# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Mon Apr 13 19:26:39 2020
#   Inital geometry file: a 123 line input string
#   Ligand name: 6-(4-{[4-(propan-2-yl)phenyl]acetyl}piperazin-1-yl)pyridazine-3-carbonitrile
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)c1ccc(CC(=O)N2CCN(CC2)c3ccc(nn3)C#N)cc1
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 7DQ  7DQ  6-(4-{[4-(propan-2-yl)phenyl]acetyl}piperazin-1-yl)pyridazine-3-carbonitrile  ligand  49  26  .  2022-07-23  2022-07-26
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as OK (reasonable std)
;

data_comp_7DQ
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 7DQ  C17  C  CR6   0   0.131  -6.7903   0.2022  -0.1115
 7DQ  C20  C  CR16  0  -0.202  -6.3292  -0.6659   0.8855
 7DQ  C21  C  CR16  0  -0.308  -4.9858  -0.8728   0.9693
 7DQ  C22  C  CH2   0  -0.302  -1.9776   0.4725  -0.8586
 7DQ  C26  C  CR16  0  -0.320   5.0749   1.5217   0.6082
 7DQ  C01  C  CH3   0  -0.645   7.9342  -0.4580   1.5461
 7DQ  C03  C  CH3   0  -0.642   8.4031   0.9482  -0.4885
 7DQ  C04  C  CR6   0   0.160   6.0362   0.5783   0.2625
 7DQ  C05  C  CR16  0  -0.302   5.6305  -0.5084  -0.5136
 7DQ  C06  C  CR16  0  -0.278   4.3143  -0.6430  -0.9238
 7DQ  C07  C  CR6   0   0.159   3.3547   0.3038  -0.5740
 7DQ  C08  C  CH2   0  -0.720   1.9307   0.1529  -1.0174
 7DQ  C11  C  CH2   0  -0.314  -0.9691  -1.9228   0.3312
 7DQ  C12  C  CH2   0  -0.305  -2.0686  -1.1071   0.9960
 7DQ  C14  C  CR6   0   0.560  -4.1535  -0.2023   0.0392
 7DQ  C18  C  CSP   0   0.075  -8.1803   0.4823  -0.2778
 7DQ  C23  C  CH2   0  -0.330  -0.8822  -0.3682  -1.4970
 7DQ  C25  C  CR16  0  -0.297   3.7537   1.3870   0.1970
 7DQ  N10  N  NT    0  -0.461  -0.1256  -1.0729  -0.4830
 7DQ  N13  N  NT    0  -0.507  -2.8145  -0.3486   0.0053
 7DQ  N15  N  N     0  -0.343  -4.6910   0.6282  -0.8765
 7DQ  N16  N  N     0  -0.235  -5.9705   0.8165  -0.9484
 7DQ  N19  N  NS    0  -0.247  -9.3044   0.7012  -0.4026
 7DQ  O24  O  O     0  -0.482   1.6946  -1.3736   0.8115
 7DQ  H1   H  HCR6  0   0.303  -7.0153  -1.1489   1.5672
 7DQ  H2   H  HCR6  0   0.301  -4.5950  -1.5283   1.7314
 7DQ  H3   H  HCH2  0   0.249  -1.5290   1.2791  -0.2671
 7DQ  H4   H  HCH2  0   0.290  -2.5839   0.9253  -1.6356
 7DQ  H5   H  HCR6  0   0.244   5.3599   2.3786   1.2084
 7DQ  H6   H  HCH3  0   0.230   8.9428  -0.2909   1.9278
 7DQ  H7   H  HCH3  0   0.231   7.2769  -0.6226   2.4006
 7DQ  H8   H  HCH3  0   0.218   7.9553  -1.3774   0.9576
 7DQ  H9   H  HCH1  0   0.238   7.5254   1.6251   1.3361
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 7DQ  H11  H  HCH3  0   0.228   9.4301   1.1010  -0.1526
 7DQ  H12  H  HCH3  0   0.219   8.3982   0.0835  -1.1548
 7DQ  H13  H  HCR6  0   0.242   6.3502  -1.2652  -0.8039
 7DQ  H14  H  HCR6  0   0.242   4.0300  -1.4971  -1.5279
 7DQ  H15  H  HCH2  0   0.292   1.4299   1.1250  -0.9992
 7DQ  H16  H  HCH2  0   0.294   1.8922  -0.1849  -2.0571
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 7DQ  H18  H  HCH2  0   0.257  -1.4176  -2.6921  -0.3036
 7DQ  H19  H  HCH2  0   0.277  -2.7168  -1.7924   1.5327
 7DQ  H20  H  HCH2  0   0.257  -1.6279  -0.4237   1.7297
 7DQ  H21  H  HCH2  0   0.262  -1.3325  -1.0972  -2.1766
 7DQ  H22  H  HCH2  0   0.288  -0.2425   0.2754  -2.0929
 7DQ  H23  H  HCR6  0   0.243   3.0268   2.1396   0.4808
 7DQ  C09  C  C     0   0.571   1.1609  -0.8272  -0.1409
 7DQ  C02  C  CH1   0  -0.327   7.4726   0.7321   0.7055

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 7DQ  N19  C18  triple    1.152  0.020  1.152
 7DQ  C18  C17  single    1.428  0.020  1.428
 7DQ  C17  C20  aromatic  1.400  0.020  1.400
 7DQ  C17  N16  aromatic  1.323  0.020  1.323
 7DQ  C20  C21  aromatic  1.362  0.020  1.362
 7DQ  N16  N15  aromatic  1.295  0.020  1.295
 7DQ  C21  C14  aromatic  1.417  0.020  1.417
 7DQ  N15  C14  aromatic  1.348  0.020  1.348
 7DQ  C14  N13  single    1.347  0.020  1.347
 7DQ  N13  C22  single    1.456  0.020  1.456
 7DQ  N13  C12  single    1.454  0.020  1.454
 7DQ  C22  C23  single    1.521  0.020  1.521
 7DQ  C12  C11  single    1.522  0.020  1.522
 7DQ  C23  N10  single    1.448  0.020  1.448
 7DQ  C11  N10  single    1.448  0.020  1.448
 7DQ  N10  C09  single    1.354  0.020  1.354
 7DQ  C09  C08  single    1.524  0.020  1.524
 7DQ  C09  O24  double    1.221  0.020  1.221
 7DQ  C08  C07  single    1.499  0.020  1.499
 7DQ  C06  C07  aromatic  1.393  0.020  1.393
 7DQ  C06  C05  aromatic  1.385  0.020  1.385
 7DQ  C07  C25  aromatic  1.388  0.020  1.388
 7DQ  C05  C04  aromatic  1.396  0.020  1.396
 7DQ  C25  C26  aromatic  1.390  0.020  1.390
 7DQ  C04  C26  aromatic  1.391  0.020  1.391
 7DQ  C04  C02  single    1.511  0.020  1.511
 7DQ  C01  C02  single    1.528  0.020  1.528
 7DQ  C02  C03  single    1.529  0.020  1.529
 7DQ  C20  H1   single    0.930  0.020  1.080
 7DQ  C21  H2   single    0.930  0.020  1.080
 7DQ  C22  H3   single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C22  H4   single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C26  H5   single    0.930  0.020  1.080
 7DQ  C01  H6   single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C01  H7   single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C01  H8   single    0.970  0.020  1.090
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 7DQ  C03  H12  single    0.970  0.020  1.090
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 7DQ  C06  H14  single    0.930  0.020  1.080
 7DQ  C08  H15  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C08  H16  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C11  H17  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C11  H18  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C12  H19  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C12  H20  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C23  H21  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C23  H22  single    0.970  0.020  1.090
 7DQ  C25  H23  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 7DQ  N16  C17  C18  116.01  3.000
 7DQ  N16  C17  C20  122.30  3.000
 7DQ  C18  C17  C20  121.69  3.000
 7DQ  H1   C20  C21  121.29  3.000
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 7DQ  H2   C21  C14  122.59  3.000
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 7DQ  H4   C22  H3   107.94  3.000
 7DQ  H4   C22  N13  109.82  3.000
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 7DQ  H4   C22  C23  109.43  3.000
 7DQ  H3   C22  C23  109.78  3.000
 7DQ  N13  C22  C23  110.56  3.000
 7DQ  H5   C26  C25  119.35  3.000
 7DQ  H5   C26  C04  119.47  3.000
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 7DQ  H8   C01  H7   107.88  3.000
 7DQ  H8   C01  H6   107.43  3.000
 7DQ  H7   C01  H6   107.83  3.000
 7DQ  H8   C01  C02  111.41  3.000
 7DQ  H7   C01  C02  111.50  3.000
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 7DQ  H12  C03  C02  111.22  3.000
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 7DQ  H10  C03  C02  111.39  3.000
 7DQ  C05  C04  C02  121.24  3.000
 7DQ  C02  C04  C26  121.01  3.000
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 7DQ  H13  C05  C06  118.93  3.000
 7DQ  H13  C05  C04  119.97  3.000
 7DQ  C06  C05  C04  121.10  3.000
 7DQ  H14  C06  C07  119.66  3.000
 7DQ  H14  C06  C05  119.39  3.000
 7DQ  C07  C06  C05  120.95  3.000
 7DQ  C25  C07  C08  121.05  3.000
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 7DQ  H18  C11  N10  108.99  3.000
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 7DQ  N13  C12  C11  110.65  3.000
 7DQ  N15  C14  N13  116.49  3.000
 7DQ  N13  C14  C21  123.29  3.000
 7DQ  N15  C14  C21  120.22  3.000
 7DQ  N19  C18  C17  180.00  3.000
 7DQ  H22  C23  H21  107.25  3.000
 7DQ  H22  C23  N10  111.41  3.000
 7DQ  H21  C23  N10  109.02  3.000
 7DQ  H22  C23  C22  109.09  3.000
 7DQ  H21  C23  C22  109.43  3.000
 7DQ  N10  C23  C22  110.57  3.000
 7DQ  H23  C25  C07  119.63  3.000
 7DQ  H23  C25  C26  119.51  3.000
 7DQ  C07  C25  C26  120.86  3.000
 7DQ  C23  N10  C11  112.03  3.000
 7DQ  C11  N10  C09  121.20  3.000
 7DQ  C23  N10  C09  125.81  3.000
 7DQ  C14  N13  C12  123.33  3.000
 7DQ  C12  N13  C22  113.80  3.000
 7DQ  C14  N13  C22  121.65  3.000
 7DQ  N16  N15  C14  121.41  3.000
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 7DQ  O24  C09  N10  122.10  3.000
 7DQ  O24  C09  C08  121.05  3.000
 7DQ  N10  C09  C08  116.84  3.000
 7DQ  H9   C02  C04  107.32  3.000
 7DQ  H9   C02  C03  107.77  3.000
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 7DQ  H9   C02  C01  107.69  3.000
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 7DQ  C04  C02  C01  111.66  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 7DQ  CONST_01  C14  C21  C20  C17     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_02  C14  N15  N16  C17     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_03  N15  N16  C17  C20     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_04  N15  C14  C21  C20     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_05  N16  C17  C20  C21     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_06  N16  N15  C14  C21     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_07  C06  C07  C25  C26     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_08  C06  C05  C04  C26     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_09  C07  C06  C05  C04     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_10  C07  C25  C26  C04     0.00   0.0  0
 7DQ  CONST_11  C25  C07  C06  C05     0.00   0.0  0
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 7DQ  CONST_20  N15  N16  C17  C18   180.00   0.0  0
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 7DQ  CONST_30  O24  C09  N10  C23   180.00   0.0  0
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 7DQ  Var_05    C23  N10  C11  C12   -57.64  30.0  1
 7DQ  Var_06    N13  C22  C23  N10   -54.20  30.0  1
 7DQ  Var_07    N13  C12  C11  N10    54.01  30.0  1
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 7DQ  Var_09    C09  C08  C07  C06    80.14  30.0  2
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 7DQ  Var_11    H6   C01  C02  C04  -175.16  30.0  3
 7DQ  Var_12    H10  C03  C02  C04    57.55  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 7DQ  plan-1  C17  0.020
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