# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 17 01:24:34 2020
#   Inital geometry file: a 101 line input string
#   Ligand name: 4-[4-(pyrazol-1-ylmethyl)phenyl]benzenesulfonamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: N[S](=O)(=O)c1ccc(cc1)c2ccc(Cn3cccn3)cc2
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 8GH  8GH  4-[4-(pyrazol-1-ylmethyl)phenyl]benzenesulfonamide  ligand  37  22  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_8GH
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 8GH  C2   C  CR16  0  -0.198   3.1037   0.7561   0.8710
 8GH  C3   C  CR16  0  -0.304   1.7374   0.7710   1.0771
 8GH  C4   C  CR6   0   0.107   0.8854  -0.0346   0.3146
 8GH  C5   C  CR16  0  -0.300   1.4443  -0.8601  -0.6608
 8GH  C6   C  CR16  0  -0.220   2.8123  -0.8836  -0.8794
 8GH  C17  C  CR15  0   0.031  -6.1559  -1.1453  -0.5234
 8GH  C16  C  CR15  0  -0.493  -6.7819  -0.7489  -1.6814
 8GH  C1   C  CR6   0  -0.225   3.6329  -0.0751  -0.1089
 8GH  C7   C  CR6   0   0.080  -0.5727  -0.0094   0.5341
 8GH  C8   C  CR16  0  -0.296  -1.1047   0.1571   1.8144
 8GH  C9   C  CR16  0  -0.265  -2.4732   0.1782   2.0155
 8GH  C10  C  CR6   0   0.059  -3.3560   0.0357   0.9475
 8GH  C11  C  CR16  0  -0.272  -2.8322  -0.1267  -0.3286
 8GH  C12  C  CR16  0  -0.292  -1.4599  -0.1504  -0.5309
 8GH  C13  C  CH2   0  -0.321  -4.8384   0.0488   1.2299
 8GH  C15  C  CR15  0  -0.058  -6.5925   0.6427  -1.7146
 8GH  S1   S  S     0   1.361   5.3782  -0.0660  -0.3899
 8GH  N13  N  NR5   0  -0.272  -5.6585  -0.0323   0.0496
 8GH  N14  N  N     0  -0.283  -5.9080   1.0619  -0.6661
 8GH  O18  O  OS    0  -0.652   5.6410  -0.8483  -1.5907
 8GH  O19  O  OS    0  -0.667   5.8725   1.3028  -0.3407
 8GH  N20  N  NC2   0  -0.887   5.9260  -0.7912   0.9890
 8GH  H1   H  HCR6  0   0.287   3.7445   1.3921   1.4671
 8GH  H2   H  HCR6  0   0.270   1.3280   1.4350   1.8272
 8GH  H3   H  HCR6  0   0.270   0.8098  -1.5103  -1.2484
 8GH  H4   H  HCR6  0   0.285   3.2243  -1.5329  -1.6393
 8GH  H6   H  HCR5  0   0.262  -7.3032  -1.3680  -2.3918
 8GH  H7   H  HCR6  0   0.260  -0.4464   0.2481   2.6691
 8GH  H8   H  HCR6  0   0.258  -2.8589   0.3007   3.0210
 8GH  H9   H  HCR6  0   0.256  -3.4842  -0.2319  -1.1860
 8GH  H10  H  HCR6  0   0.260  -1.0833  -0.2589  -1.5404
 8GH  H11  H  HCH2  0   0.284  -5.0974  -0.7893   1.8783
 8GH  H12  H  HCH2  0   0.287  -5.1118   0.9575   1.7670
 8GH  H13  H  HCR5  0   0.262  -6.9354   1.3478  -2.4568
 8GH  H14  H  HNC2  0   0.416   5.7426  -1.7892   1.0084
 8GH  H15  H  HNC2  0   0.420   6.9159  -0.6136   1.1338
 8GH  H5   H  HCR5  0   0.293  -6.0325  -2.1173  -0.0733

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 8GH  C17  C16  aromatic  1.375  0.020  1.375
 8GH  C17  N13  aromatic  1.347  0.020  1.347
 8GH  C16  C15  aromatic  1.405  0.020  1.405
 8GH  N13  C13  single    1.440  0.020  1.440
 8GH  N13  N14  aromatic  1.331  0.020  1.331
 8GH  C11  C12  aromatic  1.387  0.020  1.387
 8GH  C11  C10  aromatic  1.389  0.020  1.389
 8GH  C13  C10  single    1.509  0.020  1.509
 8GH  C15  N14  aromatic  1.320  0.020  1.320
 8GH  C12  C7   aromatic  1.393  0.020  1.393
 8GH  C10  C9   aromatic  1.393  0.020  1.393
 8GH  C7   C4   single    1.475  0.020  1.475
 8GH  C7   C8   aromatic  1.396  0.020  1.396
 8GH  C9   C8   aromatic  1.383  0.020  1.383
 8GH  C4   C5   aromatic  1.395  0.020  1.395
 8GH  C4   C3   aromatic  1.399  0.020  1.399
 8GH  C5   C6   aromatic  1.385  0.020  1.385
 8GH  C3   C2   aromatic  1.382  0.020  1.382
 8GH  C6   C1   aromatic  1.386  0.020  1.386
 8GH  C2   C1   aromatic  1.390  0.020  1.390
 8GH  C1   S1   single    1.768  0.020  1.768
 8GH  O18  S1   double    1.457  0.020  1.457
 8GH  N20  S1   single    1.651  0.020  1.651
 8GH  S1   O19  double    1.456  0.020  1.456
 8GH  C2   H1   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C3   H2   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C5   H3   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C6   H4   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C17  H5   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C16  H6   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C8   H7   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C9   H8   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C11  H9   single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C12  H10  single    0.930  0.020  1.080
 8GH  C13  H11  single    0.970  0.020  1.090
 8GH  C13  H12  single    0.970  0.020  1.090
 8GH  C15  H13  single    0.930  0.020  1.080
 8GH  N20  H14  single    0.890  0.020  1.040
 8GH  N20  H15  single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 8GH  H1   C2   C1   120.97  3.000
 8GH  H1   C2   C3   119.81  3.000
 8GH  C1   C2   C3   119.22  3.000
 8GH  H2   C3   C4   120.06  3.000
 8GH  H2   C3   C2   118.95  3.000
 8GH  C4   C3   C2   120.98  3.000
 8GH  C7   C4   C5   120.69  3.000
 8GH  C5   C4   C3   118.56  3.000
 8GH  C7   C4   C3   120.75  3.000
 8GH  H3   C5   C6   118.89  3.000
 8GH  H3   C5   C4   120.03  3.000
 8GH  C6   C5   C4   121.07  3.000
 8GH  H4   C6   C1   121.03  3.000
 8GH  H4   C6   C5   119.83  3.000
 8GH  C1   C6   C5   119.14  3.000
 8GH  H5   C17  N13  121.67  3.000
 8GH  H5   C17  C16  131.58  3.000
 8GH  N13  C17  C16  106.75  3.000
 8GH  H6   C16  C15  128.26  3.000
 8GH  H6   C16  C17  127.61  3.000
 8GH  C15  C16  C17  104.13  3.000
 8GH  S1   C1   C6   119.95  3.000
 8GH  S1   C1   C2   119.01  3.000
 8GH  C6   C1   C2   121.03  3.000
 8GH  C12  C7   C8   118.05  3.000
 8GH  C8   C7   C4   121.01  3.000
 8GH  C12  C7   C4   120.94  3.000
 8GH  H7   C8   C9   119.05  3.000
 8GH  H7   C8   C7   120.14  3.000
 8GH  C9   C8   C7   120.80  3.000
 8GH  H8   C9   C10  119.82  3.000
 8GH  H8   C9   C8   119.25  3.000
 8GH  C10  C9   C8   120.93  3.000
 8GH  C13  C10  C11  122.91  3.000
 8GH  C13  C10  C9   118.57  3.000
 8GH  C11  C10  C9   118.51  3.000
 8GH  H9   C11  C12  118.60  3.000
 8GH  H9   C11  C10  120.80  3.000
 8GH  C12  C11  C10  120.60  3.000
 8GH  H10  C12  C11  118.79  3.000
 8GH  H10  C12  C7   120.09  3.000
 8GH  C11  C12  C7   121.11  3.000
 8GH  H12  C13  H11  106.73  3.000
 8GH  H12  C13  N13  107.93  3.000
 8GH  H11  C13  N13  107.99  3.000
 8GH  H12  C13  C10  110.23  3.000
 8GH  H11  C13  C10  109.74  3.000
 8GH  N13  C13  C10  113.94  3.000
 8GH  H13  C15  N14  120.21  3.000
 8GH  H13  C15  C16  128.34  3.000
 8GH  N14  C15  C16  111.44  3.000
 8GH  N20  S1   O19  105.78  3.000
 8GH  O19  S1   O18  118.12  3.000
 8GH  N20  S1   O18  113.11  3.000
 8GH  O19  S1   C1   109.55  3.000
 8GH  N20  S1   C1   101.10  3.000
 8GH  O18  S1   C1   107.84  3.000
 8GH  N14  N13  C13  120.09  3.000
 8GH  N14  N13  C17  112.41  3.000
 8GH  C13  N13  C17  127.27  3.000
 8GH  N13  N14  C15  105.26  3.000
 8GH  H15  N20  H14  110.19  3.000
 8GH  H15  N20  S1   111.44  3.000
 8GH  H14  N20  S1   112.82  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 8GH  CONST_01  C7   C4   C3   C2    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_02  C5   C4   C3   C2      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_03  C5   C6   C1   C2      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_06  C6   C5   C4   C3      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_07  C6   C1   C2   C3      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_08  C11  C12  C7   C4    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_09  C9   C8   C7   C4    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_10  C1   C6   C5   C4      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_11  C1   C2   C3   C4      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_14  C7   C4   C5   C6    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_15  N14  C15  C16  C17     0.00   0.0  0
 8GH  CONST_16  C15  N14  N13  C17     0.00   0.0  0
 8GH  CONST_17  N14  N13  C17  C16     0.00   0.0  0
 8GH  CONST_18  N13  N14  C15  C16     0.00   0.0  0
 8GH  CONST_19  C10  C11  C12  C7      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_20  C10  C9   C8   C7      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_21  C11  C12  C7   C8      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_22  C11  C10  C9   C8      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_23  C12  C11  C10  C9      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_24  C12  C7   C8   C9      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_25  N13  C17  C16  C15     0.00   0.0  0
 8GH  CONST_26  S1   C1   C2   C3    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_27  S1   C1   C6   C5    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_28  C13  N13  C17  C16   180.00   0.0  0
 8GH  CONST_29  C13  C10  C9   C8    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_30  C13  C10  C11  C12   180.00   0.0  0
 8GH  CONST_31  C15  N14  N13  C13   180.00   0.0  0
 8GH  CONST_32  H4   C6   C1   C2    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_33  H3   C5   C4   C3    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_34  H10  C12  C7   C4      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_35  H7   C8   C7   C4      0.00   0.0  0
 8GH  CONST_36  H1   C2   C3   C4    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_37  H2   C3   C4   C5    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_38  H13  C15  C16  C17   180.00   0.0  0
 8GH  CONST_39  H9   C11  C12  C7    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_40  H8   C9   C8   C7    180.00   0.0  0
 8GH  CONST_41  H5   C17  C16  C15   180.00   0.0  0
 8GH  CONST_42  H6   C16  C17  N13   180.00   0.0  0
 8GH  Var_01    C10  C13  N13  C17    92.39  30.0  2
 8GH  Var_02    N13  C13  C10  C9    176.79  30.0  3
 8GH  Var_03    O18  S1   C1   C2   -171.08  30.0  2
 8GH  Var_04    H14  N20  S1   C1     73.22  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 8GH  plan-1  C17  0.020
 8GH  plan-1  C16  0.020
 8GH  plan-1  C13  0.020
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 8GH  plan-3  H9   0.020
 8GH  plan-3  H10  0.020

