# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Fri Apr 10 00:35:45 2020
#   Inital geometry file: a 125 line input string
#   Ligand name: cyclohexyl{4-[(isoquinolin-5-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl}methanone
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O=C(C1CCCCC1)N2CCN(CC2)[S](=O)(=O)c3cccc4cnccc34
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 6G1  6G1  cyclohexyl{4-[(isoquinolin-5-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl}methanone  ligand  52  27  .  2021-08-05  2021-08-05  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_6G1
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 6G1  C10  C  CH2   0  -0.330   1.8121   0.4998   0.5125
 6G1  N12  N  N     0  -0.614  -0.2372  -0.6105  -0.1829
 6G1  C13  C  CH2   0  -0.291   0.3051  -0.8493  -1.5216
 6G1  C20  C  CR16  0  -0.400  -4.8701  -1.0481   0.4767
 6G1  C21  C  CR16  0  -0.072  -6.2315  -1.0339   0.6015
 6G1  C24  C  CR66  0  -0.013  -4.9984   1.2896  -0.0846
 6G1  C26  C  CR16  0  -0.252  -3.0608   2.6330  -0.5674
 6G1  O01  O  O     0  -0.496   4.0319  -0.3398  -2.2085
 6G1  C03  C  CH1   0  -0.414   4.6847  -0.0309   0.0687
 6G1  C04  C  CH2   0  -0.404   5.9174  -0.8771  -0.2465
 6G1  C05  C  CH2   0  -0.438   6.9344  -0.8032   0.8876
 6G1  C06  C  CH2   0  -0.429   7.3433   0.6372   1.1745
 6G1  C07  C  CH2   0  -0.431   6.1244   1.5046   1.4672
 6G1  C08  C  CH2   0  -0.426   5.0923   1.4255   0.3467
 6G1  N09  N  NT    0  -0.469   2.3799   0.2071  -0.7862
 6G1  C11  C  CH2   0  -0.272   0.7584  -0.5300   0.8847
 6G1  C14  C  CH2   0  -0.322   1.3712   0.1891  -1.8259
 6G1  S15  S  S     0   1.410  -1.7493  -1.1396   0.1616
 6G1  O16  O  OS    0  -0.649  -2.1631  -2.1094  -0.8426
 6G1  O17  O  OS    0  -0.649  -1.8052  -1.5189   1.5656
 6G1  C18  C  CR6   0  -0.235  -2.7897   0.2892  -0.0500
 6G1  C19  C  CR66  0   0.265  -4.1959   0.1413   0.1172
 6G1  N22  N  N     0  -0.401  -7.0011   0.0564   0.3998
 6G1  C23  C  CR16  0  -0.077  -6.3987   1.1650   0.0722
 6G1  C25  C  CR16  0  -0.282  -4.4144   2.5274  -0.4310
 6G1  C27  C  CR16  0  -0.222  -2.2445   1.5018  -0.3727
 6G1  H1   H  HCH2  0   0.283   2.5673   0.5122   1.2913
 6G1  H2   H  HCH2  0   0.261   1.3595   1.4964   0.4874
 6G1  H3   H  HCH2  0   0.260   0.7329  -1.8544  -1.5873
 6G1  H4   H  HCH2  0   0.279  -0.4835  -0.7670  -2.2672
 6G1  H5   H  HCR6  0   0.272  -4.3483  -1.9742   0.6646
 6G1  H6   H  HCR6  0   0.275  -6.7548  -1.9404   0.8803
 6G1  H7   H  HCR6  0   0.281  -2.6017   3.5759  -0.8287
 6G1  H8   H  HCH1  0   0.250   4.2397  -0.4402   0.9818
 6G1  H9   H  HCH2  0   0.233   5.6232  -1.9151  -0.4191
 6G1  H10  H  HCH2  0   0.218   6.3796  -0.5239  -1.1718
 6G1  H11  H  HCH2  0   0.211   6.5073  -1.2472   1.7937
 6G1  H12  H  HCH2  0   0.230   7.8117  -1.4029   0.6334
 6G1  H13  H  HCH2  0   0.229   8.0425   0.6755   2.0131
 6G1  H14  H  HCH2  0   0.210   7.8752   1.0420   0.3067
 6G1  H15  H  HCH2  0   0.214   5.6630   1.1776   2.4054
 6G1  H16  H  HCH2  0   0.233   6.4245   2.5444   1.6161
 6G1  H17  H  HCH2  0   0.228   5.5102   1.8554  -0.5698
 6G1  H18  H  HCH2  0   0.243   4.2209   2.0328   0.6059
 6G1  H19  H  HCH2  0   0.253   1.2320  -1.5039   1.0449
 6G1  H20  H  HCH2  0   0.282   0.2877  -0.2221   1.8155
 6G1  H21  H  HCH2  0   0.283   1.8269  -0.0399  -2.7846
 6G1  H22  H  HCH2  0   0.254   0.9139   1.1810  -1.9007
 6G1  H23  H  HCR6  0   0.277  -7.0192   2.0421  -0.0874
 6G1  H24  H  HCR6  0   0.277  -5.0552   3.3867  -0.5845
 6G1  H25  H  HCR6  0   0.281  -1.1740   1.6046  -0.4830
 6G1  C02  C  C     0   0.597   3.6755  -0.0816  -1.0664

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 6G1  C07  C06  single    1.524  0.020  1.524
 6G1  C07  C08  single    1.525  0.020  1.525
 6G1  C06  C05  single    1.525  0.020  1.525
 6G1  C08  C03  single    1.538  0.020  1.538
 6G1  C05  C04  single    1.525  0.020  1.525
 6G1  C03  C04  single    1.528  0.020  1.528
 6G1  C03  C02  single    1.520  0.020  1.520
 6G1  C23  N22  aromatic  1.304  0.020  1.304
 6G1  C23  C24  aromatic  1.415  0.020  1.415
 6G1  N22  C21  aromatic  1.350  0.020  1.350
 6G1  O01  C02  double    1.224  0.020  1.224
 6G1  C02  N09  single    1.357  0.020  1.357
 6G1  C21  C20  aromatic  1.367  0.020  1.367
 6G1  C25  C24  aromatic  1.412  0.020  1.412
 6G1  C25  C26  aromatic  1.365  0.020  1.365
 6G1  C24  C19  aromatic  1.415  0.020  1.415
 6G1  N09  C14  single    1.449  0.020  1.449
 6G1  N09  C10  single    1.447  0.020  1.447
 6G1  C26  C27  aromatic  1.409  0.020  1.409
 6G1  C20  C19  aromatic  1.414  0.020  1.414
 6G1  C19  C18  aromatic  1.424  0.020  1.424
 6G1  C14  C13  single    1.519  0.020  1.519
 6G1  C10  C11  single    1.520  0.020  1.520
 6G1  C27  C18  aromatic  1.368  0.020  1.368
 6G1  C18  S15  single    1.780  0.020  1.780
 6G1  N12  C11  single    1.462  0.020  1.462
 6G1  N12  C13  single    1.464  0.020  1.464
 6G1  N12  S15  single    1.639  0.020  1.639
 6G1  S15  O16  double    1.456  0.020  1.456
 6G1  S15  O17  double    1.455  0.020  1.455
 6G1  C10  H1   single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C10  H2   single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C13  H3   single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C13  H4   single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C20  H5   single    0.930  0.020  1.080
 6G1  C21  H6   single    0.930  0.020  1.080
 6G1  C26  H7   single    0.930  0.020  1.080
 6G1  C03  H8   single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C04  H9   single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C04  H10  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C05  H11  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C05  H12  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C06  H13  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C06  H14  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C07  H15  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C07  H16  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C08  H17  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C08  H18  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C11  H19  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C11  H20  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C14  H21  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C14  H22  single    0.970  0.020  1.090
 6G1  C23  H23  single    0.930  0.020  1.080
 6G1  C25  H24  single    0.930  0.020  1.080
 6G1  C27  H25  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 6G1  H2   C10  H1   107.09  3.000
 6G1  H2   C10  C11  109.62  3.000
 6G1  H1   C10  C11  108.34  3.000
 6G1  H2   C10  N09  109.01  3.000
 6G1  H1   C10  N09  111.92  3.000
 6G1  C11  C10  N09  110.78  3.000
 6G1  S15  N12  C11  119.52  3.000
 6G1  S15  N12  C13  118.78  3.000
 6G1  C11  N12  C13  115.11  3.000
 6G1  H4   C13  H3   108.15  3.000
 6G1  H4   C13  C14  108.64  3.000
 6G1  H3   C13  C14  109.96  3.000
 6G1  H4   C13  N12  110.22  3.000
 6G1  H3   C13  N12  110.46  3.000
 6G1  C14  C13  N12  109.37  3.000
 6G1  H5   C20  C19  122.38  3.000
 6G1  H5   C20  C21  118.32  3.000
 6G1  C19  C20  C21  119.30  3.000
 6G1  H6   C21  N22  116.04  3.000
 6G1  H6   C21  C20  119.72  3.000
 6G1  N22  C21  C20  124.23  3.000
 6G1  C25  C24  C23  120.93  3.000
 6G1  C25  C24  C19  120.78  3.000
 6G1  C23  C24  C19  118.29  3.000
 6G1  H7   C26  C27  119.20  3.000
 6G1  H7   C26  C25  120.87  3.000
 6G1  C27  C26  C25  119.93  3.000
 6G1  H8   C03  C08  108.11  3.000
 6G1  H8   C03  C04  107.03  3.000
 6G1  C08  C03  C04  110.37  3.000
 6G1  H8   C03  C02  109.90  3.000
 6G1  C04  C03  C02  111.30  3.000
 6G1  C08  C03  C02  110.04  3.000
 6G1  H10  C04  H9   106.69  3.000
 6G1  H10  C04  C05  109.38  3.000
 6G1  H9   C04  C05  110.07  3.000
 6G1  H10  C04  C03  109.68  3.000
 6G1  H9   C04  C03  109.97  3.000
 6G1  C05  C04  C03  110.96  3.000
 6G1  H12  C05  H11  106.44  3.000
 6G1  H12  C05  C06  110.30  3.000
 6G1  H11  C05  C06  109.37  3.000
 6G1  H12  C05  C04  109.62  3.000
 6G1  H11  C05  C04  109.60  3.000
 6G1  C06  C05  C04  111.38  3.000
 6G1  H14  C06  H13  106.52  3.000
 6G1  H14  C06  C07  109.28  3.000
 6G1  H13  C06  C07  110.15  3.000
 6G1  H14  C06  C05  109.29  3.000
 6G1  H13  C06  C05  110.44  3.000
 6G1  C07  C06  C05  111.06  3.000
 6G1  H16  C07  H15  106.45  3.000
 6G1  H16  C07  C08  109.59  3.000
 6G1  H15  C07  C08  109.19  3.000
 6G1  H16  C07  C06  110.37  3.000
 6G1  H15  C07  C06  109.35  3.000
 6G1  C08  C07  C06  111.74  3.000
 6G1  H18  C08  H17  106.53  3.000
 6G1  H18  C08  C07  109.65  3.000
 6G1  H17  C08  C07  109.64  3.000
 6G1  H18  C08  C03  110.96  3.000
 6G1  H17  C08  C03  108.76  3.000
 6G1  C07  C08  C03  111.18  3.000
 6G1  C14  N09  C02  120.94  3.000
 6G1  C14  N09  C10  111.92  3.000
 6G1  C02  N09  C10  127.08  3.000
 6G1  H20  C11  H19  108.30  3.000
 6G1  H20  C11  N12  110.23  3.000
 6G1  H19  C11  N12  110.64  3.000
 6G1  H20  C11  C10  108.54  3.000
 6G1  H19  C11  C10  109.80  3.000
 6G1  N12  C11  C10  109.31  3.000
 6G1  H22  C14  H21  107.82  3.000
 6G1  H22  C14  N09  109.18  3.000
 6G1  H21  C14  N09  110.12  3.000
 6G1  H22  C14  C13  109.87  3.000
 6G1  H21  C14  C13  109.10  3.000
 6G1  N09  C14  C13  110.69  3.000
 6G1  C18  S15  O17  107.54  3.000
 6G1  O17  S15  O16  118.74  3.000
 6G1  C18  S15  O16  106.65  3.000
 6G1  O17  S15  N12  108.81  3.000
 6G1  O16  S15  N12  109.41  3.000
 6G1  C18  S15  N12  104.78  3.000
 6G1  C27  C18  C19  120.89  3.000
 6G1  C27  C18  S15  120.43  3.000
 6G1  C19  C18  S15  118.68  3.000
 6G1  C18  C19  C24  117.32  3.000
 6G1  C18  C19  C20  126.04  3.000
 6G1  C24  C19  C20  116.64  3.000
 6G1  C23  N22  C21  117.45  3.000
 6G1  H23  C23  N22  117.37  3.000
 6G1  H23  C23  C24  118.56  3.000
 6G1  N22  C23  C24  124.08  3.000
 6G1  H24  C25  C26  120.76  3.000
 6G1  H24  C25  C24  119.06  3.000
 6G1  C26  C25  C24  120.18  3.000
 6G1  H25  C27  C18  120.20  3.000
 6G1  H25  C27  C26  118.90  3.000
 6G1  C18  C27  C26  120.89  3.000
 6G1  N09  C02  C03  118.23  3.000
 6G1  N09  C02  O01  121.04  3.000
 6G1  C03  C02  O01  120.70  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 6G1  CONST_01  C23  N22  C21  C20    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_02  C23  C24  C19  C20    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_03  C25  C24  C19  C20  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_04  C27  C18  C19  C20  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_05  C24  C23  N22  C21    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_06  C24  C19  C20  C21    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_07  C18  C19  C20  C21  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_08  C27  C26  C25  C24    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_09  C27  C18  C19  C24    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_10  C23  C24  C25  C26  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_11  C19  C24  C25  C26    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_12  C19  C18  C27  C26    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_13  C23  C24  C19  C18  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_14  C25  C24  C19  C18    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_15  C25  C26  C27  C18    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_16  N22  C23  C24  C19    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_17  N22  C21  C20  C19    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_18  C25  C24  C23  N22  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_19  S15  C18  C19  C20    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_20  S15  C18  C19  C24  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_21  S15  C18  C27  C26  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_22  C03  C02  N09  C10    0.00   0.0  0
 6G1  CONST_23  C14  N09  C02  C03  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_24  H23  C23  N22  C21  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_25  H7   C26  C25  C24  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_26  H5   C20  C19  C24  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_27  H24  C25  C24  C19  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_28  H6   C21  C20  C19  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_29  H25  C27  C18  C19  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_30  O01  C02  N09  C10  180.00   0.0  0
 6G1  CONST_31  C14  N09  C02  O01    0.00   0.0  0
 6G1  Var_01    C13  C14  N09  C10  -58.85  30.0  1
 6G1  Var_02    C13  N12  C11  C10   53.30  30.0  1
 6G1  Var_03    N09  C10  C11  N12  -54.17  30.0  1
 6G1  Var_04    N09  C14  C13  N12   54.09  30.0  1
 6G1  Var_05    C06  C07  C08  C03   55.10  30.0  1
 6G1  Var_06    C06  C05  C04  C03  -56.80  30.0  1
 6G1  Var_07    C07  C06  C05  C04   55.37  30.0  1
 6G1  Var_08    C08  C07  C06  C05  -54.63  30.0  1
 6G1  Var_09    C14  N09  C10  C11   58.91  30.0  1
 6G1  Var_10    C14  C13  N12  C11  -53.33  30.0  1
 6G1  Var_11    C19  C18  S15  N12  177.04  30.0  1
 6G1  Var_12    C18  S15  N12  C13  -97.86  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 6G1  chir_01  C03  C08  C04  C02  positiv

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 6G1  plan-1  C10  0.020
 6G1  plan-1  O01  0.020
 6G1  plan-1  C03  0.020
 6G1  plan-1  N09  0.020
 6G1  plan-1  C14  0.020
 6G1  plan-1  C02  0.020
 6G1  plan-2  C20  0.020
 6G1  plan-2  C21  0.020
 6G1  plan-2  C24  0.020
 6G1  plan-2  C26  0.020
 6G1  plan-2  S15  0.020
 6G1  plan-2  C18  0.020
 6G1  plan-2  C19  0.020
 6G1  plan-2  N22  0.020
 6G1  plan-2  C23  0.020
 6G1  plan-2  C25  0.020
 6G1  plan-2  C27  0.020
 6G1  plan-2  H5   0.020
 6G1  plan-2  H6   0.020
 6G1  plan-2  H7   0.020
 6G1  plan-2  H23  0.020
 6G1  plan-2  H24  0.020
 6G1  plan-2  H25  0.020

