25  CONST_40  H17  C17  C18  C13  180.00  0.0  0
 D25  CONST_41  H16  C16  C15  C14  180.00  0.0  0

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 D25  plan-1  C1   0.020
 D25  plan-1  C2   0.020
 D25  plan-1  C3   0.020
 D25  plan-1  C6   0.020
 D25  plan-1  N6   0.020
 D25  plan-1  N10  0.020
 D25  plan-1  H1   0.020
 D25  plan-1  H6   0.020
 D25  plan-1  H10  0.020
 D25  plan-2  C2   0.020
 D25  plan-2  C3   0.020
 D25  plan-2  C4   0.020
 D25  plan-2  O10  0.020
 D25  plan-2  N11  0.020
 D25  plan-2  C12  0.020
 D25  plan-2  C13  0.020
 D25  plan-2  H4   0.020
 D25  plan-3  C12  0.020
 D25  plan-3  C13  0.020
 D25  plan-3  C14  0.020
 D25  plan-3  C15  0.020
 D25  plan-3  C16  0.020
 D25  plan-3  C17  0.020
 D25  plan-3  C18  0.020
 D25  plan-3  H14  0.020
 D25  plan-3  H18  0.020
 D25  plan-3  H15  0.020
 D25  plan-3  H16  0.020
 D25  plan-3  H17  0.020

