# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sun Apr  5 09:02:13 2020
#   Inital geometry file: a 47 line input string
#   Ligand name: 3-(trifluoromethyl)aniline
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Nc1cccc(c1)C(F)(F)F
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 51R  51R  3-(trifluoromethyl)aniline  ligand  17  11  .  2021-08-04  2021-08-04  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_51R
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 51R  CG   C  CR16  0  -0.328  -0.2077  -1.5843  -0.0344
 51R  CD1  C  CR16  0  -0.234  -1.5673  -1.8758  -0.0256
 51R  CE1  C  CR16  0  -0.316  -2.5148  -0.8709   0.0083
 51R  CD2  C  CR6   0  -0.180   0.1795  -0.2522  -0.0107
 51R  CE2  C  CR16  0  -0.352  -0.7606   0.7704   0.0235
 51R  CZ   C  CR6   0   0.333  -2.1268   0.4767   0.0350
 51R  NH2  N  NH2   0  -0.861  -3.0626   1.4779   0.1226
 51R  CM   C  CT    0   1.044   1.6264   0.1309  -0.0084
 51R  F3   F  F     0  -0.317   1.9687   0.7696   1.1220
 51R  F1   F  F     0  -0.303   2.4434  -0.9205  -0.1207
 51R  F2   F  F     0  -0.316   1.9243   0.9652  -1.0163
 51R  H1   H  HCR6  0   0.262   0.5150  -2.3863  -0.0609
 51R  H2   H  HCR6  0   0.263  -1.8903  -2.9085  -0.0466
 51R  H3   H  HCR6  0   0.265  -3.5690  -1.1213   0.0146
 51R  H4   H  HCR6  0   0.271  -0.4462   1.8079   0.0416
 51R  H5   H  HNH2  0   0.384  -3.9903   1.2498  -0.1957
 51R  H6   H  HNH2  0   0.384  -2.7696   2.3926  -0.1797

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 51R  F2   CM   single    1.342  0.020  1.342
 51R  CG   CD1  aromatic  1.391  0.020  1.391
 51R  CG   CD2  aromatic  1.387  0.020  1.387
 51R  CD1  CE1  aromatic  1.382  0.020  1.382
 51R  CM   F1   single    1.336  0.020  1.336
 51R  CM   CD2  single    1.497  0.020  1.497
 51R  CM   F3   single    1.343  0.020  1.343
 51R  CD2  CE2  aromatic  1.389  0.020  1.389
 51R  CE1  CZ   aromatic  1.403  0.020  1.403
 51R  CE2  CZ   aromatic  1.397  0.020  1.397
 51R  CZ   NH2  single    1.373  0.020  1.373
 51R  CG   H1   single    0.930  0.020  1.080
 51R  CD1  H2   single    0.930  0.020  1.080
 51R  CE1  H3   single    0.930  0.020  1.080
 51R  CE2  H4   single    0.930  0.020  1.080
 51R  NH2  H5   single    0.890  0.020  1.040
 51R  NH2  H6   single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 51R  H1   CG   CD2  121.78  3.000
 51R  H1   CG   CD1  119.92  3.000
 51R  CD2  CG   CD1  118.29  3.000
 51R  H2   CD1  CE1  119.33  3.000
 51R  H2   CD1  CG   119.46  3.000
 51R  CE1  CD1  CG   121.21  3.000
 51R  H3   CE1  CZ   119.41  3.000
 51R  H3   CE1  CD1  119.95  3.000
 51R  CZ   CE1  CD1  120.64  3.000
 51R  CM   CD2  CE2  117.75  3.000
 51R  CE2  CD2  CG   121.21  3.000
 51R  CM   CD2  CG   121.03  3.000
 51R  H4   CE2  CZ   118.98  3.000
 51R  H4   CE2  CD2  120.56  3.000
 51R  CZ   CE2  CD2  120.46  3.000
 51R  NH2  CZ   CE2  120.90  3.000
 51R  NH2  CZ   CE1  120.88  3.000
 51R  CE2  CZ   CE1  118.18  3.000
 51R  H6   NH2  H5   112.27  3.000
 51R  H6   NH2  CZ   116.41  3.000
 51R  H5   NH2  CZ   116.27  3.000
 51R  F2   CM   F1   106.87  3.000
 51R  F1   CM   F3   106.81  3.000
 51R  F2   CM   F3   106.26  3.000
 51R  F3   CM   CD2  111.69  3.000
 51R  F1   CM   CD2  112.93  3.000
 51R  F2   CM   CD2  111.88  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 51R  CONST_01  CZ   CE1  CD1  CG     0.00   0.0  0
 51R  CONST_02  CZ   CE2  CD2  CG     0.00   0.0  0
 51R  CONST_03  CE2  CD2  CG   CD1    0.00   0.0  0
 51R  CONST_04  CE2  CZ   CE1  CD1    0.00   0.0  0
 51R  CONST_05  CD2  CG   CD1  CE1    0.00   0.0  0
 51R  CONST_06  CD2  CE2  CZ   CE1    0.00   0.0  0
 51R  CONST_07  CM   CD2  CG   CD1  180.00   0.0  0
 51R  CONST_08  NH2  CZ   CE1  CD1  180.00   0.0  0
 51R  CONST_09  NH2  CZ   CE2  CD2  180.00   0.0  0
 51R  CONST_10  CM   CD2  CE2  CZ   180.00   0.0  0
 51R  CONST_11  H3   CE1  CD1  CG   180.00   0.0  0
 51R  CONST_12  H4   CE2  CD2  CG   180.00   0.0  0
 51R  CONST_13  H1   CG   CD1  CE1  180.00   0.0  0
 51R  CONST_14  H2   CD1  CG   CD2  180.00   0.0  0
 51R  Var_01    F2   CM   CD2  CG   124.82  30.0  3

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 51R  plan-1  CG   0.020
 51R  plan-1  CD1  0.020
 51R  plan-1  CE1  0.020
 51R  plan-1  CD2  0.020
 51R  plan-1  CE2  0.020
 51R  plan-1  CZ   0.020
 51R  plan-1  NH2  0.020
 51R  plan-1  CM   0.020
 51R  plan-1  H1   0.020
 51R  plan-1  H2   0.020
 51R  plan-1  H3   0.020
 51R  plan-1  H4   0.020
 51R  plan-2  CZ   0.020
 51R  plan-2  NH2  0.020
 51R  plan-2  H5   0.020
 51R  plan-2  H6   0.020

