# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Wed Apr 22 02:42:45 2020
#   Inital geometry file: a 157 line input string
#   Ligand name: 4-{3-[(4-chlorophenyl)amino]-3-oxopropyl}-3-({[5-(propan-2-yl)-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl]carbonyl}amino)benzoic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)N1CCc2nc(sc2C1)C(=O)Nc3cc(ccc3CCC(=O)Nc4ccc(Cl)cc4)C(O)=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 D1Q  D1Q  '4-{3-[(4-chlorophenyl)amino]-3-oxopropyl}-3-({[5-(propan-2-yl)-4,5,6,7-tetrahydro[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl]carbonyl}amino)benzoic acid'  ligand  62  36  .  2021-08-08  2021-08-08  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_D1Q
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 D1Q  C1    C   CR16   0  -0.319  -3.6655   0.5601   0.8710
 D1Q  C2    C   CR16   0  -0.202  -4.3340   1.7732   0.7821
 D1Q  C3    C   CR6    0  -0.054  -4.5091   2.3856  -0.4461
 D1Q  C4    C   CR16   0  -0.200  -4.0442   1.7809  -1.6034
 D1Q  C5    C   CR16   0  -0.347  -3.3757   0.5749  -1.5147
 D1Q  C6    C   CR6    0   0.380  -3.1567  -0.0421  -0.2807
 D1Q  CL7   CL  CL     0  -0.134  -5.3003   3.9257  -0.5391
 D1Q  N8    N   NH1    0  -0.749  -2.4010  -1.2151  -0.2938
 D1Q  C9    C   C      0   0.557  -1.9397  -1.9543   0.7482
 D1Q  C10   C   CH2    0  -0.610  -0.9960  -3.0652   0.3435
 D1Q  C11   C   CH2    0  -0.535   0.1584  -3.2281   1.3492
 D1Q  C12   C   CR6    0   0.093   1.3818  -3.8243   0.7131
 D1Q  C13   C   CR6    0   0.314   2.2706  -3.0252  -0.0176
 D1Q  C14   C   CR16   0  -0.322   3.4083  -3.5736  -0.5956
 D1Q  C15   C   CR6    0  -0.116   3.6938  -4.9276  -0.4593
 D1Q  C16   C   CR16   0  -0.284   2.8081  -5.7263   0.2565
 D1Q  C17   C   CR16   0  -0.310   1.6690  -5.1795   0.8273
 D1Q  O18   O   O      0  -0.463  -2.2330  -1.7492   1.9118
 D1Q  N19   N   NH1    0  -0.758   1.9755  -1.6538  -0.1607
 D1Q  C20   C   C      0   0.515   2.8216  -0.6304   0.0711
 D1Q  C21   C   CR5    0  -0.089   2.1579   0.6925   0.0059
 D1Q  O22   O   O      0  -0.450   4.0084  -0.7204   0.3276
 D1Q  C23   C   C      0   0.401   4.9470  -5.5192  -1.0942
 D1Q  O24   O   OC    -1  -0.593   5.1175  -6.7444  -0.9486
 D1Q  O25   O   O      0  -0.591   5.6910  -4.7274  -1.7038
 D1Q  N26   N   N      0  -0.407   0.8925   0.8817  -0.1971
 D1Q  C27   C   CR5    0   0.369   0.5859   2.2056  -0.1587
 D1Q  C28   C   CR5    0  -0.292   1.6428   3.0364   0.0728
 D1Q  S29   S   S2     0   0.295   3.0787   2.1215   0.2586
 D1Q  C30   C   CH2    0  -0.314   1.5484   4.5248   0.1494
 D1Q  N31   N   NT     0  -0.433   0.2839   4.9626  -0.4206
 D1Q  C32   C   CH2    0  -0.301  -0.8142   4.1942   0.1542
 D1Q  C33   C   CH2    0  -0.511  -0.7877   2.7511  -0.3279
 D1Q  C34   C   CH1    0  -0.056   0.0574   6.4096  -0.2970
 D1Q  C35   C   CH3    0  -0.700   1.3212   7.2246  -0.5534
 D1Q  C36   C   CH3    0  -0.658  -1.0189   6.8588  -1.2824
 D1Q  H1    H   HCR6   0   0.290  -3.5338   0.1114   1.8410
 D1Q  H2    H   HCR6   0   0.282  -4.7070   2.2376   1.6849
 D1Q  H4    H   HCR6   0   0.283  -4.1852   2.2477  -2.5686
 D1Q  H5    H   HCR6   0   0.281  -2.9942   0.1208  -2.4212
 D1Q  HN8   H   HNH1   0   0.419  -2.0905  -1.5018  -1.2096
 D1Q  H10   H   HCH2   0   0.306  -1.5641  -3.9977   0.2884
 D1Q  H10A  H   HCH2   0   0.268  -0.6174  -2.9016  -0.6682
 D1Q  H11   H   HCH2   0   0.257   0.4166  -2.2607   1.7866
 D1Q  H11A  H   HCH2   0   0.275  -0.1673  -3.8555   2.1784
 D1Q  H14   H   HCR6   0   0.254   4.0778  -2.9506  -1.1713
 D1Q  H16   H   HCR6   0   0.244   3.0140  -6.7819   0.3712
 D1Q  H17   H   HCR6   0   0.248   0.9929  -5.8121   1.3904
 D1Q  HN19  H   HNH1   0   0.416   1.0149  -1.3836  -0.3196
 D1Q  H30   H   HCH2   0   0.230   1.6735   4.8388   1.2004
 D1Q  H30A  H   HCH2   0   0.271   2.3771   4.9644  -0.4063
 D1Q  H32   H   HCH2   0   0.210  -0.7817   4.2193   1.2566
 D1Q  H32A  H   HCH2   0   0.242  -1.7657   4.6362  -0.1357
 D1Q  H33   H   HCH2   0   0.252  -1.0952   2.6939  -1.3753
 D1Q  H33A  H   HCH2   0   0.259  -1.5037   2.1588   0.2433
 D1Q  H34   H   HCH1   0   0.200  -0.2842   6.6429   0.7265
 D1Q  H35   H   HCH3   0   0.243   1.0690   8.2849  -0.5591
 D1Q  H35A  H   HCH3   0   0.241   2.0822   7.0809   0.2125
 D1Q  H35B  H   HCH3   0   0.227   1.7576   6.9810  -1.5243
 D1Q  H36   H   HCH3   0   0.228  -1.9709   6.3464  -1.1457
 D1Q  H36A  H   HCH3   0   0.227  -1.2121   7.9254  -1.1635
 D1Q  H36B  H   HCH3   0   0.220  -0.6888   6.6855  -2.3082

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 D1Q  C1   C2    aromatic  1.388  0.020  1.388
 D1Q  C1   C6    aromatic  1.396  0.020  1.396
 D1Q  C2   C3    aromatic  1.384  0.020  1.384
 D1Q  C3   C4    aromatic  1.386  0.020  1.386
 D1Q  C3   CL7   single    1.734  0.020  1.734
 D1Q  C4   C5    aromatic  1.382  0.020  1.382
 D1Q  C5   C6    aromatic  1.397  0.020  1.397
 D1Q  C6   N8    single    1.395  0.020  1.395
 D1Q  N8   C9    single    1.358  0.020  1.358
 D1Q  C9   C10   single    1.513  0.020  1.513
 D1Q  C9   O18   double    1.217  0.020  1.217
 D1Q  C10  C11   single    1.540  0.020  1.540
 D1Q  C11  C12   single    1.502  0.020  1.502
 D1Q  C12  C13   aromatic  1.401  0.020  1.401
 D1Q  C12  C17   aromatic  1.390  0.020  1.390
 D1Q  C13  C14   aromatic  1.389  0.020  1.389
 D1Q  C13  N19   single    1.410  0.020  1.410
 D1Q  C14  C15   aromatic  1.390  0.020  1.390
 D1Q  C15  C16   aromatic  1.391  0.020  1.391
 D1Q  C15  C23   single    1.524  0.020  1.524
 D1Q  C16  C17   aromatic  1.386  0.020  1.386
 D1Q  N19  C20   single    1.348  0.020  1.348
 D1Q  C20  C21   single    1.482  0.020  1.482
 D1Q  C20  O22   double    1.218  0.020  1.218
 D1Q  C21  N26   aromatic  1.295  0.020  1.295
 D1Q  C21  S29   aromatic  1.719  0.020  1.719
 D1Q  C23  O24   deloc     1.246  0.020  1.246
 D1Q  C23  O25   deloc     1.246  0.020  1.246
 D1Q  N26  C27   aromatic  1.360  0.020  1.360
 D1Q  C27  C28   aromatic  1.364  0.020  1.364
 D1Q  C27  C33   single    1.488  0.020  1.488
 D1Q  C28  S29   aromatic  1.713  0.020  1.713
 D1Q  C28  C30   single    1.493  0.020  1.493
 D1Q  C30  N31   single    1.454  0.020  1.454
 D1Q  N31  C32   single    1.458  0.020  1.458
 D1Q  N31  C34   single    1.470  0.020  1.470
 D1Q  C32  C33   single    1.522  0.020  1.522
 D1Q  C34  C35   single    1.526  0.020  1.526
 D1Q  C34  C36   single    1.527  0.020  1.527
 D1Q  C1   H1    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C2   H2    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C4   H4    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C5   H5    single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  N8   HN8   single    0.860  0.020  1.020
 D1Q  C10  H10   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C10  H10A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C11  H11   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C11  H11A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C14  H14   single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C16  H16   single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  C17  H17   single    0.930  0.020  1.080
 D1Q  N19  HN19  single    0.860  0.020  1.020
 D1Q  C30  H30   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C30  H30A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C32  H32   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C32  H32A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C33  H33   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C33  H33A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C34  H34   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C35  H35   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C35  H35A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C35  H35B  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C36  H36   single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C36  H36A  single    0.970  0.020  1.090
 D1Q  C36  H36B  single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 D1Q  H1    C1   C6    121.26  3.000
 D1Q  H1    C1   C2    118.74  3.000
 D1Q  C6    C1   C2    119.99  3.000
 D1Q  H2    C2   C3    120.48  3.000
 D1Q  H2    C2   C1    119.21  3.000
 D1Q  C3    C2   C1    120.31  3.000
 D1Q  CL7   C3   C4    119.72  3.000
 D1Q  CL7   C3   C2    119.90  3.000
 D1Q  C4    C3   C2    120.38  3.000
 D1Q  H4    C4   C5    119.81  3.000
 D1Q  H4    C4   C3    120.88  3.000
 D1Q  C5    C4   C3    119.30  3.000
 D1Q  H5    C5   C6    119.92  3.000
 D1Q  H5    C5   C4    118.85  3.000
 D1Q  C6    C5   C4    121.20  3.000
 D1Q  N8    C6   C5    116.61  3.000
 D1Q  N8    C6   C1    124.60  3.000
 D1Q  C5    C6   C1    118.77  3.000
 D1Q  HN8   N8   C9    115.92  3.000
 D1Q  HN8   N8   C6    114.47  3.000
 D1Q  C9    N8   C6    129.37  3.000
 D1Q  O18   C9   C10   121.99  3.000
 D1Q  O18   C9   N8    124.03  3.000
 D1Q  C10   C9   N8    113.97  3.000
 D1Q  H10A  C10  H10   105.14  3.000
 D1Q  H10A  C10  C11   111.16  3.000
 D1Q  H10   C10  C11   109.40  3.000
 D1Q  H10A  C10  C9    110.73  3.000
 D1Q  H10   C10  C9    108.40  3.000
 D1Q  C11   C10  C9    111.76  3.000
 D1Q  H11A  C11  H11   106.01  3.000
 D1Q  H11A  C11  C12   109.70  3.000
 D1Q  H11   C11  C12   109.18  3.000
 D1Q  H11A  C11  C10   109.51  3.000
 D1Q  H11   C11  C10   110.18  3.000
 D1Q  C12   C11  C10   112.09  3.000
 D1Q  C17   C12  C13   117.90  3.000
 D1Q  C17   C12  C11   121.36  3.000
 D1Q  C13   C12  C11   120.74  3.000
 D1Q  N19   C13  C14   120.88  3.000
 D1Q  N19   C13  C12   118.36  3.000
 D1Q  C14   C13  C12   120.76  3.000
 D1Q  H14   C14  C15   119.10  3.000
 D1Q  H14   C14  C13   120.10  3.000
 D1Q  C15   C14  C13   120.79  3.000
 D1Q  C23   C15  C16   121.00  3.000
 D1Q  C23   C15  C14   120.40  3.000
 D1Q  C16   C15  C14   118.61  3.000
 D1Q  H16   C16  C17   119.85  3.000
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 D1Q  C17   C16  C15   120.57  3.000
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 D1Q  H17   C17  C12   118.87  3.000
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 D1Q  HN19  N19  C13   118.36  3.000
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 D1Q  O22   C20  C21   120.79  3.000
 D1Q  O22   C20  N19   126.30  3.000
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 D1Q  N26   C21  C20   125.09  3.000
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 D1Q  H36   C36  C34   113.37  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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