# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Wed Apr 29 21:35:48 2020
#   Inital geometry file: a 92 line input string
#   Ligand name: 3-(10-methylanthracen-9-yl)propanoic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Cc1c2ccccc2c(CCC(O)=O)c3ccccc13
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 AN1  AN1  '3-(10-methylanthracen-9-yl)propanoic acid'  ligand  36  20  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_AN1
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 AN1  O1   O  OH1   0  -0.596   0.2039  -1.2804  -4.7923
 AN1  C1   C  C     0   0.554   0.0580  -0.1802  -4.0613
 AN1  O2   O  O     0  -0.443  -0.0604   0.9194  -4.5417
 AN1  C2   C  CH2   0  -0.578   0.0576  -0.4861  -2.5889
 AN1  C3   C  CH2   0  -0.582  -0.0291   0.7613  -1.7156
 AN1  C4   C  CR6   0   0.043  -0.0220   0.4179  -0.2480
 AN1  C5   C  CR66  0   0.077   1.1932   0.2251   0.4252
 AN1  C6   C  CR16  0  -0.328   2.4433   0.3142  -0.2627
 AN1  C7   C  CR16  0  -0.257   3.6282   0.1134   0.3719
 AN1  C8   C  CR16  0  -0.255   3.6488  -0.1913   1.7546
 AN1  C9   C  CR16  0  -0.340   2.4851  -0.2794   2.4517
 AN1  C10  C  CR66  0   0.103   1.2129  -0.0796   1.8304
 AN1  C11  C  CR6   0  -0.042   0.0099  -0.1815   2.5469
 AN1  C12  C  CR66  0   0.079  -1.2063  -0.0426   1.8581
 AN1  C13  C  CR66  0   0.074  -1.2254   0.2519   0.4548
 AN1  C14  C  CR16  0  -0.334  -2.4955   0.3599  -0.1903
 AN1  C15  C  CR16  0  -0.254  -3.6614   0.1969   0.4909
 AN1  C16  C  CR16  0  -0.253  -3.6418  -0.0867   1.8777
 AN1  C17  C  CR16  0  -0.316  -2.4551  -0.1996   2.5328
 AN1  C18  C  CH3   0  -0.765  -0.0182  -0.4532   4.0258
 AN1  H1   H  HOH1  0   0.479   0.1942  -1.0556  -5.7346
 AN1  H2   H  HCH2  0   0.289   0.9572  -1.0631  -2.3565
 AN1  H3   H  HCH2  0   0.294  -0.7789  -1.1614  -2.3834
 AN1  H4   H  HCH2  0   0.270  -0.9236   1.3263  -1.9716
 AN1  H5   H  HCH2  0   0.269   0.7972   1.4348  -1.9445
 AN1  H6   H  HCR6  0   0.250   2.4583   0.5358  -1.3207
 AN1  H7   H  HCR6  0   0.259   4.5568   0.1837  -0.1793
 AN1  H8   H  HCR6  0   0.259   4.5934  -0.3564   2.2560
 AN1  H9   H  HCR6  0   0.253   2.5374  -0.5191   3.5034
 AN1  H10  H  HCR6  0   0.248  -2.5443   0.5663  -1.2502
 AN1  H11  H  HCR6  0   0.259  -4.6072   0.2825  -0.0280
 AN1  H12  H  HCR6  0   0.258  -4.5724  -0.2174   2.4143
 AN1  H13  H  HCR6  0   0.256  -2.4651  -0.4237   3.5898
 AN1  H14  H  HCH3  0   0.253  -0.6606   0.2588   4.5442
 AN1  H15  H  HCH3  0   0.254  -0.4077  -1.4505   4.2408
 AN1  H16  H  HCH3  0   0.263   0.9579  -0.3828   4.4929

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 AN1  O1   C1   single    1.329  0.020  1.329
 AN1  O1   H1   single    0.850  0.020  0.980
 AN1  C1   O2   double    1.206  0.020  1.206
 AN1  C1   C2   single    1.504  0.020  1.504
 AN1  C2   C3   single    1.525  0.020  1.525
 AN1  C2   H2   single    0.970  0.020  1.090
 AN1  C2   H3   single    0.970  0.020  1.090
 AN1  C3   C4   single    1.507  0.020  1.507
 AN1  C3   H4   single    0.970  0.020  1.090
 AN1  C3   H5   single    0.970  0.020  1.090
 AN1  C4   C5   aromatic  1.403  0.020  1.403
 AN1  C4   C13  aromatic  1.403  0.020  1.403
 AN1  C5   C6   aromatic  1.430  0.020  1.430
 AN1  C5   C10  aromatic  1.438  0.020  1.438
 AN1  C6   C7   aromatic  1.359  0.020  1.359
 AN1  C6   H6   single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C7   C8   aromatic  1.416  0.020  1.416
 AN1  C7   H7   single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C8   C9   aromatic  1.359  0.020  1.359
 AN1  C8   H8   single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C9   C10  aromatic  1.430  0.020  1.430
 AN1  C9   H9   single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C10  C11  aromatic  1.404  0.020  1.404
 AN1  C11  C12  aromatic  1.405  0.020  1.405
 AN1  C11  C18  single    1.504  0.020  1.504
 AN1  C12  C13  aromatic  1.434  0.020  1.434
 AN1  C12  C17  aromatic  1.428  0.020  1.428
 AN1  C13  C14  aromatic  1.429  0.020  1.429
 AN1  C14  C15  aromatic  1.360  0.020  1.360
 AN1  C14  H10  single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C15  C16  aromatic  1.416  0.020  1.416
 AN1  C15  H11  single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C16  C17  aromatic  1.360  0.020  1.360
 AN1  C16  H12  single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C17  H13  single    0.930  0.020  1.080
 AN1  C18  H14  single    0.970  0.020  1.090
 AN1  C18  H15  single    0.970  0.020  1.090
 AN1  C18  H16  single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 AN1  H1   O1   C1   109.98  3.000
 AN1  C2   C1   O2   125.14  3.000
 AN1  C2   C1   O1   111.72  3.000
 AN1  O2   C1   O1   123.13  3.000
 AN1  H3   C2   H2   105.26  3.000
 AN1  H3   C2   C3   110.71  3.000
 AN1  H2   C2   C3   110.90  3.000
 AN1  H3   C2   C1   108.03  3.000
 AN1  H2   C2   C1   108.37  3.000
 AN1  C3   C2   C1   113.22  3.000
 AN1  H5   C3   H4   104.64  3.000
 AN1  H5   C3   C4   109.97  3.000
 AN1  H4   C3   C4   110.55  3.000
 AN1  H5   C3   C2   109.99  3.000
 AN1  H4   C3   C2   109.67  3.000
 AN1  C4   C3   C2   111.77  3.000
 AN1  C13  C4   C5   119.10  3.000
 AN1  C13  C4   C3   120.70  3.000
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 AN1  C10  C5   C6   118.13  3.000
 AN1  C10  C5   C4   120.66  3.000
 AN1  C6   C5   C4   121.21  3.000
 AN1  H6   C6   C7   118.38  3.000
 AN1  H6   C6   C5   119.72  3.000
 AN1  C7   C6   C5   121.90  3.000
 AN1  H7   C7   C8   119.93  3.000
 AN1  H7   C7   C6   120.04  3.000
 AN1  C8   C7   C6   120.03  3.000
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 AN1  H8   C8   C7   119.86  3.000
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 AN1  H9   C9   C8   118.19  3.000
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 AN1  C11  C10  C9   122.04  3.000
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 AN1  C9   C10  C5   117.80  3.000
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 AN1  C18  C11  C10  122.08  3.000
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 AN1  C14  C13  C4   121.82  3.000
 AN1  C12  C13  C4   120.20  3.000
 AN1  H10  C14  C15  118.38  3.000
 AN1  H10  C14  C13  119.83  3.000
 AN1  C15  C14  C13  121.79  3.000
 AN1  H11  C15  C16  119.85  3.000
 AN1  H11  C15  C14  119.97  3.000
 AN1  C16  C15  C14  120.18  3.000
 AN1  H12  C16  C17  120.10  3.000
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 AN1  C17  C16  C15  120.03  3.000
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 AN1  H13  C17  C12  119.54  3.000
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 AN1  H16  C18  H15  107.19  3.000
 AN1  H16  C18  H14  106.45  3.000
 AN1  H15  C18  H14  107.02  3.000
 AN1  H16  C18  C11  113.26  3.000
 AN1  H15  C18  C11  111.43  3.000
 AN1  H14  C18  C11  111.14  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 AN1  CONST_01  C7   C6   C5   C4    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_02  C9   C10  C5   C4    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_03  C11  C10  C5   C4      0.00   0.0  0
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 AN1  CONST_05  C17  C12  C13  C4    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_06  C15  C14  C13  C4    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_07  C12  C13  C4   C5      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_08  C14  C13  C4   C5    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_09  C8   C7   C6   C5      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_10  C8   C9   C10  C5      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_11  C12  C11  C10  C5      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_12  C13  C4   C5   C6    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_13  C9   C10  C5   C6      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_14  C11  C10  C5   C6    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_15  C9   C8   C7   C6      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_16  C10  C5   C6   C7      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_17  C10  C9   C8   C7      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_18  C11  C10  C9   C8    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_19  C12  C11  C10  C9    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_20  C13  C4   C5   C10     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_21  C13  C12  C11  C10     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_22  C17  C12  C11  C10   180.00   0.0  0
 AN1  CONST_23  C14  C13  C12  C11   180.00   0.0  0
 AN1  CONST_24  C16  C17  C12  C11   180.00   0.0  0
 AN1  CONST_25  C15  C14  C13  C12     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_26  C15  C16  C17  C12     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_27  C16  C17  C12  C13     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_28  C16  C15  C14  C13     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_29  C17  C12  C13  C14     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_30  C17  C16  C15  C14     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_31  C6   C5   C4   C3      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_32  C10  C5   C4   C3    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_33  C12  C13  C4   C3    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_34  C14  C13  C4   C3      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_35  C18  C11  C10  C5    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_36  C18  C11  C10  C9      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_37  C18  C11  C12  C13   180.00   0.0  0
 AN1  CONST_38  C18  C11  C12  C17     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_39  H6   C6   C5   C4      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_40  H10  C14  C13  C4      0.00   0.0  0
 AN1  CONST_41  H7   C7   C6   C5    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_42  H9   C9   C10  C5    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_43  H8   C8   C7   C6    180.00   0.0  0
 AN1  CONST_44  H13  C17  C12  C11     0.00   0.0  0
 AN1  CONST_45  H12  C16  C17  C12   180.00   0.0  0
 AN1  CONST_46  H11  C15  C14  C13   180.00   0.0  0
 AN1  CONST_47  H1   O1   C1   O2      0.00   0.0  0
 AN1  Var_01    C5   C4   C3   C2     84.76  30.0  2
 AN1  Var_02    H14  C18  C11  C10   130.07  30.0  2
 AN1  Var_03    C4   C3   C2   C1   -179.79  30.0  3
 AN1  Var_04    C3   C2   C1   O1    176.76  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
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_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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 AN1  plan-1  C6   0.020
 AN1  plan-1  C7   0.020
 AN1  plan-1  C8   0.020
 AN1  plan-1  C9   0.020
 AN1  plan-1  C10  0.020
 AN1  plan-1  C11  0.020
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 AN1  plan-1  H11  0.020
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 AN1  plan-2  O1   0.020
 AN1  plan-2  C1   0.020
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 AN1  plan-2  C2   0.020
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