# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Apr 11 07:30:51 2020
#   Inital geometry file: a 82 line input string
#   Ligand name: 2-(3-hydroxyphenyl)-3~{H}-quinazolin-4-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Oc1cccc(c1)C2=Nc3ccccc3C(=O)N2
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 9AN  9AN  2-(3-hydroxyphenyl)-3~{H}-quinazolin-4-one  ligand  28  18  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as GRAND
;

data_comp_9AN
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 9AN  CAG  C  CR16  0  -0.367  -2.3827   0.8925  -0.3669
 9AN  CAB  C  CR6   0   0.382  -3.7726   0.9158  -0.3566
 9AN  OAA  O  OH1   0  -0.629  -4.3786   2.0669  -0.6993
 9AN  CAC  C  CR16  0  -0.375  -4.4818  -0.2300  -0.0000
 9AN  CAD  C  CR16  0  -0.228  -3.7957  -1.3830   0.3451
 9AN  CAE  C  CR16  0  -0.326  -2.4100  -1.4184   0.3321
 9AN  CAF  C  CR6   0   0.035  -1.7018  -0.2726  -0.0291
 9AN  CAH  C  CR6   0   0.482  -0.2259  -0.2519  -0.0446
 9AN  NAI  N  N     0  -0.469   0.4010   0.8530   0.1547
 9AN  CAJ  C  CR66  0   0.263   1.7738   0.8295   0.1411
 9AN  CAO  C  CR16  0  -0.322   2.4684   2.0293   0.3513
 9AN  CAN  C  CR16  0  -0.237   3.8458   2.0397   0.3545
 9AN  CAM  C  CR16  0  -0.260   4.5706   0.8600   0.1493
 9AN  CAL  C  CR16  0  -0.276   3.9036  -0.3273  -0.0590
 9AN  CAK  C  CR66  0  -0.106   2.5064  -0.3506  -0.0636
 9AN  CAP  C  CR6   0   0.539   1.7824  -1.5937  -0.2941
 9AN  OAQ  O  O     0  -0.450   2.2879  -2.6819  -0.4994
 9AN  NAR  N  NR16  0  -0.723   0.4137  -1.4357  -0.2743
 9AN  H1   H  HCR6  0   0.269  -1.8316   1.7811  -0.6461
 9AN  H2   H  HOH1  0   0.477  -5.3367   1.9720  -0.6527
 9AN  H3   H  HCR6  0   0.281  -5.5657  -0.2211   0.0118
 9AN  H4   H  HCR6  0   0.271  -4.3508  -2.2649   0.6354
 9AN  H5   H  HCR6  0   0.262  -1.9039  -2.3248   0.6377
 9AN  H6   H  HCR6  0   0.267   1.9033   2.9380   0.5132
 9AN  H7   H  HCR6  0   0.270   4.3733   2.9701   0.5202
 9AN  H8   H  HCR6  0   0.267   5.6518   0.8822   0.1546
 9AN  H9   H  HCR6  0   0.269   4.4551  -1.2438  -0.2215
 9AN  H10  H  HNR6  0   0.431  -0.1349  -2.2596  -0.4850

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 9AN  OAA  CAB  single    1.345  0.020  1.345
 9AN  CAC  CAB  aromatic  1.394  0.020  1.394
 9AN  CAC  CAD  aromatic  1.385  0.020  1.385
 9AN  CAB  CAG  aromatic  1.390  0.020  1.390
 9AN  CAD  CAE  aromatic  1.386  0.020  1.386
 9AN  CAG  CAF  aromatic  1.391  0.020  1.391
 9AN  CAE  CAF  aromatic  1.395  0.020  1.395
 9AN  CAF  CAH  single    1.476  0.020  1.476
 9AN  CAH  NAI  double    1.286  0.020  1.286
 9AN  CAH  NAR  single    1.365  0.020  1.365
 9AN  NAI  CAJ  single    1.373  0.020  1.373
 9AN  NAR  CAP  single    1.378  0.020  1.378
 9AN  CAJ  CAO  aromatic  1.402  0.020  1.402
 9AN  CAJ  CAK  aromatic  1.404  0.020  1.404
 9AN  CAO  CAN  aromatic  1.378  0.020  1.378
 9AN  CAP  CAK  single    1.457  0.020  1.457
 9AN  CAP  OAQ  double    1.217  0.020  1.217
 9AN  CAK  CAL  aromatic  1.397  0.020  1.397
 9AN  CAN  CAM  aromatic  1.400  0.020  1.400
 9AN  CAL  CAM  aromatic  1.378  0.020  1.378
 9AN  CAG  H1   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  OAA  H2   single    0.850  0.020  0.980
 9AN  CAC  H3   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  CAD  H4   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  CAE  H5   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  CAO  H6   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  CAN  H7   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  CAM  H8   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  CAL  H9   single    0.930  0.020  1.080
 9AN  NAR  H10  single    0.860  0.020  1.020

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 9AN  H1   CAG  CAF  120.07  3.000
 9AN  H1   CAG  CAB  119.82  3.000
 9AN  CAF  CAG  CAB  120.11  3.000
 9AN  CAC  CAB  OAA  122.64  3.000
 9AN  CAC  CAB  CAG  119.79  3.000
 9AN  OAA  CAB  CAG  117.57  3.000
 9AN  H2   OAA  CAB  110.56  3.000
 9AN  H3   CAC  CAD  119.96  3.000
 9AN  H3   CAC  CAB  120.32  3.000
 9AN  CAD  CAC  CAB  119.72  3.000
 9AN  H4   CAD  CAE  119.65  3.000
 9AN  H4   CAD  CAC  119.42  3.000
 9AN  CAE  CAD  CAC  120.93  3.000
 9AN  H5   CAE  CAF  121.59  3.000
 9AN  H5   CAE  CAD  119.09  3.000
 9AN  CAF  CAE  CAD  119.28  3.000
 9AN  CAH  CAF  CAE  121.46  3.000
 9AN  CAH  CAF  CAG  118.37  3.000
 9AN  CAE  CAF  CAG  120.16  3.000
 9AN  NAR  CAH  NAI  122.87  3.000
 9AN  NAR  CAH  CAF  117.26  3.000
 9AN  NAI  CAH  CAF  119.86  3.000
 9AN  CAJ  NAI  CAH  118.11  3.000
 9AN  CAK  CAJ  CAO  118.85  3.000
 9AN  CAK  CAJ  NAI  122.52  3.000
 9AN  CAO  CAJ  NAI  118.63  3.000
 9AN  H6   CAO  CAN  121.03  3.000
 9AN  H6   CAO  CAJ  118.83  3.000
 9AN  CAN  CAO  CAJ  120.14  3.000
 9AN  H7   CAN  CAM  119.65  3.000
 9AN  H7   CAN  CAO  119.62  3.000
 9AN  CAM  CAN  CAO  120.74  3.000
 9AN  H8   CAM  CAL  120.17  3.000
 9AN  H8   CAM  CAN  119.98  3.000
 9AN  CAL  CAM  CAN  119.86  3.000
 9AN  H9   CAL  CAK  119.67  3.000
 9AN  H9   CAL  CAM  120.40  3.000
 9AN  CAK  CAL  CAM  119.93  3.000
 9AN  CAP  CAK  CAL  120.78  3.000
 9AN  CAL  CAK  CAJ  120.48  3.000
 9AN  CAP  CAK  CAJ  118.75  3.000
 9AN  NAR  CAP  OAQ  121.15  3.000
 9AN  OAQ  CAP  CAK  125.67  3.000
 9AN  NAR  CAP  CAK  113.18  3.000
 9AN  H10  NAR  CAP  116.24  3.000
 9AN  H10  NAR  CAH  119.15  3.000
 9AN  CAP  NAR  CAH  124.56  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 9AN  CONST_01  CAD  CAC  CAB  CAG    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_02  CAD  CAE  CAF  CAG    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_03  CAE  CAD  CAC  CAB    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_04  CAE  CAF  CAG  CAB    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_05  CAF  CAG  CAB  CAC    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_06  CAF  CAE  CAD  CAC    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_07  CAM  CAN  CAO  CAJ    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_08  CAM  CAL  CAK  CAJ    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_09  CAL  CAK  CAJ  CAO    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_10  CAL  CAM  CAN  CAO    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_11  CAK  CAJ  CAO  CAN    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_12  CAK  CAL  CAM  CAN    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_13  CAH  CAF  CAG  CAB  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_14  CAH  CAF  CAE  CAD  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_15  CAJ  NAI  CAH  CAF  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_16  CAP  NAR  CAH  CAF  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_17  CAK  CAP  NAR  CAH    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_18  CAP  NAR  CAH  NAI    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_19  NAR  CAH  NAI  CAJ    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_20  CAD  CAC  CAB  OAA  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_21  CAF  CAG  CAB  OAA  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_22  OAQ  CAP  NAR  CAH  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_23  H3   CAC  CAB  CAG  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_24  H5   CAE  CAF  CAG  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_25  H4   CAD  CAC  CAB  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_26  H1   CAG  CAB  CAC  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_27  H6   CAO  CAJ  NAI    0.00   0.0  0
 9AN  CONST_28  H7   CAN  CAO  CAJ  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_29  H9   CAL  CAK  CAJ  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_30  H8   CAM  CAN  CAO  180.00   0.0  0
 9AN  CONST_31  H10  NAR  CAH  CAF    0.00   0.0  0
 9AN  Var_01    NAI  CAH  CAF  CAG   27.00  30.0  2

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 9AN  plan-1  CAG  0.020
 9AN  plan-1  CAB  0.020
 9AN  plan-1  OAA  0.020
 9AN  plan-1  CAC  0.020
 9AN  plan-1  CAD  0.020
 9AN  plan-1  CAE  0.020
 9AN  plan-1  CAF  0.020
 9AN  plan-1  CAH  0.020
 9AN  plan-1  H1   0.020
 9AN  plan-1  H3   0.020
 9AN  plan-1  H4   0.020
 9AN  plan-1  H5   0.020
 9AN  plan-2  CAF  0.020
 9AN  plan-2  CAH  0.020
 9AN  plan-2  NAI  0.020
 9AN  plan-2  CAJ  0.020
 9AN  plan-2  CAO  0.020
 9AN  plan-2  CAN  0.020
 9AN  plan-2  CAM  0.020
 9AN  plan-2  CAL  0.020
 9AN  plan-2  CAK  0.020
 9AN  plan-2  CAP  0.020
 9AN  plan-2  OAQ  0.020
 9AN  plan-2  NAR  0.020
 9AN  plan-2  H6   0.020
 9AN  plan-2  H7   0.020
 9AN  plan-2  H8   0.020
 9AN  plan-2  H9   0.020
 9AN  plan-2  H10  0.020

