# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 17 21:40:27 2020
#   Inital geometry file: a 124 line input string
#   Ligand name: dimethyl 5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)amino]benzene-1,3-dicarboxylate
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CCOc1ccc(cc1Nc2cc(cc(c2)C(=O)OC)C(=O)OC)C(C)=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 8Q6  8Q6  'dimethyl 5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)amino]benzene-1,3-dicarboxylate'  ligand  48  27  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_8Q6
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 8Q6  CAA  C  CH3   0  -0.682   4.1583   4.0546   1.5138
 8Q6  CAB  C  CH3   0  -0.424  -3.9927  -3.5800   1.8352
 8Q6  CAC  C  CH3   0  -0.423  -5.9691   2.9033  -0.6619
 8Q6  CAD  C  CH3   0  -0.801   4.3536  -3.9493  -1.7166
 8Q6  CAH  C  CR16  0  -0.294   4.4205  -1.2417  -0.5660
 8Q6  CAI  C  CR16  0  -0.369   4.4863   0.0366  -0.0308
 8Q6  CAJ  C  CR16  0  -0.342  -0.6590  -0.4467   0.3617
 8Q6  CAK  C  CR16  0  -0.366  -1.3190   1.6956  -0.4866
 8Q6  CAL  C  CR16  0  -0.342  -3.0030   0.1414   0.2698
 8Q6  CAM  C  CR16  0  -0.338   2.0871  -0.9265  -1.0270
 8Q6  CAN  C  CH2   0  -0.192   4.5022   2.6690   1.0247
 8Q6  CAT  C  C     0   0.609  -2.2906  -2.1018   1.1616
 8Q6  CAU  C  C     0   0.610  -3.6699   2.4085  -0.6029
 8Q6  CAV  C  CR6   0   0.435  -0.3014   0.7863  -0.1860
 8Q6  CAW  C  CR6   0  -0.043   3.2242  -1.7386  -1.0690
 8Q6  CAX  C  CR6   0  -0.051  -1.9945  -0.7645   0.5767
 8Q6  CAY  C  CR6   0  -0.050  -2.6501   1.3810  -0.2551
 8Q6  CAZ  C  CR6   0   0.280   2.1204   0.3364  -0.4663
 8Q6  CBA  C  CR6   0   0.345   3.3478   0.8299   0.0323
 8Q6  OAE  O  O     0  -0.404   2.0564  -3.4957  -2.1017
 8Q6  OAF  O  O     0  -0.443  -1.4393  -2.8925   1.4889
 8Q6  OAG  O  O     0  -0.444  -3.3986   3.4939  -1.0560
 8Q6  OAP  O  O2    0  -0.456  -3.5863  -2.3276   1.2822
 8Q6  OAQ  O  O2    0  -0.455  -4.9029   2.0022  -0.3611
 8Q6  OAR  O  O2    0  -0.463   3.3068   2.0689   0.5323
 8Q6  H1   H  HCH3  0   0.237   3.7541   4.6708   0.7106
 8Q6  H2   H  HCH3  0   0.238   3.4359   4.0230   2.3290
 8Q6  H3   H  HCH3  0   0.241   5.0610   4.5388   1.8846
 8Q6  H4   H  HCH3  0   0.243  -3.6352  -3.6961   2.8579
 8Q6  H5   H  HCH3  0   0.256  -5.0782  -3.5672   1.8317
 8Q6  H6   H  HCH3  0   0.242  -3.6380  -4.4146   1.2312
 8Q6  H7   H  HCH3  0   0.242  -5.9800   3.1660  -1.7191
 8Q6  H8   H  HCH3  0   0.256  -6.8835   2.3744  -0.4113
 8Q6  H9   H  HCH3  0   0.243  -5.9002   3.8121  -0.0645
 8Q6  H10  H  HCH3  0   0.267   4.7498  -4.1234  -0.7150
 8Q6  H11  H  HCH3  0   0.269   4.1270  -4.9090  -2.1754
 8Q6  H12  H  HCH3  0   0.267   5.1430  -3.4640  -2.2927
 8Q6  H13  H  HCR6  0   0.266   5.3231  -1.8372  -0.5848
 8Q6  H14  H  HCR6  0   0.290   5.4329   0.3952   0.3479
 8Q6  H15  H  HCR6  0   0.290   0.1007  -1.1651   0.6362
 8Q6  H16  H  HCR6  0   0.278  -1.0599   2.6598  -0.9062
 8Q6  H17  H  HCR6  0   0.267  -4.0387  -0.1101   0.4382
 8Q6  H18  H  HCR6  0   0.285   1.1623  -1.2958  -1.4506
 8Q6  H19  H  HCH2  0   0.233   5.2515   2.7165   0.2284
 8Q6  H20  H  HCH2  0   0.233   4.9149   2.0636   1.8375
 8Q6  H21  H  HNH1  0   0.401   1.1707   2.1522  -0.4933
 8Q6  NAO  N  NH1   0  -0.800   1.0045   1.1626  -0.4046
 8Q6  CAS  C  C     0   0.362   3.1170  -3.0920  -1.6659

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 8Q6  OAE  CAS  double    1.216  0.020  1.216
 8Q6  CAS  CAD  single    1.506  0.020  1.506
 8Q6  CAS  CAW  single    1.483  0.020  1.483
 8Q6  CAH  CAW  aromatic  1.390  0.020  1.390
 8Q6  CAH  CAI  aromatic  1.387  0.020  1.387
 8Q6  CAW  CAM  aromatic  1.398  0.020  1.398
 8Q6  CAI  CBA  aromatic  1.389  0.020  1.389
 8Q6  CAM  CAZ  aromatic  1.382  0.020  1.382
 8Q6  CBA  CAZ  aromatic  1.414  0.020  1.414
 8Q6  CBA  OAR  single    1.337  0.020  1.337
 8Q6  CAZ  NAO  single    1.390  0.020  1.390
 8Q6  CAN  OAR  single    1.425  0.020  1.425
 8Q6  CAN  CAA  single    1.509  0.020  1.509
 8Q6  NAO  CAV  single    1.377  0.020  1.377
 8Q6  OAG  CAU  double    1.207  0.020  1.207
 8Q6  CAK  CAV  aromatic  1.397  0.020  1.397
 8Q6  CAK  CAY  aromatic  1.387  0.020  1.387
 8Q6  CAV  CAJ  aromatic  1.396  0.020  1.396
 8Q6  CAU  CAY  single    1.489  0.020  1.489
 8Q6  CAU  OAQ  single    1.321  0.020  1.321
 8Q6  CAY  CAL  aromatic  1.392  0.020  1.392
 8Q6  CAJ  CAX  aromatic  1.390  0.020  1.390
 8Q6  CAC  OAQ  single    1.428  0.020  1.428
 8Q6  CAL  CAX  aromatic  1.390  0.020  1.390
 8Q6  CAX  CAT  single    1.489  0.020  1.489
 8Q6  CAT  OAF  double    1.207  0.020  1.207
 8Q6  CAT  OAP  single    1.321  0.020  1.321
 8Q6  OAP  CAB  single    1.428  0.020  1.428
 8Q6  CAA  H1   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAA  H2   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAA  H3   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAB  H4   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAB  H5   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAB  H6   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAC  H7   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAC  H8   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAC  H9   single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAD  H10  single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAD  H11  single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAD  H12  single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAH  H13  single    0.930  0.020  1.080
 8Q6  CAI  H14  single    0.930  0.020  1.080
 8Q6  CAJ  H15  single    0.930  0.020  1.080
 8Q6  CAK  H16  single    0.930  0.020  1.080
 8Q6  CAL  H17  single    0.930  0.020  1.080
 8Q6  CAM  H18  single    0.930  0.020  1.080
 8Q6  CAN  H19  single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  CAN  H20  single    0.970  0.020  1.090
 8Q6  NAO  H21  single    0.860  0.020  1.020

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 8Q6  H3   CAA  H2   107.91  3.000
 8Q6  H3   CAA  H1   107.87  3.000
 8Q6  H2   CAA  H1   108.77  3.000
 8Q6  H3   CAA  CAN  109.24  3.000
 8Q6  H2   CAA  CAN  111.52  3.000
 8Q6  H1   CAA  CAN  111.39  3.000
 8Q6  H6   CAB  H5   109.44  3.000
 8Q6  H6   CAB  H4   109.38  3.000
 8Q6  H5   CAB  H4   109.42  3.000
 8Q6  H6   CAB  OAP  111.37  3.000
 8Q6  H5   CAB  OAP  105.84  3.000
 8Q6  H4   CAB  OAP  111.32  3.000
 8Q6  H9   CAC  H8   109.45  3.000
 8Q6  H9   CAC  H7   109.37  3.000
 8Q6  H8   CAC  H7   109.46  3.000
 8Q6  H9   CAC  OAQ  111.32  3.000
 8Q6  H8   CAC  OAQ  105.83  3.000
 8Q6  H7   CAC  OAQ  111.35  3.000
 8Q6  H12  CAD  H11  108.69  3.000
 8Q6  H12  CAD  H10  107.04  3.000
 8Q6  H11  CAD  H10  108.79  3.000
 8Q6  H12  CAD  CAS  111.03  3.000
 8Q6  H11  CAD  CAS  110.21  3.000
 8Q6  H10  CAD  CAS  110.98  3.000
 8Q6  H13  CAH  CAW  121.02  3.000
 8Q6  H13  CAH  CAI  118.32  3.000
 8Q6  CAW  CAH  CAI  120.66  3.000
 8Q6  H14  CAI  CBA  120.83  3.000
 8Q6  H14  CAI  CAH  118.85  3.000
 8Q6  CBA  CAI  CAH  120.32  3.000
 8Q6  H15  CAJ  CAX  118.95  3.000
 8Q6  H15  CAJ  CAV  120.45  3.000
 8Q6  CAX  CAJ  CAV  120.60  3.000
 8Q6  H16  CAK  CAY  119.74  3.000
 8Q6  H16  CAK  CAV  119.25  3.000
 8Q6  CAY  CAK  CAV  121.01  3.000
 8Q6  H17  CAL  CAY  120.66  3.000
 8Q6  H17  CAL  CAX  120.67  3.000
 8Q6  CAY  CAL  CAX  118.67  3.000
 8Q6  H18  CAM  CAZ  119.42  3.000
 8Q6  H18  CAM  CAW  119.03  3.000
 8Q6  CAZ  CAM  CAW  121.55  3.000
 8Q6  H20  CAN  H19  107.83  3.000
 8Q6  H20  CAN  OAR  109.87  3.000
 8Q6  H19  CAN  OAR  109.94  3.000
 8Q6  H20  CAN  CAA  110.68  3.000
 8Q6  H19  CAN  CAA  110.61  3.000
 8Q6  OAR  CAN  CAA  107.90  3.000
 8Q6  OAP  CAT  OAF  123.72  3.000
 8Q6  OAP  CAT  CAX  112.61  3.000
 8Q6  OAF  CAT  CAX  123.67  3.000
 8Q6  OAQ  CAU  OAG  123.73  3.000
 8Q6  OAQ  CAU  CAY  112.61  3.000
 8Q6  OAG  CAU  CAY  123.66  3.000
 8Q6  NAO  CAV  CAK  118.60  3.000
 8Q6  CAK  CAV  CAJ  118.21  3.000
 8Q6  NAO  CAV  CAJ  123.15  3.000
 8Q6  CAS  CAW  CAM  118.90  3.000
 8Q6  CAM  CAW  CAH  118.80  3.000
 8Q6  CAS  CAW  CAH  122.29  3.000
 8Q6  CAT  CAX  CAL  121.85  3.000
 8Q6  CAT  CAX  CAJ  117.21  3.000
 8Q6  CAL  CAX  CAJ  120.94  3.000
 8Q6  CAU  CAY  CAL  121.95  3.000
 8Q6  CAL  CAY  CAK  120.55  3.000
 8Q6  CAU  CAY  CAK  117.50  3.000
 8Q6  NAO  CAZ  CBA  118.29  3.000
 8Q6  NAO  CAZ  CAM  122.80  3.000
 8Q6  CBA  CAZ  CAM  118.88  3.000
 8Q6  OAR  CBA  CAZ  115.39  3.000
 8Q6  OAR  CBA  CAI  124.85  3.000
 8Q6  CAZ  CBA  CAI  119.75  3.000
 8Q6  CAT  OAP  CAB  117.68  3.000
 8Q6  CAU  OAQ  CAC  117.67  3.000
 8Q6  CBA  OAR  CAN  119.59  3.000
 8Q6  H21  NAO  CAZ  116.59  3.000
 8Q6  H21  NAO  CAV  116.05  3.000
 8Q6  CAZ  NAO  CAV  127.32  3.000
 8Q6  OAE  CAS  CAW  120.69  3.000
 8Q6  CAW  CAS  CAD  118.28  3.000
 8Q6  OAE  CAS  CAD  121.03  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 8Q6  CONST_01  CAZ  CAM  CAW  CAH     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_02  CAZ  CBA  CAI  CAH     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_03  CAM  CAW  CAH  CAI     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_04  CAM  CAZ  CBA  CAI     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_05  CAY  CAK  CAV  CAJ     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_06  CAY  CAL  CAX  CAJ     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_07  CAX  CAJ  CAV  CAK     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_08  CAX  CAL  CAY  CAK     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_09  CAV  CAK  CAY  CAL     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_10  CAV  CAJ  CAX  CAL     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_11  CBA  CAI  CAH  CAW     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_12  CBA  CAZ  CAM  CAW     0.00   0.0  0
 8Q6  CONST_13  OAR  CBA  CAI  CAH   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_14  CAS  CAW  CAH  CAI   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_15  NAO  CAZ  CBA  CAI   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_16  OAR  CBA  CAZ  CAM   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_17  CAZ  CAM  CAW  CAS   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_18  CAV  CAJ  CAX  CAT   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_19  CAY  CAL  CAX  CAT   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_20  CAV  CAK  CAY  CAU   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_21  CAX  CAL  CAY  CAU   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_22  NAO  CAZ  CAM  CAW   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_23  NAO  CAV  CAJ  CAX   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_24  NAO  CAV  CAK  CAY   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_25  H18  CAM  CAW  CAH   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_26  H16  CAK  CAV  CAJ   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_27  H17  CAL  CAX  CAJ   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_28  H15  CAJ  CAV  CAK   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_29  H13  CAH  CAW  CAM   180.00   0.0  0
 8Q6  CONST_30  H14  CAI  CAH  CAW   180.00   0.0  0
 8Q6  Var_01    CAZ  NAO  CAV  CAJ    17.90  30.0  2
 8Q6  Var_02    CAV  NAO  CAZ  CAM    36.59  30.0  2
 8Q6  Var_03    CAH  CAW  CAS  CAD     0.28  30.0  2
 8Q6  Var_04    OAF  CAT  CAX  CAJ     2.26  30.0  2
 8Q6  Var_05    OAG  CAU  CAY  CAK    -0.88  30.0  2
 8Q6  Var_06    CAZ  CBA  OAR  CAN  -178.23  30.0  3
 8Q6  Var_07    CAX  CAT  OAP  CAB  -179.88  30.0  1
 8Q6  Var_08    CAY  CAU  OAQ  CAC  -179.71  30.0  1
 8Q6  Var_09    H10  CAD  CAS  CAW    59.30  30.0  3
 8Q6  Var_10    H19  CAN  OAR  CBA    58.97  30.0  1
 8Q6  Var_11    H4   CAB  OAP  CAT    62.04  30.0  3
 8Q6  Var_12    H7   CAC  OAQ  CAU    60.06  30.0  3
 8Q6  Var_13    H1   CAA  CAN  OAR   -60.25  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 8Q6  plan-1  CAH  0.020
 8Q6  plan-1  CAI  0.020
 8Q6  plan-1  CAM  0.020
 8Q6  plan-1  CAW  0.020
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 8Q6  plan-1  OAR  0.020
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 8Q6  plan-1  CAS  0.020
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 8Q6  plan-2  CAL  0.020
 8Q6  plan-2  CAT  0.020
 8Q6  plan-2  CAU  0.020
 8Q6  plan-2  CAV  0.020
 8Q6  plan-2  CAX  0.020
 8Q6  plan-2  CAY  0.020
 8Q6  plan-2  H15  0.020
 8Q6  plan-2  H16  0.020
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 8Q6  plan-2  NAO  0.020
 8Q6  plan-3  CAD  0.020
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 8Q6  plan-3  CAS  0.020
 8Q6  plan-4  CAU  0.020
 8Q6  plan-4  CAY  0.020
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 8Q6  plan-5  CAT  0.020
 8Q6  plan-5  CAX  0.020
 8Q6  plan-5  OAF  0.020
 8Q6  plan-5  OAP  0.020

