# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Apr 11 03:21:46 2020
#   Inital geometry file: a 94 line input string
#   Ligand name: 2-(4-ethoxyphenyl)-3~{H}-quinazolin-4-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CCOc1ccc(cc1)C2=Nc3ccccc3C(=O)N2
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 9AQ  9AQ  2-(4-ethoxyphenyl)-3~{H}-quinazolin-4-one  ligand  34  20  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_9AQ
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 9AQ  CAA  C  CH3   0  -0.682   7.2141   0.0360   0.0164
 9AQ  CAB  C  CH2   0  -0.194   5.8117  -0.5045  -0.1223
 9AQ  OAC  O  O2    0  -0.462   4.9012   0.5719   0.0844
 9AQ  CAD  C  CR6   0   0.398   3.5863   0.3305   0.0465
 9AQ  CAI  C  CR16  0  -0.332   2.7454   1.4246   0.2832
 9AQ  CAH  C  CR16  0  -0.254   1.3780   1.2679   0.2705
 9AQ  CAE  C  CR16  0  -0.372   3.0202  -0.9175  -0.2096
 9AQ  CAF  C  CR16  0  -0.280   1.6414  -1.0620  -0.2123
 9AQ  CAG  C  CR6   0  -0.011   0.7971   0.0174   0.0312
 9AQ  CAJ  C  CR6   0   0.497  -0.6671  -0.1050   0.0384
 9AQ  NAK  N  N     0  -0.478  -1.3982   0.9430  -0.1274
 9AQ  CAL  C  CR66  0   0.266  -2.7613   0.7959  -0.1014
 9AQ  CAQ  C  CR16  0  -0.324  -3.5650   1.9339  -0.2668
 9AQ  CAP  C  CR16  0  -0.237  -4.9376   1.8212  -0.2488
 9AQ  CAO  C  CR16  0  -0.262  -5.5521   0.5765  -0.0667
 9AQ  CAN  C  CR16  0  -0.276  -4.7782  -0.5515   0.0954
 9AQ  CAM  C  CR66  0  -0.108  -3.3846  -0.4499   0.0780
 9AQ  CAR  C  CR6   0   0.536  -2.5487  -1.6280   0.2613
 9AQ  OAS  O  O     0  -0.452  -2.9515  -2.7639   0.4367
 9AQ  NAT  N  NR16  0  -0.731  -1.2004  -1.3478   0.2348
 9AQ  H1   H  HCH3  0   0.237   7.4171   0.8150  -0.7184
 9AQ  H2   H  HCH3  0   0.237   7.3889   0.4411   1.0130
 9AQ  H3   H  HCH3  0   0.240   7.9268  -0.7715  -0.1472
 9AQ  H4   H  HCH2  0   0.230   5.6635  -0.9354  -1.1176
 9AQ  H5   H  HCH2  0   0.231   5.6305  -1.2942   0.6137
 9AQ  H6   H  HCR6  0   0.270   3.1797   2.3956   0.4844
 9AQ  H7   H  HCR6  0   0.264   0.7433   2.1227   0.4599
 9AQ  H8   H  HCR6  0   0.289   3.6306  -1.7861  -0.4116
 9AQ  H9   H  HCR6  0   0.263   1.2485  -2.0453  -0.4389
 9AQ  H10  H  HCR6  0   0.265  -3.0868   2.8944  -0.4091
 9AQ  H11  H  HCR6  0   0.269  -5.5487   2.7049  -0.3782
 9AQ  H12  H  HCR6  0   0.266  -6.6310   0.5027  -0.0541
 9AQ  H13  H  HCR6  0   0.268  -5.2417  -1.5185   0.2399
 9AQ  H14  H  HNR6  0   0.430  -0.5838  -2.1300   0.4111

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 9AQ  CAO  CAN  aromatic  1.378  0.020  1.378
 9AQ  CAO  CAP  aromatic  1.400  0.020  1.400
 9AQ  CAN  CAM  aromatic  1.397  0.020  1.397
 9AQ  CAP  CAQ  aromatic  1.377  0.020  1.377
 9AQ  OAS  CAR  double    1.218  0.020  1.218
 9AQ  CAM  CAR  single    1.456  0.020  1.456
 9AQ  CAM  CAL  aromatic  1.404  0.020  1.404
 9AQ  CAR  NAT  single    1.377  0.020  1.377
 9AQ  CAQ  CAL  aromatic  1.403  0.020  1.403
 9AQ  CAL  NAK  single    1.371  0.020  1.371
 9AQ  NAT  CAJ  single    1.367  0.020  1.367
 9AQ  NAK  CAJ  double    1.288  0.020  1.288
 9AQ  CAJ  CAG  single    1.469  0.020  1.469
 9AQ  CAG  CAH  aromatic  1.399  0.020  1.399
 9AQ  CAG  CAF  aromatic  1.392  0.020  1.392
 9AQ  CAH  CAI  aromatic  1.376  0.020  1.376
 9AQ  CAF  CAE  aromatic  1.386  0.020  1.386
 9AQ  CAI  CAD  aromatic  1.400  0.020  1.400
 9AQ  CAE  CAD  aromatic  1.394  0.020  1.394
 9AQ  CAD  OAC  single    1.337  0.020  1.337
 9AQ  OAC  CAB  single    1.425  0.020  1.425
 9AQ  CAB  CAA  single    1.509  0.020  1.509
 9AQ  CAA  H1   single    0.970  0.020  1.090
 9AQ  CAA  H2   single    0.970  0.020  1.090
 9AQ  CAA  H3   single    0.970  0.020  1.090
 9AQ  CAB  H4   single    0.970  0.020  1.090
 9AQ  CAB  H5   single    0.970  0.020  1.090
 9AQ  CAI  H6   single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAH  H7   single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAE  H8   single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAF  H9   single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAQ  H10  single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAP  H11  single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAO  H12  single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  CAN  H13  single    0.930  0.020  1.080
 9AQ  NAT  H14  single    0.860  0.020  1.020

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 9AQ  H3   CAA  H2   107.93  3.000
 9AQ  H3   CAA  H1   107.86  3.000
 9AQ  H2   CAA  H1   108.72  3.000
 9AQ  H3   CAA  CAB  109.18  3.000
 9AQ  H2   CAA  CAB  111.48  3.000
 9AQ  H1   CAA  CAB  111.53  3.000
 9AQ  H5   CAB  H4   107.76  3.000
 9AQ  H5   CAB  OAC  109.98  3.000
 9AQ  H4   CAB  OAC  110.04  3.000
 9AQ  H5   CAB  CAA  110.51  3.000
 9AQ  H4   CAB  CAA  110.51  3.000
 9AQ  OAC  CAB  CAA  108.05  3.000
 9AQ  CAD  OAC  CAB  119.19  3.000
 9AQ  CAE  CAD  CAI  119.12  3.000
 9AQ  CAE  CAD  OAC  124.47  3.000
 9AQ  CAI  CAD  OAC  116.40  3.000
 9AQ  H6   CAI  CAH  120.16  3.000
 9AQ  H6   CAI  CAD  119.43  3.000
 9AQ  CAH  CAI  CAD  120.41  3.000
 9AQ  H7   CAH  CAG  119.52  3.000
 9AQ  H7   CAH  CAI  119.44  3.000
 9AQ  CAG  CAH  CAI  121.04  3.000
 9AQ  H8   CAE  CAF  118.53  3.000
 9AQ  H8   CAE  CAD  121.63  3.000
 9AQ  CAF  CAE  CAD  119.84  3.000
 9AQ  H9   CAF  CAG  121.38  3.000
 9AQ  H9   CAF  CAE  117.13  3.000
 9AQ  CAG  CAF  CAE  121.47  3.000
 9AQ  CAJ  CAG  CAF  122.73  3.000
 9AQ  CAF  CAG  CAH  118.11  3.000
 9AQ  CAJ  CAG  CAH  119.16  3.000
 9AQ  NAT  CAJ  NAK  122.46  3.000
 9AQ  NAK  CAJ  CAG  119.81  3.000
 9AQ  NAT  CAJ  CAG  117.73  3.000
 9AQ  CAL  NAK  CAJ  118.32  3.000
 9AQ  CAM  CAL  CAQ  118.71  3.000
 9AQ  CAQ  CAL  NAK  118.70  3.000
 9AQ  CAM  CAL  NAK  122.60  3.000
 9AQ  H10  CAQ  CAP  120.97  3.000
 9AQ  H10  CAQ  CAL  118.83  3.000
 9AQ  CAP  CAQ  CAL  120.20  3.000
 9AQ  H11  CAP  CAO  119.58  3.000
 9AQ  H11  CAP  CAQ  119.63  3.000
 9AQ  CAO  CAP  CAQ  120.79  3.000
 9AQ  H12  CAO  CAN  120.21  3.000
 9AQ  H12  CAO  CAP  120.01  3.000
 9AQ  CAN  CAO  CAP  119.78  3.000
 9AQ  H13  CAN  CAM  119.59  3.000
 9AQ  H13  CAN  CAO  120.46  3.000
 9AQ  CAM  CAN  CAO  119.95  3.000
 9AQ  CAR  CAM  CAN  120.80  3.000
 9AQ  CAR  CAM  CAL  118.62  3.000
 9AQ  CAN  CAM  CAL  120.58  3.000
 9AQ  NAT  CAR  OAS  121.09  3.000
 9AQ  NAT  CAR  CAM  113.26  3.000
 9AQ  OAS  CAR  CAM  125.65  3.000
 9AQ  H14  NAT  CAR  115.85  3.000
 9AQ  H14  NAT  CAJ  119.36  3.000
 9AQ  CAR  NAT  CAJ  124.74  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 9AQ  CONST_01  CAG  CAH  CAI  CAD     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_02  CAG  CAF  CAE  CAD     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_03  CAF  CAG  CAH  CAI     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_04  CAF  CAE  CAD  CAI     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_05  CAE  CAF  CAG  CAH     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_06  CAE  CAD  CAI  CAH     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_07  CAO  CAN  CAM  CAL     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_08  CAO  CAP  CAQ  CAL     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_09  CAN  CAO  CAP  CAQ     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_10  CAN  CAM  CAL  CAQ     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_11  CAM  CAN  CAO  CAP     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_12  CAM  CAL  CAQ  CAP     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_13  CAJ  CAG  CAH  CAI   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_14  CAJ  CAG  CAF  CAE   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_15  CAR  NAT  CAJ  CAG   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_16  CAL  NAK  CAJ  CAG   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_17  CAM  CAR  NAT  CAJ     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_18  CAR  NAT  CAJ  NAK     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_19  NAT  CAJ  NAK  CAL     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_20  CAH  CAI  CAD  OAC   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_21  CAF  CAE  CAD  OAC   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_22  OAS  CAR  NAT  CAJ   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_23  H7   CAH  CAI  CAD   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_24  H9   CAF  CAE  CAD   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_25  H8   CAE  CAD  CAI   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_26  H6   CAI  CAD  CAE   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_27  H10  CAQ  CAL  NAK     0.00   0.0  0
 9AQ  CONST_28  H13  CAN  CAM  CAL   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_29  H11  CAP  CAQ  CAL   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_30  H12  CAO  CAP  CAQ   180.00   0.0  0
 9AQ  CONST_31  H14  NAT  CAJ  CAG     0.00   0.0  0
 9AQ  Var_01    NAT  CAJ  CAG  CAH  -159.35  30.0  2
 9AQ  Var_02    CAI  CAD  OAC  CAB   178.78  30.0  2
 9AQ  Var_03    H4   CAB  OAC  CAD    61.04  30.0  3
 9AQ  Var_04    H1   CAA  CAB  OAC   -60.40  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 9AQ  plan-1  OAC  0.020
 9AQ  plan-1  CAD  0.020
 9AQ  plan-1  CAI  0.020
 9AQ  plan-1  CAH  0.020
 9AQ  plan-1  CAE  0.020
 9AQ  plan-1  CAF  0.020
 9AQ  plan-1  CAG  0.020
 9AQ  plan-1  CAJ  0.020
 9AQ  plan-1  H6   0.020
 9AQ  plan-1  H7   0.020
 9AQ  plan-1  H8   0.020
 9AQ  plan-1  H9   0.020
 9AQ  plan-2  CAG  0.020
 9AQ  plan-2  CAJ  0.020
 9AQ  plan-2  NAK  0.020
 9AQ  plan-2  CAL  0.020
 9AQ  plan-2  CAQ  0.020
 9AQ  plan-2  CAP  0.020
 9AQ  plan-2  CAO  0.020
 9AQ  plan-2  CAN  0.020
 9AQ  plan-2  CAM  0.020
 9AQ  plan-2  CAR  0.020
 9AQ  plan-2  OAS  0.020
 9AQ  plan-2  NAT  0.020
 9AQ  plan-2  H10  0.020
 9AQ  plan-2  H11  0.020
 9AQ  plan-2  H12  0.020
 9AQ  plan-2  H13  0.020
 9AQ  plan-2  H14  0.020

