# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Apr 16 08:57:57 2020
#   Inital geometry file: a 62 line input string
#   Ligand name: 4-oxidanylfuro[3,2-g]chromen-7-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Oc1c2ccoc2cc3OC(=O)C=Cc13
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 8B6  8B6  4-oxidanylfuro[3,2-g]chromen-7-one  ligand  21  15  .  2021-08-06  2021-08-06  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_8B6
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 8B6  C4   C  CR16  0  -0.478   2.9944   0.9572   0.0077
 8B6  C5   C  CR6   0   0.543   3.1196  -0.4800  -0.0691
 8B6  CA   C  CR15  0   0.015  -3.7430  -0.5903   0.0660
 8B6  O    O  O     0  -0.434   4.1486  -1.1059  -0.1259
 8B6  CB   C  CR15  0  -0.359  -3.2275   0.6499   0.1155
 8B6  CG   C  CR56  0  -0.108  -1.7990   0.4755   0.0801
 8B6  CD1  C  CR6   0   0.303  -0.6991   1.3268   0.1007
 8B6  CD2  C  CR56  0   0.383  -1.5880  -0.9052   0.0104
 8B6  CE1  C  CR66  0  -0.155   0.5840   0.7612   0.0466
 8B6  CE2  C  CR16  0  -0.450  -0.3461  -1.5121  -0.0437
 8B6  CZ   C  CR66  0   0.396   0.7245  -0.6395  -0.0247
 8B6  OH   O  O     0  -0.471   1.9605  -1.1910  -0.0784
 8B6  C3   C  CR16  0  -0.097   1.7839   1.5427   0.0615
 8B6  O1   O  OH1   0  -0.596  -0.7963   2.6556   0.1682
 8B6  O4   O  O     0  -0.432  -2.7688  -1.5438   0.0031
 8B6  H1   H  HCR6  0   0.289   3.9062   1.5362   0.0193
 8B6  H2   H  HCR5  0   0.296  -4.7584  -0.9515   0.0674
 8B6  H3   H  HCR5  0   0.277  -3.7913   1.5670   0.1702
 8B6  H4   H  HCR6  0   0.293  -0.2151  -2.5839  -0.0973
 8B6  H5   H  HCR6  0   0.292   1.7172   2.6209   0.1162
 8B6  H6   H  HOH1  0   0.492  -1.7159   2.9411   0.2192

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 8B6  CB   CA   aromatic  1.344  0.020  1.344
 8B6  CB   CG   aromatic  1.440  0.020  1.440
 8B6  CA   O4   aromatic  1.365  0.020  1.365
 8B6  O1   CD1  single    1.334  0.020  1.334
 8B6  CG   CD1  aromatic  1.391  0.020  1.391
 8B6  CG   CD2  aromatic  1.398  0.020  1.398
 8B6  CD1  CE1  aromatic  1.403  0.020  1.403
 8B6  O4   CD2  aromatic  1.342  0.020  1.342
 8B6  CD2  CE2  aromatic  1.383  0.020  1.383
 8B6  CE1  C3   single    1.432  0.020  1.432
 8B6  CE1  CZ   aromatic  1.410  0.020  1.410
 8B6  C3   C4   double    1.346  0.020  1.346
 8B6  CE2  CZ   aromatic  1.381  0.020  1.381
 8B6  CZ   OH   single    1.355  0.020  1.355
 8B6  C4   C5   single    1.445  0.020  1.445
 8B6  OH   C5   single    1.360  0.020  1.360
 8B6  C5   O    double    1.206  0.020  1.206
 8B6  C4   H1   single    0.930  0.020  1.080
 8B6  CA   H2   single    0.930  0.020  1.080
 8B6  CB   H3   single    0.930  0.020  1.080
 8B6  CE2  H4   single    0.930  0.020  1.080
 8B6  C3   H5   single    0.930  0.020  1.080
 8B6  O1   H6   single    0.850  0.020  0.980

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 8B6  H1   C4   C3   121.71  3.000
 8B6  H1   C4   C5   117.43  3.000
 8B6  C3   C4   C5   120.86  3.000
 8B6  OH   C5   O    117.11  3.000
 8B6  O    C5   C4   126.36  3.000
 8B6  OH   C5   C4   116.53  3.000
 8B6  H2   CA   O4   116.01  3.000
 8B6  H2   CA   CB   132.11  3.000
 8B6  O4   CA   CB   111.88  3.000
 8B6  H3   CB   CG   128.56  3.000
 8B6  H3   CB   CA   125.90  3.000
 8B6  CG   CB   CA   105.54  3.000
 8B6  CD2  CG   CD1  119.06  3.000
 8B6  CD2  CG   CB   105.69  3.000
 8B6  CD1  CG   CB   135.25  3.000
 8B6  O1   CD1  CE1  118.03  3.000
 8B6  CE1  CD1  CG   118.41  3.000
 8B6  O1   CD1  CG   123.56  3.000
 8B6  O4   CD2  CE2  125.51  3.000
 8B6  CE2  CD2  CG   124.79  3.000
 8B6  O4   CD2  CG   109.71  3.000
 8B6  C3   CE1  CZ   117.34  3.000
 8B6  CZ   CE1  CD1  119.58  3.000
 8B6  C3   CE1  CD1  123.08  3.000
 8B6  H4   CE2  CZ   122.21  3.000
 8B6  H4   CE2  CD2  123.07  3.000
 8B6  CZ   CE2  CD2  114.72  3.000
 8B6  OH   CZ   CE2  116.71  3.000
 8B6  OH   CZ   CE1  119.84  3.000
 8B6  CE2  CZ   CE1  123.45  3.000
 8B6  CZ   OH   C5   124.38  3.000
 8B6  H5   C3   CE1  119.53  3.000
 8B6  H5   C3   C4   119.42  3.000
 8B6  CE1  C3   C4   121.05  3.000
 8B6  H6   O1   CD1  111.53  3.000
 8B6  CD2  O4   CA   107.18  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 8B6  CONST_01  CD1  CG   CB   CA    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_02  CD2  CG   CB   CA      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_03  CG   CD2  O4   CA      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_04  CE2  CD2  O4   CA    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_05  CD2  O4   CA   CB      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_06  CE1  CD1  CG   CB    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_07  O4   CD2  CG   CB      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_08  CE2  CD2  CG   CB    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_09  O4   CA   CB   CG      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_10  CZ   CE1  CD1  CG      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_11  CZ   CE2  CD2  CG      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_12  O4   CD2  CG   CD1   180.00   0.0  0
 8B6  CONST_13  CE2  CD2  CG   CD1     0.00   0.0  0
 8B6  CONST_14  CE2  CZ   CE1  CD1     0.00   0.0  0
 8B6  CONST_15  CE1  CD1  CG   CD2     0.00   0.0  0
 8B6  CONST_16  CE1  CZ   CE2  CD2     0.00   0.0  0
 8B6  CONST_17  O4   CD2  CE2  CZ    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_18  O1   CD1  CG   CB      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_19  O1   CD1  CG   CD2   180.00   0.0  0
 8B6  CONST_20  O1   CD1  CE1  CZ    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_21  O1   CD1  CE1  C3      0.00   0.0  0
 8B6  CONST_22  H2   CA   CB   CG    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_23  H4   CE2  CD2  CG    180.00   0.0  0
 8B6  CONST_24  H3   CB   CG   CD1     0.00   0.0  0
 8B6  Var_01    CD1  CE1  C3   C4   -179.99  30.0  1
 8B6  Var_02    CE1  C3   C4   C5      0.11  30.0  1
 8B6  Var_03    CE1  CZ   OH   C5     -0.01  30.0  1
 8B6  Var_04    C3   C4   C5   OH     -0.24  30.0  1

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 8B6  plan-1  C4   0.020
 8B6  plan-1  C5   0.020
 8B6  plan-1  O    0.020
 8B6  plan-1  OH   0.020
 8B6  plan-2  CA   0.020
 8B6  plan-2  CB   0.020
 8B6  plan-2  CG   0.020
 8B6  plan-2  CD1  0.020
 8B6  plan-2  CD2  0.020
 8B6  plan-2  CE1  0.020
 8B6  plan-2  CE2  0.020
 8B6  plan-2  CZ   0.020
 8B6  plan-2  OH   0.020
 8B6  plan-2  C3   0.020
 8B6  plan-2  O1   0.020
 8B6  plan-2  O4   0.020
 8B6  plan-2  H2   0.020
 8B6  plan-2  H3   0.020
 8B6  plan-2  H4   0.020

