# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Sun Apr  5 03:21:41 2020
#   Inital geometry file: a 146 line input string
#   Ligand name: N-{N-[4-(acetylamino)-3-chloro-5-methylbenzyl]carbamimidoyl}-3-(4-methoxyphenyl)-5-methyl-1,2-thiazole-4-carboxamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: COc1ccc(cc1)c2nsc(C)c2C(=O)NC(=N)NCc3cc(C)c(NC(C)=O)c(Cl)c3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 0VB  0VB  N-{N-[4-(acetylamino)-3-chloro-5-methylbenzyl]carbamimidoyl}-3-(4-methoxyphenyl)-5-methyl-1,2-thiazole-4-carboxamide  ligand  57  33  .  2021-08-03  2021-08-03  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_0VB
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 0VB  C01  C   CR16  0  -0.266   4.1314   2.3471   1.6045
 0VB  C02  C   CR16  0  -0.286   3.2837   1.9377  -0.5943
 0VB  C03  C   CR16  0  -0.332   3.7530   3.6704   1.5097
 0VB  C04  C   CR16  0  -0.371   2.9039   3.2672  -0.7078
 0VB  C05  C   CR16  0  -0.345  -2.8239  -2.1257  -0.3063
 0VB  C06  C   CR16  0  -0.310  -3.5556  -0.3700  -1.7627
 0VB  C07  C   CR6   0   0.049   3.8938   1.4540   0.5572
 0VB  C08  C   CR5   0  -0.061   3.6125  -1.0835   0.1688
 0VB  C09  C   CR6   0   0.080  -2.6582  -1.3857  -1.4736
 0VB  C10  C   CR6   0   0.091  -3.8734  -1.8811   0.5682
 0VB  C11  C   CR6   0   0.340  -4.7758  -0.8523   0.2732
 0VB  C12  C   CR6   0   0.382   3.1309   4.1444   0.3510
 0VB  C13  C   CR6   0  -0.051  -4.6004  -0.1098  -0.8888
 0VB  C14  C   CR5   0   0.270   4.3272   0.0543   0.6655
 0VB  C15  C   CR5   0  -0.177   4.3028  -2.2442   0.4049
 0VB  C17  C   C     0   0.499  -7.1295  -0.8271   0.8809
 0VB  C18  C   C     0   0.646   0.8927  -1.9424  -2.2839
 0VB  C19  C   CH3   0  -0.723  -4.0467  -2.7028   1.8103
 0VB  C20  C   CH3   0  -0.737   3.9451  -3.6547   0.0807
 0VB  C21  C   CH3   0  -0.784  -8.0975  -0.4417   1.9677
 0VB  C22  C   CH3   0  -0.439   2.1640   5.9801  -0.8023
 0VB  C23  C   CH2   0  -0.300  -1.5150  -1.6774  -2.4070
 0VB  N24  N   N     0  -0.553   5.4728  -0.2178   1.2366
 0VB  N25  N   NH1   0  -0.719   2.0697  -1.6866  -1.5512
 0VB  N26  N   N     0  -0.704   0.9114  -2.5348  -3.4132
 0VB  N27  N   NH1   0  -0.727  -5.8276  -0.5698   1.1631
 0VB  N28  N   NH1   0  -0.661  -0.2618  -1.5510  -1.7020
 0VB  O29  O   O     0  -0.434   1.3370  -0.4711   0.2395
 0VB  O30  O   O     0  -0.473  -7.4836  -1.3044  -0.1818
 0VB  O31  O   O2    0  -0.466   2.7926   5.4436   0.3464
 0VB  S32  S   S2    0   0.417   5.7462  -1.8429   1.2201
 0VB  CL1  CL  CL    0  -0.111  -5.6720   1.1991  -1.2406
 0VB  H1   H   HCR6  0   0.257   4.6064   1.9965   2.5116
 0VB  H2   H   HCR6  0   0.259   3.1210   1.2871  -1.4444
 0VB  H3   H   HCR6  0   0.267   3.9331   4.3498   2.3333
 0VB  H4   H   HCR6  0   0.284   2.4425   3.5985  -1.6276
 0VB  H5   H   HCR6  0   0.257  -2.1231  -2.9205  -0.0784
 0VB  H6   H   HCR6  0   0.278  -3.4388   0.2276  -2.6574
 0VB  H7   H   HCH3  0   0.251  -3.9737  -2.0939   2.7132
 0VB  H8   H   HCH3  0   0.255  -5.0220  -3.1911   1.8321
 0VB  H9   H   HCH3  0   0.255  -3.2826  -3.4755   1.8717
 0VB  H10  H   HCH3  0   0.279   4.2521  -3.9059  -0.9355
 0VB  H11  H   HCH3  0   0.275   4.4370  -4.3546   0.7534
 0VB  H12  H   HCH3  0   0.272   2.8715  -3.8155   0.1584
 0VB  H13  H   HCH3  0   0.253  -7.6258  -0.3168   2.9407
 0VB  H14  H   HCH3  0   0.274  -8.5709   0.5047   1.7013
 0VB  H15  H   HCH3  0   0.267  -8.8821  -1.1913   2.0479
 0VB  H16  H   HCH3  0   0.231   2.8066   5.9187  -1.6844
 0VB  H17  H   HCH3  0   0.231   1.2163   5.4816  -1.0203
 0VB  H18  H   HCH3  0   0.262   1.9667   7.0265  -0.5846
 0VB  H19  H   HCH2  0   0.259  -1.6029  -2.6943  -2.7951
 0VB  H20  H   HCH2  0   0.248  -1.5595  -1.0079  -3.2727
 0VB  H21  H   HNH1  0   0.428   2.9156  -2.0038  -2.0015
 0VB  H22  H   H     0   0.335   1.8459  -2.8100  -3.6892
 0VB  H23  H   HNH1  0   0.409  -5.5852  -0.2613   2.0921
 0VB  H24  H   HNH1  0   0.413  -0.2059  -0.8922  -0.9409
 0VB  C16  C   C     0   0.460   2.2282  -1.0387  -0.3646

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 0VB  O31  C22  single    1.415  0.020  1.415
 0VB  O31  C12  single    1.342  0.020  1.342
 0VB  C03  C12  aromatic  1.398  0.020  1.398
 0VB  C03  C01  aromatic  1.380  0.020  1.380
 0VB  C12  C04  aromatic  1.394  0.020  1.394
 0VB  C01  C07  aromatic  1.397  0.020  1.397
 0VB  C04  C02  aromatic  1.387  0.020  1.387
 0VB  C21  C17  single    1.505  0.020  1.505
 0VB  C07  C02  aromatic  1.390  0.020  1.390
 0VB  C07  C14  single    1.469  0.020  1.469
 0VB  O30  C17  double    1.218  0.020  1.218
 0VB  N24  C14  aromatic  1.309  0.020  1.309
 0VB  N24  S32  aromatic  1.648  0.020  1.648
 0VB  CL1  C13  single    1.728  0.020  1.728
 0VB  C17  N27  single    1.357  0.020  1.357
 0VB  C14  C08  aromatic  1.432  0.020  1.432
 0VB  S32  C15  aromatic  1.706  0.020  1.706
 0VB  N27  C11  single    1.406  0.020  1.406
 0VB  C13  C11  aromatic  1.390  0.020  1.390
 0VB  C13  C06  aromatic  1.387  0.020  1.387
 0VB  C08  C15  aromatic  1.371  0.020  1.371
 0VB  C08  C16  single    1.484  0.020  1.484
 0VB  O29  C16  double    1.217  0.020  1.217
 0VB  C11  C10  aromatic  1.400  0.020  1.400
 0VB  C15  C20  single    1.491  0.020  1.491
 0VB  C06  C09  aromatic  1.386  0.020  1.386
 0VB  C16  N25  single    1.361  0.020  1.361
 0VB  C10  C19  single    1.499  0.020  1.499
 0VB  C10  C05  aromatic  1.388  0.020  1.388
 0VB  C09  C05  aromatic  1.392  0.020  1.392
 0VB  C09  C23  single    1.504  0.020  1.504
 0VB  N28  C23  single    1.444  0.020  1.444
 0VB  N28  C18  single    1.351  0.020  1.351
 0VB  N25  C18  single    1.410  0.020  1.410
 0VB  C18  N26  double    1.275  0.020  1.275
 0VB  C01  H1   single    0.930  0.020  1.080
 0VB  C02  H2   single    0.930  0.020  1.080
 0VB  C03  H3   single    0.930  0.020  1.080
 0VB  C04  H4   single    0.930  0.020  1.080
 0VB  C05  H5   single    0.930  0.020  1.080
 0VB  C06  H6   single    0.930  0.020  1.080
 0VB  C19  H7   single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C19  H8   single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C19  H9   single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C20  H10  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C20  H11  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C20  H12  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C21  H13  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C21  H14  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C21  H15  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C22  H16  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C22  H17  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C22  H18  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C23  H19  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  C23  H20  single    0.970  0.020  1.090
 0VB  N25  H21  single    0.860  0.020  1.020
 0VB  N26  H22  single    0.890  0.020  1.040
 0VB  N27  H23  single    0.860  0.020  1.020
 0VB  N28  H24  single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 0VB  H1   C01  C07  119.73  3.000
 0VB  H1   C01  C03  119.26  3.000
 0VB  C07  C01  C03  121.01  3.000
 0VB  H2   C02  C07  120.48  3.000
 0VB  H2   C02  C04  118.06  3.000
 0VB  C07  C02  C04  121.43  3.000
 0VB  H3   C03  C12  119.46  3.000
 0VB  H3   C03  C01  120.26  3.000
 0VB  C12  C03  C01  120.28  3.000
 0VB  H4   C04  C12  121.54  3.000
 0VB  H4   C04  C02  118.70  3.000
 0VB  C12  C04  C02  119.76  3.000
 0VB  H5   C05  C10  119.06  3.000
 0VB  H5   C05  C09  119.29  3.000
 0VB  C10  C05  C09  121.65  3.000
 0VB  H6   C06  C13  119.92  3.000
 0VB  H6   C06  C09  120.48  3.000
 0VB  C13  C06  C09  119.60  3.000
 0VB  C14  C07  C02  121.47  3.000
 0VB  C14  C07  C01  120.25  3.000
 0VB  C02  C07  C01  118.25  3.000
 0VB  C16  C08  C15  123.85  3.000
 0VB  C16  C08  C14  124.47  3.000
 0VB  C15  C08  C14  111.20  3.000
 0VB  C23  C09  C06  120.31  3.000
 0VB  C23  C09  C05  120.51  3.000
 0VB  C06  C09  C05  119.17  3.000
 0VB  C19  C10  C11  120.19  3.000
 0VB  C19  C10  C05  120.85  3.000
 0VB  C11  C10  C05  118.96  3.000
 0VB  N27  C11  C13  121.06  3.000
 0VB  C13  C11  C10  119.17  3.000
 0VB  N27  C11  C10  119.76  3.000
 0VB  O31  C12  C04  124.43  3.000
 0VB  C04  C12  C03  119.26  3.000
 0VB  O31  C12  C03  116.30  3.000
 0VB  CL1  C13  C11  119.77  3.000
 0VB  C11  C13  C06  121.44  3.000
 0VB  CL1  C13  C06  118.76  3.000
 0VB  N24  C14  C08  115.02  3.000
 0VB  C08  C14  C07  125.73  3.000
 0VB  N24  C14  C07  119.24  3.000
 0VB  S32  C15  C20  121.98  3.000
 0VB  C20  C15  C08  130.00  3.000
 0VB  S32  C15  C08  108.01  3.000
 0VB  O30  C17  N27  122.34  3.000
 0VB  N27  C17  C21  114.72  3.000
 0VB  O30  C17  C21  122.92  3.000
 0VB  N28  C18  N26  121.91  3.000
 0VB  N26  C18  N25  122.15  3.000
 0VB  N28  C18  N25  115.92  3.000
 0VB  H9   C19  H8   107.98  3.000
 0VB  H9   C19  H7   107.60  3.000
 0VB  H8   C19  H7   107.03  3.000
 0VB  H9   C19  C10  110.78  3.000
 0VB  H8   C19  C10  111.42  3.000
 0VB  H7   C19  C10  111.83  3.000
 0VB  H12  C20  H11  107.86  3.000
 0VB  H12  C20  H10  108.06  3.000
 0VB  H11  C20  H10  107.49  3.000
 0VB  H12  C20  C15  111.16  3.000
 0VB  H11  C20  C15  111.45  3.000
 0VB  H10  C20  C15  110.66  3.000
 0VB  H15  C21  H14  107.62  3.000
 0VB  H15  C21  H13  109.00  3.000
 0VB  H14  C21  H13  107.86  3.000
 0VB  H15  C21  C17  109.91  3.000
 0VB  H14  C21  C17  108.94  3.000
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 0VB  H18  C22  H17  108.77  3.000
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_chem_comp_tor.id
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