# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue Mar 17 23:52:13 2020
#   Inital geometry file: a 80 line input string
#   Ligand name: 3-phenylquinazolin-4(3H)-one
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: O=C1N(C=Nc2ccccc12)c3ccccc3
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 0OK  0OK  3-phenylquinazolin-4(3H)-one  ligand  27  17  .  2021-08-03  2021-08-03  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_0OK
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 0OK  CAG  C  CR16  0  -0.257  -2.5492  -0.5083  -1.1202
 0OK  CAC  C  CR16  0  -0.260  -3.9277  -0.6548  -1.0772
 0OK  CAB  C  CR16  0  -0.242  -4.6472  -0.1838   0.0144
 0OK  CAD  C  CR16  0  -0.258  -3.9869   0.4347   1.0670
 0OK  CAH  C  CR16  0  -0.257  -2.6062   0.5785   1.0340
 0OK  CAM  C  CR6   0   0.285  -1.8991   0.1087  -0.0617
 0OK  NAQ  N  NR6   0  -0.622  -0.4815   0.2861  -0.1051
 0OK  CAK  C  CR16  0   0.141   0.0189   1.5346  -0.3546
 0OK  NAL  N  N     0  -0.456   1.2584   1.8419  -0.3981
 0OK  CAO  C  CR66  0   0.248   2.1678   0.8320  -0.1754
 0OK  CAI  C  CR16  0  -0.310   3.5352   1.1323  -0.2131
 0OK  CAE  C  CR16  0  -0.236   4.4660   0.1405   0.0073
 0OK  CAF  C  CR16  0  -0.257   4.0609  -1.1730   0.2696
 0OK  CAJ  C  CR16  0  -0.273   2.7193  -1.4833   0.3093
 0OK  CAP  C  CR66  0  -0.096   1.7651  -0.4857   0.0872
 0OK  CAN  C  CR6   0   0.570   0.3438  -0.8066   0.1352
 0OK  OAA  O  O     0  -0.443  -0.1199  -1.9057   0.3641
 0OK  H1   H  HCR6  0   0.272  -1.9859  -0.8641  -1.9729
 0OK  H2   H  HCR6  0   0.268  -4.4401  -1.1329  -1.9011
 0OK  H3   H  HCR6  0   0.266  -5.7228  -0.2973   0.0425
 0OK  H4   H  HCR6  0   0.268  -4.5428   0.8045   1.9180
 0OK  H5   H  HCR6  0   0.274  -2.0831   1.0518   1.8550
 0OK  H6   H  HCR6  0   0.299  -0.7309   2.2977  -0.5279
 0OK  H7   H  HCR6  0   0.269   3.8409   2.1500  -0.4182
 0OK  H8   H  HCR6  0   0.271   5.5210   0.3793  -0.0235
 0OK  H9   H  HCR6  0   0.268   4.8014  -1.9424   0.4408
 0OK  H10  H  HCR6  0   0.268   2.3971  -2.4956   0.5126

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 0OK  CAB  CAC  aromatic  1.390  0.020  1.390
 0OK  CAB  CAD  aromatic  1.388  0.020  1.388
 0OK  CAC  CAG  aromatic  1.387  0.020  1.387
 0OK  CAD  CAH  aromatic  1.389  0.020  1.389
 0OK  CAG  CAM  aromatic  1.387  0.020  1.387
 0OK  CAH  CAM  aromatic  1.386  0.020  1.386
 0OK  CAM  NAQ  single    1.429  0.020  1.429
 0OK  NAQ  CAK  single    1.368  0.020  1.368
 0OK  NAQ  CAN  single    1.390  0.020  1.390
 0OK  CAK  NAL  double    1.278  0.020  1.278
 0OK  OAA  CAN  double    1.215  0.020  1.215
 0OK  CAN  CAP  single    1.458  0.020  1.458
 0OK  NAL  CAO  single    1.377  0.020  1.377
 0OK  CAP  CAO  aromatic  1.403  0.020  1.403
 0OK  CAP  CAJ  aromatic  1.398  0.020  1.398
 0OK  CAO  CAI  aromatic  1.400  0.020  1.400
 0OK  CAJ  CAF  aromatic  1.378  0.020  1.378
 0OK  CAI  CAE  aromatic  1.378  0.020  1.378
 0OK  CAF  CAE  aromatic  1.399  0.020  1.399
 0OK  CAG  H1   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAC  H2   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAB  H3   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAD  H4   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAH  H5   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAK  H6   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAI  H7   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAE  H8   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAF  H9   single    0.930  0.020  1.080
 0OK  CAJ  H10  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 0OK  H1   CAG  CAM  120.24  3.000
 0OK  H1   CAG  CAC  120.47  3.000
 0OK  CAM  CAG  CAC  119.28  3.000
 0OK  H2   CAC  CAB  120.19  3.000
 0OK  H2   CAC  CAG  119.60  3.000
 0OK  CAB  CAC  CAG  120.21  3.000
 0OK  H3   CAB  CAD  119.99  3.000
 0OK  H3   CAB  CAC  119.97  3.000
 0OK  CAD  CAB  CAC  120.03  3.000
 0OK  H4   CAD  CAH  119.62  3.000
 0OK  H4   CAD  CAB  120.30  3.000
 0OK  CAH  CAD  CAB  120.08  3.000
 0OK  H5   CAH  CAM  120.08  3.000
 0OK  H5   CAH  CAD  120.52  3.000
 0OK  CAM  CAH  CAD  119.40  3.000
 0OK  NAQ  CAM  CAH  119.20  3.000
 0OK  NAQ  CAM  CAG  119.79  3.000
 0OK  CAH  CAM  CAG  120.99  3.000
 0OK  CAN  NAQ  CAK  122.12  3.000
 0OK  CAN  NAQ  CAM  119.08  3.000
 0OK  CAK  NAQ  CAM  118.79  3.000
 0OK  H6   CAK  NAL  119.76  3.000
 0OK  H6   CAK  NAQ  114.75  3.000
 0OK  NAL  CAK  NAQ  125.49  3.000
 0OK  CAO  NAL  CAK  117.31  3.000
 0OK  CAP  CAO  CAI  119.13  3.000
 0OK  CAI  CAO  NAL  118.89  3.000
 0OK  CAP  CAO  NAL  121.98  3.000
 0OK  H7   CAI  CAE  121.09  3.000
 0OK  H7   CAI  CAO  118.85  3.000
 0OK  CAE  CAI  CAO  120.06  3.000
 0OK  H8   CAE  CAF  119.65  3.000
 0OK  H8   CAE  CAI  119.68  3.000
 0OK  CAF  CAE  CAI  120.67  3.000
 0OK  H9   CAF  CAJ  120.13  3.000
 0OK  H9   CAF  CAE  119.95  3.000
 0OK  CAJ  CAF  CAE  119.92  3.000
 0OK  H10  CAJ  CAP  119.62  3.000
 0OK  H10  CAJ  CAF  120.42  3.000
 0OK  CAP  CAJ  CAF  119.95  3.000
 0OK  CAN  CAP  CAJ  120.20  3.000
 0OK  CAJ  CAP  CAO  120.27  3.000
 0OK  CAN  CAP  CAO  119.53  3.000
 0OK  OAA  CAN  CAP  125.29  3.000
 0OK  CAP  CAN  NAQ  113.58  3.000
 0OK  OAA  CAN  NAQ  121.14  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 0OK  CONST_01  CAD  CAB  CAC  CAG    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_02  CAD  CAH  CAM  CAG    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_03  CAH  CAD  CAB  CAC    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_04  CAH  CAM  CAG  CAC    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_05  CAM  CAG  CAC  CAB    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_06  CAM  CAH  CAD  CAB    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_07  CAF  CAJ  CAP  CAO    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_08  CAF  CAE  CAI  CAO    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_09  CAJ  CAP  CAO  CAI    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_10  CAJ  CAF  CAE  CAI    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_11  CAP  CAO  CAI  CAE    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_12  CAP  CAJ  CAF  CAE    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_13  NAQ  CAM  CAG  CAC  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_14  NAQ  CAM  CAH  CAD  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_15  NAL  CAK  NAQ  CAM  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_16  CAP  CAN  NAQ  CAM  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_17  CAO  NAL  CAK  NAQ    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_18  CAP  CAN  NAQ  CAK    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_19  CAN  NAQ  CAK  NAL    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_20  OAA  CAN  NAQ  CAM    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_21  OAA  CAN  NAQ  CAK  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_22  H3   CAB  CAC  CAG  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_23  H5   CAH  CAM  CAG  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_24  H4   CAD  CAB  CAC  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_25  H1   CAG  CAC  CAB  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_26  H2   CAC  CAB  CAD  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_27  H7   CAI  CAO  NAL    0.00   0.0  0
 0OK  CONST_28  H10  CAJ  CAP  CAO  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_29  H8   CAE  CAI  CAO  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_30  H9   CAF  CAE  CAI  180.00   0.0  0
 0OK  CONST_31  H6   CAK  NAQ  CAM    0.00   0.0  0
 0OK  Var_01    CAK  NAQ  CAM  CAG  105.16  30.0  2

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 0OK  plan-1  CAG  0.020
 0OK  plan-1  CAC  0.020
 0OK  plan-1  CAB  0.020
 0OK  plan-1  CAD  0.020
 0OK  plan-1  CAH  0.020
 0OK  plan-1  CAM  0.020
 0OK  plan-1  NAQ  0.020
 0OK  plan-1  H1   0.020
 0OK  plan-1  H2   0.020
 0OK  plan-1  H3   0.020
 0OK  plan-1  H4   0.020
 0OK  plan-1  H5   0.020
 0OK  plan-2  CAM  0.020
 0OK  plan-2  NAQ  0.020
 0OK  plan-2  CAK  0.020
 0OK  plan-2  NAL  0.020
 0OK  plan-2  CAO  0.020
 0OK  plan-2  CAI  0.020
 0OK  plan-2  CAE  0.020
 0OK  plan-2  CAF  0.020
 0OK  plan-2  CAJ  0.020
 0OK  plan-2  CAP  0.020
 0OK  plan-2  CAN  0.020
 0OK  plan-2  OAA  0.020
 0OK  plan-2  H6   0.020
 0OK  plan-2  H7   0.020
 0OK  plan-2  H8   0.020
 0OK  plan-2  H9   0.020
 0OK  plan-2  H10  0.020

