# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Mon Apr  6 21:09:49 2020
#   Inital geometry file: a 135 line input string
#   Ligand name: 4,4'-(2-{3-[(4-fluorophenyl)amino]phenyl}ethene-1,1-diyl)diphenol
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Oc1ccc(cc1)C(=Cc2cccc(Nc3ccc(F)cc3)c2)c4ccc(O)cc4
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 5ES  5ES  4,4'-(2-{3-[(4-fluorophenyl)amino]phenyl}ethene-1,1-diyl)diphenol  ligand  50  30  .  2021-08-04  2021-08-04  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_5ES
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 5ES  O01  O  OH1   0  -0.629   5.3978   4.5294  -0.0142
 5ES  C02  C  CR6   0   0.344   4.5479   3.4904   0.0896
 5ES  C03  C  CR16  0  -0.371   3.6832   3.3269   1.1688
 5ES  C04  C  CR16  0  -0.298   2.8373   2.2308   1.2203
 5ES  C05  C  CR16  0  -0.323   4.5525   2.5394  -0.9295
 5ES  C06  C  CR16  0  -0.286   3.7057   1.4483  -0.8614
 5ES  C07  C  CR6   0   0.053   2.8197   1.2721   0.2059
 5ES  C08  C  C     0   0.109   1.9034   0.1141   0.2476
 5ES  C09  C  CR6   0  -0.050   2.4077  -1.1479  -0.3376
 5ES  C10  C  CR16  0  -0.256   1.7052  -1.8084  -1.3419
 5ES  C11  C  CR16  0  -0.371   2.1763  -2.9885  -1.8940
 5ES  C12  C  CR6   0   0.344   3.3733  -3.5388  -1.4421
 5ES  O13  O  OH1   0  -0.631   3.8792  -4.6861  -1.9347
 5ES  C14  C  CR16  0  -0.325   4.0946  -2.8845  -0.4449
 5ES  C15  C  CR16  0  -0.265   3.6161  -1.7000   0.0873
 5ES  C16  C  C1    0  -0.343   0.6665   0.2450   0.7622
 5ES  C17  C  CR6   0   0.128  -0.3389  -0.7967   1.0006
 5ES  C18  C  CR16  0  -0.328  -0.0144  -2.1027   1.3772
 5ES  C19  C  CR16  0  -0.228  -1.0279  -3.0111   1.6369
 5ES  C20  C  CR16  0  -0.365  -2.3611  -2.6559   1.5106
 5ES  C21  C  CR6   0   0.383  -2.7071  -1.3507   1.1452
 5ES  N22  N  NH1   0  -0.804  -4.0494  -1.0195   1.0753
 5ES  C23  C  CR6   0   0.349  -4.6340   0.0709   0.4473
 5ES  C24  C  CR16  0  -0.308  -4.1222   0.6287  -0.7277
 5ES  C25  C  CR16  0  -0.402  -4.7554   1.7007  -1.3380
 5ES  C26  C  CR6   0   0.497  -5.9190   2.2007  -0.7886
 5ES  F27  F  F     0  -0.322  -6.5357   3.2389  -1.3847
 5ES  C28  C  CR16  0  -0.398  -6.4663   1.6562   0.3561
 5ES  C29  C  CR16  0  -0.328  -5.8155   0.6005   0.9744
 5ES  C30  C  CR16  0  -0.406  -1.6835  -0.4297   0.9149
 5ES  H1   H  HOH1  0   0.475   5.3204   5.1073   0.7532
 5ES  H2   H  HCR6  0   0.272   3.6777   4.0461   1.9801
 5ES  H3   H  HCR6  0   0.256   2.1946   2.1127   2.0838
 5ES  H4   H  HCR6  0   0.264   5.2226   2.6581  -1.7720
 5ES  H5   H  HCR6  0   0.254   3.7289   0.7252  -1.6667
 5ES  H6   H  HCR6  0   0.253   0.7727  -1.3934  -1.7030
 5ES  H7   H  HCR6  0   0.270   1.6110  -3.4780  -2.6789
 5ES  H8   H  HOH1  0   0.475   3.2979  -5.0473  -2.6133
 5ES  H9   H  HCR6  0   0.263   5.0289  -3.3048  -0.0937
 5ES  H10  H  HCR6  0   0.251   4.1915  -1.2025   0.8588
 5ES  H11  H  H     0   0.248   0.3443   1.2461   1.0330
 5ES  H12  H  HCR6  0   0.250   1.0180  -2.4033   1.4858
 5ES  H13  H  HCR6  0   0.254  -0.7766  -4.0193   1.9409
 5ES  H14  H  HCR6  0   0.260  -3.1393  -3.3850   1.7032
 5ES  H15  H  HNH1  0   0.398  -4.6686  -1.5920   1.6256
 5ES  H16  H  HCR6  0   0.285  -3.2327   0.2218  -1.1889
 5ES  H17  H  HCR6  0   0.279  -4.3495   2.1275  -2.2458
 5ES  H18  H  HCR6  0   0.279  -7.3816   2.0554   0.7733
 5ES  H19  H  HCR6  0   0.273  -6.2319   0.1808   1.8820
 5ES  H20  H  HCR6  0   0.269  -1.9230   0.5981   0.6733

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 5ES  O01  C02  single    1.346  0.020  1.346
 5ES  C02  C05  aromatic  1.394  0.020  1.394
 5ES  C02  C03  aromatic  1.393  0.020  1.393
 5ES  C05  C06  aromatic  1.383  0.020  1.383
 5ES  C03  C04  aromatic  1.385  0.020  1.385
 5ES  C06  C07  aromatic  1.398  0.020  1.398
 5ES  C04  C07  aromatic  1.396  0.020  1.396
 5ES  C07  C08  single    1.477  0.020  1.477
 5ES  F27  C26  single    1.347  0.020  1.347
 5ES  C08  C09  single    1.480  0.020  1.480
 5ES  C08  C16  double    1.346  0.020  1.346
 5ES  C09  C10  aromatic  1.392  0.020  1.392
 5ES  C09  C15  aromatic  1.395  0.020  1.395
 5ES  C10  C11  aromatic  1.385  0.020  1.385
 5ES  C15  C14  aromatic  1.384  0.020  1.384
 5ES  C11  C12  aromatic  1.393  0.020  1.393
 5ES  C14  C12  aromatic  1.394  0.020  1.394
 5ES  C12  O13  single    1.347  0.020  1.347
 5ES  C16  C17  single    1.467  0.020  1.467
 5ES  C26  C25  aromatic  1.380  0.020  1.380
 5ES  C26  C28  aromatic  1.381  0.020  1.381
 5ES  C25  C24  aromatic  1.387  0.020  1.387
 5ES  C28  C29  aromatic  1.386  0.020  1.386
 5ES  C17  C30  aromatic  1.396  0.020  1.396
 5ES  C17  C18  aromatic  1.397  0.020  1.397
 5ES  C24  C23  aromatic  1.398  0.020  1.398
 5ES  C30  C21  aromatic  1.396  0.020  1.396
 5ES  C29  C23  aromatic  1.398  0.020  1.398
 5ES  C23  N22  single    1.388  0.020  1.388
 5ES  C18  C19  aromatic  1.386  0.020  1.386
 5ES  C21  N22  single    1.384  0.020  1.384
 5ES  C21  C20  aromatic  1.399  0.020  1.399
 5ES  C19  C20  aromatic  1.385  0.020  1.385
 5ES  O01  H1   single    0.850  0.020  0.980
 5ES  C03  H2   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C04  H3   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C05  H4   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C06  H5   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C10  H6   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C11  H7   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  O13  H8   single    0.850  0.020  0.980
 5ES  C14  H9   single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C15  H10  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C16  H11  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C18  H12  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C19  H13  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C20  H14  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  N22  H15  single    0.860  0.020  1.020
 5ES  C24  H16  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C25  H17  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C28  H18  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C29  H19  single    0.930  0.020  1.080
 5ES  C30  H20  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 5ES  H1   O01  C02  110.53  3.000
 5ES  C05  C02  C03  119.24  3.000
 5ES  C03  C02  O01  122.84  3.000
 5ES  C05  C02  O01  117.91  3.000
 5ES  H2   C03  C04  119.60  3.000
 5ES  H2   C03  C02  120.34  3.000
 5ES  C04  C03  C02  120.05  3.000
 5ES  H3   C04  C07  119.81  3.000
 5ES  H3   C04  C03  118.57  3.000
 5ES  C07  C04  C03  121.61  3.000
 5ES  H4   C05  C06  120.25  3.000
 5ES  H4   C05  C02  119.73  3.000
 5ES  C06  C05  C02  120.02  3.000
 5ES  H5   C06  C07  119.82  3.000
 5ES  H5   C06  C05  118.51  3.000
 5ES  C07  C06  C05  121.67  3.000
 5ES  C08  C07  C06  120.89  3.000
 5ES  C08  C07  C04  121.71  3.000
 5ES  C06  C07  C04  117.40  3.000
 5ES  C16  C08  C09  123.18  3.000
 5ES  C16  C08  C07  120.30  3.000
 5ES  C09  C08  C07  116.49  3.000
 5ES  C15  C09  C10  117.98  3.000
 5ES  C15  C09  C08  120.82  3.000
 5ES  C10  C09  C08  121.20  3.000
 5ES  H6   C10  C11  119.11  3.000
 5ES  H6   C10  C09  119.56  3.000
 5ES  C11  C10  C09  121.33  3.000
 5ES  H7   C11  C12  120.31  3.000
 5ES  H7   C11  C10  119.72  3.000
 5ES  C12  C11  C10  119.97  3.000
 5ES  C14  C12  O13  117.84  3.000
 5ES  O13  C12  C11  122.72  3.000
 5ES  C14  C12  C11  119.43  3.000
 5ES  H8   O13  C12  110.49  3.000
 5ES  H9   C14  C15  120.38  3.000
 5ES  H9   C14  C12  119.75  3.000
 5ES  C15  C14  C12  119.87  3.000
 5ES  H10  C15  C14  118.89  3.000
 5ES  H10  C15  C09  119.69  3.000
 5ES  C14  C15  C09  121.41  3.000
 5ES  H11  C16  C17  114.25  3.000
 5ES  H11  C16  C08  117.23  3.000
 5ES  C17  C16  C08  128.52  3.000
 5ES  C30  C17  C18  119.06  3.000
 5ES  C18  C17  C16  123.24  3.000
 5ES  C30  C17  C16  117.60  3.000
 5ES  H12  C18  C19  119.84  3.000
 5ES  H12  C18  C17  120.59  3.000
 5ES  C19  C18  C17  119.56  3.000
 5ES  H13  C19  C20  119.20  3.000
 5ES  H13  C19  C18  119.56  3.000
 5ES  C20  C19  C18  121.24  3.000
 5ES  H14  C20  C21  119.77  3.000
 5ES  H14  C20  C19  120.15  3.000
 5ES  C21  C20  C19  120.07  3.000
 5ES  C30  C21  N22  123.01  3.000
 5ES  N22  C21  C20  118.44  3.000
 5ES  C30  C21  C20  118.51  3.000
 5ES  H15  N22  C23  115.79  3.000
 5ES  H15  N22  C21  115.63  3.000
 5ES  C23  N22  C21  128.28  3.000
 5ES  C29  C23  C24  118.38  3.000
 5ES  C29  C23  N22  118.89  3.000
 5ES  C24  C23  N22  122.67  3.000
 5ES  H16  C24  C25  118.61  3.000
 5ES  H16  C24  C23  120.63  3.000
 5ES  C25  C24  C23  120.75  3.000
 5ES  H17  C25  C26  120.48  3.000
 5ES  H17  C25  C24  120.19  3.000
 5ES  C26  C25  C24  119.33  3.000
 5ES  C28  C26  F27  119.30  3.000
 5ES  C28  C26  C25  121.42  3.000
 5ES  F27  C26  C25  119.28  3.000
 5ES  H18  C28  C29  120.41  3.000
 5ES  H18  C28  C26  120.63  3.000
 5ES  C29  C28  C26  118.96  3.000
 5ES  H19  C29  C28  119.24  3.000
 5ES  H19  C29  C23  119.61  3.000
 5ES  C28  C29  C23  121.15  3.000
 5ES  H20  C30  C21  120.06  3.000
 5ES  H20  C30  C17  118.43  3.000
 5ES  C21  C30  C17  121.50  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 5ES  CONST_01  C07  C06  C05  C02     0.00   0.0  0
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 5ES  CONST_03  C06  C05  C02  C03     0.00   0.0  0
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loop_
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