# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue Aug  2 16:55:22 2022
#   Inital geometry file: a 204 line input string
#   Ligand name: (2~{S})-2-[[(2~{R})-2-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-2-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-6-(hydroxymethyl)-5-oxidanyl-oxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]-3-oxidanyl-propanoic acid
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: C[C@@H](O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[C@@H]1NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 87E  87E  "(2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-6-(hydroxymethyl)-5-oxidanyl-oxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]-3-oxidanyl-propanoic acid"  ligand  83  50  .  2022-09-16  2022-09-22
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK
;

data_comp_87E
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 87E  N1   N  NR16   0  -0.735  15.6573  10.4731  13.8645
 87E  C2   C  CR6    0   0.729  15.8178   9.2472  14.4563
 87E  O2   O  O      0  -0.470  16.9070   8.8332  14.7914
 87E  N3   N  NH1    0  -0.629   8.3905   6.5286   9.3746
 87E  C4   C  CR16   0  -0.519  13.3128  10.2567  13.6517
 87E  O4   O  OH1    0  -0.654  15.0035   7.6243  17.5969
 87E  C5   C  CR15   0   0.202  14.6878   7.2262  15.2574
 87E  C6   C  CR15   0  -0.033  14.0726   7.1776  16.6538
 87E  P1   P  P      0   1.374   9.7337   7.0556  15.0783
 87E  P2   P  P      0   1.372  10.1316   7.5621  12.1277
 87E  C1   C  CR6    0   0.566  14.4807  11.0758  13.4414
 87E  O1   O  O      0  -0.455  14.4992  12.1872  12.9481
 87E  N2   N  NR6    0  -0.566  14.6436   8.5418  14.6358
 87E  C3   C  CR16   0   0.093  13.4425   9.0526  14.2295
 87E  O3   O  O      0  -0.495  13.9355   6.3389  14.4860
 87E  N4   N  NH1    0  -0.633   6.3919   5.9396   6.4707
 87E  C7   C  CR15   0  -0.043  13.7119   5.6926  16.7549
 87E  O7   O  O2     0  -0.748  10.1906   7.8959  13.7343
 87E  C8   C  CR15   0  -0.007  13.2859   5.3702  15.3211
 87E  O8   O  O      0  -0.785   8.8936   5.8734  14.7149
 87E  C9   C  CH2    0  -0.194  11.7941   5.3719  15.0734
 87E  O9   O  OP    -1  -0.770   9.2873   8.0741  16.0727
 87E  C10  C  CH1    0   0.294   7.6049   6.7426  11.6841
 87E  O10  O  OP    -1  -0.777  10.5138   6.1410  11.8561
 87E  C11  C  CH1    0  -0.017   5.7326   8.1195  12.1420
 87E  O11  O  O      0  -0.769  10.8218   8.7009  11.4512
 87E  C12  C  CH1    0   0.023   5.1884   8.0003  10.7125
 87E  O12  O  O2     0  -0.643   8.5205   7.7893  11.8390
 87E  C13  C  CH1    0   0.025   6.3499   7.8051   9.7479
 87E  O13  O  O2     0  -0.495   6.4823   6.9631  12.4736
 87E  C14  C  CH1    0  -0.138   7.2165   6.6314  10.2021
 87E  O14  O  O2     0  -0.507   5.8359   7.5477   8.4615
 87E  C15  C  CH2    0  -0.198   4.6569   8.2985  13.1922
 87E  O15  O  OH1    0  -0.665   4.5014   9.1696  10.3415
 87E  C16  C  CH1    0  -0.064   6.4432   8.1982   7.3684
 87E  O16  O  OH1    0  -0.668   3.7134   7.2575  13.1051
 87E  C17  C  C      0   0.510   6.6976   7.2132   6.2257
 87E  O17  O  O      0  -0.512   7.1465   7.6251   5.1611
 87E  C18  C  CH3    0  -0.661   5.5756   9.3549   6.8924
 87E  O18  O  O      0  -0.494   8.5259   4.2721   9.3706
 87E  C20  C  CH3    0  -0.783  10.3091   5.5097   8.3483
 87E  C21  C  CH1    0  -0.218   6.4888   4.8643   5.5081
 87E  C22  C  C      0   0.407   5.4514   3.7741   5.8836
 87E  C23  C  CH2    0  -0.145   7.9048   4.2910   5.5349
 87E  H1   H  HNR6   0   0.423  16.5122  11.0011  13.7362
 87E  H3   H  HCR6   0   0.283  12.3440  10.6093  13.3348
 87E  H4   H  HOH1   0   0.466  14.5352   7.9090  18.3879
 87E  H5   H  HCR5   0   0.266  15.7403   6.9361  15.3011
 87E  H6   H  HCR5   0   0.254  13.1531   7.7726  16.6739
 87E  H7   H  HCR6   0   0.327  12.5833   8.4194  14.3935
 87E  H8   H  HNH1   0   0.392   6.0318   5.6854   7.3784
 87E  H10  H  HCR5   0   0.247  12.9040   5.5113  17.4746
 87E  H11  H  HCR5   0   0.254  13.6526   4.3740  15.0500
 87E  H12  H  HCH2   0   0.216  11.3770   4.4799  15.5537
 87E  H13  H  HCH2   0   0.237  11.6147   5.2740  13.9985
 87E  H15  H  HCH1   0   0.238   8.0311   5.7953  12.0190
 87E  H17  H  HCH1   0   0.228   6.3638   9.0173  12.1967
 87E  H18  H  HCH1   0   0.225   4.5422   7.1154  10.6480
 87E  H19  H  HCH1   0   0.233   6.9504   8.7272   9.7449
 87E  H20  H  HCH1   0   0.267   6.6305   5.7163  10.0835
 87E  H21  H  HCH2   0   0.218   5.1424   8.3304  14.1765
 87E  H22  H  HCH2   0   0.206   4.1983   9.2832  13.0414
 87E  H23  H  HOH1   0   0.457   3.5882   9.0991  10.6335
 87E  H24  H  HCH1   0   0.246   7.4272   8.5925   7.6517
 87E  H25  H  HOH1   0   0.456   3.0137   7.4321  13.7408
 87E  H26  H  HCH3   0   0.238   5.4430  10.0775   7.6971
 87E  H27  H  HCH3   0   0.230   6.0349   9.8690   6.0507
 87E  H28  H  HCH3   0   0.230   4.5898   9.0032   6.5852
 87E  H30  H  HCH3   0   0.257  10.9178   4.6177   8.4744
 87E  H31  H  HCH3   0   0.266  10.1094   5.6357   7.2826
 87E  H32  H  HCH3   0   0.252  10.8768   6.3762   8.6840
 87E  H33  H  HCH1   0   0.228   6.2787   5.2566   4.5109
 87E  H34  H  HOH1   0   0.451   8.8949   2.9001   4.6251
 87E  H35  H  HCH2   0   0.200   8.6187   5.0977   5.3215
 87E  H36  H  HCH2   0   0.185   8.1131   3.9345   6.5518
 87E  O5   O  OH1    0  -0.666  14.8514   4.9249  17.0573
 87E  O6   O  O2     0  -0.625  11.2104   6.5421  15.6046
 87E  C19  C  C      0   0.526   9.0062   5.3608   9.0930
 87E  O19  O  OC    -1  -0.604   5.3330   3.5550   7.1071
 87E  O20  O  O      0  -0.587   4.8550   3.2159   4.9495
 87E  O21  O  OH1    0  -0.665   8.0021   3.2538   4.5879
 87E  H9   H  HOH1   0   0.445  15.3027   5.3438  17.7997
 87E  H2   H  HNH1   0   0.397   8.9158   7.3762   9.2250

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 87E  O20  C22  deloc   1.241  0.020  1.241
 87E  C22  C21  single  1.551  0.020  1.551
 87E  C22  O19  deloc   1.249  0.020  1.249
 87E  O17  C17  double  1.227  0.020  1.227
 87E  C21  N4   single  1.446  0.020  1.446
 87E  C21  C23  single  1.528  0.020  1.528
 87E  O21  C23  single  1.408  0.020  1.408
 87E  C17  N4   single  1.332  0.020  1.332
 87E  C17  C16  single  1.530  0.020  1.530
 87E  C16  C18  single  1.522  0.020  1.522
 87E  C16  O14  single  1.410  0.020  1.410
 87E  C20  C19  single  1.508  0.020  1.508
 87E  O14  C13  single  1.409  0.020  1.409
 87E  C19  O18  double  1.222  0.020  1.222
 87E  C19  N3   single  1.350  0.020  1.350
 87E  N3   C14  single  1.440  0.020  1.440
 87E  C13  C14  single  1.528  0.020  1.528
 87E  C13  C12  single  1.522  0.020  1.522
 87E  C14  C10  single  1.536  0.020  1.536
 87E  O15  C12  single  1.406  0.020  1.406
 87E  C12  C11  single  1.534  0.020  1.534
 87E  O12  C10  single  1.399  0.020  1.399
 87E  O12  P2   single  1.652  0.020  1.652
 87E  C10  O13  single  1.390  0.020  1.390
 87E  O11  P2   deloc   1.494  0.020  1.494
 87E  C11  O13  single  1.417  0.020  1.417
 87E  C11  C15  single  1.514  0.020  1.514
 87E  P2   O10  deloc   1.496  0.020  1.496
 87E  P2   O7   single  1.642  0.020  1.642
 87E  O16  C15  single  1.408  0.020  1.408
 87E  O7   P1   single  1.650  0.020  1.650
 87E  O8   P1   deloc   1.495  0.020  1.495
 87E  P1   O6   single  1.650  0.020  1.650
 87E  P1   O9   deloc   1.492  0.020  1.492
 87E  O1   C1   double  1.216  0.020  1.216
 87E  O6   C9   single  1.411  0.020  1.411
 87E  C9   C8   single  1.512  0.020  1.512
 87E  C4   C1   single  1.442  0.020  1.442
 87E  C4   C3   double  1.342  0.020  1.342
 87E  C1   N1   single  1.388  0.020  1.388
 87E  O3   C8   single  1.434  0.020  1.434
 87E  O3   C5   single  1.396  0.020  1.396
 87E  N1   C2   single  1.371  0.020  1.371
 87E  C3   N2   single  1.367  0.020  1.367
 87E  C8   C7   single  1.530  0.020  1.530
 87E  C2   N2   single  1.382  0.020  1.382
 87E  C2   O2   double  1.212  0.020  1.212
 87E  N2   C5   single  1.456  0.020  1.456
 87E  C5   C6   single  1.527  0.020  1.527
 87E  C7   C6   single  1.532  0.020  1.532
 87E  C7   O5   single  1.407  0.020  1.407
 87E  C6   O4   single  1.398  0.020  1.398
 87E  N1   H1   single  0.860  0.020  1.020
 87E  N3   H2   single  0.860  0.020  1.020
 87E  C4   H3   single  0.930  0.020  1.080
 87E  O4   H4   single  0.850  0.020  0.980
 87E  C5   H5   single  0.970  0.020  1.090
 87E  C6   H6   single  0.970  0.020  1.090
 87E  C3   H7   single  0.930  0.020  1.080
 87E  N4   H8   single  0.860  0.020  1.020
 87E  O5   H9   single  0.850  0.020  0.980
 87E  C7   H10  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C8   H11  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C9   H12  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C9   H13  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C10  H15  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C11  H17  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C12  H18  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C13  H19  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C14  H20  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C15  H21  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C15  H22  single  0.970  0.020  1.090
 87E  O15  H23  single  0.850  0.020  0.980
 87E  C16  H24  single  0.970  0.020  1.090
 87E  O16  H25  single  0.850  0.020  0.980
 87E  C18  H26  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C18  H27  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C18  H28  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C20  H30  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C20  H31  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C20  H32  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C21  H33  single  0.970  0.020  1.090
 87E  O21  H34  single  0.850  0.020  0.980
 87E  C23  H35  single  0.970  0.020  1.090
 87E  C23  H36  single  0.970  0.020  1.090

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 87E  H1   N1   C1   116.78  3.000
 87E  H1   N1   C2   114.96  3.000
 87E  C1   N1   C2   128.26  3.000
 87E  N2   C2   O2   123.59  3.000
 87E  O2   C2   N1   122.00  3.000
 87E  N2   C2   N1   114.41  3.000
 87E  H2   N3   C19  117.30  3.000
 87E  H2   N3   C14  116.74  3.000
 87E  C19  N3   C14  123.61  3.000
 87E  H3   C4   C3   120.45  3.000
 87E  H3   C4   C1   119.93  3.000
 87E  C3   C4   C1   119.62  3.000
 87E  H4   O4   C6   108.96  3.000
 87E  H5   C5   O3   111.87  3.000
 87E  H5   C5   N2   106.63  3.000
 87E  O3   C5   N2   108.80  3.000
 87E  H5   C5   C6   110.06  3.000
 87E  N2   C5   C6   114.02  3.000
 87E  O3   C5   C6   105.55  3.000
 87E  H6   C6   C7   109.13  3.000
 87E  H6   C6   C5   109.74  3.000
 87E  C7   C6   C5   100.73  3.000
 87E  H6   C6   O4   111.89  3.000
 87E  C7   C6   O4   114.96  3.000
 87E  C5   C6   O4   109.78  3.000
 87E  O9   P1   O8   122.25  3.000
 87E  O9   P1   O7   106.15  3.000
 87E  O8   P1   O7   111.13  3.000
 87E  O9   P1   O6   105.53  3.000
 87E  O8   P1   O6   109.54  3.000
 87E  O7   P1   O6    99.82  3.000
 87E  O12  P2   O11  105.46  3.000
 87E  O11  P2   O10  121.59  3.000
 87E  O12  P2   O10  110.35  3.000
 87E  O10  P2   O7   111.19  3.000
 87E  O11  P2   O7   105.76  3.000
 87E  O12  P2   O7   100.25  3.000
 87E  O1   C1   C4   126.20  3.000
 87E  C4   C1   N1   113.29  3.000
 87E  O1   C1   N1   120.50  3.000
 87E  C3   N2   C5   119.42  3.000
 87E  C5   N2   C2   119.42  3.000
 87E  C3   N2   C2   121.16  3.000
 87E  H7   C3   N2   115.78  3.000
 87E  H7   C3   C4   120.98  3.000
 87E  N2   C3   C4   123.24  3.000
 87E  C8   O3   C5   110.59  3.000
 87E  H8   N4   C21  115.80  3.000
 87E  H8   N4   C17  119.21  3.000
 87E  C21  N4   C17  124.95  3.000
 87E  H10  C7   C8   112.02  3.000
 87E  H10  C7   O5   111.42  3.000
 87E  C8   C7   O5   108.18  3.000
 87E  H10  C7   C6   112.15  3.000
 87E  O5   C7   C6   110.64  3.000
 87E  C8   C7   C6   102.01  3.000
 87E  P2   O7   P1   133.13  3.000
 87E  H11  C8   C9   106.90  3.000
 87E  H11  C8   C7   109.28  3.000
 87E  C9   C8   C7   115.34  3.000
 87E  H11  C8   O3   108.57  3.000
 87E  C7   C8   O3   106.09  3.000
 87E  C9   C8   O3   110.53  3.000
 87E  H13  C9   H12  107.18  3.000
 87E  H13  C9   C8   108.82  3.000
 87E  H12  C9   C8   107.63  3.000
 87E  H13  C9   O6   112.09  3.000
 87E  H12  C9   O6   110.64  3.000
 87E  C8   C9   O6   110.32  3.000
 87E  H15  C10  C14  109.39  3.000
 87E  H15  C10  O13  106.18  3.000
 87E  C14  C10  O13  110.81  3.000
 87E  H15  C10  O12  111.09  3.000
 87E  O13  C10  O12  110.30  3.000
 87E  C14  C10  O12  109.05  3.000
 87E  H17  C11  C15  106.08  3.000
 87E  H17  C11  O13  110.55  3.000
 87E  C15  C11  O13  108.06  3.000
 87E  H17  C11  C12  108.27  3.000
 87E  C15  C11  C12  113.80  3.000
 87E  O13  C11  C12  110.01  3.000
 87E  H18  C12  O15  111.55  3.000
 87E  H18  C12  C13  107.98  3.000
 87E  O15  C12  C13  108.19  3.000
 87E  H18  C12  C11  109.04  3.000
 87E  O15  C12  C11  110.76  3.000
 87E  C13  C12  C11  109.25  3.000
 87E  C10  O12  P2   123.68  3.000
 87E  H19  C13  O14  110.47  3.000
 87E  H19  C13  C14  109.57  3.000
 87E  O14  C13  C14  109.75  3.000
 87E  H19  C13  C12  108.10  3.000
 87E  C14  C13  C12  110.05  3.000
 87E  O14  C13  C12  108.88  3.000
 87E  C11  O13  C10  115.07  3.000
 87E  H20  C14  C13  107.86  3.000
 87E  H20  C14  C10  107.51  3.000
 87E  C13  C14  C10  112.00  3.000
 87E  H20  C14  N3   108.36  3.000
 87E  C10  C14  N3   110.69  3.000
 87E  C13  C14  N3   110.27  3.000
 87E  C16  O14  C13  117.80  3.000
 87E  H22  C15  H21  106.38  3.000
 87E  H22  C15  O16  112.04  3.000
 87E  H21  C15  O16  111.92  3.000
 87E  H22  C15  C11  107.93  3.000
 87E  H21  C15  C11  108.13  3.000
 87E  O16  C15  C11  110.23  3.000
 87E  H23  O15  C12  108.84  3.000
 87E  H24  C16  C18  108.59  3.000
 87E  H24  C16  C17  105.97  3.000
 87E  C18  C16  C17  110.51  3.000
 87E  H24  C16  O14  110.61  3.000
 87E  C18  C16  O14  110.34  3.000
 87E  C17  C16  O14  110.71  3.000
 87E  H25  O16  C15  108.21  3.000
 87E  O17  C17  C16  119.53  3.000
 87E  C16  C17  N4   116.10  3.000
 87E  O17  C17  N4   124.37  3.000
 87E  H28  C18  H27  108.42  3.000
 87E  H28  C18  H26  108.17  3.000
 87E  H27  C18  H26  108.02  3.000
 87E  H28  C18  C16  110.98  3.000
 87E  H27  C18  C16  111.12  3.000
 87E  H26  C18  C16  110.02  3.000
 87E  H32  C20  H31  107.73  3.000
 87E  H32  C20  H30  108.98  3.000
 87E  H31  C20  H30  108.08  3.000
 87E  H32  C20  C19  112.13  3.000
 87E  H31  C20  C19  109.60  3.000
 87E  H30  C20  C19  110.20  3.000
 87E  H33  C21  C23  109.22  3.000
 87E  H33  C21  C22  110.18  3.000
 87E  C23  C21  C22  110.60  3.000
 87E  H33  C21  N4   109.13  3.000
 87E  C23  C21  N4   109.23  3.000
 87E  C22  C21  N4   108.46  3.000
 87E  C21  C22  O20  117.09  3.000
 87E  C21  C22  O19  115.09  3.000
 87E  O20  C22  O19  127.82  3.000
 87E  H36  C23  H35  107.17  3.000
 87E  H36  C23  O21  111.77  3.000
 87E  H35  C23  O21  111.45  3.000
 87E  H36  C23  C21  108.30  3.000
 87E  H35  C23  C21  108.87  3.000
 87E  O21  C23  C21  109.19  3.000
 87E  H9   O5   C7   107.91  3.000
 87E  C9   O6   P1   120.54  3.000
 87E  C20  C19  O18  122.66  3.000
 87E  O18  C19  N3   122.97  3.000
 87E  C20  C19  N3   114.31  3.000
 87E  H34  O21  C23  108.01  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 87E  CONST_01  C3   N2   C2   N1      0.00   0.0  0
 87E  CONST_02  C5   N2   C2   N1    180.00   0.0  0
 87E  CONST_03  N2   C2   N1   C1      0.00   0.0  0
 87E  CONST_04  C1   N1   C2   O2    180.00   0.0  0
 87E  CONST_05  C3   N2   C2   O2    180.00   0.0  0
 87E  CONST_06  C5   N2   C2   O2      0.00   0.0  0
 87E  CONST_07  H1   N1   C2   N2    180.00   0.0  0
 87E  CONST_08  H1   N1   C2   O2      0.00   0.0  0
 87E  CONST_09  C20  C19  N3   C14   180.00   0.0  0
 87E  CONST_10  O18  C19  N3   C14     0.00   0.0  0
 87E  CONST_11  C21  N4   C17  C16   180.00   0.0  0
 87E  CONST_12  C21  N4   C17  O17     0.00   0.0  0
 87E  CONST_13  H8   N4   C17  C16     0.00   0.0  0
 87E  CONST_14  H8   N4   C17  O17   180.00   0.0  0
 87E  CONST_15  H2   N3   C19  O18   180.00   0.0  0
 87E  CONST_16  H2   N3   C19  C20     0.00   0.0  0
 87E  Var_01    C3   C4   C1   N1      1.13  30.0  1
 87E  Var_02    C4   C1   N1   C2     -1.23  30.0  1
 87E  Var_03    C4   C3   N2   C2     -0.73  30.0  1
 87E  Var_04    C5   N2   C3   C4    179.84  30.0  1
 87E  Var_05    N2   C3   C4   C1     -0.25  30.0  1
 87E  Var_06    O1   C1   N1   C2    178.85  30.0  1
 87E  Var_07    C3   C4   C1   O1   -178.96  30.0  1
 87E  Var_08    H3   C4   C1   N1   -178.19  30.0  1
 87E  Var_09    H7   C3   N2   C2    178.76  30.0  1
 87E  Var_10    H1   N1   C1   C4    179.64  30.0  1
 87E  Var_11    H7   C3   N2   C5     -0.66  30.0  1
 87E  Var_12    H7   C3   C4   C1   -179.72  30.0  1
 87E  Var_13    H3   C4   C3   N2    179.06  30.0  1
 87E  Var_14    H3   C4   C1   O1      1.72  30.0  1
 87E  Var_15    H1   N1   C1   O1     -0.28  30.0  1
 87E  Var_16    C8   C9   O6   P1    160.05  30.0  3
 87E  Var_17    C10  O12  P2   O7   -103.07  30.0  2
 87E  Var_18    O11  P2   O12  C10   147.27  30.0  3
 87E  Var_19    O10  P2   O12  C10    14.25  30.0  3
 87E  Var_20    O12  P2   O7   P1     75.54  30.0  1
 87E  Var_21    O11  P2   O7   P1   -175.04  30.0  1
 87E  Var_22    O10  P2   O7   P1    -41.16  30.0  1
 87E  Var_23    O8   P1   O7   P2    -12.30  30.0  3
 87E  Var_24    O6   P1   O7   P2    103.22  30.0  3
 87E  Var_25    O9   P1   O7   P2   -147.33  30.0  3
 87E  Var_26    C9   O6   P1   O7    -84.22  30.0  3
 87E  Var_27    C9   O6   P1   O8     32.50  30.0  3
 87E  Var_28    O9   P1   O6   C9    165.84  30.0  2
 87E  Var_29    H30  C20  C19  N3    159.05  30.0  3
 87E  Var_30    H31  C20  C19  N3    -82.12  30.0  3
 87E  Var_31    H32  C20  C19  N3     37.47  30.0  3
 87E  Var_32    H12  C9   O6   P1    -80.96  30.0  3
 87E  Var_33    H13  C9   O6   P1     38.62  30.0  3
 87E  Var_34    H30  C20  C19  O18   -23.64  30.0  3
 87E  Var_35    H31  C20  C19  O18    95.19  30.0  3
 87E  Var_36    H32  C20  C19  O18  -145.22  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 87E  chir_01  C5   O3   N2   C6   negativ
 87E  chir_02  C6   O4   C5   C7   negativ
 87E  chir_05  C7   C8   C6   O5   positiv
 87E  chir_06  C8   O3   C7   C9   negativ
 87E  chir_07  C10  C14  O12  O13  negativ
 87E  chir_08  C11  O13  C15  C12  positiv
 87E  chir_09  C12  O15  C11  C13  positiv
 87E  chir_10  C13  O14  C14  C12  positiv
 87E  chir_11  C14  N3   C10  C13  negativ
 87E  chir_12  C16  O14  C17  C18  negativ
 87E  chir_13  C21  N4   C22  C23  positiv

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 87E  plan-1  N4   0.020
 87E  plan-1  C16  0.020
 87E  plan-1  C17  0.020
 87E  plan-1  O17  0.020
 87E  plan-1  C21  0.020
 87E  plan-1  H8   0.020
 87E  plan-2  N3   0.020
 87E  plan-2  C14  0.020
 87E  plan-2  O18  0.020
 87E  plan-2  C20  0.020
 87E  plan-2  C19  0.020
 87E  plan-2  H2   0.020
 87E  plan-3  N1   0.020
 87E  plan-3  C4   0.020
 87E  plan-3  C1   0.020
 87E  plan-3  O1   0.020
 87E  plan-4  N1   0.020
 87E  plan-4  C2   0.020
 87E  plan-4  O2   0.020
 87E  plan-4  C5   0.020
 87E  plan-4  C1   0.020
 87E  plan-4  N2   0.020
 87E  plan-4  C3   0.020
 87E  plan-4  H1   0.020
 87E  plan-5  C21  0.020
 87E  plan-5  C22  0.020
 87E  plan-5  O19  0.020
 87E  plan-5  O20  0.020

