# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Apr 11 04:16:40 2020
#   Inital geometry file: a 103 line input string
#   Ligand name: 2-(4-pyridin-2-ylphenyl)-3~{H}-quinazolin-4-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O=C1NC(=Nc2ccccc12)c3ccc(cc3)c4ccccn4
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 9AW  9AW  2-(4-pyridin-2-ylphenyl)-3~{H}-quinazolin-4-one  ligand  36  23  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_9AW
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 9AW  CAW  C  CR16  0  -0.336  -4.9976   1.3499  -0.1049
 9AW  CAV  C  CR16  0  -0.149  -6.3825   1.3517  -0.1192
 9AW  CAU  C  CR16  0  -0.324  -7.0574   0.1438  -0.0403
 9AW  CAT  C  CR16  0  -0.071  -6.3022  -1.0173   0.0421
 9AW  NAS  N  N     0  -0.427  -4.9781  -1.0266   0.0586
 9AW  CAR  C  CR6   0   0.231  -4.3239   0.1326  -0.0063
 9AW  CAO  C  CR6   0   0.079  -2.8466   0.0596   0.0135
 9AW  CAP  C  CR16  0  -0.267  -2.1994  -1.1264  -0.3319
 9AW  CAQ  C  CR16  0  -0.280  -0.8185  -1.2121  -0.3205
 9AW  CAN  C  CR16  0  -0.307  -2.0637   1.1570   0.3779
 9AW  CAM  C  CR16  0  -0.252  -0.6842   1.0759   0.3870
 9AW  CAL  C  CR6   0   0.008  -0.0418  -0.1121   0.0407
 9AW  CAD  C  CR6   0   0.491   1.4308  -0.1595   0.0541
 9AW  NAE  N  N     0  -0.470   2.1020   0.9302  -0.0773
 9AW  CAF  C  CR66  0   0.265   3.4721   0.8534  -0.0632
 9AW  CAK  C  CR16  0  -0.322   4.2132   2.0363  -0.1969
 9AW  CAJ  C  CR16  0  -0.237   5.5901   1.9938  -0.1939
 9AW  CAI  C  CR16  0  -0.259   6.2680   0.7766  -0.0584
 9AW  CAH  C  CR16  0  -0.276   5.5549  -0.3948   0.0738
 9AW  CAG  C  CR66  0  -0.106   4.1579  -0.3645   0.0712
 9AW  CAB  C  CR6   0   0.539   3.3856  -1.5904   0.2232
 9AW  OAA  O  O     0  -0.449   3.8483  -2.7075   0.3630
 9AW  NAC  N  NR16  0  -0.728   2.0237  -1.3794   0.2091
 9AW  H1   H  HCR6  0   0.273  -4.4560   2.2819  -0.1874
 9AW  H2   H  HCR6  0   0.278  -6.9251   2.2843  -0.1989
 9AW  H3   H  HCR6  0   0.274  -8.1372   0.0964  -0.0475
 9AW  H4   H  HCR6  0   0.265  -6.7909  -1.9838   0.0996
 9AW  H5   H  HCR6  0   0.263  -2.7809  -1.9890  -0.6260
 9AW  H6   H  HCR6  0   0.264  -0.3637  -2.1449  -0.6293
 9AW  H7   H  HCR6  0   0.262  -2.5263   2.0862   0.6826
 9AW  H8   H  HCR6  0   0.265  -0.0994   1.9365   0.6807
 9AW  H9   H  HCR6  0   0.267   3.6842   2.9744  -0.3043
 9AW  H10  H  HCR6  0   0.270   6.1542   2.9112  -0.3000
 9AW  H11  H  HCR6  0   0.267   7.3492   0.7574  -0.0585
 9AW  H12  H  HCR6  0   0.269   6.0697  -1.3402   0.1822
 9AW  H13  H  HNR6  0   0.432   1.4457  -2.1949   0.3662

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 9AW  CAI  CAH  aromatic  1.378  0.020  1.378
 9AW  CAI  CAJ  aromatic  1.400  0.020  1.400
 9AW  CAH  CAG  aromatic  1.397  0.020  1.397
 9AW  CAJ  CAK  aromatic  1.378  0.020  1.378
 9AW  OAA  CAB  double    1.217  0.020  1.217
 9AW  CAG  CAB  single    1.457  0.020  1.457
 9AW  CAG  CAF  aromatic  1.404  0.020  1.404
 9AW  CAB  NAC  single    1.378  0.020  1.378
 9AW  CAK  CAF  aromatic  1.402  0.020  1.402
 9AW  CAF  NAE  single    1.372  0.020  1.372
 9AW  NAC  CAD  single    1.365  0.020  1.365
 9AW  NAE  CAD  double    1.287  0.020  1.287
 9AW  CAD  CAL  single    1.473  0.020  1.473
 9AW  CAL  CAM  aromatic  1.394  0.020  1.394
 9AW  CAL  CAQ  aromatic  1.394  0.020  1.394
 9AW  CAM  CAN  aromatic  1.382  0.020  1.382
 9AW  CAQ  CAP  aromatic  1.384  0.020  1.384
 9AW  CAN  CAO  aromatic  1.396  0.020  1.396
 9AW  CAP  CAO  aromatic  1.395  0.020  1.395
 9AW  CAO  CAR  single    1.479  0.020  1.479
 9AW  CAR  CAW  aromatic  1.395  0.020  1.395
 9AW  CAR  NAS  aromatic  1.333  0.020  1.333
 9AW  CAW  CAV  aromatic  1.385  0.020  1.385
 9AW  NAS  CAT  aromatic  1.324  0.020  1.324
 9AW  CAV  CAU  aromatic  1.386  0.020  1.386
 9AW  CAT  CAU  aromatic  1.388  0.020  1.388
 9AW  CAW  H1   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAV  H2   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAU  H3   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAT  H4   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAP  H5   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAQ  H6   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAN  H7   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAM  H8   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAK  H9   single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAJ  H10  single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAI  H11  single    0.930  0.020  1.080
 9AW  CAH  H12  single    0.930  0.020  1.080
 9AW  NAC  H13  single    0.860  0.020  1.020

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 9AW  H1   CAW  CAR  121.05  3.000
 9AW  H1   CAW  CAV  119.94  3.000
 9AW  CAR  CAW  CAV  119.00  3.000
 9AW  H2   CAV  CAU  120.75  3.000
 9AW  H2   CAV  CAW  120.22  3.000
 9AW  CAU  CAV  CAW  119.03  3.000
 9AW  H3   CAU  CAT  120.49  3.000
 9AW  H3   CAU  CAV  121.62  3.000
 9AW  CAT  CAU  CAV  117.89  3.000
 9AW  H4   CAT  NAS  116.33  3.000
 9AW  H4   CAT  CAU  120.24  3.000
 9AW  NAS  CAT  CAU  123.42  3.000
 9AW  CAR  NAS  CAT  118.95  3.000
 9AW  CAO  CAR  NAS  116.53  3.000
 9AW  NAS  CAR  CAW  121.70  3.000
 9AW  CAO  CAR  CAW  121.76  3.000
 9AW  CAN  CAO  CAP  118.22  3.000
 9AW  CAP  CAO  CAR  120.14  3.000
 9AW  CAN  CAO  CAR  121.65  3.000
 9AW  H5   CAP  CAQ  119.32  3.000
 9AW  H5   CAP  CAO  119.76  3.000
 9AW  CAQ  CAP  CAO  120.92  3.000
 9AW  H6   CAQ  CAL  121.31  3.000
 9AW  H6   CAQ  CAP  118.05  3.000
 9AW  CAL  CAQ  CAP  120.62  3.000
 9AW  H7   CAN  CAM  118.39  3.000
 9AW  H7   CAN  CAO  120.58  3.000
 9AW  CAM  CAN  CAO  121.01  3.000
 9AW  H8   CAM  CAL  119.77  3.000
 9AW  H8   CAM  CAN  119.67  3.000
 9AW  CAL  CAM  CAN  120.55  3.000
 9AW  CAD  CAL  CAM  119.06  3.000
 9AW  CAM  CAL  CAQ  118.68  3.000
 9AW  CAD  CAL  CAQ  122.26  3.000
 9AW  NAC  CAD  NAE  122.81  3.000
 9AW  NAE  CAD  CAL  119.55  3.000
 9AW  NAC  CAD  CAL  117.63  3.000
 9AW  CAF  NAE  CAD  118.19  3.000
 9AW  CAG  CAF  CAK  118.86  3.000
 9AW  CAK  CAF  NAE  118.65  3.000
 9AW  CAG  CAF  NAE  122.49  3.000
 9AW  H9   CAK  CAJ  121.04  3.000
 9AW  H9   CAK  CAF  118.83  3.000
 9AW  CAJ  CAK  CAF  120.13  3.000
 9AW  H10  CAJ  CAI  119.62  3.000
 9AW  H10  CAJ  CAK  119.64  3.000
 9AW  CAI  CAJ  CAK  120.74  3.000
 9AW  H11  CAI  CAH  120.16  3.000
 9AW  H11  CAI  CAJ  119.98  3.000
 9AW  CAH  CAI  CAJ  119.86  3.000
 9AW  H12  CAH  CAG  119.66  3.000
 9AW  H12  CAH  CAI  120.42  3.000
 9AW  CAG  CAH  CAI  119.93  3.000
 9AW  CAB  CAG  CAH  120.77  3.000
 9AW  CAB  CAG  CAF  118.75  3.000
 9AW  CAH  CAG  CAF  120.48  3.000
 9AW  NAC  CAB  OAA  121.15  3.000
 9AW  NAC  CAB  CAG  113.21  3.000
 9AW  OAA  CAB  CAG  125.65  3.000
 9AW  H13  NAC  CAB  116.08  3.000
 9AW  H13  NAC  CAD  119.32  3.000
 9AW  CAB  NAC  CAD  124.55  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 9AW  CONST_03  CAT  NAS  CAR  CAW    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_04  CAT  CAU  CAV  CAW    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_05  CAO  CAR  CAW  CAV  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_06  NAS  CAR  CAW  CAV    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_07  NAS  CAT  CAU  CAV    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_08  CAR  CAW  CAV  CAU    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_09  CAR  NAS  CAT  CAU    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_10  CAO  CAR  NAS  CAT  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_13  CAM  CAN  CAO  CAR  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_14  CAQ  CAP  CAO  CAR  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_15  CAL  CAM  CAN  CAO    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_16  CAL  CAQ  CAP  CAO    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_17  CAM  CAL  CAQ  CAP    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_18  CAM  CAN  CAO  CAP    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_19  CAN  CAM  CAL  CAQ    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_20  CAN  CAO  CAP  CAQ    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_21  CAI  CAH  CAG  CAF    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_22  CAI  CAJ  CAK  CAF    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_23  CAH  CAI  CAJ  CAK    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_24  CAH  CAG  CAF  CAK    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_25  CAG  CAH  CAI  CAJ    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_26  CAG  CAF  CAK  CAJ    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_27  CAD  CAL  CAQ  CAP  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_28  CAD  CAL  CAM  CAN  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_29  CAB  NAC  CAD  CAL  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_30  CAF  NAE  CAD  CAL  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_31  CAG  CAB  NAC  CAD    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_32  CAB  NAC  CAD  NAE    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_33  NAC  CAD  NAE  CAF    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_34  OAA  CAB  NAC  CAD  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_35  H3   CAU  CAV  CAW  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_36  H4   CAT  CAU  CAV  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_37  H1   CAW  CAV  CAU  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_38  H2   CAV  CAU  CAT  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_39  H7   CAN  CAO  CAR    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_40  H5   CAP  CAO  CAR    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_41  H8   CAM  CAN  CAO  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_42  H6   CAQ  CAP  CAO  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_43  H9   CAK  CAF  NAE    0.00   0.0  0
 9AW  CONST_44  H12  CAH  CAG  CAF  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_45  H10  CAJ  CAK  CAF  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_46  H11  CAI  CAJ  CAK  180.00   0.0  0
 9AW  CONST_47  H13  NAC  CAD  CAL    0.00   0.0  0
 9AW  Var_01    NAC  CAD  CAL  CAQ  -24.59  30.0  2

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 9AW  plan-1  CAW  0.020
 9AW  plan-1  CAV  0.020
 9AW  plan-1  CAU  0.020
 9AW  plan-1  CAT  0.020
 9AW  plan-1  NAS  0.020
 9AW  plan-1  CAR  0.020
 9AW  plan-1  CAO  0.020
 9AW  plan-1  H1   0.020
 9AW  plan-1  H2   0.020
 9AW  plan-1  H3   0.020
 9AW  plan-1  H4   0.020
 9AW  plan-2  CAR  0.020
 9AW  plan-2  CAO  0.020
 9AW  plan-2  CAP  0.020
 9AW  plan-2  CAQ  0.020
 9AW  plan-2  CAN  0.020
 9AW  plan-2  CAM  0.020
 9AW  plan-2  CAL  0.020
 9AW  plan-2  CAD  0.020
 9AW  plan-2  H5   0.020
 9AW  plan-2  H6   0.020
 9AW  plan-2  H7   0.020
 9AW  plan-2  H8   0.020
 9AW  plan-3  CAL  0.020
 9AW  plan-3  CAD  0.020
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 9AW  plan-3  H9   0.020
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 9AW  plan-3  H11  0.020
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 9AW  plan-3  H13  0.020

