# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 17 22:57:00 2020
#   Inital geometry file: a 105 line input string
#   Ligand name: 1,3-bis(chloranyl)-6-[(~{E})-(4-methoxyphenyl)iminomethyl]dibenzofuran-2,7-diol
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(cc1)N=Cc2c(O)ccc3c2oc4cc(Cl)c(O)c(Cl)c34
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 8QK  8QK  1,3-bis(chloranyl)-6-[(~{E})-(4-methoxyphenyl)iminomethyl]dibenzofuran-2,7-diol  ligand  40  27  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_8QK
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 8QK  CAA  C   CH3   0  -0.438  -8.0487   2.8942   0.4599
 8QK  CAF  C   C1    0   0.067  -1.9093  -0.5475  -0.0040
 8QK  CAG  C   CR16  0  -0.363   0.4456  -3.5118   0.0629
 8QK  CAH  C   CR16  0  -0.296  -4.3608   0.8952   0.5898
 8QK  CAI  C   CR16  0  -0.288  -5.3727  -0.9212  -0.6013
 8QK  CAJ  C   CR16  0  -0.376  -5.5652   1.5839   0.5717
 8QK  CAK  C   CR16  0  -0.333  -6.5719  -0.2401  -0.6339
 8QK  CAL  C   CR16  0  -0.363   1.6799  -2.8986   0.0835
 8QK  CAM  C   CR16  0  -0.302   2.7938   1.9295   0.0675
 8QK  CAQ  C   CR6   0   0.367  -0.7431  -2.7632   0.0332
 8QK  CAR  C   CR6   0  -0.208   4.1783   1.8785   0.0991
 8QK  CAS  C   CR6   0   0.272  -4.2409  -0.3571  -0.0078
 8QK  CAT  C   CR6   0   0.496   4.8962   0.6734   0.1272
 8QK  CAU  C   CR6   0   0.379  -6.6807   1.0247  -0.0493
 8QK  CAV  C   CR6   0  -0.355   4.1829  -0.5241   0.1201
 8QK  CAW  C   CR6   0  -0.231  -0.7060  -1.3508   0.0235
 8QK  CAX  C   CR56  0   0.312   2.1415   0.7194   0.0636
 8QK  CAY  C   CR56  0   0.080   1.7506  -1.5037   0.0731
 8QK  CAZ  C   CR56  0   0.352   0.5633  -0.7775   0.0427
 8QK  CBA  C   CR56  0   0.255   2.7969  -0.5126   0.0876
 8QK  OAC  O   OH1   0  -0.596   6.2304   0.6083   0.1603
 8QK  OAO  O   O2    0  -0.468  -7.8874   1.6137  -0.1181
 8QK  OAP  O   O     0  -0.481   0.7902   0.5541   0.0364
 8QK  CL1  CL  CL    0  -0.093   5.0782   3.3566   0.1036
 8QK  CL2  CL  CL    0  -0.093   5.0478  -2.0107   0.1542
 8QK  H1   H   HCH3  0   0.261  -9.0816   3.1838   0.2846
 8QK  H2   H   HCH3  0   0.230  -7.8658   2.8828   1.5375
 8QK  H3   H   HCH3  0   0.230  -7.3917   3.6361  -0.0012
 8QK  H4   H   H     0   0.267  -1.7944   0.5366  -0.0219
 8QK  H5   H   HCR6  0   0.276   0.3764  -4.5916   0.0700
 8QK  H6   H   HCR6  0   0.274  -3.5206   1.3420   1.1067
 8QK  H7   H   HCR6  0   0.265  -5.2994  -1.9025  -1.0532
 8QK  H8   H   HCR6  0   0.284  -5.6158   2.5477   1.0596
 8QK  H9   H   HCR6  0   0.268  -7.4376  -0.6847  -1.1084
 8QK  H10  H   HCR6  0   0.263   2.5745  -3.5044   0.1078
 8QK  H11  H   HCR6  0   0.306   2.2647   2.8721   0.0467
 8QK  H12  H   HOH1  0   0.477  -2.6305  -2.7413  -0.0123
 8QK  H13  H   HOH1  0   0.477   6.6223   1.4911   0.1880
 8QK  NAN  N   N     0  -0.551  -3.0604  -1.1042  -0.0225
 8QK  OAB  O   OH1   0  -0.622  -1.8963  -3.4157   0.0123

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 8QK  CL1  CAR  single    1.731  0.020  1.731
 8QK  CAR  CAM  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8QK  CAR  CAT  aromatic  1.403  0.020  1.403
 8QK  CAM  CAX  aromatic  1.375  0.020  1.375
 8QK  OAC  CAT  single    1.336  0.020  1.336
 8QK  CAT  CAV  aromatic  1.394  0.020  1.394
 8QK  CAK  CAI  aromatic  1.379  0.020  1.379
 8QK  CAK  CAU  aromatic  1.398  0.020  1.398
 8QK  CAX  OAP  aromatic  1.362  0.020  1.362
 8QK  CAX  CBA  aromatic  1.396  0.020  1.396
 8QK  OAO  CAU  single    1.345  0.020  1.345
 8QK  OAO  CAA  single    1.414  0.020  1.414
 8QK  OAP  CAZ  aromatic  1.351  0.020  1.351
 8QK  CAI  CAS  aromatic  1.397  0.020  1.397
 8QK  CAU  CAJ  aromatic  1.394  0.020  1.394
 8QK  CAV  CBA  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8QK  CAV  CL2  single    1.720  0.020  1.720
 8QK  CBA  CAY  aromatic  1.441  0.020  1.441
 8QK  CAZ  CAY  aromatic  1.392  0.020  1.392
 8QK  CAZ  CAW  aromatic  1.393  0.020  1.393
 8QK  CAF  CAW  single    1.447  0.020  1.447
 8QK  CAF  NAN  double    1.279  0.020  1.279
 8QK  CAS  NAN  single    1.397  0.020  1.397
 8QK  CAS  CAH  aromatic  1.393  0.020  1.393
 8QK  CAJ  CAH  aromatic  1.388  0.020  1.388
 8QK  CAY  CAL  aromatic  1.397  0.020  1.397
 8QK  CAW  CAQ  aromatic  1.413  0.020  1.413
 8QK  CAL  CAG  aromatic  1.378  0.020  1.378
 8QK  CAQ  CAG  aromatic  1.405  0.020  1.405
 8QK  CAQ  OAB  single    1.325  0.020  1.325
 8QK  CAA  H1   single    0.970  0.020  1.090
 8QK  CAA  H2   single    0.970  0.020  1.090
 8QK  CAA  H3   single    0.970  0.020  1.090
 8QK  CAF  H4   single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAG  H5   single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAH  H6   single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAI  H7   single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAJ  H8   single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAK  H9   single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAL  H10  single    0.930  0.020  1.080
 8QK  CAM  H11  single    0.930  0.020  1.080
 8QK  OAB  H12  single    0.850  0.020  0.980
 8QK  OAC  H13  single    0.850  0.020  0.980

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 8QK  H3   CAA  H2   108.81  3.000
 8QK  H3   CAA  H1   108.80  3.000
 8QK  H2   CAA  H1   108.71  3.000
 8QK  H3   CAA  OAO  111.94  3.000
 8QK  H2   CAA  OAO  111.99  3.000
 8QK  H1   CAA  OAO  106.49  3.000
 8QK  H4   CAF  NAN  121.84  3.000
 8QK  H4   CAF  CAW  117.69  3.000
 8QK  NAN  CAF  CAW  120.47  3.000
 8QK  H5   CAG  CAQ  118.54  3.000
 8QK  H5   CAG  CAL  120.07  3.000
 8QK  CAQ  CAG  CAL  121.39  3.000
 8QK  H6   CAH  CAS  120.60  3.000
 8QK  H6   CAH  CAJ  118.35  3.000
 8QK  CAS  CAH  CAJ  121.03  3.000
 8QK  H7   CAI  CAS  119.23  3.000
 8QK  H7   CAI  CAK  119.76  3.000
 8QK  CAS  CAI  CAK  121.00  3.000
 8QK  H8   CAJ  CAU  121.41  3.000
 8QK  H8   CAJ  CAH  118.50  3.000
 8QK  CAU  CAJ  CAH  120.09  3.000
 8QK  H9   CAK  CAU  119.52  3.000
 8QK  H9   CAK  CAI  120.18  3.000
 8QK  CAU  CAK  CAI  120.31  3.000
 8QK  H10  CAL  CAY  121.20  3.000
 8QK  H10  CAL  CAG  119.49  3.000
 8QK  CAY  CAL  CAG  119.31  3.000
 8QK  H11  CAM  CAX  122.36  3.000
 8QK  H11  CAM  CAR  121.43  3.000
 8QK  CAX  CAM  CAR  116.21  3.000
 8QK  OAB  CAQ  CAW  121.00  3.000
 8QK  OAB  CAQ  CAG  118.30  3.000
 8QK  CAW  CAQ  CAG  120.70  3.000
 8QK  CL1  CAR  CAT  117.88  3.000
 8QK  CAT  CAR  CAM  122.91  3.000
 8QK  CL1  CAR  CAM  119.22  3.000
 8QK  NAN  CAS  CAI  117.66  3.000
 8QK  NAN  CAS  CAH  123.93  3.000
 8QK  CAI  CAS  CAH  118.40  3.000
 8QK  OAC  CAT  CAV  117.98  3.000
 8QK  CAV  CAT  CAR  118.43  3.000
 8QK  OAC  CAT  CAR  123.59  3.000
 8QK  OAO  CAU  CAK  116.42  3.000
 8QK  OAO  CAU  CAJ  124.42  3.000
 8QK  CAK  CAU  CAJ  119.15  3.000
 8QK  CL2  CAV  CBA  120.68  3.000
 8QK  CL2  CAV  CAT  119.02  3.000
 8QK  CBA  CAV  CAT  120.30  3.000
 8QK  CAZ  CAW  CAQ  115.80  3.000
 8QK  CAQ  CAW  CAF  122.22  3.000
 8QK  CAZ  CAW  CAF  121.97  3.000
 8QK  OAP  CAX  CBA  111.05  3.000
 8QK  CBA  CAX  CAM  123.65  3.000
 8QK  OAP  CAX  CAM  125.29  3.000
 8QK  CBA  CAY  CAZ  105.11  3.000
 8QK  CAZ  CAY  CAL  118.55  3.000
 8QK  CBA  CAY  CAL  136.34  3.000
 8QK  OAP  CAZ  CAY  111.78  3.000
 8QK  CAY  CAZ  CAW  124.25  3.000
 8QK  OAP  CAZ  CAW  123.97  3.000
 8QK  CAY  CBA  CAX  105.42  3.000
 8QK  CAY  CBA  CAV  136.08  3.000
 8QK  CAX  CBA  CAV  118.50  3.000
 8QK  H13  OAC  CAT  111.18  3.000
 8QK  CAU  OAO  CAA  118.56  3.000
 8QK  CAZ  OAP  CAX  106.63  3.000
 8QK  CAS  NAN  CAF  121.84  3.000
 8QK  H12  OAB  CAQ  107.94  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 8QK  CONST_01  CBA  CAY  CAL  CAG  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_02  CAZ  CAY  CAL  CAG    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_03  CAZ  CAW  CAQ  CAG    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_04  CAK  CAI  CAS  CAH    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_05  CAK  CAU  CAJ  CAH    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_06  CAJ  CAU  CAK  CAI    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_07  CAJ  CAH  CAS  CAI    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_08  CAX  CBA  CAY  CAL  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_09  CAV  CBA  CAY  CAL    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_10  OAP  CAZ  CAY  CAL  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_11  CAW  CAZ  CAY  CAL    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_12  CAW  CAQ  CAG  CAL    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_13  CAV  CAT  CAR  CAM    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_14  CAZ  OAP  CAX  CAM  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_15  CAV  CBA  CAX  CAM    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_16  CAY  CBA  CAX  CAM  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_17  OAP  CAZ  CAW  CAQ  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_18  CAY  CAZ  CAW  CAQ    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_19  CAY  CAL  CAG  CAQ    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_20  OAP  CAX  CAM  CAR  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_21  CBA  CAX  CAM  CAR    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_22  CBA  CAV  CAT  CAR    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_23  CAU  CAK  CAI  CAS    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_24  CAU  CAJ  CAH  CAS    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_25  CAX  CAM  CAR  CAT    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_26  CAX  CBA  CAV  CAT    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_27  CAY  CBA  CAV  CAT  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_28  OAP  CAX  CBA  CAV  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_29  CAZ  CAY  CBA  CAV  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_30  CAX  OAP  CAZ  CAW  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_31  CBA  CAY  CAZ  CAW  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_32  CAY  CAZ  OAP  CAX    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_33  CAZ  CAY  CBA  CAX    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_34  OAP  CAX  CBA  CAY    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_35  CBA  CAX  OAP  CAZ    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_36  OAP  CAZ  CAY  CBA    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_37  OAP  CAZ  CAW  CAF    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_38  CAY  CAZ  CAW  CAF  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_39  CAG  CAQ  CAW  CAF  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_40  OAO  CAU  CAJ  CAH  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_41  OAO  CAU  CAK  CAI  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_42  NAN  CAS  CAH  CAJ  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_43  NAN  CAS  CAI  CAK  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_44  OAB  CAQ  CAG  CAL  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_45  OAC  CAT  CAR  CAM  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_46  CL2  CAV  CAT  CAR  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_47  CL1  CAR  CAT  CAV  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_48  CL1  CAR  CAM  CAX  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_49  CL2  CAV  CBA  CAX  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_50  CL2  CAV  CBA  CAY    0.00   0.0  0
 8QK  CONST_51  OAB  CAQ  CAW  CAZ  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_52  OAC  CAT  CAV  CBA  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_53  H7   CAI  CAS  CAH  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_54  H6   CAH  CAS  CAI  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_55  H9   CAK  CAU  CAJ  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_56  H8   CAJ  CAU  CAK  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_57  H10  CAL  CAG  CAQ  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_58  H11  CAM  CAR  CAT  180.00   0.0  0
 8QK  CONST_59  H5   CAG  CAQ  CAW  180.00   0.0  0
 8QK  Var_01    CAW  CAF  NAN  CAS  178.00   0.0  2
 8QK  Var_02    CAK  CAU  OAO  CAA  179.95  30.0  2
 8QK  Var_03    CAI  CAS  NAN  CAF  152.33  30.0  2
 8QK  Var_04    NAN  CAF  CAW  CAQ   -0.10  30.0  2
 8QK  Var_05    H1   CAA  OAO  CAU  179.44  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 8QK  plan-1  CAH  0.020
 8QK  plan-1  CAI  0.020
 8QK  plan-1  CAJ  0.020
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 8QK  plan-3  NAN  0.020

