# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 10 02:36:48 2020
#   Inital geometry file: a 88 line input string
#   Ligand name: 5-(2,4-dihydroxyphenyl)-4-(2-fluorophenyl)-2,4-dihydro-3H-1,2,4-triazol-3-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Oc1ccc(c(O)c1)C2=NNC(=O)N2c3ccccc3F
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 6G7  6G7  5-(2,4-dihydroxyphenyl)-4-(2-fluorophenyl)-2,4-dihydro-3H-1,2,4-triazol-3-one  ligand  31  21  .  2021-08-05  2021-08-05  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_6G7
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 6G7  C1   C  CR6   0   0.384  -3.6461   1.0927   0.0197
 6G7  C2   C  CR16  0  -0.477  -3.6275  -0.2036  -0.4752
 6G7  C3   C  CR6   0   0.363  -2.4867  -0.9910  -0.3541
 6G7  C9   C  CR5   0   0.546  -0.1227  -1.2715   0.3077
 6G7  C12  C  CR5   0   0.650   2.0186  -1.9363   0.3866
 6G7  C14  C  CR6   0   0.075   1.6682   0.4902   0.2983
 6G7  C15  C  CR6   0   0.564   1.5423   1.1782  -0.8996
 6G7  C16  C  CR16  0  -0.414   2.0167   2.4649  -1.0478
 6G7  C19  C  CR16  0  -0.245   2.3112   1.0994   1.3658
 6G7  C4   C  CR6   0  -0.128  -1.3242  -0.4581   0.2407
 6G7  C5   C  CR16  0  -0.268  -1.3844   0.8409   0.7565
 6G7  C6   C  CR16  0  -0.354  -2.5176   1.6162   0.6562
 6G7  O7   O  OH1   0  -0.622  -4.7279   1.8791  -0.0728
 6G7  O8   O  OH1   0  -0.627  -2.5597  -2.2371  -0.8309
 6G7  N10  N  N     0  -0.357  -0.1447  -2.5653   0.2534
 6G7  N11  N  NR15  0  -0.502   1.1471  -2.9650   0.2948
 6G7  N13  N  NR5   0  -0.658   1.1746  -0.8260   0.4006
 6G7  C17  C  CR16  0  -0.229   2.6544   3.0661   0.0287
 6G7  C18  C  CR16  0  -0.272   2.8070   2.3871   1.2307
 6G7  O20  O  O     0  -0.486   3.2314  -1.9375   0.4377
 6G7  F21  F  F     0  -0.294   0.9339   0.5701  -1.9216
 6G7  H1   H  HCR6  0   0.283  -4.5064  -0.6288  -0.9464
 6G7  H2   H  HCR6  0   0.292   1.8968   2.9822  -1.9904
 6G7  H3   H  HCR6  0   0.287   2.4077   0.5644   2.3012
 6G7  H4   H  HCR6  0   0.275  -0.5286   1.2588   1.2675
 6G7  H5   H  HCR6  0   0.269  -2.5376   2.6158   1.0689
 6G7  H6   H  HOH1  0   0.480  -5.4410   1.4280  -0.5397
 6G7  H7   H  HOH1  0   0.479  -1.7572  -2.7385  -0.5865
 6G7  H8   H  HNR5  0   0.434   1.3801  -3.9448   0.2726
 6G7  H9   H  HCR6  0   0.279   3.0340   4.0731  -0.0783
 6G7  H10  H  HCR6  0   0.274   3.3077   2.8603   2.0637

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 6G7  O7   C1   single    1.341  0.020  1.341
 6G7  C1   C2   aromatic  1.388  0.020  1.388
 6G7  C1   C6   aromatic  1.397  0.020  1.397
 6G7  C18  C17  aromatic  1.389  0.020  1.389
 6G7  C18  C19  aromatic  1.386  0.020  1.386
 6G7  C2   C3   aromatic  1.391  0.020  1.391
 6G7  C6   C5   aromatic  1.377  0.020  1.377
 6G7  C17  C16  aromatic  1.388  0.020  1.388
 6G7  C19  C14  aromatic  1.387  0.020  1.387
 6G7  C3   O8   single    1.336  0.020  1.336
 6G7  C3   C4   aromatic  1.410  0.020  1.410
 6G7  C5   C4   aromatic  1.399  0.020  1.399
 6G7  C16  C15  aromatic  1.379  0.020  1.379
 6G7  C4   C9   single    1.452  0.020  1.452
 6G7  C14  C15  aromatic  1.387  0.020  1.387
 6G7  C14  N13  single    1.409  0.020  1.409
 6G7  C15  F21  single    1.336  0.020  1.336
 6G7  C9   N13  single    1.375  0.020  1.375
 6G7  C9   N10  double    1.295  0.020  1.295
 6G7  N13  C12  single    1.395  0.020  1.395
 6G7  N10  N11  single    1.353  0.020  1.353
 6G7  C12  O20  double    1.214  0.020  1.214
 6G7  C12  N11  single    1.351  0.020  1.351
 6G7  C2   H1   single    0.930  0.020  1.080
 6G7  C16  H2   single    0.930  0.020  1.080
 6G7  C19  H3   single    0.930  0.020  1.080
 6G7  C5   H4   single    0.930  0.020  1.080
 6G7  C6   H5   single    0.930  0.020  1.080
 6G7  O7   H6   single    0.850  0.020  0.980
 6G7  O8   H7   single    0.850  0.020  0.980
 6G7  N11  H8   single    0.860  0.020  1.020
 6G7  C17  H9   single    0.930  0.020  1.080
 6G7  C18  H10  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 6G7  O7   C1   C6   117.60  3.000
 6G7  C6   C1   C2   120.10  3.000
 6G7  O7   C1   C2   122.29  3.000
 6G7  H1   C2   C3   118.73  3.000
 6G7  H1   C2   C1   120.69  3.000
 6G7  C3   C2   C1   120.57  3.000
 6G7  O8   C3   C4   123.22  3.000
 6G7  C4   C3   C2   119.91  3.000
 6G7  O8   C3   C2   116.86  3.000
 6G7  N13  C9   N10  110.03  3.000
 6G7  N10  C9   C4   122.92  3.000
 6G7  N13  C9   C4   127.03  3.000
 6G7  O20  C12  N13  127.22  3.000
 6G7  O20  C12  N11  130.27  3.000
 6G7  N13  C12  N11  102.50  3.000
 6G7  N13  C14  C19  121.11  3.000
 6G7  N13  C14  C15  119.61  3.000
 6G7  C19  C14  C15  119.26  3.000
 6G7  F21  C15  C16  119.94  3.000
 6G7  F21  C15  C14  118.44  3.000
 6G7  C16  C15  C14  121.62  3.000
 6G7  H2   C16  C17  121.29  3.000
 6G7  H2   C16  C15  120.10  3.000
 6G7  C17  C16  C15  118.60  3.000
 6G7  H3   C19  C18  120.78  3.000
 6G7  H3   C19  C14  119.30  3.000
 6G7  C18  C19  C14  119.91  3.000
 6G7  C5   C4   C9   122.59  3.000
 6G7  C9   C4   C3   119.32  3.000
 6G7  C5   C4   C3   118.09  3.000
 6G7  H4   C5   C6   117.93  3.000
 6G7  H4   C5   C4   119.95  3.000
 6G7  C6   C5   C4   122.11  3.000
 6G7  H5   C6   C5   120.53  3.000
 6G7  H5   C6   C1   120.33  3.000
 6G7  C5   C6   C1   119.14  3.000
 6G7  H6   O7   C1   110.83  3.000
 6G7  H7   O8   C3   110.14  3.000
 6G7  N11  N10  C9   106.12  3.000
 6G7  H8   N11  N10  120.50  3.000
 6G7  H8   N11  C12  126.36  3.000
 6G7  N10  N11  C12  113.14  3.000
 6G7  C14  N13  C12  122.06  3.000
 6G7  C12  N13  C9   108.20  3.000
 6G7  C14  N13  C9   128.92  3.000
 6G7  H9   C17  C18  120.15  3.000
 6G7  H9   C17  C16  119.20  3.000
 6G7  C18  C17  C16  120.65  3.000
 6G7  H10  C18  C17  120.25  3.000
 6G7  H10  C18  C19  119.81  3.000
 6G7  C17  C18  C19  119.94  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 6G7  CONST_01  C4   C3   C2   C1     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_02  C4   C5   C6   C1     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_03  C5   C6   C1   C2     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_04  C5   C4   C3   C2     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_05  C6   C1   C2   C3     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_06  C6   C5   C4   C3     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_07  C17  C18  C19  C14    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_08  C17  C16  C15  C14    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_09  C18  C17  C16  C15    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_10  C18  C19  C14  C15    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_11  C19  C18  C17  C16    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_12  C19  C14  C15  C16    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_13  C9   C4   C3   C2   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_14  C6   C5   C4   C9   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_15  N13  C14  C15  C16  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_16  C18  C19  C14  N13  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_17  N11  C12  N13  C9     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_18  C12  N11  N10  C9     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_19  C4   C9   N13  C12  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_20  N10  C9   N13  C12    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_21  C4   C9   N13  C14    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_22  N10  C9   N13  C14  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_23  N11  C12  N13  C14  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_24  N11  N10  C9   C4   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_25  N13  C12  N11  N10    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_26  N13  C9   N10  N11    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_27  O8   C3   C2   C1   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_28  O7   C1   C2   C3   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_29  O8   C3   C4   C9     0.00   0.0  0
 6G7  CONST_30  F21  C15  C14  C19  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_31  O7   C1   C6   C5   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_32  O8   C3   C4   C5   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_33  F21  C15  C14  N13    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_34  F21  C15  C16  C17  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_35  O20  C12  N13  C9   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_36  O20  C12  N13  C14    0.00   0.0  0
 6G7  CONST_37  O20  C12  N11  N10  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_38  H4   C5   C6   C1   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_39  H5   C6   C1   C2   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_40  H10  C18  C19  C14  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_41  H2   C16  C15  C14  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_42  H9   C17  C16  C15  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_43  H3   C19  C14  C15  180.00   0.0  0
 6G7  CONST_44  H1   C2   C3   C4   180.00   0.0  0
 6G7  CONST_45  H8   N11  N10  C9   180.00   0.0  0
 6G7  Var_01    N13  C9   C4   C3   155.58  30.0  2
 6G7  Var_02    C19  C14  N13  C9   117.46  30.0  2

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 6G7  plan-1  C9   0.020
 6G7  plan-1  C12  0.020
 6G7  plan-1  C14  0.020
 6G7  plan-1  C4   0.020
 6G7  plan-1  N10  0.020
 6G7  plan-1  N11  0.020
 6G7  plan-1  N13  0.020
 6G7  plan-1  O20  0.020
 6G7  plan-1  H8   0.020
 6G7  plan-2  C1   0.020
 6G7  plan-2  C2   0.020
 6G7  plan-2  C3   0.020
 6G7  plan-2  C9   0.020
 6G7  plan-2  C4   0.020
 6G7  plan-2  C5   0.020
 6G7  plan-2  C6   0.020
 6G7  plan-2  O7   0.020
 6G7  plan-2  O8   0.020
 6G7  plan-2  H1   0.020
 6G7  plan-2  H4   0.020
 6G7  plan-2  H5   0.020
 6G7  plan-3  C14  0.020
 6G7  plan-3  C15  0.020
 6G7  plan-3  C16  0.020
 6G7  plan-3  C19  0.020
 6G7  plan-3  N13  0.020
 6G7  plan-3  C17  0.020
 6G7  plan-3  C18  0.020
 6G7  plan-3  F21  0.020
 6G7  plan-3  H2   0.020
 6G7  plan-3  H3   0.020
 6G7  plan-3  H9   0.020
 6G7  plan-3  H10  0.020

