# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sun Sep 25 17:05:33 2022
#   Inital geometry file: a 174 line input string
#   Ligand name: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylanilino)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: NC(=O)c1cccc(N[C@H]2O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)[C@@H](O)[C@H]2O)c1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 9XR  9XR  "[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylanilino)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)"  ligand  74  45  .  2022-09-16  2022-11-17
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_9XR
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 9XR  O7N   O  O     0  -0.472   -2.1786  53.3543  22.2800
 9XR  C7N   C  C     0   0.477   -3.2933  52.9657  21.9628
 9XR  N7N   N  NH2   0  -0.809   -4.2259  52.6203  22.8662
 9XR  C3N   C  CR6   0  -0.015   -3.6927  52.8489  20.5236
 9XR  C2N   C  CR16  0  -0.388   -5.0186  52.9990  20.1232
 9XR  C4N   C  CR16  0  -0.313   -2.6937  52.6260  19.5837
 9XR  C5N   C  CR16  0  -0.229   -3.0405  52.5249  18.2436
 9XR  C6N   C  CR16  0  -0.341   -4.3563  52.6531  17.8398
 9XR  C1N   C  CR6   0   0.413   -5.3716  52.8932  18.7745
 9XR  C1D   C  CH1   0   0.125   -7.7528  53.3569  19.1648
 9XR  O4D   O  O2    0  -0.559   -7.7330  54.7312  19.5835
 9XR  C2D   C  CH1   0   0.010   -9.1110  53.2644  18.4538
 9XR  O2D   O  OH1   0  -0.649   -9.2681  52.2043  17.5674
 9XR  C3D   C  CH1   0  -0.070   -9.1954  54.6017  17.7094
 9XR  O3D   O  OH1   0  -0.654   -8.5276  54.5726  16.4735
 9XR  C4D   C  CH1   0   0.037   -8.4477  55.5522  18.6494
 9XR  C5D   C  CH2   0  -0.243   -9.3915  56.4724  19.3957
 9XR  O5D   O  O2    0  -0.582   -8.6526  57.3667  20.2358
 9XR  PN    P  P     0   1.470   -8.4168  57.1533  21.7985
 9XR  O1N   O  OH1   0  -0.760   -8.1276  55.6207  22.0286
 9XR  O2N   O  O     0  -0.670   -7.4576  58.1300  22.3305
 9XR  O3    O  O2    0  -0.691   -9.9011  57.2515  22.4604
 9XR  PA    P  P     0   1.486  -10.7425  58.5651  22.8953
 9XR  O1A   O  OH1   0  -0.747   -9.8822  59.0855  24.1107
 9XR  O2A   O  O     0  -0.667  -12.1572  58.2264  23.1146
 9XR  O5B   O  O2    0  -0.601  -10.4522  59.6477  21.7589
 9XR  C5B   C  CH2   0  -0.222  -11.0910  59.6411  20.4745
 9XR  C4B   C  CH1   0   0.030  -11.8448  60.9293  20.2336
 9XR  C3B   C  CH1   0  -0.013  -11.0208  62.2053  20.4511
 9XR  O3B   O  OH1   0  -0.652  -10.4482  62.5969  19.2423
 9XR  C2B   C  CH1   0  -0.048  -12.0516  63.1801  21.0467
 9XR  O2B   O  OH1   0  -0.652  -12.7400  63.7813  19.9900
 9XR  C1B   C  CH1   0   0.133  -12.9827  62.2232  21.8030
 9XR  O4B   O  O2    0  -0.477  -12.9742  61.0224  21.0868
 9XR  N9A   N  NR5   0  -0.522  -12.5948  61.9642  23.1805
 9XR  C4A   C  CR56  0   0.515  -13.4128  61.3211  24.0752
 9XR  C5A   C  CR56  0   0.014  -12.6012  60.9708  25.1363
 9XR  N7A   N  N     0  -0.516  -11.3069  61.3680  24.8996
 9XR  C8A   C  CR15  0   0.112  -11.3506  61.9518  23.7335
 9XR  N3A   N  N     0  -0.457  -14.7106  61.0647  23.9540
 9XR  C2A   C  CR16  0   0.044  -15.1767  60.4090  25.0036
 9XR  N1A   N  N     0  -0.468  -14.5183  60.0066  26.0863
 9XR  C6A   C  CR6   0   0.471  -13.2107  60.2666  26.1908
 9XR  N6A   N  NH2   0  -0.815  -12.5440  59.8525  27.2672
 9XR  N8N   N  NH1   0  -0.708   -6.6729  52.9993  18.3300
 9XR  H71N  H  HNH2  0   0.402   -3.9996  52.6515  23.8472
 9XR  H72N  H  HNH2  0   0.409   -5.0752  52.1471  22.6108
 9XR  H2N   H  HCR6  0   0.271   -5.7706  53.2372  20.8636
 9XR  H4N   H  HCR6  0   0.252   -1.6627  52.5244  19.8921
 9XR  H5N   H  HCR6  0   0.257   -2.2749  52.3414  17.5008
 9XR  H6N1  H  HCR6  0   0.265   -4.6084  52.5690  16.7891
 9XR  H1D   H  HCH1  0   0.275   -7.7249  52.7657  20.0823
 9XR  H2D   H  HCH1  0   0.254   -9.8788  53.2643  19.2390
 9XR  HO2N  H  HOH1  0   0.465   -9.3187  51.3808  18.0634
 9XR  H3D   H  HCH1  0   0.263  -10.2414  54.9075  17.5796
 9XR  HO3N  H  HOH1  0   0.459   -8.9865  53.9550  15.8934
 9XR  H4D   H  HCH1  0   0.277   -7.7348  56.1578  18.0807
 9XR  H51N  H  HCH2  0   0.279   -9.9265  57.0927  18.6768
 9XR  H52N  H  HCH2  0   0.260  -10.1375  55.9052  19.9613
 9XR  H1    H  HOH1  0   0.513   -7.8949  55.1333  21.1943
 9XR  H2    H  HOH1  0   0.500  -10.2408  59.8776  24.5771
 9XR  H52A  H  HCH2  0   0.264  -11.7661  58.7885  20.3678
 9XR  H51A  H  HCH2  0   0.265  -10.3094  59.5456  19.7202
 9XR  H4B   H  HCH1  0   0.259  -12.1878  60.8989  19.1919
 9XR  H3B   H  HCH1  0   0.246  -10.2449  62.0255  21.2031
 9XR  HO3A  H  HOH1  0   0.460   -9.7612  63.2473  19.4192
 9XR  H2B   H  HCH1  0   0.265  -11.5932  63.9227  21.7112
 9XR  HO2A  H  HOH1  0   0.460  -13.3312  64.4515  20.3480
 9XR  H1B   H  HCH1  0   0.284  -14.0032  62.6079  21.8430
 9XR  H8A   H  HCR5  0   0.314  -10.4911  62.3883  23.2497
 9XR  H2A   H  HCR6  0   0.254  -16.2332  60.1639  24.9831
 9XR  H61A  H  HNH2  0   0.405  -13.0220  59.3533  27.9978
 9XR  H62A  H  HNH2  0   0.414  -11.5637  60.0422  27.3821
 9XR  HN8N  H  HNH1  0   0.388   -6.7867  53.1708  17.3423

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 9XR  O3D  C3D   single    1.405  0.020  1.405
 9XR  C4D  O4D   single    1.434  0.020  1.434
 9XR  C4D  C3D   single    1.532  0.020  1.532
 9XR  C4D  C5D   single    1.515  0.020  1.515
 9XR  O4D  C1D   single    1.437  0.020  1.437
 9XR  C3D  C2D   single    1.533  0.020  1.533
 9XR  O2D  C2D   single    1.391  0.020  1.391
 9XR  C5D  O5D   single    1.432  0.020  1.432
 9XR  O5D  PN    single    1.595  0.020  1.595
 9XR  N8N  C1D   single    1.411  0.020  1.411
 9XR  N8N  C1N   single    1.379  0.020  1.379
 9XR  C2D  C1D   single    1.536  0.020  1.536
 9XR  C1N  C6N   aromatic  1.401  0.020  1.401
 9XR  C1N  C2N   aromatic  1.398  0.020  1.398
 9XR  C6N  C5N   aromatic  1.382  0.020  1.382
 9XR  O2N  PN    double    1.469  0.020  1.469
 9XR  C2N  C3N   aromatic  1.393  0.020  1.393
 9XR  PN   O3    single    1.628  0.020  1.628
 9XR  PN   O1N   single    1.576  0.020  1.576
 9XR  O3   PA    single    1.619  0.020  1.619
 9XR  C5B  C4B   single    1.512  0.020  1.512
 9XR  C5B  O5B   single    1.435  0.020  1.435
 9XR  C5N  C4N   aromatic  1.388  0.020  1.388
 9XR  C3N  C4N   aromatic  1.390  0.020  1.390
 9XR  C3N  C7N   single    1.498  0.020  1.498
 9XR  C4B  O4B   single    1.418  0.020  1.418
 9XR  C4B  C3B   single    1.534  0.020  1.534
 9XR  C7N  N7N   single    1.344  0.020  1.344
 9XR  C7N  O7N   double    1.222  0.020  1.222
 9XR  O2A  PA    double    1.471  0.020  1.471
 9XR  O5B  PA    single    1.596  0.020  1.596
 9XR  PA   O1A   single    1.577  0.020  1.577
 9XR  O3B  C3B   single    1.394  0.020  1.394
 9XR  O4B  C1B   single    1.398  0.020  1.398
 9XR  O2B  C2B   single    1.397  0.020  1.397
 9XR  C3B  C2B   single    1.539  0.020  1.539
 9XR  C2B  C1B   single    1.534  0.020  1.534
 9XR  C1B  N9A   single    1.454  0.020  1.454
 9XR  N9A  C8A   aromatic  1.362  0.020  1.362
 9XR  N9A  C4A   aromatic  1.372  0.020  1.372
 9XR  C8A  N7A   aromatic  1.305  0.020  1.305
 9XR  C4A  N3A   aromatic  1.328  0.020  1.328
 9XR  C4A  C5A   aromatic  1.381  0.020  1.381
 9XR  N3A  C2A   aromatic  1.322  0.020  1.322
 9XR  N7A  C5A   aromatic  1.374  0.020  1.374
 9XR  C5A  C6A   aromatic  1.407  0.020  1.407
 9XR  C2A  N1A   aromatic  1.330  0.020  1.330
 9XR  C6A  N1A   aromatic  1.337  0.020  1.337
 9XR  C6A  N6A   single    1.332  0.020  1.332
 9XR  N7N  H71N  single    0.860  0.020  1.020
 9XR  N7N  H72N  single    0.860  0.020  1.020
 9XR  C2N  H2N   single    0.930  0.020  1.080
 9XR  C4N  H4N   single    0.930  0.020  1.080
 9XR  C5N  H5N   single    0.930  0.020  1.080
 9XR  C6N  H6N1  single    0.930  0.020  1.080
 9XR  C1D  H1D   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C2D  H2D   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  O2D  HO2N  single    0.850  0.020  0.980
 9XR  C3D  H3D   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  O3D  HO3N  single    0.850  0.020  0.980
 9XR  C4D  H4D   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C5D  H51N  single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C5D  H52N  single    0.970  0.020  1.090
 9XR  O1N  H1    single    0.850  0.020  0.980
 9XR  O1A  H2    single    0.850  0.020  0.980
 9XR  C5B  H52A  single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C5B  H51A  single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C4B  H4B   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C3B  H3B   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  O3B  HO3A  single    0.850  0.020  0.980
 9XR  C2B  H2B   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  O2B  HO2A  single    0.850  0.020  0.980
 9XR  C1B  H1B   single    0.970  0.020  1.090
 9XR  C8A  H8A   single    0.930  0.020  1.080
 9XR  C2A  H2A   single    0.930  0.020  1.080
 9XR  N6A  H61A  single    0.860  0.020  1.020
 9XR  N6A  H62A  single    0.860  0.020  1.020
 9XR  N8N  HN8N  single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 9XR  C3N   C7N  N7N   116.16  3.000
 9XR  N7N   C7N  O7N   122.70  3.000
 9XR  C3N   C7N  O7N   121.14  3.000
 9XR  H72N  N7N  H71N  116.86  3.000
 9XR  H72N  N7N  C7N   122.46  3.000
 9XR  H71N  N7N  C7N   119.40  3.000
 9XR  C4N   C3N  C2N   120.47  3.000
 9XR  C4N   C3N  C7N   118.07  3.000
 9XR  C2N   C3N  C7N   121.42  3.000
 9XR  H2N   C2N  C1N   120.09  3.000
 9XR  H2N   C2N  C3N   119.25  3.000
 9XR  C1N   C2N  C3N   120.62  3.000
 9XR  H4N   C4N  C5N   120.46  3.000
 9XR  H4N   C4N  C3N   120.52  3.000
 9XR  C5N   C4N  C3N   119.02  3.000
 9XR  H5N   C5N  C6N   119.24  3.000
 9XR  H5N   C5N  C4N   119.88  3.000
 9XR  C6N   C5N  C4N   120.88  3.000
 9XR  H6N1  C6N  C1N   119.44  3.000
 9XR  H6N1  C6N  C5N   119.83  3.000
 9XR  C1N   C6N  C5N   120.72  3.000
 9XR  N8N   C1N  C6N   118.82  3.000
 9XR  C6N   C1N  C2N   118.27  3.000
 9XR  N8N   C1N  C2N   122.91  3.000
 9XR  H1D   C1D  N8N   109.90  3.000
 9XR  H1D   C1D  C2D   112.27  3.000
 9XR  N8N   C1D  C2D   112.81  3.000
 9XR  H1D   C1D  O4D   105.83  3.000
 9XR  C2D   C1D  O4D   101.81  3.000
 9XR  N8N   C1D  O4D   113.85  3.000
 9XR  C4D   O4D  C1D   110.54  3.000
 9XR  H2D   C2D  C3D   107.99  3.000
 9XR  H2D   C2D  O2D   112.13  3.000
 9XR  C3D   C2D  O2D   110.44  3.000
 9XR  H2D   C2D  C1D   106.70  3.000
 9XR  O2D   C2D  C1D   116.16  3.000
 9XR  C3D   C2D  C1D   102.77  3.000
 9XR  HO2N  O2D  C2D   109.24  3.000
 9XR  H3D   C3D  C4D   111.40  3.000
 9XR  H3D   C3D  O3D   110.78  3.000
 9XR  C4D   C3D  O3D   108.70  3.000
 9XR  H3D   C3D  C2D   110.67  3.000
 9XR  C4D   C3D  C2D   102.50  3.000
 9XR  O3D   C3D  C2D   112.51  3.000
 9XR  HO3N  O3D  C3D   108.45  3.000
 9XR  H4D   C4D  C5D   109.01  3.000
 9XR  H4D   C4D  C3D   110.02  3.000
 9XR  C5D   C4D  C3D   112.04  3.000
 9XR  H4D   C4D  O4D   109.29  3.000
 9XR  C5D   C4D  O4D   109.71  3.000
 9XR  C3D   C4D  O4D   106.72  3.000
 9XR  H52N  C5D  H51N  107.53  3.000
 9XR  H52N  C5D  O5D   111.84  3.000
 9XR  H51N  C5D  O5D   106.54  3.000
 9XR  H52N  C5D  C4D   111.38  3.000
 9XR  H51N  C5D  C4D   109.06  3.000
 9XR  O5D   C5D  C4D   110.30  3.000
 9XR  PN    O5D  C5D   124.57  3.000
 9XR  O3    PN   O2N   114.08  3.000
 9XR  O3    PN   O1N    99.58  3.000
 9XR  O2N   PN   O1N   118.28  3.000
 9XR  O1N   PN   O5D   107.48  3.000
 9XR  O3    PN   O5D   104.80  3.000
 9XR  O2N   PN   O5D   111.26  3.000
 9XR  H1    O1N  PN    113.40  3.000
 9XR  PA    O3   PN    129.18  3.000
 9XR  O5B   PA   O2A   115.92  3.000
 9XR  O5B   PA   O1A   103.04  3.000
 9XR  O2A   PA   O1A   119.05  3.000
 9XR  O1A   PA   O3    101.02  3.000
 9XR  O5B   PA   O3    105.34  3.000
 9XR  O2A   PA   O3    110.67  3.000
 9XR  H2    O1A  PA    115.52  3.000
 9XR  C5B   O5B  PA    123.60  3.000
 9XR  H51A  C5B  H52A  107.88  3.000
 9XR  H51A  C5B  C4B   108.77  3.000
 9XR  H52A  C5B  C4B   109.95  3.000
 9XR  H51A  C5B  O5B   107.49  3.000
 9XR  H52A  C5B  O5B   111.48  3.000
 9XR  C4B   C5B  O5B   111.15  3.000
 9XR  H4B   C4B  O4B   108.90  3.000
 9XR  H4B   C4B  C3B   109.00  3.000
 9XR  O4B   C4B  C3B   106.73  3.000
 9XR  H4B   C4B  C5B   106.47  3.000
 9XR  C3B   C4B  C5B   114.72  3.000
 9XR  O4B   C4B  C5B   110.92  3.000
 9XR  H3B   C3B  C2B   108.22  3.000
 9XR  H3B   C3B  O3B   110.52  3.000
 9XR  C2B   C3B  O3B   115.65  3.000
 9XR  H3B   C3B  C4B   109.95  3.000
 9XR  C2B   C3B  C4B   102.82  3.000
 9XR  O3B   C3B  C4B   109.35  3.000
 9XR  HO3A  O3B  C3B   108.89  3.000
 9XR  H2B   C2B  C1B   112.16  3.000
 9XR  H2B   C2B  O2B   111.89  3.000
 9XR  C1B   C2B  O2B   110.00  3.000
 9XR  H2B   C2B  C3B   112.55  3.000
 9XR  C1B   C2B  C3B   101.67  3.000
 9XR  O2B   C2B  C3B   108.05  3.000
 9XR  HO2A  O2B  C2B   108.71  3.000
 9XR  H1B   C1B  N9A   106.11  3.000
 9XR  H1B   C1B  O4B   109.10  3.000
 9XR  N9A   C1B  O4B   109.30  3.000
 9XR  H1B   C1B  C2B   111.45  3.000
 9XR  N9A   C1B  C2B   114.58  3.000
 9XR  O4B   C1B  C2B   106.23  3.000
 9XR  C1B   O4B  C4B   111.67  3.000
 9XR  C8A   N9A  C4A   106.00  3.000
 9XR  C4A   N9A  C1B   122.82  3.000
 9XR  C8A   N9A  C1B   129.05  3.000
 9XR  N3A   C4A  C5A   126.53  3.000
 9XR  C5A   C4A  N9A   105.63  3.000
 9XR  N3A   C4A  N9A   127.83  3.000
 9XR  C6A   C5A  N7A   132.97  3.000
 9XR  C6A   C5A  C4A   116.63  3.000
 9XR  N7A   C5A  C4A   110.35  3.000
 9XR  C8A   N7A  C5A   104.58  3.000
 9XR  H8A   C8A  N7A   123.73  3.000
 9XR  H8A   C8A  N9A   122.84  3.000
 9XR  N7A   C8A  N9A   113.43  3.000
 9XR  C2A   N3A  C4A   111.57  3.000
 9XR  H2A   C2A  N1A   115.42  3.000
 9XR  H2A   C2A  N3A   116.13  3.000
 9XR  N1A   C2A  N3A   128.45  3.000
 9XR  C6A   N1A  C2A   119.28  3.000
 9XR  N6A   C6A  N1A   119.48  3.000
 9XR  N6A   C6A  C5A   122.99  3.000
 9XR  N1A   C6A  C5A   117.54  3.000
 9XR  H62A  N6A  H61A  118.31  3.000
 9XR  H62A  N6A  C6A   121.46  3.000
 9XR  H61A  N6A  C6A   120.23  3.000
 9XR  HN8N  N8N  C1D   116.73  3.000
 9XR  HN8N  N8N  C1N   115.79  3.000
 9XR  C1D   N8N  C1N   123.43  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 9XR  CONST_01  C6N   C1N  C2N  C3N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_02  C6N   C5N  C4N  C3N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_03  C5N   C6N  C1N  C2N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_04  C5N   C4N  C3N  C2N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_05  C1N   C6N  C5N  C4N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_06  C1N   C2N  C3N  C4N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_07  C5A   N7A  C8A  N9A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_08  C2A   N3A  C4A  N9A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_09  N7A   C5A  C4A  N9A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_10  C6A   C5A  C4A  N9A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_11  N7A   C8A  N9A  C4A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_12  N1A   C2A  N3A  C4A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_13  C8A   N7A  C5A  C4A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_14  N1A   C6A  C5A  C4A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_15  C8A   N9A  C4A  C5A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_16  C2A   N3A  C4A  C5A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_17  C2A   N1A  C6A  C5A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_18  N3A   C4A  C5A  N7A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_19  N1A   C6A  C5A  N7A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_20  N3A   C4A  N9A  C8A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_21  C6A   C5A  N7A  C8A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_22  C6A   C5A  C4A  N3A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_23  C6A   N1A  C2A  N3A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_25  N3A   C4A  N9A  C1B     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_26  C5A   C4A  N9A  C1B   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_27  C1N   C2N  C3N  C7N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_28  C5N   C4N  C3N  C7N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_29  N8N   C1N  C2N  C3N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_30  N8N   C1N  C6N  C5N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_31  N6A   C6A  C5A  C4A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_32  N6A   C6A  C5A  N7A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_33  N6A   C6A  N1A  C2A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_34  C1D   N8N  C1N  C2N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_35  C1D   N8N  C1N  C6N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_36  H5N   C5N  C4N  C3N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_37  H6N1  C6N  C1N  C2N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_38  H4N   C4N  C3N  C2N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_39  H6N1  C6N  C5N  C4N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_40  H2N   C2N  C3N  C4N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_41  H2N   C2N  C1N  C6N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_42  H4N   C4N  C5N  C6N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_43  H5N   C5N  C6N  C1N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_45  H8A   C8A  N9A  C4A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_46  H2A   C2A  N3A  C4A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_47  H8A   C8A  N7A  C5A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_48  H2A   C2A  N1A  C6A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_51  H61A  N6A  C6A  C5A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_52  H62A  N6A  C6A  C5A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_53  H61A  N6A  C6A  N1A     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_54  H62A  N6A  C6A  N1A   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_55  H71N  N7N  C7N  C3N   180.00   0.0  0
 9XR  CONST_56  H72N  N7N  C7N  C3N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_57  H71N  N7N  C7N  O7N     0.00   0.0  0
 9XR  CONST_58  H72N  N7N  C7N  O7N   180.00   0.0  0
 9XR  Var_01    C2N   C3N  C7N  O7N  -150.97  30.0  2
 9XR  Var_02    C4N   C3N  C7N  O7N    27.07  30.0  2
 9XR  Var_03    C2N   C3N  C7N  N7N    29.05  30.0  2
 9XR  Var_04    C4N   C3N  C7N  N7N  -152.91  30.0  2
 9XR  Var_05    PN    O5D  C5D  C4D   -98.37  30.0  3
 9XR  Var_06    C4B   C5B  O5B  PA    121.08  30.0  1
 9XR  Var_07    O2N   PN   O5D  C5D   171.46  30.0  3
 9XR  Var_08    O3    PN   O5D  C5D   -64.79  30.0  3
 9XR  Var_09    O1N   PN   O5D  C5D    40.50  30.0  3
 9XR  Var_10    PA    O3   PN   O5D   -83.59  30.0  3
 9XR  Var_11    O2A   PA   O3   PN    164.96  30.0  3
 9XR  Var_12    O5B   PA   O3   PN     38.95  30.0  3
 9XR  Var_13    O1A   PA   O3   PN    -68.02  30.0  3
 9XR  Var_14    PA    O3   PN   O1N   165.33  30.0  3
 9XR  Var_15    PA    O3   PN   O2N    38.34  30.0  3
 9XR  Var_16    C5B   O5B  PA   O3     78.57  30.0  1
 9XR  Var_17    C5B   O5B  PA   O1A  -175.95  30.0  1
 9XR  Var_18    C5B   O5B  PA   O2A   -44.13  30.0  1
 9XR  Var_19    H51N  C5D  O5D  PN    143.39  30.0  1
 9XR  Var_20    H52N  C5D  O5D  PN     26.16  30.0  1
 9XR  Var_21    H52A  C5B  O5B  PA     -1.96  30.0  1
 9XR  Var_22    H51A  C5B  O5B  PA   -119.99  30.0  1

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 9XR  chir_01  C1D  O4D  N8N  C2D  positiv
 9XR  chir_02  C2D  O2D  C1D  C3D  negativ
 9XR  chir_03  C3D  O3D  C4D  C2D  positiv
 9XR  chir_04  C4D  O4D  C3D  C5D  negativ
 9XR  chir_07  C4B  C5B  O4B  C3B  negativ
 9XR  chir_08  C3B  O3B  C4B  C2B  positiv
 9XR  chir_09  C2B  O2B  C3B  C1B  positiv
 9XR  chir_10  C1B  O4B  N9A  C2B  negativ
 9XR  chir_11  PN   O2N  O3   O1N  both
 9XR  chir_12  PA   O2A  O5B  O1A  both

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 9XR  plan-1  C6A   0.020
 9XR  plan-1  N6A   0.020
 9XR  plan-1  H61A  0.020
 9XR  plan-1  H62A  0.020
 9XR  plan-2  C7N   0.020
 9XR  plan-2  C3N   0.020
 9XR  plan-2  C2N   0.020
 9XR  plan-2  C4N   0.020
 9XR  plan-2  C5N   0.020
 9XR  plan-2  C6N   0.020
 9XR  plan-2  C1N   0.020
 9XR  plan-2  N8N   0.020
 9XR  plan-2  H2N   0.020
 9XR  plan-2  H4N   0.020
 9XR  plan-2  H5N   0.020
 9XR  plan-2  H6N1  0.020
 9XR  plan-3  C1B   0.020
 9XR  plan-3  N9A   0.020
 9XR  plan-3  C4A   0.020
 9XR  plan-3  C5A   0.020
 9XR  plan-3  N7A   0.020
 9XR  plan-3  C8A   0.020
 9XR  plan-3  N3A   0.020
 9XR  plan-3  C2A   0.020
 9XR  plan-3  N1A   0.020
 9XR  plan-3  C6A   0.020
 9XR  plan-3  N6A   0.020
 9XR  plan-3  H8A   0.020
 9XR  plan-3  H2A   0.020
 9XR  plan-4  C1N   0.020
 9XR  plan-4  C1D   0.020
 9XR  plan-4  N8N   0.020
 9XR  plan-4  HN8N  0.020
 9XR  plan-5  O7N   0.020
 9XR  plan-5  C7N   0.020
 9XR  plan-5  N7N   0.020
 9XR  plan-5  C3N   0.020
 9XR  plan-5  H71N  0.020
 9XR  plan-5  H72N  0.020

