# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sat Jul 30 21:42:41 2022
#   Inital geometry file: a 180 line input string
#   Ligand name: ~{N}-[(2~{S})-3-methyl-1-[[(2~{S})-4-methyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepiperidin-3-yl]propan-2-yl]amino]pentan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]cyclohexanecarboxamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)C1CCCCC1)C(C)C)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]2CCCNC2=O)C=O
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 3XI  3XI  "N-[(2S)-3-methyl-1-[[(2S)-4-methyl-1-oxidanylidene-1-[[(2S)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepiperidin-3-yl]propan-2-yl]amino]pentan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]cyclohexanecarboxamide"  peptide  79  35  .  2022-09-22  2022-09-22
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_3XI
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 3XI  C22  C  CH2   0  -0.448  -18.3316  12.7457  -18.5211
 3XI  O25  O  O     0  -0.490  -20.6128  13.7176  -22.8105
 3XI  C21  C  CH2   0  -0.430  -17.7682  12.1991  -19.8418
 3XI  C20  C  CH2   0  -0.434  -18.6397  12.5787  -21.0470
 3XI  C19  C  CH1   0  -0.390  -19.2736  13.9481  -20.8270
 3XI  C24  C  CH2   0  -0.418  -20.2719  13.8893  -19.6476
 3XI  C23  C  CH2   0  -0.446  -19.8487  12.8588  -18.5925
 3XI  C18  C  C     0   0.576  -19.9926  14.4567  -22.0580
 3XI  N17  N  NH1   0  -0.636  -19.9447  15.7918  -22.2305
 3XI  C13  C  CH1   0  -0.171  -20.6270  16.4840  -23.2974
 3XI  C12  C  C     0   0.571  -19.6991  16.5672  -24.5081
 3XI  O26  O  O     0  -0.484  -18.6003  17.0984  -24.4274
 3XI  C14  C  CH1   0  -0.261  -21.0597  17.8871  -22.8496
 3XI  C15  C  CH3   0  -0.651  -21.9974  17.8024  -21.6498
 3XI  C16  C  CH3   0  -0.675  -21.7346  18.6379  -23.9930
 3XI  N11  N  NH1   0  -0.626  -20.1601  16.0207  -25.6416
 3XI  C06  C  CH1   0  -0.202  -19.4107  16.0796  -26.8732
 3XI  C05  C  C     0   0.569  -19.4291  17.5130  -27.4053
 3XI  O27  O  O     0  -0.472  -20.4662  18.1507  -27.4665
 3XI  C07  C  CH2   0  -0.437  -19.9988  15.1507  -27.9404
 3XI  C08  C  CH1   0  -0.233  -19.6002  13.6771  -27.8228
 3XI  C10  C  CH3   0  -0.664  -20.0397  13.0217  -26.5178
 3XI  C09  C  CH3   0  -0.652  -20.1610  12.9101  -29.0170
 3XI  C31  C  CH2   0  -0.466  -18.6863  22.5307  -26.0126
 3XI  C03  C  CH1   0  -0.224  -18.0267  19.3011  -28.3578
 3XI  C30  C  CH2   0  -0.464  -18.9061  21.0346  -25.8732
 3XI  C34  C  C     0   0.533  -16.4602  20.8859  -25.2121
 3XI  C28  C  CH2   0  -0.432  -17.1058  20.1422  -27.4797
 3XI  C02  C  C1    0   0.194  -17.5362  19.1725  -29.7860
 3XI  C29  C  CH1   0  -0.388  -17.5903  20.2747  -26.0276
 3XI  C32  C  CH2   0  -0.260  -17.7697  23.0080  -24.9063
 3XI  N04  N  NH1   0  -0.635  -18.2390  17.9716  -27.8368
 3XI  N33  N  NH1   0  -0.620  -16.6045  22.1507  -24.7828
 3XI  H12  H  HCH2  0   0.231  -18.0299  12.1059  -17.6897
 3XI  H13  H  HCH2  0   0.218  -17.9108  13.7337  -18.3115
 3XI  H10  H  HCH2  0   0.223  -17.6901  11.1109  -19.7897
 3XI  H8   H  HCH2  0   0.225  -19.4282  11.8363  -21.1922
 3XI  H31  H  HCH1  0   0.255  -18.4766  14.6546  -20.5693
 3XI  H14  H  HCH2  0   0.234  -20.3471  14.8812  -19.1965
 3XI  H15  H  HCH2  0   0.232  -21.2694  13.6380  -20.0167
 3XI  H32  H  HCH2  0   0.234  -20.2664  13.1340  -17.6223
 3XI  H33  H  HCH2  0   0.221  -20.2693  11.8798  -18.8391
 3XI  H11  H  HCH2  0   0.223  -16.7519  12.5722  -19.9883
 3XI  H9   H  HCH2  0   0.238  -18.0383  12.5700  -21.9584
 3XI  H43  H  HNH1  0   0.402  -19.3648  16.3385  -21.6127
 3XI  H4   H  HCH1  0   0.265  -21.5237  15.9131  -23.5531
 3XI  H27  H  HCH1  0   0.235  -20.1596  18.4393  -22.5557
 3XI  H5   H  HCH3  0   0.233  -21.5362  17.3118  -20.7929
 3XI  H6   H  HCH3  0   0.234  -22.2978  18.8022  -21.3345
 3XI  H7   H  HCH3  0   0.220  -22.9035  17.2494  -21.9070
 3XI  H28  H  HCH3  0   0.237  -22.0476  19.6270  -23.6581
 3XI  H29  H  HCH3  0   0.245  -21.0796  18.7796  -24.8518
 3XI  H30  H  HCH3  0   0.223  -22.6251  18.1054  -24.3343
 3XI  H42  H  HNH1  0   0.407  -21.0890  15.6295  -25.6607
 3XI  H20  H  HCH1  0   0.274  -18.3795  15.7717  -26.6725
 3XI  H21  H  HCH2  0   0.256  -19.6580  15.5078  -28.9163
 3XI  H22  H  HCH2  0   0.239  -21.0901  15.2495  -27.9488
 3XI  H23  H  HCH1  0   0.223  -18.5062  13.6302  -27.8744
 3XI  H1   H  HCH3  0   0.233  -19.5556  13.4606  -25.6466
 3XI  H2   H  HCH3  0   0.214  -21.1205  13.1085  -26.3797
 3XI  H3   H  HCH3  0   0.229  -19.7940  11.9585  -26.5260
 3XI  H24  H  HCH3  0   0.228  -19.8457  11.8661  -28.9946
 3XI  H25  H  HCH3  0   0.216  -21.2534  12.9262  -29.0120
 3XI  H26  H  HCH3  0   0.226  -19.8265  13.3389  -29.9633
 3XI  H37  H  HCH2  0   0.237  -18.2539  22.7652  -26.9888
 3XI  H38  H  HCH2  0   0.251  -19.6303  23.0731  -25.9470
 3XI  H19  H  HCH1  0   0.300  -19.0134  19.7704  -28.4378
 3XI  H35  H  HCH2  0   0.250  -19.6443  20.6765  -26.5914
 3XI  H36  H  HCH2  0   0.242  -19.3259  20.8218  -24.8849
 3XI  H16  H  HCH2  0   0.254  -16.1116  19.6890  -27.4806
 3XI  H17  H  HCH2  0   0.254  -16.9970  21.1284  -27.9369
 3XI  H18  H  H     0   0.210  -18.0897  18.4173  -30.3741
 3XI  H34  H  HCH1  0   0.281  -17.7185  19.2663  -25.6249
 3XI  H39  H  HCH2  0   0.250  -17.4271  24.0259  -25.0967
 3XI  H40  H  HCH2  0   0.232  -18.3169  23.0255  -23.9581
 3XI  H41  H  HNH1  0   0.409  -17.4191  17.4073  -27.6703
 3XI  H44  H  HNH1  0   0.389  -15.8418  22.5057  -24.2243
 3XI  O01  O  O     0  -0.358  -16.6407  19.8130  -30.2681
 3XI  O35  O  O     0  -0.504  -15.4396  20.2451  -24.9845

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 3XI  O01  C02  double  1.202  0.020  1.202
 3XI  C02  C03  single  1.516  0.020  1.516
 3XI  C09  C08  single  1.526  0.020  1.526
 3XI  C03  N04  single  1.444  0.020  1.444
 3XI  C03  C28  single  1.525  0.020  1.525
 3XI  C07  C08  single  1.531  0.020  1.531
 3XI  C07  C06  single  1.532  0.020  1.532
 3XI  N04  C05  single  1.346  0.020  1.346
 3XI  C28  C29  single  1.537  0.020  1.537
 3XI  O27  C05  double  1.219  0.020  1.219
 3XI  C08  C10  single  1.525  0.020  1.525
 3XI  C05  C06  single  1.529  0.020  1.529
 3XI  C06  N11  single  1.443  0.020  1.443
 3XI  C29  C30  single  1.527  0.020  1.527
 3XI  C29  C34  single  1.522  0.020  1.522
 3XI  C30  C31  single  1.519  0.020  1.519
 3XI  N11  C12  single  1.340  0.020  1.340
 3XI  O35  C34  double  1.226  0.020  1.226
 3XI  C31  C32  single  1.514  0.020  1.514
 3XI  C34  N33  single  1.343  0.020  1.343
 3XI  C12  O26  double  1.223  0.020  1.223
 3XI  C12  C13  single  1.528  0.020  1.528
 3XI  N33  C32  single  1.452  0.020  1.452
 3XI  C16  C14  single  1.525  0.020  1.525
 3XI  C13  C14  single  1.535  0.020  1.535
 3XI  C13  N17  single  1.443  0.020  1.443
 3XI  C14  C15  single  1.525  0.020  1.525
 3XI  N17  C18  single  1.347  0.020  1.347
 3XI  O25  C18  double  1.224  0.020  1.224
 3XI  C18  C19  single  1.514  0.020  1.514
 3XI  C20  C19  single  1.525  0.020  1.525
 3XI  C20  C21  single  1.535  0.020  1.535
 3XI  C19  C24  single  1.546  0.020  1.546
 3XI  C21  C22  single  1.536  0.020  1.536
 3XI  C24  C23  single  1.534  0.020  1.534
 3XI  C22  C23  single  1.523  0.020  1.523
 3XI  C10  H1   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C10  H2   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C10  H3   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C13  H4   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C15  H5   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C15  H6   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C15  H7   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C20  H8   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C20  H9   single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C21  H10  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C21  H11  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C22  H12  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C22  H13  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C24  H14  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C24  H15  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C28  H16  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C28  H17  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C02  H18  single  0.930  0.020  1.080
 3XI  C03  H19  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C06  H20  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C07  H21  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C07  H22  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C08  H23  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C09  H24  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C09  H25  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C09  H26  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C14  H27  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C16  H28  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C16  H29  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C16  H30  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C19  H31  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C23  H32  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C23  H33  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C29  H34  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C30  H35  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C30  H36  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C31  H37  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C31  H38  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C32  H39  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  C32  H40  single  0.970  0.020  1.090
 3XI  N04  H41  single  0.860  0.020  1.020
 3XI  N11  H42  single  0.860  0.020  1.020
 3XI  N17  H43  single  0.860  0.020  1.020
 3XI  N33  H44  single  0.860  0.020  1.020

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 3XI  H13  C22  H12  106.09  3.000
 3XI  H13  C22  C23  108.97  3.000
 3XI  H12  C22  C23  110.77  3.000
 3XI  H13  C22  C21  110.17  3.000
 3XI  H12  C22  C21  110.17  3.000
 3XI  C23  C22  C21  110.57  3.000
 3XI  H11  C21  H10  106.27  3.000
 3XI  H11  C21  C20  109.78  3.000
 3XI  H10  C21  C20  108.93  3.000
 3XI  H11  C21  C22  109.57  3.000
 3XI  H10  C21  C22  109.85  3.000
 3XI  C20  C21  C22  112.26  3.000
 3XI  H9   C20  H8   106.33  3.000
 3XI  H9   C20  C19  110.89  3.000
 3XI  H8   C20  C19  109.23  3.000
 3XI  H9   C20  C21  109.91  3.000
 3XI  H8   C20  C21  110.24  3.000
 3XI  C19  C20  C21  110.17  3.000
 3XI  H31  C19  C18  108.67  3.000
 3XI  H31  C19  C24  108.34  3.000
 3XI  C18  C19  C24  109.05  3.000
 3XI  H31  C19  C20  108.10  3.000
 3XI  C24  C19  C20  110.13  3.000
 3XI  C18  C19  C20  112.45  3.000
 3XI  H15  C24  H14  106.59  3.000
 3XI  H15  C24  C23  109.24  3.000
 3XI  H14  C24  C23  110.18  3.000
 3XI  H15  C24  C19  109.90  3.000
 3XI  H14  C24  C19  108.96  3.000
 3XI  C23  C24  C19  111.83  3.000
 3XI  H33  C23  H32  106.20  3.000
 3XI  H33  C23  C24  109.88  3.000
 3XI  H32  C23  C24  109.65  3.000
 3XI  H33  C23  C22  109.10  3.000
 3XI  H32  C23  C22  110.99  3.000
 3XI  C24  C23  C22  110.91  3.000
 3XI  N17  C18  C19  114.85  3.000
 3XI  C19  C18  O25  122.55  3.000
 3XI  N17  C18  O25  122.54  3.000
 3XI  H43  N17  C13  117.69  3.000
 3XI  H43  N17  C18  118.65  3.000
 3XI  C13  N17  C18  123.59  3.000
 3XI  H4   C13  C14  108.32  3.000
 3XI  H4   C13  C12  109.96  3.000
 3XI  C14  C13  C12  110.65  3.000
 3XI  H4   C13  N17  108.07  3.000
 3XI  C14  C13  N17  110.85  3.000
 3XI  C12  C13  N17  108.95  3.000
 3XI  N11  C12  O26  122.81  3.000
 3XI  O26  C12  C13  121.14  3.000
 3XI  N11  C12  C13  116.05  3.000
 3XI  H27  C14  C16  108.44  3.000
 3XI  H27  C14  C15  108.78  3.000
 3XI  C16  C14  C15  110.19  3.000
 3XI  H27  C14  C13  107.89  3.000
 3XI  C15  C14  C13  110.61  3.000
 3XI  C16  C14  C13  110.85  3.000
 3XI  H7   C15  H6   107.68  3.000
 3XI  H7   C15  H5   107.96  3.000
 3XI  H6   C15  H5   107.58  3.000
 3XI  H7   C15  C14  110.66  3.000
 3XI  H6   C15  C14  110.24  3.000
 3XI  H5   C15  C14  112.54  3.000
 3XI  H30  C16  H29  107.90  3.000
 3XI  H30  C16  H28  107.70  3.000
 3XI  H29  C16  H28  107.26  3.000
 3XI  H30  C16  C14  110.79  3.000
 3XI  H29  C16  C14  112.89  3.000
 3XI  H28  C16  C14  110.08  3.000
 3XI  H42  N11  C06  118.57  3.000
 3XI  H42  N11  C12  119.42  3.000
 3XI  C06  N11  C12  121.78  3.000
 3XI  H20  C06  C07  108.59  3.000
 3XI  H20  C06  C05  109.81  3.000
 3XI  C07  C06  C05  108.74  3.000
 3XI  H20  C06  N11  108.74  3.000
 3XI  C05  C06  N11  109.21  3.000
 3XI  C07  C06  N11  111.74  3.000
 3XI  N04  C05  O27  123.90  3.000
 3XI  O27  C05  C06  121.21  3.000
 3XI  N04  C05  C06  114.84  3.000
 3XI  H22  C07  H21  105.90  3.000
 3XI  H22  C07  C08  110.28  3.000
 3XI  H21  C07  C08  107.56  3.000
 3XI  H22  C07  C06  109.44  3.000
 3XI  H21  C07  C06  107.69  3.000
 3XI  C08  C07  C06  115.47  3.000
 3XI  H23  C08  C09  107.96  3.000
 3XI  H23  C08  C10  108.03  3.000
 3XI  C09  C08  C10  110.35  3.000
 3XI  H23  C08  C07  107.30  3.000
 3XI  C10  C08  C07  113.85  3.000
 3XI  C09  C08  C07  109.14  3.000
 3XI  H3   C10  H2   107.51  3.000
 3XI  H3   C10  H1   107.37  3.000
 3XI  H2   C10  H1   107.85  3.000
 3XI  H3   C10  C08  110.33  3.000
 3XI  H2   C10  C08  111.04  3.000
 3XI  H1   C10  C08  112.53  3.000
 3XI  H26  C09  H25  107.74  3.000
 3XI  H26  C09  H24  107.78  3.000
 3XI  H25  C09  H24  107.64  3.000
 3XI  H26  C09  C08  111.62  3.000
 3XI  H25  C09  C08  110.88  3.000
 3XI  H24  C09  C08  111.02  3.000
 3XI  H38  C31  H37  106.82  3.000
 3XI  H38  C31  C32  108.86  3.000
 3XI  H37  C31  C32  110.21  3.000
 3XI  H38  C31  C30  111.05  3.000
 3XI  H37  C31  C30  110.52  3.000
 3XI  C32  C31  C30  109.34  3.000
 3XI  H19  C03  N04  106.76  3.000
 3XI  H19  C03  C02  105.01  3.000
 3XI  N04  C03  C02  108.03  3.000
 3XI  H19  C03  C28  110.46  3.000
 3XI  N04  C03  C28  112.88  3.000
 3XI  C02  C03  C28  113.20  3.000
 3XI  H36  C30  H35  105.74  3.000
 3XI  H36  C30  C29  108.96  3.000
 3XI  H35  C30  C29  110.69  3.000
 3XI  H36  C30  C31  109.26  3.000
 3XI  H35  C30  C31  111.17  3.000
 3XI  C29  C30  C31  110.87  3.000
 3XI  O35  C34  N33  121.47  3.000
 3XI  N33  C34  C29  118.01  3.000
 3XI  O35  C34  C29  120.50  3.000
 3XI  H17  C28  H16  106.47  3.000
 3XI  H17  C28  C29  110.43  3.000
 3XI  H16  C28  C29  108.87  3.000
 3XI  H17  C28  C03  108.48  3.000
 3XI  H16  C28  C03  108.68  3.000
 3XI  C29  C28  C03  113.66  3.000
 3XI  H18  C02  O01  121.58  3.000
 3XI  H18  C02  C03  113.40  3.000
 3XI  O01  C02  C03  125.02  3.000
 3XI  H34  C29  C28  107.79  3.000
 3XI  H34  C29  C34  105.08  3.000
 3XI  C28  C29  C34  107.88  3.000
 3XI  H34  C29  C30  108.70  3.000
 3XI  C34  C29  C30  112.69  3.000
 3XI  C28  C29  C30  114.21  3.000
 3XI  H40  C32  H39  107.05  3.000
 3XI  H40  C32  N33  109.69  3.000
 3XI  H39  C32  N33  108.29  3.000
 3XI  H40  C32  C31  109.59  3.000
 3XI  H39  C32  C31  110.90  3.000
 3XI  N33  C32  C31  111.21  3.000
 3XI  H41  N04  C03  117.07  3.000
 3XI  H41  N04  C05  118.34  3.000
 3XI  C03  N04  C05  124.01  3.000
 3XI  H44  N33  C32  116.46  3.000
 3XI  H44  N33  C34  115.25  3.000
 3XI  C32  N33  C34  127.95  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 3XI  CONST_01  C32  N33  C34  C29     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_02  O35  C34  N33  C32   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_03  H44  N33  C34  C29   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_04  H44  N33  C34  O35     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_05  C13  N17  C18  C19   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_06  H43  N17  C18  C19     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_07  C13  N17  C18  O25     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_08  C06  N11  C12  C13   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_09  C06  N11  C12  O26     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_10  C03  N04  C05  C06   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_11  C03  N04  C05  O27     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_12  H43  N17  C18  O25   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_13  H42  N11  C12  C13     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_14  H42  N11  C12  O26   180.00   0.0  0
 3XI  CONST_15  H41  N04  C05  C06     0.00   0.0  0
 3XI  CONST_16  H41  N04  C05  O27   180.00   0.0  0
 3XI  Var_01    C19  C20  C21  C22    33.26  30.0  1
 3XI  Var_02    C19  C24  C23  C22    31.76  30.0  1
 3XI  Var_03    C24  C23  C22  C21   -64.50  30.0  1
 3XI  Var_04    C23  C22  C21  C20    29.53  30.0  1
 3XI  Var_05    C34  N33  C32  C31   -20.66  30.0  1
 3XI  Var_06    N33  C32  C31  C30    47.59  30.0  1
 3XI  Var_07    C32  C31  C30  C29   -62.37  30.0  1
 3XI  Var_08    H8   C20  C21  C22   -87.37  30.0  1
 3XI  Var_09    H9   C20  C21  C22   155.73  30.0  1
 3XI  Var_10    H14  C24  C23  C22   -89.58  30.0  1
 3XI  Var_11    H15  C24  C23  C22   153.65  30.0  1
 3XI  Var_12    H32  C23  C22  C21   173.35  30.0  1
 3XI  Var_13    H33  C23  C22  C21    56.66  30.0  1
 3XI  Var_14    H12  C22  C21  C20   152.31  30.0  1
 3XI  Var_15    H13  C22  C21  C20   -90.98  30.0  1
 3XI  Var_16    H10  C21  C20  C19   155.14  30.0  1
 3XI  Var_17    H11  C21  C20  C19   -88.87  30.0  1
 3XI  Var_18    H32  C23  C24  C19   154.69  30.0  1
 3XI  Var_19    H33  C23  C24  C19   -88.94  30.0  1
 3XI  Var_20    H12  C22  C23  C24   173.06  30.0  1
 3XI  Var_21    H13  C22  C23  C24    56.73  30.0  1
 3XI  Var_22    H10  C21  C22  C23   -91.83  30.0  1
 3XI  Var_23    H11  C21  C22  C23   151.78  30.0  1
 3XI  Var_24    H44  N33  C32  C31   166.38  30.0  1
 3XI  Var_25    H39  C32  C31  C30   168.16  30.0  1
 3XI  Var_26    H40  C32  C31  C30   -73.86  30.0  1
 3XI  Var_27    H39  C32  N33  C34  -142.76  30.0  1
 3XI  Var_28    H40  C32  N33  C34   100.73  30.0  1
 3XI  Var_29    H37  C31  C30  C29    59.12  30.0  1
 3XI  Var_30    H38  C31  C30  C29   177.48  30.0  1
 3XI  Var_31    H35  C30  C31  C32   174.06  30.0  1
 3XI  Var_32    H36  C30  C31  C32    57.73  30.0  1
 3XI  Var_33    H37  C31  C32  N33   -74.09  30.0  1
 3XI  Var_34    H38  C31  C32  N33   169.07  30.0  1
 3XI  Var_35    C09  C08  C07  C06  -175.10  30.0  3
 3XI  Var_36    C10  C08  C07  C06    61.13  30.0  3
 3XI  Var_37    H28  C16  C14  C13   179.30  30.0  3
 3XI  Var_38    H29  C16  C14  C13   -60.88  30.0  3
 3XI  Var_39    H30  C16  C14  C13    60.28  30.0  3
 3XI  Var_40    H5   C15  C14  C13    59.68  30.0  3
 3XI  Var_41    H6   C15  C14  C13   179.79  30.0  3
 3XI  Var_42    H7   C15  C14  C13   -61.20  30.0  3
 3XI  Var_43    H28  C16  C14  C15    56.52  30.0  3
 3XI  Var_44    H29  C16  C14  C15   176.34  30.0  3
 3XI  Var_45    H30  C16  C14  C15   -62.50  30.0  3
 3XI  Var_46    H5   C15  C14  C16  -177.40  30.0  3
 3XI  Var_47    H6   C15  C14  C16   -57.30  30.0  3
 3XI  Var_48    H7   C15  C14  C16    61.71  30.0  3
 3XI  Var_49    H23  C08  C07  C06   -58.36  30.0  3
 3XI  Var_50    H24  C09  C08  C07   176.69  30.0  3
 3XI  Var_51    H25  C09  C08  C07   -63.70  30.0  3
 3XI  Var_52    H26  C09  C08  C07    56.42  30.0  3
 3XI  Var_53    H1   C10  C08  C07   -64.35  30.0  3
 3XI  Var_54    H2   C10  C08  C07    56.65  30.0  3
 3XI  Var_55    H3   C10  C08  C07   175.76  30.0  3
 3XI  Var_56    H24  C09  C08  C10   -57.49  30.0  3
 3XI  Var_57    H25  C09  C08  C10    62.11  30.0  3
 3XI  Var_58    H26  C09  C08  C10  -177.76  30.0  3
 3XI  Var_59    H21  C07  C08  C10  -178.62  30.0  1
 3XI  Var_60    H22  C07  C08  C10   -63.56  30.0  1
 3XI  Var_61    H21  C07  C08  C09   -54.84  30.0  1
 3XI  Var_62    H22  C07  C08  C09    60.21  30.0  1
 3XI  Var_63    H1   C10  C08  C09   172.53  30.0  3
 3XI  Var_64    H2   C10  C08  C09   -66.47  30.0  3
 3XI  Var_65    H3   C10  C08  C09    52.64  30.0  3

loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 3XI  chir_01  C19  C18  C20  C24  positiv
 3XI  chir_02  C13  N17  C14  C12  negativ
 3XI  chir_03  C06  N11  C05  C07  positiv
 3XI  chir_04  C03  N04  C28  C02  negativ
 3XI  chir_05  C29  C28  C30  C34  positiv

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 3XI  plan-1  O25  0.020
 3XI  plan-1  C19  0.020
 3XI  plan-1  C18  0.020
 3XI  plan-1  N17  0.020
 3XI  plan-1  C13  0.020
 3XI  plan-1  H43  0.020
 3XI  plan-2  C13  0.020
 3XI  plan-2  C12  0.020
 3XI  plan-2  O26  0.020
 3XI  plan-2  N11  0.020
 3XI  plan-2  C06  0.020
 3XI  plan-2  H42  0.020
 3XI  plan-3  C06  0.020
 3XI  plan-3  C05  0.020
 3XI  plan-3  O27  0.020
 3XI  plan-3  C03  0.020
 3XI  plan-3  N04  0.020
 3XI  plan-3  H41  0.020
 3XI  plan-4  C34  0.020
 3XI  plan-4  C29  0.020
 3XI  plan-4  C32  0.020
 3XI  plan-4  N33  0.020
 3XI  plan-4  H44  0.020
 3XI  plan-4  O35  0.020
 3XI  plan-5  C03  0.020
 3XI  plan-5  C02  0.020
 3XI  plan-5  H18  0.020
 3XI  plan-5  O01  0.020

