# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Thu Mar 19 00:05:21 2020
#   Inital geometry file: a 129 line input string
#   Ligand name: 4-(3-methylisoquinolin-1-yl)-N-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]benzamide
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Cc1cc2ccccc2c(n1)c3ccc(cc3)C(=O)NCCN4CCOCC4
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 0O5  0O5  4-(3-methylisoquinolin-1-yl)-N-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]benzamide  ligand  53  28  .  2021-08-03  2021-08-03  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_0O5
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 0O5  O19  O  O     0  -0.488   2.2241  -1.6080  -0.8891
 0O5  C18  C  C     0   0.525   1.8185  -0.4529  -0.8820
 0O5  N20  N  NH1   0  -0.645   2.6266   0.6071  -1.0404
 0O5  C21  C  CH2   0  -0.302   4.0655   0.4942  -1.1150
 0O5  C22  C  CH2   0  -0.269   4.7135   0.5781   0.2668
 0O5  N23  N  NT    0  -0.431   6.1472   0.3860   0.1940
 0O5  C28  C  CH2   0  -0.303   6.8433   0.9510   1.3360
 0O5  C24  C  CH2   0  -0.188   8.3408   0.7869   1.1595
 0O5  O26  O  O2    0  -0.486   8.6989  -0.5676   0.9943
 0O5  C25  C  CH2   0  -0.184   8.0205  -1.1367  -0.1038
 0O5  C27  C  CH2   0  -0.310   6.5164  -1.0112   0.0447
 0O5  C13  C  CR6   0  -0.036   0.3627  -0.1563  -0.7076
 0O5  C17  C  CR16  0  -0.282  -0.1039   1.0166  -0.1180
 0O5  C14  C  CR16  0  -0.271  -1.4619   1.2194   0.0647
 0O5  C16  C  CR16  0  -0.257  -0.5578  -1.1206  -1.1081
 0O5  C15  C  CR16  0  -0.288  -1.9149  -0.9156  -0.9291
 0O5  C9   C  CR6   0   0.048  -2.3838   0.2513  -0.3271
 0O5  C4   C  CR6   0   0.162  -3.8329   0.5001  -0.1395
 0O5  N6   N  N     0  -0.439  -4.2650   1.6627  -0.5553
 0O5  C2   C  CR6   0   0.231  -5.5777   1.9791  -0.4626
 0O5  C1   C  CH3   0  -0.718  -5.9624   3.3357  -0.9630
 0O5  C7   C  CR66  0   0.026  -4.6880  -0.4675   0.4687
 0O5  C12  C  CR16  0  -0.330  -4.2380  -1.6851   1.0312
 0O5  C11  C  CR16  0  -0.255  -5.1265  -2.5610   1.5933
 0O5  C10  C  CR16  0  -0.245  -6.5040  -2.2615   1.6238
 0O5  C8   C  CR16  0  -0.310  -6.9649  -1.0791   1.1153
 0O5  C5   C  CR66  0   0.229  -6.0669  -0.1512   0.5386
 0O5  C3   C  CR16  0  -0.412  -6.4940   1.1002   0.0482
 0O5  H1   H  HNH1  0   0.409   2.2296   1.5312  -1.0792
 0O5  H2   H  HCH2  0   0.245   4.3177  -0.4424  -1.6107
 0O5  H3   H  HCH2  0   0.255   4.4407   1.3026  -1.7417
 0O5  H4   H  HCH2  0   0.238   4.5166   1.5717   0.6768
 0O5  H5   H  HCH2  0   0.205   4.2319  -0.1432   0.9469
 0O5  H7   H  HCH2  0   0.243   6.6123   2.0160   1.4135
 0O5  H8   H  HCH2  0   0.198   6.5306   0.4786   2.2830
 0O5  H9   H  HCH2  0   0.200   8.6690   1.3792   0.2931
 0O5  H10  H  HCH2  0   0.236   8.8673   1.1586   2.0400
 0O5  H11  H  HCH2  0   0.200   8.3317  -0.6526  -1.0404
 0O5  H12  H  HCH2  0   0.236   8.3067  -2.1882  -0.1562
 0O5  H13  H  HCH2  0   0.200   6.1775  -1.6107   0.9075
 0O5  H14  H  HCH2  0   0.242   6.0449  -1.4349  -0.8442
 0O5  H15  H  HCR6  0   0.260   0.5838   1.7759   0.2334
 0O5  H16  H  HCR6  0   0.261  -1.8076   2.1309   0.5339
 0O5  H17  H  HCR6  0   0.263  -0.2143  -2.0354  -1.5718
 0O5  H18  H  HCR6  0   0.274  -2.6125  -1.6685  -1.2735
 0O5  H19  H  HCH3  0   0.250  -5.7042   3.4481  -2.0171
 0O5  H20  H  HCH3  0   0.244  -7.0305   3.5150  -0.8541
 0O5  H21  H  HCH3  0   0.249  -5.4283   4.1149  -0.4170
 0O5  H22  H  HCR6  0   0.270  -3.1840  -1.9249   1.0358
 0O5  H23  H  HCR6  0   0.265  -4.7709  -3.4875   2.0235
 0O5  H24  H  HCR6  0   0.266  -7.1944  -2.9682   2.0656
 0O5  H25  H  HCR6  0   0.260  -8.0190  -0.8340   1.1561
 0O5  H26  H  HCR6  0   0.261  -7.5434   1.3640   0.0932

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 0O5  C1   C2   single    1.496  0.020  1.496
 0O5  C2   N6   aromatic  1.354  0.020  1.354
 0O5  C2   C3   aromatic  1.369  0.020  1.369
 0O5  N6   C4   aromatic  1.308  0.020  1.308
 0O5  C14  C17  aromatic  1.385  0.020  1.385
 0O5  C14  C9   aromatic  1.393  0.020  1.393
 0O5  C17  C13  aromatic  1.393  0.020  1.393
 0O5  C3   C5   aromatic  1.410  0.020  1.410
 0O5  O19  C18  double    1.224  0.020  1.224
 0O5  C4   C9   single    1.482  0.020  1.482
 0O5  C4   C7   aromatic  1.427  0.020  1.427
 0O5  C9   C15  aromatic  1.394  0.020  1.394
 0O5  C13  C18  single    1.496  0.020  1.496
 0O5  C13  C16  aromatic  1.392  0.020  1.392
 0O5  C5   C7   aromatic  1.416  0.020  1.416
 0O5  C5   C8   aromatic  1.414  0.020  1.414
 0O5  C18  N20  single    1.342  0.020  1.342
 0O5  C7   C12  aromatic  1.415  0.020  1.415
 0O5  C15  C16  aromatic  1.384  0.020  1.384
 0O5  C8   C10  aromatic  1.367  0.020  1.367
 0O5  N20  C21  single    1.445  0.020  1.445
 0O5  C12  C11  aromatic  1.368  0.020  1.368
 0O5  C27  C25  single    1.517  0.020  1.517
 0O5  C27  N23  single    1.453  0.020  1.453
 0O5  C21  C22  single    1.529  0.020  1.529
 0O5  C10  C11  aromatic  1.410  0.020  1.410
 0O5  C25  O26  single    1.411  0.020  1.411
 0O5  O26  C24  single    1.411  0.020  1.411
 0O5  C22  N23  single    1.448  0.020  1.448
 0O5  N23  C28  single    1.452  0.020  1.452
 0O5  C28  C24  single    1.517  0.020  1.517
 0O5  N20  H1   single    0.860  0.020  1.020
 0O5  C21  H2   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C21  H3   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C22  H4   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C22  H5   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C28  H7   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C28  H8   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C24  H9   single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C24  H10  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C25  H11  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C25  H12  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C27  H13  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C27  H14  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C17  H15  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C14  H16  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C16  H17  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C15  H18  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C1   H19  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C1   H20  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C1   H21  single    0.970  0.020  1.090
 0O5  C12  H22  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C11  H23  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C10  H24  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C8   H25  single    0.930  0.020  1.080
 0O5  C3   H26  single    0.930  0.020  1.080

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 0O5  C13  C18  N20  116.30  3.000
 0O5  N20  C18  O19  123.02  3.000
 0O5  C13  C18  O19  120.67  3.000
 0O5  H1   N20  C21  117.54  3.000
 0O5  H1   N20  C18  119.48  3.000
 0O5  C21  N20  C18  122.94  3.000
 0O5  H3   C21  H2   107.24  3.000
 0O5  H3   C21  C22  109.47  3.000
 0O5  H2   C21  C22  111.13  3.000
 0O5  H3   C21  N20  108.34  3.000
 0O5  H2   C21  N20  108.73  3.000
 0O5  C22  C21  N20  111.79  3.000
 0O5  H5   C22  H4   106.55  3.000
 0O5  H5   C22  N23  112.13  3.000
 0O5  H4   C22  N23  108.53  3.000
 0O5  H5   C22  C21  109.68  3.000
 0O5  H4   C22  C21  108.22  3.000
 0O5  N23  C22  C21  111.53  3.000
 0O5  C27  N23  C28  109.47  3.000
 0O5  C28  N23  C22  112.55  3.000
 0O5  C27  N23  C22  112.60  3.000
 0O5  H8   C28  H7   107.25  3.000
 0O5  H8   C28  C24  109.47  3.000
 0O5  H7   C28  C24  108.81  3.000
 0O5  H8   C28  N23  111.87  3.000
 0O5  H7   C28  N23  109.50  3.000
 0O5  C24  C28  N23  109.86  3.000
 0O5  H10  C24  H9   107.96  3.000
 0O5  H10  C24  O26  107.40  3.000
 0O5  H9   C24  O26  110.43  3.000
 0O5  H10  C24  C28  110.22  3.000
 0O5  H9   C24  C28  109.15  3.000
 0O5  O26  C24  C28  111.60  3.000
 0O5  C25  O26  C24  110.88  3.000
 0O5  H12  C25  H11  108.02  3.000
 0O5  H12  C25  C27  110.16  3.000
 0O5  H11  C25  C27  109.13  3.000
 0O5  H12  C25  O26  107.46  3.000
 0O5  H11  C25  O26  110.45  3.000
 0O5  C27  C25  O26  111.55  3.000
 0O5  H14  C27  H13  107.03  3.000
 0O5  H14  C27  C25  108.45  3.000
 0O5  H13  C27  C25  109.64  3.000
 0O5  H14  C27  N23  110.31  3.000
 0O5  H13  C27  N23  111.34  3.000
 0O5  C25  C27  N23  109.98  3.000
 0O5  C16  C13  C17  118.91  3.000
 0O5  C16  C13  C18  118.21  3.000
 0O5  C17  C13  C18  122.83  3.000
 0O5  H15  C17  C14  118.49  3.000
 0O5  H15  C17  C13  120.99  3.000
 0O5  C14  C17  C13  120.49  3.000
 0O5  H16  C14  C9   119.74  3.000
 0O5  H16  C14  C17  119.59  3.000
 0O5  C9   C14  C17  120.66  3.000
 0O5  H17  C16  C15  119.48  3.000
 0O5  H17  C16  C13  119.95  3.000
 0O5  C15  C16  C13  120.57  3.000
 0O5  H18  C15  C9   120.18  3.000
 0O5  H18  C15  C16  119.18  3.000
 0O5  C9   C15  C16  120.63  3.000
 0O5  C4   C9   C15  121.59  3.000
 0O5  C15  C9   C14  118.72  3.000
 0O5  C4   C9   C14  119.66  3.000
 0O5  C7   C4   N6   122.69  3.000
 0O5  C7   C4   C9   121.73  3.000
 0O5  N6   C4   C9   115.58  3.000
 0O5  C2   N6   C4   120.42  3.000
 0O5  C3   C2   C1   122.34  3.000
 0O5  C3   C2   N6   121.65  3.000
 0O5  C1   C2   N6   116.00  3.000
 0O5  H21  C1   H20  108.22  3.000
 0O5  H21  C1   H19  107.10  3.000
 0O5  H20  C1   H19  108.17  3.000
 0O5  H21  C1   C2   110.75  3.000
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 0O5  H19  C1   C2   110.83  3.000
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