# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat May  2 17:58:19 2020
#   Inital geometry file: a 157 line input string
#   Ligand name: 4-{3-[(4-chlorophenyl)amino]-3-oxopropyl}-3-({[5-(propan-2-yl)-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl]carbonyl}amino)benzoic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)N1CCc2nc(sc2C1)C(=O)Nc3cc(ccc3CCC(=O)Nc4ccc(Cl)cc4)C(O)=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 D1Q  D1Q  '4-{3-[(4-chlorophenyl)amino]-3-oxopropyl}-3-({[5-(propan-2-yl)-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl]carbonyl}amino)benzoic acid'  ligand  63  36  .  2021-08-08  2021-08-08  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_D1Q
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 D1Q  C1    C   CR16  0  -0.319  -4.9282  -0.5658   0.8739
 D1Q  C2    C   CR16  0  -0.200  -6.1599   0.0726   0.8385
 D1Q  C3    C   CR6   0  -0.058  -6.7480   0.3910  -0.3728
 D1Q  C4    C   CR16  0  -0.201  -6.1128   0.0749  -1.5636
 D1Q  C5    C   CR16  0  -0.352  -4.8864  -0.5617  -1.5288
 D1Q  C6    C   CR6   0   0.382  -4.2758  -0.8922  -0.3160
 D1Q  CL7   CL  CL    0  -0.135  -8.2869   1.1891  -0.4036
 D1Q  N8    N   NH1   0  -0.751  -3.0354  -1.5278  -0.3912
 D1Q  C9    C   C     0   0.568  -2.2450  -2.0014   0.6074
 D1Q  C10   C   CH2   0  -0.605  -0.9918  -2.6891   0.1047
 D1Q  C11   C   CH2   0  -0.538   0.0869  -2.8130   1.1800
 D1Q  C12   C   CR6   0   0.107   1.3300  -3.4550   0.6317
 D1Q  C13   C   CR6   0   0.325   2.3453  -2.7027   0.0265
 D1Q  C14   C   CR16  0  -0.290   3.4820  -3.3272  -0.4689
 D1Q  C15   C   CR6   0  -0.097   3.6275  -4.7062  -0.3664
 D1Q  C16   C   CR16  0  -0.254   2.6193  -5.4654   0.2216
 D1Q  C17   C   CR16  0  -0.301   1.4865  -4.8349   0.7043
 D1Q  O18   O   O     0  -0.461  -2.5096  -1.9049   1.7907
 D1Q  N19   N   NH1   0  -0.761   2.1853  -1.3116  -0.0787
 D1Q  C20   C   C     0   0.521   3.1273  -0.3816   0.1911
 D1Q  C21   C   CR5   0  -0.089   2.6051   1.0008   0.1326
 D1Q  O22   O   O     0  -0.445   4.2913  -0.6010   0.4699
 D1Q  C23   C   C     0   0.537   4.8670  -5.3164  -0.9076
 D1Q  O24   O   OH1   0  -0.594   4.8889  -6.6354  -0.7834
 D1Q  O25   O   O     0  -0.437   5.7648  -4.6840  -1.4107
 D1Q  N26   N   N     0  -0.410   1.3683   1.3178  -0.0870
 D1Q  C27   C   CR5   0   0.361   1.1973   2.6650  -0.0468
 D1Q  C28   C   CR5   0  -0.288   2.3308   3.3829   0.2022
 D1Q  S29   S   S2    0   0.302   3.6623   2.3267   0.4037
 D1Q  C30   C   CH2   0  -0.312   2.3901   4.8725   0.2765
 D1Q  N31   N   NT    0  -0.433   1.1840   5.4347  -0.3093
 D1Q  C32   C   CH2   0  -0.310   0.0055   4.7857   0.2543
 D1Q  C33   C   CH2   0  -0.507  -0.1123   3.3470  -0.2341
 D1Q  C34   C   CH1   0  -0.055   1.1163   6.8981  -0.1989
 D1Q  C35   C   CH3   0  -0.700   2.4540   7.5657  -0.5017
 D1Q  C36   C   CH3   0  -0.665   0.0679   7.4518  -1.1608
 D1Q  H1    H   HCR6  0   0.290  -4.4935  -0.7985   1.8312
 D1Q  H2    H   HCR6  0   0.281  -6.6539   0.3175   1.7690
 D1Q  H4    H   HCR6  0   0.283  -6.5647   0.3186  -2.5153
 D1Q  H5    H   HCR6  0   0.282  -4.3964  -0.8040  -2.4640
 D1Q  HN8   H   HNH1  0   0.420  -2.6960  -1.6773  -1.3298
 D1Q  H10   H   HCH2  0   0.306  -1.2745  -3.6866  -0.2466
 D1Q  H10A  H   HCH2  0   0.275  -0.6132  -2.1681  -0.7791
 D1Q  H11   H   HCH2  0   0.259   0.3189  -1.8330   1.6030
 D1Q  H11A  H   HCH2  0   0.280  -0.2900  -3.4202   2.0031
 D1Q  H14   H   HCR6  0   0.277   4.2523  -2.7457  -0.9535
 D1Q  H16   H   HCR6  0   0.269   2.7067  -6.5387   0.3129
 D1Q  H17   H   HCR6  0   0.264   0.7070  -5.4257   1.1693
 D1Q  HN19  H   HNH1  0   0.420   1.2596  -0.9477  -0.2590
 D1Q  HO24  H   HOH1  0   0.489   5.7140  -6.9889  -1.1473
 D1Q  H30   H   HCH2  0   0.231   2.5335   5.1752   1.3284
 D1Q  H30A  H   HCH2  0   0.273   3.2665   5.2221  -0.2703
 D1Q  H32   H   HCH2  0   0.211   0.0294   4.8021   1.3568
 D1Q  H32A  H   HCH2  0   0.253  -0.8897   5.3270  -0.0433
 D1Q  H33   H   HCH2  0   0.255  -0.4024   3.3284  -1.2882
 D1Q  H33A  H   HCH2  0   0.256  -0.8955   2.8280   0.3222
 D1Q  H34   H   HCH1  0   0.199   0.8312   7.1803   0.8298
 D1Q  H35   H   HCH3  0   0.243   2.3158   8.6462  -0.5340
 D1Q  H35A  H   HCH3  0   0.241   3.2130   7.3656   0.2539
 D1Q  H35B  H   HCH3  0   0.227   2.8425   7.2512  -1.4730
 D1Q  H36   H   HCH3  0   0.233  -0.9375   7.0823  -0.9621
 D1Q  H36A  H   HCH3  0   0.228   0.0270   8.5385  -1.0815
 D1Q  H36B  H   HCH3  0   0.221   0.3249   7.1948  -2.1900

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 D1Q  C1   C2    aromatic  1.388  0.020  1.388
 D1Q  C1   C6    aromatic  1.396  0.020  1.396
 D1Q  C2   C3    aromatic  1.384  0.020  1.384
 D1Q  C3   C4    aromatic  1.386  0.020  1.386
 D1Q  C3   CL7   single    1.734  0.020  1.734
 D1Q  C4   C5    aromatic  1.382  0.020  1.382
 D1Q  C5   C6    aromatic  1.397  0.020  1.397
 D1Q  C6   N8    single    1.396  0.020  1.396
 D1Q  N8   C9    single    1.359  0.020  1.359
 D1Q  C9   C10   single    1.515  0.020  1.515
 D1Q  C9   O18   double    1.216  0.020  1.216
 D1Q  C10  C11   single    1.528  0.020  1.528
 D1Q  C11  C12   single    1.503  0.020  1.503
 D1Q  C12  C13   aromatic  1.401  0.020  1.401
 D1Q  C12  C17   aromatic  1.391  0.020  1.391
 D1Q  C13  C14   aromatic  1.388  0.020  1.388
 D1Q  C13  N19   single    1.404  0.020  1.404
 D1Q  C14  C15   aromatic  1.390  0.020  1.390
 D1Q  C15  C16   aromatic  1.392  0.020  1.392
 D1Q  C15  C23   single    1.484  0.020  1.484
 D1Q  C16  C17   aromatic  1.383  0.020  1.383
 D1Q  N19  C20   single    1.351  0.020  1.351
 D1Q  C20  C21   single    1.479  0.020  1.479
 D1Q  C20  O22   double    1.217  0.020  1.217
 D1Q  C21  N26   aromatic  1.296  0.020  1.296
 D1Q  C21  S29   aromatic  1.717  0.020  1.717
 D1Q  C23  O24   single    1.325  0.020  1.325
 D1Q  C23  O25   double    1.208  0.020  1.208
 D1Q  N26  C27   aromatic  1.359  0.020  1.359
 D1Q  C27  C28   aromatic  1.365  0.020  1.365
 D1Q  C27  C33   single    1.488  0.020  1.488
 D1Q  C28  S29   aromatic  1.711  0.020  1.711
 D1Q  C28  C30   single    1.493  0.020  1.493
 D1Q  C30  N31   single    1.454  0.020  1.454
 D1Q  N31  C32   single    1.459  0.020  1.459
 D1Q  N31  C34   single    1.469  0.020  1.469
 D1Q  C32  C33   single    1.524  0.020  1.524
 D1Q  C34  C35   single    1.525  0.020  1.525
 D1Q  C34  C36   single    1.527  0.020  1.527
 D1Q  C1   H1    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C2   H2    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C4   H4    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C5   H5    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  N8   HN8   single    0.860  0.020  1.020
 D1Q  C10  H10   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C10  H10A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C11  H11   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C11  H11A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C14  H14   single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C16  H16   single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C17  H17   single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  N19  HN19  single    0.860  0.020  1.020
 D1Q  O24  HO24  single    0.850  0.020  0.980
 D1Q  C30  H30   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C30  H30A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C32  H32   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C32  H32A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C33  H33   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C33  H33A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C34  H34   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C35  H35   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C35  H35A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C35  H35B  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C36  H36   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C36  H36A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C36  H36B  single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 D1Q  H1    C1   C6    121.24  3.000
 D1Q  H1    C1   C2    118.71  3.000
 D1Q  C6    C1   C2    120.04  3.000
 D1Q  H2    C2   C3    120.46  3.000
 D1Q  H2    C2   C1    119.18  3.000
 D1Q  C3    C2   C1    120.36  3.000
 D1Q  CL7   C3   C4    119.76  3.000
 D1Q  CL7   C3   C2    119.92  3.000
 D1Q  C4    C3   C2    120.32  3.000
 D1Q  H4    C4   C5    119.79  3.000
 D1Q  H4    C4   C3    120.87  3.000
 D1Q  C5    C4   C3    119.34  3.000
 D1Q  H5    C5   C6    119.92  3.000
 D1Q  H5    C5   C4    118.86  3.000
 D1Q  C6    C5   C4    121.22  3.000
 D1Q  N8    C6   C5    116.69  3.000
 D1Q  N8    C6   C1    124.59  3.000
 D1Q  C5    C6   C1    118.71  3.000
 D1Q  HN8   N8   C9    115.87  3.000
 D1Q  HN8   N8   C6    114.60  3.000
 D1Q  C9    N8   C6    129.50  3.000
 D1Q  O18   C9   C10   122.59  3.000
 D1Q  O18   C9   N8    124.11  3.000
 D1Q  C10   C9   N8    113.30  3.000
 D1Q  H10A  C10  H10   105.31  3.000
 D1Q  H10A  C10  C11   111.28  3.000
 D1Q  H10   C10  C11   109.53  3.000
 D1Q  H10A  C10  C9    109.77  3.000
 D1Q  H10   C10  C9    107.84  3.000
 D1Q  C11   C10  C9    112.78  3.000
 D1Q  H11A  C11  H11   106.31  3.000
 D1Q  H11A  C11  C12   108.88  3.000
 D1Q  H11   C11  C12   110.42  3.000
 D1Q  H11A  C11  C10   109.42  3.000
 D1Q  H11   C11  C10   110.47  3.000
 D1Q  C12   C11  C10   111.21  3.000
 D1Q  C17   C12  C13   118.28  3.000
 D1Q  C17   C12  C11   119.87  3.000
 D1Q  C13   C12  C11   121.85  3.000
 D1Q  N19   C13  C14   120.81  3.000
 D1Q  N19   C13  C12   118.80  3.000
 D1Q  C14   C13  C12   120.39  3.000
 D1Q  H14   C14  C15   119.50  3.000
 D1Q  H14   C14  C13   120.12  3.000
 D1Q  C15   C14  C13   120.36  3.000
 D1Q  C23   C15  C16   122.32  3.000
 D1Q  C23   C15  C14   117.93  3.000
 D1Q  C16   C15  C14   119.75  3.000
 D1Q  H16   C16  C17   119.30  3.000
 D1Q  H16   C16  C15   121.24  3.000
 D1Q  C17   C16  C15   119.46  3.000
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 D1Q  C16   C17  C12   121.75  3.000
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 D1Q  HN19  N19  C13   118.32  3.000
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 D1Q  O22   C20  C21   121.02  3.000
 D1Q  O22   C20  N19   126.06  3.000
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 D1Q  S29   C21  C20   119.87  3.000
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 D1Q  O25   C23  C15   123.88  3.000
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 D1Q  H33A  C33  C32   109.93  3.000
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 D1Q  H36   C36  C34   113.31  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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 D1Q  plan-6  HN19  0.020

