# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 17 21:50:53 2020
#   Inital geometry file: a 104 line input string
#   Ligand name: 5-bromanyl-2-methoxy-~{N}-[3-methyl-6-(methylamino)-1,2-benzoxazol-5-yl]benzenesulfonamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CNc1cc2onc(C)c2cc1N[S](=O)(=O)c3cc(Br)ccc3OC
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 8QC  8QC  5-bromanyl-2-methoxy-~{N}-[3-methyl-6-(methylamino)-1,2-benzoxazol-5-yl]benzenesulfonamide  ligand  41  25  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_8QC
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 8QC  CAW   C   CH3   0  -0.444   1.1852  -2.8176  -3.1488
 8QC  OAU   O   O2    0  -0.465   0.5465  -2.6707  -1.8875
 8QC  CAP   C   CR6   0   0.454   1.1917  -2.0479  -0.9017
 8QC  CAQ   C   CR16  0  -0.374   2.4673  -1.5014  -1.0114
 8QC  CAR   C   CR16  0  -0.194   3.0378  -0.8325   0.0601
 8QC  CAS   C   CR6   0  -0.131   2.3418  -0.6973   1.2510
 8QC  BRAV  BR  BR    0  -0.028   3.1230   0.2229   2.6976
 8QC  CAT   C   CR16  0  -0.192   1.0717  -1.2319   1.3850
 8QC  CAO   C   CR6   0  -0.311   0.5078  -1.9069   0.3139
 8QC  SAL   S   S     0   1.377  -1.1171  -2.5940   0.5025
 8QC  OAM   O   OS    0  -0.644  -1.1018  -3.9896   0.1124
 8QC  OAN   O   OS    0  -0.638  -1.5788  -2.2150   1.8256
 8QC  NAK   N   NC1   0  -0.809  -2.0992  -1.8140  -0.5850
 8QC  CAB   C   CR6   0   0.180  -2.2837  -0.4106  -0.4419
 8QC  CAC   C   CR16  0  -0.321  -1.4021   0.4763  -1.0133
 8QC  CAD   C   CR56  0  -0.142  -1.6340   1.8410  -0.8611
 8QC  CAG   C   CR5   0   0.238  -1.0036   3.0568  -1.2615
 8QC  CAX   C   CH3   0  -0.742   0.2301   3.2148  -2.0719
 8QC  NAH   N   N     0  -0.172  -1.6632   4.0791  -0.8160
 8QC  OAI   O   O     0  -0.382  -2.7563   3.6018  -0.1077
 8QC  CAE   C   CR56  0   0.470  -2.7373   2.2630  -0.1348
 8QC  CAF   C   CR16  0  -0.493  -3.6573   1.4106   0.4471
 8QC  CAA   C   CR6   0   0.398  -3.4385   0.0354   0.2851
 8QC  NAJ   N   NH1   0  -0.664  -4.2997  -0.8744   0.7742
 8QC  CAY   C   CH3   0  -0.531  -5.4634  -0.5410   1.5485
 8QC  H1    H   HCH3  0   0.273   0.4737  -3.3315  -3.7880
 8QC  H2    H   HCH3  0   0.242   1.4272  -1.8490  -3.5901
 8QC  H3    H   HCH3  0   0.246   2.0930  -3.4178  -3.0681
 8QC  H4    H   HCR6  0   0.309   3.0346  -1.5818  -1.9281
 8QC  H5    H   HCR6  0   0.298   4.0299  -0.4177  -0.0553
 8QC  H6    H   HCR6  0   0.305   0.5189  -1.1282   2.3083
 8QC  H7    H   HNC1  0   0.424  -1.9871  -2.1585  -1.5331
 8QC  H8    H   HCR6  0   0.261  -0.5554   0.1126  -1.5811
 8QC  H9    H   HCH3  0   0.264   0.0841   2.8012  -3.0701
 8QC  H10   H   HCH3  0   0.265   0.5085   4.2618  -2.1695
 8QC  H11   H   HCH3  0   0.256   1.0607   2.6775  -1.6135
 8QC  H12   H   HCR6  0   0.288  -4.5135   1.7920   0.9849
 8QC  H13   H   HNH1  0   0.394  -4.0730  -1.8449   0.6476
 8QC  H14   H   HCH3  0   0.234  -5.2073  -0.0265   2.4788
 8QC  H15   H   HCH3  0   0.235  -6.1567   0.0946   0.9920
 8QC  H16   H   HCH3  0   0.266  -5.9817  -1.4609   1.8038

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 8QC  CAR   CAQ  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8QC  CAR   CAS  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8QC  CAQ   CAP  aromatic  1.392  0.020  1.392
 8QC  CAW   OAU  single    1.421  0.020  1.421
 8QC  BRAV  CAS  single    1.884  0.020  1.884
 8QC  CAY   NAJ  single    1.437  0.020  1.437
 8QC  CAS   CAT  aromatic  1.385  0.020  1.385
 8QC  CAP   OAU  single    1.333  0.020  1.333
 8QC  CAP   CAO  aromatic  1.402  0.020  1.402
 8QC  CAT   CAO  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8QC  NAJ   CAA  single    1.345  0.020  1.345
 8QC  CAO   SAL  single    1.774  0.020  1.774
 8QC  CAF   CAA  aromatic  1.402  0.020  1.402
 8QC  CAF   CAE  aromatic  1.383  0.020  1.383
 8QC  CAA   CAB  aromatic  1.436  0.020  1.436
 8QC  CAE   OAI  aromatic  1.339  0.020  1.339
 8QC  CAE   CAD  aromatic  1.387  0.020  1.387
 8QC  SAL   OAN  double    1.452  0.020  1.452
 8QC  SAL   NAK  single    1.660  0.020  1.660
 8QC  SAL   OAM  double    1.449  0.020  1.449
 8QC  OAI   NAH  aromatic  1.387  0.020  1.387
 8QC  CAB   NAK  single    1.423  0.020  1.423
 8QC  CAB   CAC  aromatic  1.375  0.020  1.375
 8QC  CAD   CAC  aromatic  1.393  0.020  1.393
 8QC  CAD   CAG  aromatic  1.427  0.020  1.427
 8QC  NAH   CAG  aromatic  1.296  0.020  1.296
 8QC  CAG   CAX  single    1.485  0.020  1.485
 8QC  CAW   H1   single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAW   H2   single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAW   H3   single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAQ   H4   single    0.930  0.020  1.080
 8QC  CAR   H5   single    0.930  0.020  1.080
 8QC  CAT   H6   single    0.930  0.020  1.080
 8QC  NAK   H7   single    0.890  0.020  1.040
 8QC  CAC   H8   single    0.930  0.020  1.080
 8QC  CAX   H9   single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAX   H10  single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAX   H11  single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAF   H12  single    0.930  0.020  1.080
 8QC  NAJ   H13  single    0.860  0.020  1.020
 8QC  CAY   H14  single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAY   H15  single    0.970  0.020  1.090
 8QC  CAY   H16  single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 8QC  H3    CAW  H2    109.48  3.000
 8QC  H3    CAW  H1    109.16  3.000
 8QC  H2    CAW  H1    109.11  3.000
 8QC  H3    CAW  OAU   111.40  3.000
 8QC  H2    CAW  OAU   111.51  3.000
 8QC  H1    CAW  OAU   106.08  3.000
 8QC  CAP   OAU  CAW   119.15  3.000
 8QC  CAO   CAP  CAQ   118.41  3.000
 8QC  CAO   CAP  OAU   116.89  3.000
 8QC  CAQ   CAP  OAU   124.67  3.000
 8QC  H4    CAQ  CAR   118.39  3.000
 8QC  H4    CAQ  CAP   121.23  3.000
 8QC  CAR   CAQ  CAP   120.38  3.000
 8QC  H5    CAR  CAS   120.99  3.000
 8QC  H5    CAR  CAQ   118.69  3.000
 8QC  CAS   CAR  CAQ   120.31  3.000
 8QC  CAT   CAS  BRAV  119.65  3.000
 8QC  CAT   CAS  CAR   120.40  3.000
 8QC  BRAV  CAS  CAR   119.95  3.000
 8QC  H6    CAT  CAO   119.91  3.000
 8QC  H6    CAT  CAS   120.97  3.000
 8QC  CAO   CAT  CAS   119.11  3.000
 8QC  SAL   CAO  CAT   118.62  3.000
 8QC  SAL   CAO  CAP   120.00  3.000
 8QC  CAT   CAO  CAP   121.38  3.000
 8QC  NAK   SAL  OAN   106.63  3.000
 8QC  NAK   SAL  OAM   106.40  3.000
 8QC  OAN   SAL  OAM   120.01  3.000
 8QC  OAM   SAL  CAO   109.55  3.000
 8QC  NAK   SAL  CAO   106.87  3.000
 8QC  OAN   SAL  CAO   106.68  3.000
 8QC  H7    NAK  CAB   116.30  3.000
 8QC  H7    NAK  SAL   112.78  3.000
 8QC  CAB   NAK  SAL   118.31  3.000
 8QC  CAA   CAB  CAC   121.72  3.000
 8QC  CAC   CAB  NAK   120.76  3.000
 8QC  CAA   CAB  NAK   117.50  3.000
 8QC  H8    CAC  CAD   121.13  3.000
 8QC  H8    CAC  CAB   120.19  3.000
 8QC  CAD   CAC  CAB   118.68  3.000
 8QC  CAE   CAD  CAG   103.84  3.000
 8QC  CAG   CAD  CAC   136.95  3.000
 8QC  CAE   CAD  CAC   119.21  3.000
 8QC  NAH   CAG  CAX   121.79  3.000
 8QC  CAX   CAG  CAD   127.67  3.000
 8QC  NAH   CAG  CAD   110.55  3.000
 8QC  H11   CAX  H10   108.49  3.000
 8QC  H11   CAX  H9    107.45  3.000
 8QC  H10   CAX  H9    108.50  3.000
 8QC  H11   CAX  CAG   110.56  3.000
 8QC  H10   CAX  CAG   111.36  3.000
 8QC  H9    CAX  CAG   110.37  3.000
 8QC  OAI   NAH  CAG   107.77  3.000
 8QC  CAE   OAI  NAH   108.81  3.000
 8QC  CAF   CAE  OAI   126.75  3.000
 8QC  OAI   CAE  CAD   109.04  3.000
 8QC  CAF   CAE  CAD   124.21  3.000
 8QC  H12   CAF  CAA   121.83  3.000
 8QC  H12   CAF  CAE   121.26  3.000
 8QC  CAA   CAF  CAE   116.89  3.000
 8QC  NAJ   CAA  CAF   121.44  3.000
 8QC  CAF   CAA  CAB   119.27  3.000
 8QC  NAJ   CAA  CAB   119.28  3.000
 8QC  H13   NAJ  CAY   118.34  3.000
 8QC  H13   NAJ  CAA   117.60  3.000
 8QC  CAY   NAJ  CAA   123.89  3.000
 8QC  H16   CAY  H15   108.03  3.000
 8QC  H16   CAY  H14   108.07  3.000
 8QC  H15   CAY  H14   107.94  3.000
 8QC  H16   CAY  NAJ   108.46  3.000
 8QC  H15   CAY  NAJ   111.98  3.000
 8QC  H14   CAY  NAJ   112.21  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 8QC  CONST_01  CAS   CAR  CAQ  CAP      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_02  CAS   CAT  CAO  CAP      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_03  CAT   CAS  CAR  CAQ      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_04  CAT   CAO  CAP  CAQ      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_05  CAO   CAP  CAQ  CAR      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_06  CAO   CAT  CAS  CAR      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_07  CAE   CAF  CAA  CAB      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_08  CAE   CAD  CAC  CAB      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_09  CAG   CAD  CAC  CAB    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_10  CAF   CAA  CAB  CAC      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_11  CAF   CAE  CAD  CAC      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_12  OAI   CAE  CAD  CAC    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_13  NAH   CAG  CAD  CAC    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_14  CAA   CAF  CAE  CAD      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_15  NAH   OAI  CAE  CAD      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_16  CAA   CAB  CAC  CAD      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_17  OAI   NAH  CAG  CAD      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_18  CAF   CAE  CAD  CAG    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_19  OAI   CAE  CAD  CAG      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_20  CAE   OAI  NAH  CAG      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_21  CAF   CAE  OAI  NAH    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_22  CAE   CAD  CAG  NAH      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_23  CAA   CAF  CAE  OAI    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_24  CAR   CAQ  CAP  OAU    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_25  CAT   CAO  CAP  OAU    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_26  BRAV  CAS  CAR  CAQ    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_27  SAL   CAO  CAP  CAQ    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_28  SAL   CAO  CAT  CAS    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_29  CAO   CAT  CAS  BRAV   180.00   0.0  0
 8QC  CONST_30  CAF   CAA  CAB  NAK    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_31  CAD   CAC  CAB  NAK    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_32  NAJ   CAA  CAB  CAC    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_33  CAX   CAG  CAD  CAC      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_34  CAE   CAD  CAG  CAX    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_35  OAI   NAH  CAG  CAX    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_36  NAJ   CAA  CAF  CAE    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_37  H5    CAR  CAQ  CAP    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_38  H6    CAT  CAO  CAP    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_39  H4    CAQ  CAR  CAS    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_40  H12   CAF  CAA  CAB    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_41  H8    CAC  CAD  CAG      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_44  CAY   NAJ  CAA  CAB    180.00   0.0  0
 8QC  CONST_45  CAY   NAJ  CAA  CAF      0.00   0.0  0
 8QC  CONST_46  H13   NAJ  CAA  CAB      0.00   0.0  0
 8QC  Var_01    CAQ   CAP  OAU  CAW      0.77  30.0  2
 8QC  Var_02    OAN   SAL  CAO  CAP   -176.70  30.0  2
 8QC  Var_03    CAB   NAK  SAL  CAO    -62.41  30.0  3
 8QC  Var_04    H9    CAX  CAG  CAD     62.89  30.0  2
 8QC  Var_05    H1    CAW  OAU  CAP   -179.04  30.0  3
 8QC  Var_06    H14   CAY  NAJ  CAA    -61.25  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 8QC  plan-1  OAU   0.020
 8QC  plan-1  CAP   0.020
 8QC  plan-1  CAQ   0.020
 8QC  plan-1  CAR   0.020
 8QC  plan-1  CAS   0.020
 8QC  plan-1  BRAV  0.020
 8QC  plan-1  CAT   0.020
 8QC  plan-1  CAO   0.020
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 8QC  plan-2  NAK   0.020
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 8QC  plan-4  H13   0.020

