# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Apr 18 09:56:48 2020
#   Inital geometry file: a 100 line input string
#   Ligand name: 5-bromanyl-~{N}-(3,6-dimethyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(Br)cc1[S](=O)(=O)Nc2cc3c(C)noc3cc2C
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 8Q3  8Q3  5-bromanyl-~{N}-(3,6-dimethyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide  ligand  39  24  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_8Q3
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 8Q3  CAX   C   CH3   0  -0.718   4.3943   1.2220   1.2551
 8Q3  CAB   C   CR6   0   0.011   3.5429   0.1794   0.5972
 8Q3  CAC   C   CR16  0  -0.393   3.8770  -1.1598   0.7207
 8Q3  CAD   C   CR56  0   0.437   3.0624  -2.0844   0.0833
 8Q3  OAG   O   O     0  -0.337   3.1915  -3.4164   0.0746
 8Q3  NAH   N   N     0  -0.169   2.1701  -3.9532  -0.6804
 8Q3  CAI   C   CR5   0   0.219   1.4412  -2.9815  -1.1265
 8Q3  CAW   C   CH3   0  -0.722   0.2506  -3.2150  -1.9803
 8Q3  CAE   C   CR56  0  -0.239   1.9589  -1.7266  -0.6706
 8Q3  CAF   C   CR16  0  -0.271   1.6153  -0.3864  -0.8008
 8Q3  CAA   C   CR6   0   0.385   2.4027   0.5498  -0.1582
 8Q3  NAJ   N   NC1   0  -0.853   2.0879   1.9350  -0.2714
 8Q3  SAK   S   S     0   1.375   0.9528   2.5676   0.7489
 8Q3  OAL   O   OS    0  -0.623   1.2736   2.0956   2.0835
 8Q3  OAM   O   OS    0  -0.616   0.8932   3.9904   0.4799
 8Q3  CAN   C   CR6   0  -0.399  -0.5979   1.8233   0.3013
 8Q3  CAS   C   CR16  0  -0.177  -1.2411   1.0163   1.2226
 8Q3  CAR   C   CR6   0  -0.142  -2.4421   0.4185   0.8761
 8Q3  BRAV  BR  BR    0   0.010  -3.3285  -0.6803   2.1211
 8Q3  CAQ   C   CR16  0  -0.225  -2.9877   0.6214  -0.3813
 8Q3  CAP   C   CR16  0  -0.375  -2.3353   1.4223  -1.3059
 8Q3  CAO   C   CR6   0   0.539  -1.1301   2.0353  -0.9782
 8Q3  OAT   O   O2    0  -0.454  -0.4122   2.7907  -1.8114
 8Q3  CAU   C   CH3   0  -0.476  -0.8991   3.0285  -3.1230
 8Q3  H1    H   HCH3  0   0.206   4.5993   2.0535   0.5826
 8Q3  H2    H   HCH3  0   0.267   3.8980   1.6343   2.1331
 8Q3  H3    H   HCH3  0   0.275   5.3434   0.7982   1.5766
 8Q3  H4    H   HCR6  0   0.257   4.7477  -1.4665   1.2848
 8Q3  H5    H   HCH3  0   0.310  -0.6307  -2.7462  -1.5428
 8Q3  H6    H   HCH3  0   0.279   0.3992  -2.7771  -2.9676
 8Q3  H7    H   HCH3  0   0.251   0.0523  -4.2774  -2.0998
 8Q3  H8    H   HCR6  0   0.263   0.7612  -0.0822  -1.3916
 8Q3  H9    H   HNC1  0   0.433   2.0231   2.3047  -1.2138
 8Q3  H10   H   HCR6  0   0.302  -0.8031   0.8554   2.1977
 8Q3  H11   H   HCR6  0   0.286  -3.9232   0.1572  -0.6617
 8Q3  H12   H   HCR6  0   0.278  -2.7803   1.5535  -2.2821
 8Q3  H13   H   HCH3  0   0.270  -0.9817   2.1018  -3.6946
 8Q3  H14   H   HCH3  0   0.235  -1.8677   3.5317  -3.1050
 8Q3  H15   H   HCH3  0   0.301  -0.1716   3.6774  -3.6015

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 8Q3  CAQ   CAP  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8Q3  CAQ   CAR  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8Q3  CAP   CAO  aromatic  1.391  0.020  1.391
 8Q3  CAU   OAT  single    1.419  0.020  1.419
 8Q3  BRAV  CAR  single    1.882  0.020  1.882
 8Q3  CAR   CAS  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8Q3  CAO   OAT  single    1.334  0.020  1.334
 8Q3  CAO   CAN  aromatic  1.402  0.020  1.402
 8Q3  CAX   CAB  single    1.498  0.020  1.498
 8Q3  CAS   CAN  aromatic  1.383  0.020  1.383
 8Q3  CAN   SAK  single    1.777  0.020  1.777
 8Q3  CAB   CAC  aromatic  1.386  0.020  1.386
 8Q3  CAB   CAA  aromatic  1.417  0.020  1.417
 8Q3  CAC   CAD  aromatic  1.387  0.020  1.387
 8Q3  SAK   NAJ  single    1.652  0.020  1.652
 8Q3  SAK   OAM  double    1.449  0.020  1.449
 8Q3  SAK   OAL  double    1.451  0.020  1.451
 8Q3  CAD   OAG  aromatic  1.338  0.020  1.338
 8Q3  CAD   CAE  aromatic  1.384  0.020  1.384
 8Q3  CAA   NAJ  single    1.425  0.020  1.425
 8Q3  CAA   CAF  aromatic  1.382  0.020  1.382
 8Q3  OAG   NAH  aromatic  1.379  0.020  1.379
 8Q3  CAE   CAF  aromatic  1.390  0.020  1.390
 8Q3  CAE   CAI  aromatic  1.432  0.020  1.432
 8Q3  NAH   CAI  aromatic  1.294  0.020  1.294
 8Q3  CAI   CAW  single    1.484  0.020  1.484
 8Q3  CAX   H1   single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAX   H2   single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAX   H3   single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAC   H4   single    0.930  0.020  1.080
 8Q3  CAW   H5   single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAW   H6   single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAW   H7   single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAF   H8   single    0.930  0.020  1.080
 8Q3  NAJ   H9   single    0.890  0.020  1.040
 8Q3  CAS   H10  single    0.930  0.020  1.080
 8Q3  CAQ   H11  single    0.930  0.020  1.080
 8Q3  CAP   H12  single    0.930  0.020  1.080
 8Q3  CAU   H13  single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAU   H14  single    0.970  0.020  1.090
 8Q3  CAU   H15  single    0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 8Q3  H3    CAX  H2    107.85  3.000
 8Q3  H3    CAX  H1    108.40  3.000
 8Q3  H2    CAX  H1    107.12  3.000
 8Q3  H3    CAX  CAB   110.76  3.000
 8Q3  H2    CAX  CAB   111.00  3.000
 8Q3  H1    CAX  CAB   111.54  3.000
 8Q3  CAA   CAB  CAC   119.61  3.000
 8Q3  CAA   CAB  CAX   120.63  3.000
 8Q3  CAC   CAB  CAX   119.76  3.000
 8Q3  H4    CAC  CAD   121.55  3.000
 8Q3  H4    CAC  CAB   120.96  3.000
 8Q3  CAD   CAC  CAB   117.48  3.000
 8Q3  CAE   CAD  OAG   109.32  3.000
 8Q3  CAE   CAD  CAC   123.12  3.000
 8Q3  OAG   CAD  CAC   127.56  3.000
 8Q3  NAH   OAG  CAD   108.64  3.000
 8Q3  CAI   NAH  OAG   108.28  3.000
 8Q3  CAE   CAI  CAW   127.68  3.000
 8Q3  CAW   CAI  NAH   122.16  3.000
 8Q3  CAE   CAI  NAH   110.16  3.000
 8Q3  H7    CAW  H6    108.53  3.000
 8Q3  H7    CAW  H5    108.48  3.000
 8Q3  H6    CAW  H5    107.52  3.000
 8Q3  H7    CAW  CAI   111.31  3.000
 8Q3  H6    CAW  CAI   110.40  3.000
 8Q3  H5    CAW  CAI   110.50  3.000
 8Q3  CAF   CAE  CAI   136.55  3.000
 8Q3  CAI   CAE  CAD   103.60  3.000
 8Q3  CAF   CAE  CAD   119.85  3.000
 8Q3  H8    CAF  CAA   120.88  3.000
 8Q3  H8    CAF  CAE   121.16  3.000
 8Q3  CAA   CAF  CAE   117.97  3.000
 8Q3  NAJ   CAA  CAF   119.72  3.000
 8Q3  CAF   CAA  CAB   121.96  3.000
 8Q3  NAJ   CAA  CAB   118.31  3.000
 8Q3  H9    NAJ  SAK   112.97  3.000
 8Q3  H9    NAJ  CAA   116.24  3.000
 8Q3  SAK   NAJ  CAA   118.36  3.000
 8Q3  CAN   SAK  OAM   109.18  3.000
 8Q3  OAM   SAK  OAL   119.94  3.000
 8Q3  CAN   SAK  OAL   106.75  3.000
 8Q3  OAL   SAK  NAJ   106.94  3.000
 8Q3  OAM   SAK  NAJ   106.83  3.000
 8Q3  CAN   SAK  NAJ   106.47  3.000
 8Q3  CAO   CAN  CAS   121.30  3.000
 8Q3  CAS   CAN  SAK   118.83  3.000
 8Q3  CAO   CAN  SAK   119.85  3.000
 8Q3  H10   CAS  CAR   120.83  3.000
 8Q3  H10   CAS  CAN   119.95  3.000
 8Q3  CAR   CAS  CAN   119.22  3.000
 8Q3  CAQ   CAR  BRAV  120.02  3.000
 8Q3  BRAV  CAR  CAS   119.65  3.000
 8Q3  CAQ   CAR  CAS   120.34  3.000
 8Q3  H11   CAQ  CAP   118.83  3.000
 8Q3  H11   CAQ  CAR   120.87  3.000
 8Q3  CAP   CAQ  CAR   120.30  3.000
 8Q3  H12   CAP  CAO   121.06  3.000
 8Q3  H12   CAP  CAQ   118.60  3.000
 8Q3  CAO   CAP  CAQ   120.34  3.000
 8Q3  OAT   CAO  CAP   124.65  3.000
 8Q3  OAT   CAO  CAN   116.83  3.000
 8Q3  CAP   CAO  CAN   118.50  3.000
 8Q3  CAU   OAT  CAO   119.17  3.000
 8Q3  H15   CAU  H14   109.04  3.000
 8Q3  H15   CAU  H13   109.10  3.000
 8Q3  H14   CAU  H13   109.43  3.000
 8Q3  H15   CAU  OAT   106.11  3.000
 8Q3  H14   CAU  OAT   111.50  3.000
 8Q3  H13   CAU  OAT   111.57  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 8Q3  CONST_01  OAG   CAD  CAC  CAB   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_02  CAE   CAD  CAC  CAB     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_03  CAE   CAF  CAA  CAB     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_04  CAF   CAA  CAB  CAC     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_05  NAH   OAG  CAD  CAC   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_06  CAF   CAE  CAD  CAC     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_07  CAI   CAE  CAD  CAC   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_08  CAA   CAB  CAC  CAD     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_09  CAI   NAH  OAG  CAD     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_10  CAA   CAF  CAE  CAD     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_11  NAH   CAI  CAE  CAD     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_12  CAF   CAE  CAD  OAG   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_13  CAI   CAE  CAD  OAG     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_14  CAE   CAI  NAH  OAG     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_15  CAE   CAD  OAG  NAH     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_16  CAF   CAE  CAI  NAH   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_17  CAA   CAF  CAE  CAI   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_18  CAQ   CAP  CAO  CAN     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_19  CAQ   CAR  CAS  CAN     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_20  CAP   CAQ  CAR  CAS     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_21  CAP   CAO  CAN  CAS     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_22  CAO   CAP  CAQ  CAR     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_23  CAO   CAN  CAS  CAR     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_24  CAD   CAC  CAB  CAX   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_25  CAF   CAA  CAB  CAX   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_26  NAJ   CAA  CAB  CAC   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_27  CAW   CAI  CAE  CAD   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_28  CAW   CAI  NAH  OAG   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_29  CAF   CAE  CAI  CAW     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_30  NAJ   CAA  CAF  CAE   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_31  CAP   CAO  CAN  SAK   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_32  CAR   CAS  CAN  SAK   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_33  BRAV  CAR  CAS  CAN   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_34  OAT   CAO  CAN  CAS   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_35  CAP   CAQ  CAR  BRAV  180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_36  OAT   CAO  CAP  CAQ   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_37  H8    CAF  CAA  CAB   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_38  H4    CAC  CAD  OAG     0.00   0.0  0
 8Q3  CONST_39  H12   CAP  CAO  CAN   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_40  H11   CAQ  CAR  CAS   180.00   0.0  0
 8Q3  CONST_41  H10   CAS  CAR  CAQ   180.00   0.0  0
 8Q3  Var_01    CAN   SAK  NAJ  CAA   -67.06  30.0  1
 8Q3  Var_02    CAO   CAN  SAK  NAJ   -62.34  30.0  2
 8Q3  Var_03    H1    CAX  CAB  CAC   134.44  30.0  2
 8Q3  Var_04    H5    CAW  CAI  NAH   124.90  30.0  2
 8Q3  Var_05    H13   CAU  OAT  CAO   -62.62  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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