# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Wed Mar  9 17:58:59 2022
#   Inital geometry file: a 107 line input string
#   Ligand name: 6-(3-aminophenyl)-N-tert-butyl-2-(trifluoromethyl)quinazolin-4-amine
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)(C)Nc1nc(nc2ccc(cc12)c3cccc(N)c3)C(F)(F)F
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 D23  D23  6-(3-aminophenyl)-N-tert-butyl-2-(trifluoromethyl)quinazolin-4-amine  ligand  45  26  .  2022-03-18  2022-03-18
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_D23
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 D23  C1    C  CR16  0  -0.368  -4.6329   0.8005   0.5294
 D23  C2    C  CR6   0   0.344  -5.9598   0.3629   0.5365
 D23  C3    C  CR16  0  -0.308  -6.2888  -0.7767  -0.2055
 D23  C4    C  CR16  0  -0.211  -5.3135  -1.4469  -0.9225
 D23  C5    C  CR16  0  -0.324  -3.9973  -1.0101  -0.9235
 D23  C6    C  CR6   0   0.106  -3.6519   0.1247  -0.1904
 D23  N7    N  NH2   0  -0.836  -6.9067   1.0011   1.3095
 D23  C8    C  CR6   0   0.104  -2.2585   0.6088  -0.1710
 D23  C9    C  CR16  0  -0.275  -1.9728   1.9887  -0.2259
 D23  C10   C  CR16  0  -0.276  -0.6847   2.4505  -0.1996
 D23  C11   C  CR66  0   0.236   0.3931   1.5519  -0.1213
 D23  C12   C  CR66  0   0.037   0.1250   0.1697  -0.0769
 D23  C13   C  CR16  0  -0.356  -1.2038  -0.2769  -0.0957
 D23  N14   N  N     0  -0.459   1.6630   2.0452  -0.0865
 D23  C15   C  CR6   0   0.120   2.5912   1.1491  -0.0082
 D23  N16   N  N     0  -0.493   2.4925  -0.1762   0.0336
 D23  C17   C  CR6   0   0.575   1.2800  -0.6988  -0.0004
 D23  N18   N  NH1   0  -0.676   1.1388  -2.0230   0.0359
 D23  C19   C  CT    0   0.092   2.1969  -3.0370   0.1468
 D23  C20   C  CH3   0  -0.633   2.9719  -2.8723   1.4546
 D23  C21   C  CH3   0  -0.634   3.1434  -2.9775  -1.0537
 D23  C22   C  CH3   0  -0.663   1.4749  -4.3831   0.1502
 D23  C23   C  CT    0   1.021   4.0199   1.6318   0.0287
 D23  F24   F  F     0  -0.327   4.6881   1.2403  -1.0697
 D23  F25   F  F     0  -0.312   4.1118   2.9628   0.0849
 D23  F26   F  F     0  -0.301   4.6804   1.1423   1.0774
 D23  H1    H  HCR6  0   0.229  -4.3625   1.6691   1.1193
 D23  H3    H  HCR6  0   0.232  -7.3101  -1.1369  -0.2194
 D23  H4    H  HCR6  0   0.235  -5.5876  -2.3211  -1.4979
 D23  H5    H  HCR6  0   0.225  -3.2576  -1.5279  -1.5195
 D23  HN71  H  HNH2  0   0.357  -7.8629   0.8792   1.0222
 D23  HN72  H  HNH2  0   0.356  -6.7169   1.9630   1.5342
 D23  H9    H  HCR6  0   0.243  -2.7855   2.6977  -0.3094
 D23  H10   H  HCR6  0   0.249  -0.4748   3.5103  -0.2467
 D23  H13   H  HCR6  0   0.216  -1.4351  -1.3321  -0.0193
 D23  H18   H  HNH1  0   0.394   0.2024  -2.3827  -0.0198
 D23  H201  H  HCH3  0   0.254   3.5088  -1.9266   1.4855
 D23  H202  H  HCH3  0   0.223   2.3018  -2.9169   2.3139
 D23  H203  H  HCH3  0   0.216   3.7014  -3.6774   1.5575
 D23  H211  H  HCH3  0   0.216   3.8490  -3.8077  -1.0027
 D23  H212  H  HCH3  0   0.221   2.5889  -3.0637  -1.9890
 D23  H213  H  HCH3  0   0.251   3.7090  -2.0486  -1.0713
 D23  H221  H  HCH3  0   0.232   0.7817  -4.4648   0.9895
 D23  H222  H  HCH3  0   0.231   0.9123  -4.5356  -0.7730
 D23  H223  H  HCH3  0   0.238   2.1928  -5.1973   0.2370

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 D23  C1   C2    aromatic  1.397  0.020  1.397
 D23  C1   C6    aromatic  1.392  0.020  1.392
 D23  C1   H1    single    0.930  0.020  1.080
 D23  C2   C3    aromatic  1.399  0.020  1.399
 D23  C2   N7    single    1.379  0.020  1.379
 D23  C3   C4    aromatic  1.384  0.020  1.384
 D23  C3   H3    single    0.930  0.020  1.080
 D23  C4   C5    aromatic  1.387  0.020  1.387
 D23  C4   H4    single    0.930  0.020  1.080
 D23  C5   C6    aromatic  1.394  0.020  1.394
 D23  C5   H5    single    0.930  0.020  1.080
 D23  C6   C8    single    1.475  0.020  1.475
 D23  N7   HN71  single    0.890  0.020  1.040
 D23  N7   HN72  single    0.890  0.020  1.040
 D23  C8   C9    aromatic  1.410  0.020  1.410
 D23  C8   C13   aromatic  1.379  0.020  1.379
 D23  C9   C10   aromatic  1.369  0.020  1.369
 D23  C9   H9    single    0.930  0.020  1.080
 D23  C10  C11   aromatic  1.405  0.020  1.405
 D23  C10  H10   single    0.930  0.020  1.080
 D23  C11  C12   aromatic  1.409  0.020  1.409
 D23  C11  N14   aromatic  1.363  0.020  1.363
 D23  C12  C13   aromatic  1.402  0.020  1.402
 D23  C12  C17   aromatic  1.447  0.020  1.447
 D23  C13  H13   single    0.930  0.020  1.080
 D23  N14  C15   aromatic  1.293  0.020  1.293
 D23  C15  N16   aromatic  1.330  0.020  1.330
 D23  C15  C23   single    1.508  0.020  1.508
 D23  N16  C17   aromatic  1.321  0.020  1.321
 D23  C17  N18   single    1.332  0.020  1.332
 D23  N18  C19   single    1.470  0.020  1.470
 D23  N18  H18   single    0.860  0.020  1.020
 D23  C19  C20   single    1.529  0.020  1.529
 D23  C19  C21   single    1.530  0.020  1.530
 D23  C19  C22   single    1.527  0.020  1.527
 D23  C20  H201  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C20  H202  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C20  H203  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C21  H211  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C21  H212  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C21  H213  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C22  H221  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C22  H222  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C22  H223  single    0.970  0.020  1.090
 D23  C23  F24   single    1.344  0.020  1.344
 D23  C23  F25   single    1.335  0.020  1.335
 D23  C23  F26   single    1.333  0.020  1.333

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 D23  H1    C1   C6    119.65  3.000
 D23  H1    C1   C2    119.01  3.000
 D23  C6    C1   C2    121.32  3.000
 D23  N7    C2   C3    120.85  3.000
 D23  N7    C2   C1    120.66  3.000
 D23  C3    C2   C1    118.41  3.000
 D23  H3    C3   C4    119.80  3.000
 D23  H3    C3   C2    119.97  3.000
 D23  C4    C3   C2    120.23  3.000
 D23  H4    C4   C5    119.64  3.000
 D23  H4    C4   C3    119.24  3.000
 D23  C5    C4   C3    121.12  3.000
 D23  H5    C5   C6    120.64  3.000
 D23  H5    C5   C4    119.91  3.000
 D23  C6    C5   C4    119.41  3.000
 D23  C8    C6   C5    120.53  3.000
 D23  C8    C6   C1    119.97  3.000
 D23  C5    C6   C1    119.50  3.000
 D23  HN72  N7   HN71  111.04  3.000
 D23  HN72  N7   C2    115.99  3.000
 D23  HN71  N7   C2    115.89  3.000
 D23  C13   C8   C9    118.40  3.000
 D23  C13   C8   C6    120.81  3.000
 D23  C9    C8   C6    120.80  3.000
 D23  H9    C9   C10   119.17  3.000
 D23  H9    C9   C8    119.48  3.000
 D23  C10   C9   C8    121.34  3.000
 D23  H10   C10  C11   118.70  3.000
 D23  H10   C10  C9    120.84  3.000
 D23  C11   C10  C9    120.47  3.000
 D23  N14   C11  C12   122.12  3.000
 D23  N14   C11  C10   118.99  3.000
 D23  C12   C11  C10   118.89  3.000
 D23  C17   C12  C13   124.48  3.000
 D23  C17   C12  C11   116.01  3.000
 D23  C13   C12  C11   119.51  3.000
 D23  H13   C13  C12   120.79  3.000
 D23  H13   C13  C8    117.79  3.000
 D23  C12   C13  C8    121.39  3.000
 D23  C15   N14  C11   114.82  3.000
 D23  C23   C15  N16   112.86  3.000
 D23  C23   C15  N14   117.38  3.000
 D23  N16   C15  N14   129.76  3.000
 D23  C17   N16  C15   117.50  3.000
 D23  N18   C17  N16   119.34  3.000
 D23  N18   C17  C12   120.89  3.000
 D23  N16   C17  C12   119.78  3.000
 D23  H18   N18  C19   115.35  3.000
 D23  H18   N18  C17   116.95  3.000
 D23  C19   N18  C17   127.70  3.000
 D23  C22   C19  C21   109.17  3.000
 D23  C22   C19  C20   109.43  3.000
 D23  C21   C19  C20   110.69  3.000
 D23  C22   C19  N18   105.54  3.000
 D23  C21   C19  N18   111.06  3.000
 D23  C20   C19  N18   110.80  3.000
 D23  H203  C20  H202  107.84  3.000
 D23  H203  C20  H201  107.98  3.000
 D23  H202  C20  H201  108.44  3.000
 D23  H203  C20  C19   109.88  3.000
 D23  H202  C20  C19   110.98  3.000
 D23  H201  C20  C19   111.59  3.000
 D23  H213  C21  H212  108.54  3.000
 D23  H213  C21  H211  108.33  3.000
 D23  H212  C21  H211  107.98  3.000
 D23  H213  C21  C19   111.57  3.000
 D23  H212  C21  C19   110.81  3.000
 D23  H211  C21  C19   109.51  3.000
 D23  H223  C22  H222  107.62  3.000
 D23  H223  C22  H221  107.54  3.000
 D23  H222  C22  H221  108.21  3.000
 D23  H223  C22  C19   110.33  3.000
 D23  H222  C22  C19   111.39  3.000
 D23  H221  C22  C19   111.58  3.000
 D23  F26   C23  F25   107.39  3.000
 D23  F26   C23  F24   106.84  3.000
 D23  F25   C23  F24   106.89  3.000
 D23  F26   C23  C15   111.79  3.000
 D23  F25   C23  C15   112.65  3.000
 D23  F24   C23  C15   110.96  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 D23  CONST_01  C4    C3   C2   C1      0.00   0.0  0
 D23  CONST_02  C4    C5   C6   C1      0.00   0.0  0
 D23  CONST_05  C5    C6   C1   C2      0.00   0.0  0
 D23  CONST_06  C8    C6   C1   C2    180.00   0.0  0
 D23  CONST_07  C5    C4   C3   C2      0.00   0.0  0
 D23  CONST_08  C6    C1   C2   C3      0.00   0.0  0
 D23  CONST_09  C6    C5   C4   C3      0.00   0.0  0
 D23  CONST_10  C8    C6   C5   C4    180.00   0.0  0
 D23  CONST_13  C10   C9   C8   C6    180.00   0.0  0
 D23  CONST_14  C12   C13  C8   C6    180.00   0.0  0
 D23  CONST_15  C11   C10  C9   C8      0.00   0.0  0
 D23  CONST_16  C11   C12  C13  C8      0.00   0.0  0
 D23  CONST_17  C17   C12  C13  C8    180.00   0.0  0
 D23  CONST_18  C12   C13  C8   C9      0.00   0.0  0
 D23  CONST_19  C12   C11  C10  C9      0.00   0.0  0
 D23  CONST_20  N14   C11  C10  C9    180.00   0.0  0
 D23  CONST_21  C13   C8   C9   C10     0.00   0.0  0
 D23  CONST_22  C13   C12  C11  C10     0.00   0.0  0
 D23  CONST_23  C17   C12  C11  C10   180.00   0.0  0
 D23  CONST_24  C15   N14  C11  C10   180.00   0.0  0
 D23  CONST_25  N16   C17  C12  C11     0.00   0.0  0
 D23  CONST_26  N16   C15  N14  C11     0.00   0.0  0
 D23  CONST_27  C15   N14  C11  C12     0.00   0.0  0
 D23  CONST_28  C15   N16  C17  C12     0.00   0.0  0
 D23  CONST_29  N14   C11  C12  C13   180.00   0.0  0
 D23  CONST_30  N16   C17  C12  C13   180.00   0.0  0
 D23  CONST_31  C17   C12  C11  N14     0.00   0.0  0
 D23  CONST_32  C17   N16  C15  N14     0.00   0.0  0
 D23  CONST_33  N7    C2   C3   C4    180.00   0.0  0
 D23  CONST_34  N7    C2   C1   C6    180.00   0.0  0
 D23  CONST_35  N18   C17  C12  C11   180.00   0.0  0
 D23  CONST_36  C23   C15  N14  C11   180.00   0.0  0
 D23  CONST_37  N18   C17  C12  C13     0.00   0.0  0
 D23  CONST_38  N18   C17  N16  C15   180.00   0.0  0
 D23  CONST_39  C23   C15  N16  C17   180.00   0.0  0
 D23  CONST_40  H3    C3   C2   C1    180.00   0.0  0
 D23  CONST_41  H5    C5   C6   C1    180.00   0.0  0
 D23  CONST_42  H4    C4   C3   C2    180.00   0.0  0
 D23  CONST_43  H1    C1   C2   C3    180.00   0.0  0
 D23  CONST_44  H9    C9   C8   C6      0.00   0.0  0
 D23  CONST_45  H13   C13  C8   C6      0.00   0.0  0
 D23  CONST_46  H10   C10  C9   C8    180.00   0.0  0
 D23  CONST_47  C19   N18  C17  C12   180.00   0.0  0
 D23  CONST_48  C19   N18  C17  N16     0.00   0.0  0
 D23  CONST_51  H18   N18  C17  C12     0.00   0.0  0
 D23  Var_01    F24   C23  C15  N14  -114.59  30.0  2
 D23  Var_02    C20   C19  N18  C17    61.35  30.0  3
 D23  Var_03    H201  C20  C19  N18   -64.59  30.0  3
 D23  Var_04    H211  C21  C19  N18  -173.74  30.0  3
 D23  Var_05    H221  C22  C19  N18   -60.14  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 D23  plan-1  C1    0.020
 D23  plan-1  C2    0.020
 D23  plan-1  C3    0.020
 D23  plan-1  C4    0.020
 D23  plan-1  C5    0.020
 D23  plan-1  C6    0.020
 D23  plan-1  N7    0.020
 D23  plan-1  C8    0.020
 D23  plan-1  H1    0.020
 D23  plan-1  H3    0.020
 D23  plan-1  H4    0.020
 D23  plan-1  H5    0.020
 D23  plan-2  C6    0.020
 D23  plan-2  C8    0.020
 D23  plan-2  C9    0.020
 D23  plan-2  C10   0.020
 D23  plan-2  C11   0.020
 D23  plan-2  C12   0.020
 D23  plan-2  C13   0.020
 D23  plan-2  N14   0.020
 D23  plan-2  C15   0.020
 D23  plan-2  N16   0.020
 D23  plan-2  C17   0.020
 D23  plan-2  N18   0.020
 D23  plan-2  C23   0.020
 D23  plan-2  H9    0.020
 D23  plan-2  H10   0.020
 D23  plan-2  H13   0.020
 D23  plan-3  C2    0.020
 D23  plan-3  N7    0.020
 D23  plan-3  HN71  0.020
 D23  plan-3  HN72  0.020
 D23  plan-4  C17   0.020
 D23  plan-4  N18   0.020
 D23  plan-4  C19   0.020
 D23  plan-4  H18   0.020

